Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GPLGGSPPDLPEGYEQRTTQQGQVYFLHTQTGVSTWHDPRVPRDLSNINCEELGPLPPGWEIRNTATGRVYFVDHNNRTT
QFTDPRLSAN

The query sequence (length=90) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2kxq:A 90 90 1.0000 1.0000 1.0000 6.74e-64 2laz:A, 2lb0:A, 2ltz:A
2 2djy:A 42 37 0.4111 0.8810 1.0000 9.85e-22
3 2djy:A 42 41 0.2000 0.4286 0.4390 6.12e-04
4 2lb1:A 35 35 0.3333 0.8571 0.8571 2.78e-18 2ltx:A
5 2lb1:A 35 32 0.1333 0.3429 0.3750 0.053 2ltx:A
6 5cq2:A 76 77 0.4000 0.4737 0.4675 5.98e-18 5dws:A, 5dws:E, 5dws:G, 5dzd:A, 5dzd:B, 2jo9:A, 4rof:A, 4rof:B
7 5cq2:A 76 33 0.2556 0.3026 0.6970 5.41e-11 5dws:A, 5dws:E, 5dws:G, 5dzd:A, 5dzd:B, 2jo9:A, 4rof:A, 4rof:B
8 6jjz:B 96 81 0.3556 0.3333 0.3951 1.42e-13 6jjz:A, 6kkg:A, 6kkg:B
9 6jjz:B 96 39 0.2222 0.2083 0.5128 4.34e-09 6jjz:A, 6kkg:A, 6kkg:B
10 5dws:C 40 34 0.2667 0.6000 0.7059 3.82e-12
11 5dws:C 40 31 0.1667 0.3750 0.4839 3.61e-05
12 2jmf:A 43 36 0.2778 0.5814 0.6944 8.59e-12
13 2jmf:A 43 31 0.1444 0.3023 0.4194 0.083
14 1i5h:W 50 42 0.2444 0.4400 0.5238 1.52e-11
15 1i5h:W 50 43 0.1889 0.3400 0.3953 5.59e-04
16 4lcd:A 419 38 0.2778 0.0597 0.6579 1.89e-11 4lcd:B
17 4lcd:A 419 36 0.1889 0.0406 0.4722 5.17e-05 4lcd:B
18 6jjy:A 128 81 0.3333 0.2344 0.3704 1.37e-10 6j68:A, 6j68:B, 6j69:A, 6jjw:A, 6jjx:B, 6jjx:A
19 6jjy:A 128 32 0.2000 0.1406 0.5625 1.90e-07 6j68:A, 6j68:B, 6j69:A, 6jjw:A, 6jjx:B, 6jjx:A
20 2m3o:W 43 37 0.2222 0.4651 0.5405 3.61e-09 2kpz:A, 2kq0:A, 2mpt:A, 4n7h:A
21 2m3o:W 43 32 0.1444 0.3023 0.4062 0.003 2kpz:A, 2kq0:A, 2mpt:A, 4n7h:A
22 2ltv:A 36 35 0.2000 0.5000 0.5143 1.95e-08 2law:A
23 2ltv:A 36 32 0.1444 0.3611 0.4062 1.58e-05 2law:A
24 7lp3:A 37 36 0.2222 0.5405 0.5556 2.90e-08 7lp3:C
25 7lp3:A 37 34 0.1111 0.2703 0.2941 0.12 7lp3:C
26 2laj:A 40 33 0.2111 0.4750 0.5758 3.65e-08
27 2laj:A 40 32 0.1444 0.3250 0.4062 0.006
28 7lp2:E 37 30 0.2111 0.5135 0.6333 1.36e-07 2lb2:A, 7lp2:A, 7lp2:C, 2lty:A
29 7lp2:E 37 32 0.1222 0.2973 0.3438 0.045 2lb2:A, 7lp2:A, 7lp2:C, 2lty:A
30 2n8t:A 39 32 0.1778 0.4103 0.5000 5.02e-07
31 2n8t:A 39 37 0.1222 0.2821 0.2973 0.13
32 1jmq:A 46 32 0.1778 0.3478 0.5000 2.46e-06 1k5r:A, 1k9q:A, 1k9r:A, 2lax:A, 2lay:A, 2ltw:A
