Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
GPLGSKIVRIEKARDIPLGATVRNEMDSVIISRIVKGGAAEKSGLLHEGDEVLEINGIEIRGKDVNEVFDLLSDMHGTLT
FVLIPS

The query sequence (length=86) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 4wsi:A 372 81 0.9419 0.2177 1.0000 3.10e-50 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
2 6nid:B 88 82 0.3721 0.3636 0.3902 1.96e-18 6nid:A, 6nid:C
3 2ejy:A 85 82 0.3023 0.3059 0.3171 9.35e-13
4 1rzx:A 98 89 0.3488 0.3061 0.3371 7.03e-11 5i7z:A, 1x8s:A
5 1n7f:A 86 68 0.3140 0.3140 0.3971 6.08e-10 1n7f:B
6 6xa7:B 96 92 0.3488 0.3125 0.3261 6.91e-08 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
7 6kz1:A 97 83 0.3140 0.2784 0.3253 4.88e-06 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
8 4e34:A 87 56 0.2209 0.2184 0.3393 1.80e-05 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
9 1u38:A 89 62 0.2791 0.2697 0.3871 7.33e-05
10 7qqn:C 414 55 0.2558 0.0531 0.4000 1.24e-04 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
11 1b8q:A 127 51 0.2558 0.1732 0.4314 1.70e-04
12 5heb:A 119 56 0.2093 0.1513 0.3214 1.92e-04 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
13 2m0z:A 97 69 0.2558 0.2268 0.3188 3.24e-04 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
14 4xh7:A 110 67 0.2326 0.1818 0.2985 0.001
15 1zub:A 109 43 0.1977 0.1560 0.3953 0.003
16 3jxt:A 96 35 0.1628 0.1458 0.4000 0.003 3jxt:B
17 6q0m:B 94 86 0.2442 0.2234 0.2442 0.003
18 7p70:A 407 44 0.1860 0.0393 0.3636 0.004 7pc4:A, 7qql:A
19 7p73:A 420 46 0.1860 0.0381 0.3478 0.004 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
20 8blu:B 195 83 0.2907 0.1282 0.3012 0.004 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
21 2qt5:A 194 61 0.1977 0.0876 0.2787 0.004 2qt5:B
22 2qt5:A 194 75 0.2674 0.1186 0.3067 0.035 2qt5:B
23 2ka9:A 189 32 0.1512 0.0688 0.4062 0.005 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
24 7pc3:A 405 32 0.1512 0.0321 0.4062 0.005 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
25 8bv7:A 95 36 0.1628 0.1474 0.3889 0.006 8buw:A, 8buw:B
26 7pcb:A 415 42 0.1744 0.0361 0.3571 0.006 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
27 3vqg:A 85 33 0.1744 0.1765 0.4545 0.009
28 7d6f:A 87 56 0.1977 0.1954 0.3036 0.009
29 2r4h:C 98 32 0.1860 0.1633 0.5000 0.012
30 4c2c:A 433 49 0.2442 0.0485 0.4286 0.014 4c2d:A, 4c2d:B, 4c2d:C, 4c2f:A, 4c2g:A
31 5wou:A 95 61 0.2093 0.1895 0.2951 0.016
32 2koh:A 111 44 0.1744 0.1351 0.3409 0.016 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
33 8b82:A 108 46 0.1744 0.1389 0.3261 0.018 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
34 2exg:A 101 53 0.1744 0.1485 0.2830 0.019 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
35 2i0i:A 81 35 0.1512 0.1605 0.3714 0.019 2i0i:B, 2i0i:C
36 3ch8:A 190 66 0.1860 0.0842 0.2424 0.025 2qbw:A
37 4wyu:A 201 72 0.2791 0.1194 0.3333 0.030 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
