Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
GPLPNKLWCICRQPHNNRFMICCDLCEDWFHGTCVGVTKAMGTDMENKGIDWKCPKCVKR

The query sequence (length=60) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 5wlf:A 60 60 1.0000 1.0000 1.0000 8.46e-41 5wle:A
2 1wem:A 76 55 0.6000 0.4737 0.6545 1.09e-24 4l7x:A, 2m3h:A
3 3kv4:A 432 52 0.4000 0.0556 0.4615 6.60e-13 4do0:A, 3k3n:A, 3k3o:A, 2wwu:A
4 3kv6:D 448 52 0.4333 0.0580 0.5000 8.70e-13 3kv5:D, 3kv5:A, 3kv6:A, 3kv9:A, 3kva:A, 3u78:A
5 8f8y:B 433 54 0.4167 0.0577 0.4630 1.15e-12 8f8y:A, 8f8z:A, 8f8z:B, 3kqi:A, 7m10:A, 3pu3:A, 3pu3:B, 3pu8:B, 3pu8:A, 3pua:A, 3pus:A, 3pus:B
6 1wep:A 79 52 0.4167 0.3165 0.4808 1.28e-12
7 9c0o:A 63 56 0.3500 0.3333 0.3750 7.10e-10
8 2f6j:A 168 55 0.3833 0.1369 0.4182 3.74e-09 8ag2:A, 6aze:A, 7dmy:A, 7dn4:A, 7dn4:B, 7dn4:C, 7dn4:D, 7dn4:E, 7dn4:F, 7f5c:A, 7f5d:A, 7f5e:A, 2f6j:B, 2f6j:C, 2f6n:A, 2f6n:B, 8f6g:A, 2fsa:A, 2fsa:B, 2fsa:C, 2fuu:A, 5h6y:A, 7k6r:A, 7k6s:A, 7kdw:A, 7kdw:B, 7kdz:A, 7lp0:A, 7lp0:B, 7lpk:A, 7lpk:B, 7lrk:A, 7lrk:B, 7lro:A, 7lro:B, 6lu5:A, 6lu6:A, 7m2e:A, 8ou2:A, 8ou2:B, 3qzs:A, 3qzs:B, 3qzt:A, 3qzv:A, 5r4g:A, 5r4h:A, 5r4i:A, 5r4j:A, 5r4k:A, 5r4l:A, 5r4m:A, 5r4n:A, 2ri7:A, 7rwn:A, 7rwo:A, 7rwp:A, 7rwq:A, 7vd4:A
9 1we9:A 64 44 0.3333 0.3125 0.4545 1.40e-07
10 5y20:A 52 42 0.3167 0.3654 0.4524 1.45e-07
11 5yc3:A 60 41 0.3333 0.3333 0.4878 1.61e-07 5yc4:A
12 2k16:A 75 58 0.3667 0.2933 0.3793 2.80e-07 5c13:A, 5c13:C, 5c13:E, 5c13:G, 2k17:A, 5wxg:A, 5wxh:C, 5wxh:A, 5xmy:A, 5xmy:C
13 6j2p:A 98 51 0.2833 0.1735 0.3333 4.42e-06 6j2p:B, 6j2p:D, 6j2p:C
14 5tab:A 53 40 0.2833 0.3208 0.4250 1.63e-05
15 5z8l:A 204 33 0.2333 0.0686 0.4242 5.61e-05 5z8n:A, 5z8n:B, 5z8n:C
16 2lv9:A 80 32 0.2333 0.1750 0.4375 4.29e-04 4l58:A
17 6wxk:B 51 39 0.2500 0.2941 0.3846 0.001 6wxk:A, 6wxk:C, 6wxk:D, 6wxk:E
18 5tbn:A 57 32 0.2333 0.2456 0.4375 0.001
19 5znp:B 186 30 0.2000 0.0645 0.4000 0.002 5znp:A, 5znr:A, 5znr:B
20 8hxx:N 375 43 0.2500 0.0400 0.3488 0.006 8hxy:N, 8hy0:N, 8i3f:B, 8jho:N, 8tof:G, 8w9c:E, 8w9d:E, 8w9e:E, 8w9f:E
21 8hxx:N 375 47 0.2333 0.0373 0.2979 3.0 8hxy:N, 8hy0:N, 8i3f:B, 8jho:N, 8tof:G, 8w9c:E, 8w9d:E, 8w9e:E, 8w9f:E
22 8ihn:M 357 43 0.2500 0.0420 0.3488 0.006 8kd4:E
