Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GPRRTRTTFTSSQIAELEQHFLQGRYLTAPRLADLSAKLALGTAQVKIWFKNRRRRHKIQSDQHKDQS

The query sequence (length=68) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1zq3:P 68 68 1.0000 1.0000 1.0000 9.61e-46
2 3rkq:A 58 58 0.4118 0.4828 0.4828 1.02e-13 3rkq:B
3 2h1k:B 60 56 0.3676 0.4167 0.4464 6.50e-13 2h1k:A
4 8eml:A 58 55 0.3971 0.4655 0.4909 7.56e-13 8eml:B
5 6m3d:C 108 50 0.3824 0.2407 0.5200 2.59e-12 1du0:A, 1du0:B, 1hdd:C, 1hdd:D, 2hdd:A, 2hdd:B, 3hdd:A, 3hdd:B, 2hos:A, 2hos:B, 2hot:A, 2hot:B
6 6m3d:C 108 48 0.3676 0.2315 0.5208 7.10e-12 1du0:A, 1du0:B, 1hdd:C, 1hdd:D, 2hdd:A, 2hdd:B, 3hdd:A, 3hdd:B, 2hos:A, 2hos:B, 2hot:A, 2hot:B
7 1jgg:A 57 57 0.3529 0.4211 0.4211 6.11e-12 1jgg:B
8 1b72:A 68 53 0.3676 0.3676 0.4717 6.50e-12
9 1ig7:A 58 56 0.3824 0.4483 0.4643 1.45e-11
10 4rdu:D 62 56 0.3676 0.4032 0.4464 2.50e-11 4rdu:A, 4xrs:I, 4xrs:G
11 6es3:K 72 49 0.3676 0.3472 0.5102 8.08e-11 6es2:K, 6es2:L, 6es3:M, 5lty:K, 5lty:M, 5lux:K, 5lux:L, 7q3o:K, 7q3o:C, 7q3o:E, 7q3o:G, 7q4n:K, 7q4n:C
12 8pna:A 67 60 0.3676 0.3731 0.4167 8.47e-11 8pm5:A, 8pm5:D, 8pm5:G, 8pm5:M, 8pm5:J, 8pm7:A, 8pm7:C, 8pm7:E, 8pm7:G, 8pmc:A, 8pmc:C, 8pmc:E, 8pmc:G, 8pmf:A, 8pmn:A, 8pmv:A, 8pmv:D, 8pmv:G, 8pmv:J, 8pn4:A, 8pn4:D, 8pn4:G, 8pn4:M, 8pn4:J, 8pnc:A, 8pnc:K, 8pnc:E, 8pnc:H
13 2me6:A 71 56 0.3824 0.3662 0.4643 1.04e-10
14 1nk2:P 77 56 0.3824 0.3377 0.4643 2.25e-10 1nk3:P
15 5flv:M 229 52 0.3824 0.1135 0.5000 4.74e-10 5flv:A, 5flv:E, 5flv:I, 4s0h:A, 4s0h:B, 4s0h:E, 4s0h:F, 6wc2:N, 6wc2:M, 6wc2:O, 6wc5:I, 6wc5:N, 2x6u:A, 2x6v:A, 2x6v:B
16 3a01:A 78 62 0.3676 0.3205 0.4032 5.74e-10 3a01:E
17 2r5z:A 75 55 0.3676 0.3333 0.4545 1.11e-09 9ant:A, 9ant:B, 5jlw:A, 5jlw:D, 5jlx:A, 5jlx:D, 2r5y:A, 4xic:A, 4xic:D, 4xid:A, 4xid:D
18 1puf:A 77 64 0.4118 0.3636 0.4375 2.32e-09 2lp0:A
19 1ahd:P 68 59 0.3676 0.3676 0.4237 2.35e-09
20 3cmy:A 60 60 0.3676 0.4167 0.4167 3.28e-09
21 3a01:F 61 52 0.3382 0.3770 0.4423 4.60e-09 3a01:B, 3lnq:A
22 4cyc:A 66 57 0.3529 0.3636 0.4211 1.14e-08 1b8i:A
23 4uus:A 67 49 0.3235 0.3284 0.4490 2.08e-08 4uus:E
24 1fjl:A 65 58 0.3382 0.3538 0.3966 2.43e-08 1fjl:B, 1fjl:C
25 5zjr:A 64 59 0.3382 0.3594 0.3898 2.82e-08 5zjq:A, 5zjs:A, 5zjt:A, 5zjt:E
26 2lkx:A 68 52 0.3382 0.3382 0.4423 3.97e-08
27 4rbo:A 55 52 0.2941 0.3636 0.3846 1.02e-07 4rbo:D
28 9b8u:B 66 50 0.3088 0.3182 0.4200 1.64e-07 9b8u:A, 9b8u:C, 9b8u:D