33 1jmq:A 46 31 0.1556 0.3043 0.4516 0.009 1k5r:A, 1k9q:A, 1k9r:A, 2lax:A, 2lay:A, 2ltw:A
34 2ez5:W 46 39 0.1778 0.3478 0.4103 8.18e-06
35 2ez5:W 46 41 0.1556 0.3043 0.3415 0.53
36 2nc3:A 33 30 0.1667 0.4545 0.5000 1.39e-04 2nc4:A, 2nc5:A, 2nc6:A
37 2nc3:A 33 31 0.1222 0.3333 0.3548 1.4 2nc4:A, 2nc5:A, 2nc6:A
38 8sg2:A 163 32 0.1556 0.0859 0.4375 0.009 6dun:A, 6dun:B, 7efj:A, 7efx:A, 7ekv:A, 7f0m:A, 7f0m:C, 7f0m:B, 7f0m:D, 1f8a:B, 4gwv:A, 3i6c:A, 3i6c:B, 1i8g:B, 1i8h:B, 3ikd:A, 3ikd:B, 3ikg:A, 3ikg:B, 9inr:A, 9inr:B, 2itk:A, 3jyj:A, 3jyj:B, 3kab:A, 3kac:A, 3kac:B, 3kad:A, 3kaf:A, 3kag:A, 3kah:A, 3kai:A, 3kce:A, 2lb3:A, 2n1o:A, 1nmw:A, 3ntp:A, 6o33:A, 6o34:A, 3odk:A, 3oob:A, 1pin:A, 2q5a:A, 3tc5:A, 3tcz:A, 3tdb:A, 4tns:A, 4tyo:A, 4tyo:B, 5uy9:A, 6vaj:A, 3wh0:A, 2xp3:A, 2xp4:A, 2xp5:A, 2xp6:A, 2xp7:A, 2xp8:A, 2xp9:A, 2xpa:A, 2xpb:A
39 8sg2:A 163 31 0.1333 0.0736 0.3871 2.5 6dun:A, 6dun:B, 7efj:A, 7efx:A, 7ekv:A, 7f0m:A, 7f0m:C, 7f0m:B, 7f0m:D, 1f8a:B, 4gwv:A, 3i6c:A, 3i6c:B, 1i8g:B, 1i8h:B, 3ikd:A, 3ikd:B, 3ikg:A, 3ikg:B, 9inr:A, 9inr:B, 2itk:A, 3jyj:A, 3jyj:B, 3kab:A, 3kac:A, 3kac:B, 3kad:A, 3kaf:A, 3kag:A, 3kah:A, 3kai:A, 3kce:A, 2lb3:A, 2n1o:A, 1nmw:A, 3ntp:A, 6o33:A, 6o34:A, 3odk:A, 3oob:A, 1pin:A, 2q5a:A, 3tc5:A, 3tcz:A, 3tdb:A, 4tns:A, 4tyo:A, 4tyo:B, 5uy9:A, 6vaj:A, 3wh0:A, 2xp3:A, 2xp4:A, 2xp5:A, 2xp6:A, 2xp7:A, 2xp8:A, 2xp9:A, 2xpa:A, 2xpb:A
40 8pxx:A 99 65 0.1778 0.1616 0.2462 0.078 2dyf:A
41 2dld:A 337 48 0.1667 0.0445 0.3125 0.86 2dld:B
42 2wyh:A 905 42 0.1444 0.0144 0.3095 2.3 2wyh:B, 2wyi:A, 2wyi:B
43 8snb:6M 391 75 0.2000 0.0460 0.2400 2.3
44 4d9k:A 366 31 0.1667 0.0410 0.4839 2.5 4d9k:B, 4d9k:C
45 7y5f:B 341 26 0.1111 0.0293 0.3846 5.7 7vgn:A, 7y5f:A, 7y5i:A, 7y5i:B, 7y5p:A, 7y5p:B, 7yhe:A, 7yhe:B, 7yw9:A
46 7pl9:A 994 23 0.1111 0.0101 0.4348 6.2 7pl9:B, 7pl9:C, 7pl9:D, 7pl9:E
47 3sxq:A 519 16 0.1000 0.0173 0.5625 7.0 3sxq:B, 3ttb:A, 3ttb:B
48 6zj3:SE 265 20 0.1111 0.0377 0.5000 7.8
49 5dv4:A 344 16 0.1000 0.0262 0.5625 9.4 5dv2:A, 3ngn:A, 3ngo:A, 3ngq:A
50 3ecq:B 1347 22 0.0889 0.0059 0.3636 9.9 5a55:A, 5a56:A, 5a57:A, 5a58:A, 5a59:A, 5a5a:A, 3ecq:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218