23 8ihn:M 357 47 0.2333 0.0392 0.2979 3.3 8kd4:E
24 3zpv:1 62 46 0.3167 0.3065 0.4130 0.008 3zpv:3, 3zpv:5, 3zpv:7, 3zpv:9, 3zpv:A, 3zpv:C, 3zpv:E, 3zpv:G, 3zpv:I, 3zpv:K, 3zpv:M, 3zpv:O, 3zpv:Q, 3zpv:S, 3zpv:U, 3zpv:W, 3zpv:Y
25 1x4i:A 70 61 0.3667 0.3143 0.3607 0.037 7zmx:A, 7zmx:B
26 3o70:A 55 32 0.2000 0.2182 0.3750 0.039 3o7a:A
27 8kd6:E 301 43 0.2500 0.0498 0.3488 0.055 8kd2:E
28 2xb1:C 97 52 0.2833 0.1753 0.3269 0.058 4up0:A, 4up5:A, 2xb1:A
29 7yi2:D 321 43 0.2500 0.0467 0.3488 0.059 7yi0:D, 7yi3:D, 7yi4:D, 7yi5:D
30 3n9m:A 503 38 0.2333 0.0278 0.3684 0.059 3n9l:A, 3n9m:C, 3n9n:A, 3n9o:A, 3n9p:A, 3n9q:A, 3puq:A, 3puq:C, 3pur:A, 3pur:C
31 5b73:A 313 45 0.2667 0.0511 0.3556 0.075 4cos:A, 7cwh:B, 5y1z:C, 5y1z:D
32 5tdr:A 70 31 0.2000 0.1714 0.3871 0.10 5tdw:A
33 7klo:A 59 51 0.2500 0.2542 0.2941 0.18 7klr:A
34 6ryr:W 708 47 0.2167 0.0184 0.2766 0.19 2l75:A, 1mm2:A, 6q3m:D, 6ryu:W, 6ryu:V
35 3u5o:C 195 54 0.3000 0.0923 0.3333 0.20 8bd8:A, 8bd9:A, 8bdy:A, 5mr8:A, 3u5m:A, 3u5m:B, 3u5m:C, 3u5m:D, 3u5m:F, 3u5m:G, 3u5m:H, 3u5m:I, 3u5m:K, 3u5m:J, 3u5m:L, 3u5n:A, 3u5n:B, 3u5o:A, 3u5o:B, 3u5o:D, 3u5o:E, 3u5o:F, 3u5o:G, 3u5o:H, 3u5p:A, 3u5p:B, 3u5p:C, 3u5p:D, 3u5p:E, 3u5p:F, 3u5p:G, 3u5p:H, 7zdd:A
36 5c11:A 52 21 0.1500 0.1731 0.4286 0.30 3gl6:A, 2kgg:A, 2kgi:A
37 2ma5:A 61 34 0.2167 0.2131 0.3824 0.30
38 1weu:A 91 61 0.3667 0.2418 0.3607 0.39 3c6w:A, 3c6w:C, 2k1j:A, 2m1r:A, 2pnx:A, 2pnx:C, 2vnf:A, 2vnf:C, 1wen:A
39 1wes:A 71 58 0.3667 0.3099 0.3793 0.40 2g6q:A
40 2qic:A 51 53 0.3500 0.4118 0.3962 0.44
41 2mny:A 55 51 0.2167 0.2364 0.2549 0.48 2mnz:A
42 7y0i:A 56 56 0.3167 0.3393 0.3393 0.59
43 6fhq:A 58 56 0.2833 0.2931 0.3036 0.66 6fhq:B, 6fi1:A, 6fi1:B, 4qf3:A, 4qf3:B
44 1f62:A 51 48 0.2500 0.2941 0.3125 0.68
45 4o64:A 116 41 0.1833 0.0948 0.2683 1.1 4o64:B, 4o64:C
46 2miq:A 94 57 0.2667 0.1702 0.2807 1.1
47 3o36:A 184 31 0.2000 0.0652 0.3871 1.2 7b9x:A, 5h1t:A, 5h1t:B, 5h1t:C, 5h1t:D, 5h1u:B, 5h1u:A, 5h1u:C, 5h1u:D, 5h1v:A, 5h1v:B, 3o33:A, 3o33:B, 3o33:C, 3o33:D, 3o34:A, 3o35:B, 3o35:A, 3o36:B, 3o37:A, 3o37:B, 3o37:C, 3o37:D, 4yab:A, 4yab:B, 4yad:A, 4yad:B, 4yat:A, 4yat:B, 4yax:A, 4yax:B, 4ybm:A, 4ybm:B, 4ybs:A, 4ybt:A, 4yc9:A, 4zql:A, 4zql:B