29 8osb:E 62 51 0.3235 0.3548 0.4314 2.22e-07
30 2ld5:A 67 56 0.2941 0.2985 0.3571 2.79e-07
31 4qtr:C 57 53 0.3382 0.4035 0.4340 3.40e-07 4qtr:A, 4qtr:B, 4qtr:D
32 5eea:G 63 56 0.2647 0.2857 0.3214 6.68e-07 8byx:B, 8byx:J, 8byx:A, 8byx:K, 8byx:G, 8byx:L, 5edn:A, 5edn:B, 5edn:G, 5edn:J, 5eea:B, 5eea:A, 5eea:J, 5ef6:A, 5ef6:J, 5ef6:B, 5ef6:G, 5eg0:B, 5ego:B, 5no6:A, 5no6:B, 7psx:A, 7psx:B, 7psx:G, 7psx:J
33 6e8c:A 135 55 0.3088 0.1556 0.3818 2.90e-05 6a8r:A, 6a8r:B, 6dfy:C, 6dfy:D, 7dw5:A, 7dw5:B, 6u81:A, 6u82:A, 6u82:D, 5z2t:C, 5z2t:D, 5z6z:A, 5zfw:A, 5zfy:A, 5zfz:A
34 6e8c:A 135 61 0.2647 0.1333 0.2951 0.67 6a8r:A, 6a8r:B, 6dfy:C, 6dfy:D, 7dw5:A, 7dw5:B, 6u81:A, 6u82:A, 6u82:D, 5z2t:C, 5z2t:D, 5z6z:A, 5zfw:A, 5zfy:A, 5zfz:A
35 5hod:A 61 63 0.3088 0.3443 0.3333 5.45e-04 5hod:D
36 8ejo:A 56 55 0.2500 0.3036 0.3091 6.13e-04 8ejo:B, 8ejp:A, 8ejp:B
37 1gt0:C 137 56 0.2206 0.1095 0.2679 7.30e-04 1cqt:A, 1cqt:B, 1e3o:C, 1hf0:A, 1hf0:B, 1o4x:A, 1oct:C
38 7xrc:C 134 54 0.2647 0.1343 0.3333 7.64e-04 2xsd:C
39 3d1n:I 150 56 0.2500 0.1133 0.3036 0.001 3d1n:K, 3d1n:J, 3d1n:L, 3d1n:M, 3d1n:N, 3d1n:O, 3d1n:P
40 5wc9:A 136 58 0.2794 0.1397 0.3276 0.002 1au7:A, 1au7:B, 5wc9:B, 5wc9:E, 5wc9:F
41 1mnm:C 77 53 0.2647 0.2338 0.3396 0.003 1mnm:D
42 8g8e:X 140 56 0.2647 0.1286 0.3214 0.003 8g87:X, 8g88:X, 8g8b:X, 8g8g:X, 8sps:M, 7u0g:K
43 1akh:B 78 53 0.2647 0.2308 0.3396 0.004 1apl:C, 1apl:D, 1k61:A, 1k61:B, 1k61:C, 1k61:D, 1le8:B, 1yrn:B
44 1le8:A 53 44 0.2206 0.2830 0.3409 0.007 1akh:A, 1yrn:A
45 1lfu:P 82 59 0.2647 0.2195 0.3051 0.047 1b72:B, 1b8i:B, 4cyc:B, 1puf:B, 2r5y:B, 2r5z:B, 4uus:B, 4uus:F, 5zjq:B, 5zjr:B, 5zjs:B, 5zjt:B
46 4egc:A 539 53 0.2500 0.0315 0.3208 0.090
47 3l1p:A 147 56 0.2353 0.1088 0.2857 0.11 8bx2:A, 6ht5:E, 3l1p:B, 8sps:L, 8spu:L, 6t90:K, 7u0g:M, 7u0g:L, 7u0i:L, 7u0i:M
48 1yol:A 256 24 0.1765 0.0469 0.5000 0.18 7ah3:B, 6ate:A, 5d10:A, 5d10:B, 5d11:A, 5d11:B, 5d12:B, 7d57:B, 7d5o:B, 3el7:A, 3en5:A, 3en6:B, 3en7:A, 4fic:A, 4fic:B, 8haq:A, 8haq:B, 6hve:B, 6hvf:A, 6hvf:B, 2hwo:A, 2hwo:B, 2hwp:A, 2hwp:B, 8jf3:A, 8jf3:B, 4lgg:A, 4lgg:B, 4lgh:A, 4lgh:B, 3lok:A, 3lok:B, 2qlq:A, 2qlq:B, 3qlf:A, 2qq7:A, 2qq7:B, 3uqf:B, 6wiw:A, 4ybj:B, 1yol:B
49 8bx1:A 127 42 0.1912 0.1024 0.3095 0.53