38 4wyu:A 201 95 0.3256 0.1393 0.2947 0.067 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
39 1n7t:A 103 66 0.1860 0.1553 0.2424 0.031 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
40 8bq8:C 93 91 0.2326 0.2151 0.2198 0.069 8bq8:A, 8bq8:B
41 5zys:A 90 48 0.1860 0.1778 0.3333 0.082
42 2pdz:A 86 69 0.2558 0.2558 0.3188 0.091
43 6ar4:B 87 54 0.1744 0.1724 0.2778 0.26 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
44 6gbe:A 119 50 0.1744 0.1261 0.3000 0.43
45 1ihj:B 95 46 0.1744 0.1579 0.3261 0.46 1ihj:A
46 1l6o:A 95 47 0.1628 0.1474 0.2979 0.53 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
47 2l4t:A 124 32 0.1279 0.0887 0.3438 0.54 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
48 6bxg:A 98 52 0.2209 0.1939 0.3654 0.75
49 5ez0:D 95 58 0.2209 0.2000 0.3276 1.1 5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
50 8xud:D 651 38 0.1395 0.0184 0.3158 1.1 6iqq:C, 6iqq:D, 5wql:D, 5wql:C, 8xud:C
51 7qct:A 90 39 0.1628 0.1556 0.3590 1.2 7qct:B
52 3cyy:B 81 55 0.1744 0.1852 0.2727 1.4 3cyy:A
53 5t63:A 283 36 0.1279 0.0389 0.3056 1.8 5b6l:A, 5gnd:A
54 5oak:A 90 59 0.2209 0.2111 0.3220 2.1 5oak:C
55 2egn:A 83 67 0.1744 0.1807 0.2239 2.1
56 6zbq:A 89 32 0.1395 0.1348 0.3750 2.2 6zc4:A
57 1cf3:A 581 40 0.1395 0.0207 0.3000 2.5 1gal:A, 8jpz:A, 8jpz:B, 5nit:A, 5niw:A, 3qvp:A, 3qvr:A
58 2kaw:A 90 32 0.1279 0.1222 0.3438 2.7 6lcb:A, 2mx6:A
59 4xhv:A 94 64 0.1744 0.1596 0.2344 2.8
60 3tsz:A 341 70 0.2209 0.0557 0.2714 3.1 3shw:A
61 2hxv:A 349 67 0.2442 0.0602 0.3134 3.1
62 8c1t:A 90 29 0.1163 0.1111 0.3448 3.9 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
63 4bjr:A 500 44 0.1977 0.0340 0.3864 5.1 4b0t:A, 4b0t:B, 4bjr:B
64 6rm3:SB0 210 56 0.1977 0.0810 0.3036 5.4
65 8ovw:N 391 44 0.1977 0.0435 0.3864 5.4 8ow1:N
66 9f8x:A 572 31 0.1279 0.0192 0.3548 6.0 9f8x:B, 9f8x:C, 9f8x:D, 1qni:A, 1qni:B, 1qni:C, 1qni:D, 1qni:E, 1qni:F
67 1qzw:A 432 64 0.1977 0.0394 0.2656 6.3 3kl4:A, 5l3s:A, 5l3s:C, 5l3s:E, 5l3s:G, 5l3v:A, 5l3v:B, 1qzw:C, 1qzw:E, 1qzw:G, 3zn8:M
68 2ych:A 336 51 0.1977 0.0506 0.3333 6.7
69 8rd8:Sn 88 19 0.1047 0.1023 0.4737 8.4 8rdv:Sn, 8rdw:Sn
70 6x23:A 89 23 0.1163 0.1124 0.4348 8.5
71 6gaw:BC 571 28 0.1279 0.0193 0.3929 9.6 6gaz:BC, 6gb2:BC, 7po2:7, 8qrn:7, 6rw5:7
72 7aq4:B 588 56 0.2558 0.0374 0.3929 9.7 7apy:A, 7apy:B, 7aq0:A, 7aq0:B, 7aq2:A, 7aq2:B, 7aq3:A, 7aq3:B, 7aq4:A, 7aq5:A, 7aq5:B, 7aq6:A, 7aq6:B, 7aq7:A, 7aq7:B, 7aq8:A, 7aq8:B, 7aq9:A, 7aq9:B, 7aqa:A, 7aqa:B, 7qba:H, 7qba:I, 6rkz:A, 6rkz:B, 6rl0:A, 6rl0:B, 6rl0:C, 6rl0:D, 3sbp:A, 3sbp:B, 3sbp:C, 3sbp:D, 3sbp:E, 3sbp:F, 3sbp:G, 3sbp:H, 3sbq:A, 3sbq:B, 3sbr:A, 3sbr:B, 3sbr:C, 3sbr:D, 3sbr:E, 3sbr:F, 3sbr:G, 3sbr:H, 6y6y:A, 6y6y:B, 6y71:A, 6y71:B, 6y72:A, 6y72:B, 6y77:A, 6y77:B, 6y7d:A, 6y7d:B, 6y7e:A, 6y7e:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218