48 1mm3:A 61 49 0.2333 0.2295 0.2857 1.2
49 5ons:A 181 32 0.2333 0.0773 0.4375 1.4 5vyc:k1, 5vyc:k6, 5vyc:k2, 5vyc:k5, 5vyc:k3, 5vyc:k4
50 9atn:A 98 48 0.2333 0.1429 0.2917 1.8
51 1wee:A 72 28 0.1500 0.1250 0.3214 3.0
52 1ubw:A 348 30 0.1667 0.0287 0.3333 3.6 1ubx:A, 1uby:A
53 4q6f:A 56 31 0.2000 0.2143 0.3871 3.7 6fap:A, 6fap:B, 6fap:C, 6fap:D, 6fhu:A, 6fhu:B, 6fhu:D, 6fhu:C, 6fi0:A, 6fi0:B, 6fi0:C, 6fi0:D, 6fkp:A, 6fkp:D, 6fkp:C, 6fkp:B, 4q6f:B, 4q6f:C, 4q6f:D, 4qf2:A, 4qf2:B, 4qf2:C, 4qf2:D, 5t8r:D, 5t8r:A, 5t8r:B, 5t8r:C
54 4i1i:A 320 19 0.1667 0.0312 0.5263 3.7
55 2ysm:A 111 48 0.2500 0.1351 0.3125 4.0
56 2ysm:A 111 48 0.2167 0.1171 0.2708 9.1
57 5xfo:A 315 57 0.3167 0.0603 0.3333 4.4 8h43:A, 8h43:B, 8h43:C, 4hcz:A, 4hcz:B, 7lky:B, 7lky:H, 7lky:A, 7lky:C, 7lky:D, 7lky:E, 7lky:F, 7lky:G, 6wat:AA, 6wat:AC, 6wat:BA, 6wat:BC, 6wat:CA, 6wat:CC, 6wat:DA, 6wat:DC, 6wat:EC, 6wat:EA, 6wat:FA, 6wat:FC, 6wat:GA, 6wat:GC, 6wat:HA, 6wat:HC, 6wat:IA, 6wat:IC, 6wat:JA, 6wat:JC, 6wat:KA, 6wat:KC, 6wat:OC, 6wat:LA, 6wat:LC, 6wat:MA, 6wat:MC, 6wat:NA, 6wat:NC, 6wat:OA, 6wav:A, 6wav:C, 6wav:B, 6wav:D, 5xfn:A, 5xfp:B, 5xfp:A, 5xfp:E, 5xfq:A, 5xfq:B
58 1i3q:I 122 29 0.1833 0.0902 0.3793 4.8 4a3b:I, 4a3c:I, 4a3d:I, 4a3e:I, 4a3f:I, 4a3g:I, 4a3i:I, 4a3j:I, 4a3k:I, 4a3l:I, 4a3m:I, 4a93:I, 2b8k:I, 4bbr:I, 4bbs:I, 6blo:I, 6blp:I, 6bm2:I, 6bm4:I, 6bqf:I, 4bxx:I, 4bxz:I, 4by1:I, 4by7:I, 5c3e:I, 5c4a:I, 5c4j:I, 5c4x:I, 8cen:I, 8ceo:I, 3cqz:I, 2e2h:I, 2e2i:I, 2e2j:I, 3fki:I, 5fmf:I, 5fyw:I, 5fz5:I, 3gtg:I, 3gtj:I, 3gtk:I, 3gtl:I, 3gtm:I, 3gto:I, 3gtp:I, 3gtq:I, 6gyk:I, 6gyl:I, 6gym:I, 3h3v:J, 3hou:I, 3hou:U, 3hov:I, 3how:I, 3hox:I, 3hoy:I, 3hoz:I, 3i4m:I, 3i4n:I, 1i50:I, 1i6h:I, 6i84:I, 5ip7:I, 5ip9:I, 3j0k:I, 2ja5:I, 2ja6:I, 2ja7:I, 2ja7:U, 2ja8:I, 8jch:I, 3k1f:I, 8k5p:I, 3k7a:I, 1k83:I, 7ked:I, 7kee:I, 7kef:I, 3m3y:I, 3m4o:I, 7mei:i, 7mei:I, 7mk9:I, 7mka:i, 7ml0:I, 7ml1:I, 7ml2:I, 7ml4:I, 1nik:I, 7nkx:I, 7nky:I, 2nvq:I, 2nvt:I, 2nvx:I, 2nvy:I, 2nvz:I, 7o4i:I, 7o4j:I, 6o6c:G, 7o72:I, 7o73:I, 7o75:I, 5oqj:I, 5oqm:I, 5ot2:I, 3po2:I, 3po3:I, 1r5u:I, 1r9s:I, 1r9t:I, 2r92:I, 7rim:I, 7rip:I, 7riq:I, 7riw:I, 7rix:I, 7riy:I, 3rzd:I, 3rzo:I, 3s14:I, 