50 1y57:A 452 24 0.1618 0.0243 0.4583 0.73 1a07:A, 1a07:B, 1a08:A, 1a08:B, 1a09:A, 1a09:B, 1a1a:A, 1a1a:B, 1a1b:A, 1a1b:B, 1a1c:A, 1a1c:B, 1a1e:A, 1a1e:B, 4agw:A, 4agw:B, 7ah3:A, 2bdf:A, 2bdf:B, 2bdj:A, 1bkm:A, 5bmm:A, 5bmm:B, 5d12:A, 7d57:A, 7d5o:A, 3d7t:B, 4dgg:A, 4dgg:B, 3dqw:A, 3dqw:B, 3dqw:C, 3dqw:D, 3dqx:A, 3dqx:B, 6e6e:A, 6e6e:B, 6e6e:C, 6e6e:D, 6e6e:E, 6e6e:F, 6e6e:G, 6e6e:H, 3el8:A, 3en4:A, 3en4:B, 3en5:B, 1f1w:A, 3f3t:A, 3f3u:A, 3f3u:B, 3f3v:A, 3f3v:B, 3f3w:A, 3f3w:B, 6f3f:A, 4f5a:A, 4f5b:A, 3f6x:A, 3f6x:B, 3f6x:C, 3f6x:D, 3g5d:A, 3g5d:B, 3g6g:A, 3g6g:B, 3g6h:B, 3geq:A, 3geq:B, 2h8h:A, 1hcs:B, 1hct:B, 4hvu:A, 4hvv:A, 6hve:A, 4hxj:A, 1is0:A, 1is0:B, 5j5s:A, 5j5s:B, 8jn8:A, 8jn9:A, 4k11:A, 8k79:A, 8k79:B, 5k9i:A, 5k9i:B, 1kc2:A, 1ksw:A, 6l8l:A, 6l8l:B, 6l8l:C, 6l8l:D, 4mcv:A, 4mcv:B, 4mxo:A, 4mxo:B, 4mxx:A, 4mxx:B, 4mxy:A, 4mxy:B, 4mxz:A, 4mxz:B, 7nes:A, 7ng7:A, 1nlo:C, 1nlp:C, 1nzl:B, 1nzv:B, 4o2p:A, 4o2p:B, 1o41:A, 1o42:A, 1o43:A, 1o44:A, 1o45:A, 1o46:A, 1o47:A, 1o48:A, 1o49:A, 1o4a:A, 1o4b:A, 1o4c:A, 1o4d:A, 1o4e:A, 1o4f:A, 1o4g:A, 1o4h:A, 1o4i:A, 1o4j:A, 1o4k:A, 1o4n:A, 1o4o:A, 1o4p:A, 1o4q:A, 1o4r:A, 5oav:A, 5oav:C, 5ob0:A, 5ob1:A, 5ob2:A, 5ob2:C, 3oez:A, 3oez:B, 2oiq:A, 7ote:A, 7ote:B, 1p13:B, 1p13:A, 1prl:C, 1prm:C, 3qlf:B, 3qlg:A, 3qlg:B, 4qt7:A, 1qwe:A, 1qwf:A, 1rlp:C, 1rlq:C, 4rtv:A, 4rtw:A, 4rtw:C, 4rty:A, 4rtz:A, 1sha:A, 1shb:A, 1shd:A, 1skj:A, 1sps:A, 1sps:B, 1sps:C, 2src:A, 3svv:A, 3svv:B, 5swh:A, 5swh:B, 5sys:A, 5sys:B, 5t0p:A, 5t0p:B, 5teh:A, 5teh:B, 3tz7:A, 3tz7:B, 3tz8:A, 3tz8:B, 3tz9:A, 3tz9:B, 3u4w:A, 3u51:A, 3u51:B, 4u5j:A, 4u5j:B, 3uqf:A, 3uqg:A, 3uqg:B, 7wf5:A, 7wf5:B, 6wiw:B, 8xn8:A, 5xp5:A, 5xp5:B, 5xp7:A, 5xp7:B, 4ybj:A, 4ybk:A, 1yom:A, 1yom:B
51 8ik5:C 67 57 0.2353 0.2388 0.2807 0.90 8ike:C, 8ilw:C
52 2dq7:X 263 25 0.1471 0.0380 0.4000 1.8
53 6hd7:v 161 39 0.1912 0.0807 0.3333 2.6 4xnh:C, 4xpd:C, 4y49:C, 4y49:I, 4y49:O
54 3pjz:A 468 13 0.1029 0.0150 0.5385 3.8 4j9u:C, 4j9u:D, 3pjz:B
55 5hzw:A 668 46 0.2059 0.0210 0.3043 3.8 5i04:A
56 7zel:A 827 29 0.1471 0.0121 0.3448 3.8 7zel:B, 7zep:B, 7zes:A, 7zes:B
57 7sbb:I 680 29 0.1324 0.0132 0.3103 5.4
58 7sba:I 899 29 0.1324 0.0100 0.3103 5.6 7sba:K, 7sbb:J, 7sbb:K
59 6fqp:A 67 24 0.1912 0.1940 0.5417 6.0 6fqp:B, 6fqq:A, 6fqq:B, 6fqq:D, 6fqq:E
60 4j7g:A 448 57 0.2500 0.0379 0.2982 6.6 4j7g:B, 4j7h:A, 4j7h:B
61 1xpx:A 144 27 0.1471 0.0694 0.3704 8.3
62 2jae:A 478 50 0.2353 0.0335 0.3200 9.0 2jae:B, 2jb1:A, 2jb1:B, 2jb2:A, 2jb2:B, 2jb3:A, 2jb3:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218