3s15:I, 3s16:I, 3s17:I, 3s1m:I, 3s1n:I, 3s1q:I, 3s1r:I, 3s2d:I, 3s2h:I, 1sfo:I, 5sva:I, 8tug:I, 8tvp:I, 8tvq:I, 8tvs:I, 8tvv:I, 8tvw:I, 8tvx:I, 8tvy:I, 1twa:I, 1twc:I, 1twf:I, 1twg:I, 1twh:I, 5u5q:I, 8u9r:I, 8u9x:I, 8ukq:I, 8ukr:I, 8uks:I, 8ukt:I, 8uku:I, 6upx:I, 6upy:I, 6upz:I, 6uq0:I, 6uq1:I, 6uq2:I, 6uq3:I, 4v1m:I, 4v1n:I, 4v1o:I, 2vum:I, 5vvr:I, 5vvs:I, 5w4u:I, 5w51:I, 1wcm:I, 4x67:I, 4x6a:I, 1y1v:I, 1y1w:I, 4y52:I, 1y77:I, 4y7n:I, 2yu9:I, 7zs9:I, 7zsa:I, 7zsb:I
59 2vp7:A 66 41 0.2000 0.1818 0.2927 5.1 2dx8:A, 2dx8:B, 2vpb:A, 2vpd:A, 2vpd:C, 2vpe:C, 2vpe:A, 2vpg:A, 2vpg:C, 2yyr:A, 2yyr:B
60 6asb:I 121 38 0.1833 0.0909 0.2895 5.5 6asb:C, 6asb:L
61 3u5m:E 173 54 0.3000 0.1040 0.3333 5.5
62 4dem:F 346 24 0.1333 0.0231 0.3333 6.6 3b7l:A, 5cg5:A, 5cg6:A, 3cp6:A, 5dgm:F, 5dgn:F, 5dgs:F, 5diq:F, 5djp:F, 5djr:F, 5djv:F, 2f7m:F, 2f89:F, 2f8c:F, 2f8z:F, 2f92:F, 2f94:F, 2f9k:F, 4ga3:A, 4h5c:F, 4h5d:F, 4h5e:F, 5ja0:F, 5juz:F, 4jvj:F, 5jv0:F, 5jv1:F, 5jv2:F, 4kfa:A, 4kpd:A, 4kpj:A, 4kq5:A, 4kqs:A, 4kqu:A, 5ksx:F, 4l2x:F, 4lfv:F, 4lpg:F, 4lph:F, 3n1v:F, 3n1w:F, 4n1z:F, 3n3l:F, 3n45:F, 3n46:F, 3n49:F, 3n5h:F, 3n5j:F, 3n6k:F, 6n7y:F, 6n7z:F, 6n82:F, 6n83:F, 4n9u:A, 4nfi:F, 4nfj:F, 4nfk:F, 4ng6:A, 4nke:A, 4nkf:A, 4nua:A, 6oag:F, 6oah:F, 4ogu:A, 2opm:A, 2opn:A, 4p0v:A, 4p0w:A, 4p0x:A, 4pvx:F, 4pvy:F, 4q23:A, 2qis:A, 4qpf:A, 4qxs:F, 2rah:A, 4rxa:A, 3rye:A, 3s4j:A, 2vf6:A, 5ygi:A, 1yq7:A, 1yv5:A, 1zw5:A
63 5xpd:A 269 16 0.1333 0.0297 0.5000 7.2
64 6d7j:A 799 32 0.1667 0.0125 0.3125 7.3 6d7j:D
65 2jmi:A 60 39 0.2333 0.2333 0.3590 7.7 2jmj:A
66 2e6r:A 92 49 0.2333 0.1522 0.2857 7.9
67 5t64:A 406 31 0.1833 0.0271 0.3548 9.6 5t64:B, 5t67:A, 5t67:B, 5t6b:A, 5t6b:B, 5t6b:C, 5t6b:D
68 6me8:A 449 16 0.1333 0.0178 0.5000 9.7 6me6:A, 6me7:A, 6me9:A
69 6iiv:A 461 16 0.1333 0.0174 0.5000 9.9 1b13:A, 1b2j:A, 1b2o:A, 1b2o:B, 1be7:A, 1bfy:A, 1c09:A, 1c09:B, 1c09:C, 1fhh:A, 1fhm:A, 6iiu:A, 1irn:A, 1iro:A, 1r0h:A, 4rxn:A, 5rxn:A, 1smm:A, 1smu:A, 1smw:A, 1t9o:A, 1t9o:B, 1t9o:C, 1t9p:A, 1t9p:B, 1t9p:C, 1t9q:A
70 5zb8:A 400 8 0.1000 0.0150 0.7500 9.9 7k30:A, 7k31:A, 7k32:A, 7k33:A, 5zb8:B, 5zb8:C, 5zb8:D, 5zb8:E

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218