Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GPIRKVLLLKEDHEGLGISITGGKEHGVPILISEIHPGQPADRCGGLHVGDAILAVNGVNLRDTKHKEAVTILSQQRGEI
EFEVVYV

The query sequence (length=87) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4e34:A 87 87 1.0000 1.0000 1.0000 3.27e-58 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
2 7p70:A 407 84 0.5172 0.1106 0.5357 2.37e-21 7pc4:A, 7qql:A
3 2pdz:A 86 84 0.4828 0.4884 0.5000 8.81e-21
4 7qqn:C 414 87 0.3793 0.0797 0.3793 7.91e-16 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
5 3jxt:A 96 85 0.4598 0.4167 0.4706 1.00e-12 3jxt:B
6 6xa7:B 96 82 0.3678 0.3333 0.3902 9.84e-11 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
7 5heb:A 119 75 0.4023 0.2941 0.4667 1.51e-10 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
8 2r4h:C 98 67 0.2299 0.2041 0.2985 5.44e-10
9 1n7f:A 86 64 0.3218 0.3256 0.4375 1.05e-09 1n7f:B
10 6kz1:A 97 91 0.3908 0.3505 0.3736 3.13e-09 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
11 2qt5:A 194 82 0.3333 0.1495 0.3537 6.16e-09 2qt5:B
12 2qt5:A 194 81 0.3218 0.1443 0.3457 7.63e-08 2qt5:B
13 7x2e:A 163 64 0.3103 0.1656 0.4219 2.12e-08 2kbs:A
14 1ihj:B 95 88 0.3333 0.3053 0.3295 2.43e-08 1ihj:A
15 8bq8:C 93 90 0.3908 0.3656 0.3778 3.12e-08 8bq8:A, 8bq8:B
16 7d6f:A 87 81 0.3103 0.3103 0.3333 3.49e-08
17 2m0z:A 97 76 0.3678 0.3299 0.4211 5.27e-08 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
18 2ka9:A 189 94 0.4138 0.1905 0.3830 7.47e-08 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
19 2ka9:A 189 74 0.3218 0.1481 0.3784 4.35e-07 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
20 4wyu:A 201 66 0.3678 0.1592 0.4848 7.58e-08 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
21 4wyu:A 201 80 0.3563 0.1542 0.3875 3.18e-04 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
22 5ez0:D 95 71 0.2414 0.2211 0.2958 1.02e-07 5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
23 6hks:B 94 68 0.2529 0.2340 0.3235 1.08e-07 8cqy:A, 6hks:A, 6hks:C, 6hks:D, 6hks:E, 6hks:F, 8oep:A, 8oep:C, 6t36:A
24 8cn1:H 101 74 0.3218 0.2772 0.3784 1.25e-07 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
25 2egn:A 83 84 0.3333 0.3494 0.3452 1.33e-07
26 7weg:B 96 72 0.3448 0.3125 0.4167 1.71e-07 7weg:A
27 7pc3:A 405 66 0.3333 0.0716 0.4394 2.03e-07 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
28 2i0i:A 81 59 0.3448 0.3704 0.5085 4.42e-07 2i0i:B, 2i0i:C
29 8b82:A 108 66 0.3563 0.2870 0.4697 6.39e-07 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
30 7pc5:A 405 68 0.3218 0.0691 0.4118 9.87e-07
31 5wou:A 95 66 0.3218 0.2947 0.4242 1.33e-06
32 8bv7:A 95 47 0.2299 0.2105 0.4255 2.72e-06 8buw:A, 8buw:B
33 5zys:A 90 69 0.2759 0.2667 0.3478 2.94e-06
34 4ydp:A 83 54 0.2414 0.2530 0.3889 4.11e-06 4ydp:B
35 6ar4:B 87 76 0.2644 0.2644 0.3026 7.05e-06 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
36 6nid:B 88 85 0.2874 0.2841 0.2941 9.92e-06 6nid:A, 6nid:C
37 6gbe:A 119 80 0.2644 0.1933 0.2875 1.52e-05
38 6yx0:B 112 96 0.3563 0.2768 0.3229 2.01e-05 7a00:A, 7a00:B, 1q3p:A, 1q3p:B, 3qjm:A, 3qjm:B, 3qjn:A, 3qjn:B, 3qjn:C, 3qjn:D, 3qjn:E, 3qjn:F, 3qjn:G, 3qjn:H, 8s1r:AAA, 8s1r:BBB, 8s1r:CCC, 8s1r:DDD, 6ywz:B, 6ywz:A, 6yx0:A, 6yx1:A, 6yx1:B, 6yx2:A, 6yx2:B
39 8c1t:A 90 83 0.2989 0.2889 0.3133 2.04e-05 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
40 4xh7:A 110 64 0.2644 0.2091 0.3594 7.21e-05
41 4wsi:A 372 53 0.2184 0.0511 0.3585 2.61e-04 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
42 1zub:A 109 85 0.2759 0.2202 0.2824 2.63e-04
43 7qqm:A 413 82 0.2874 0.0605 0.3049 3.60e-04
44 5oak:A 90 56 0.2414 0.2333 0.3750 3.96e-04 5oak:C
45 7pcb:A 415 56 0.2414 0.0506 0.3750 4.10e-04 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
46 7p73:A 420 64 0.2644 0.0548 0.3594 4.39e-04 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
47 2os6:A 89 73 0.2069 0.2022 0.2466 4.47e-04
48 4xhv:A 94 82 0.2874 0.2660 0.3049 8.09e-04
49 1n7t:A 103 78 0.2759 0.2330 0.3077 0.001 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
50 3ch8:A 190 78 0.2759 0.1263 0.3077 0.001 2qbw:A
51 1u38:A 89 61 0.2299 0.2247 0.3279 0.001
52 2exg:A 101 91 0.2759 0.2376 0.2637 0.003 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
53 5f67:A 98 65 0.2644 0.2347 0.3538 0.004 5f67:B
54 2ejy:A 85 83 0.2529 0.2588 0.2651 0.004
55 1b8q:A 127 69 0.2644 0.1811 0.3333 0.006
56 2l4t:A 124 51 0.1839 0.1290 0.3137 0.008 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
57 6x23:A 89 79 0.2184 0.2135 0.2405 0.010
58 3cyy:B 81 55 0.1724 0.1852 0.2727 0.014 3cyy:A
59 2m0u:A 117 40 0.1724 0.1282 0.3750 0.025
60 5n7d:A 423 65 0.2069 0.0426 0.2769 0.033 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
61 6ezi:A 86 67 0.2644 0.2674 0.3433 0.040 3tmh:A, 3tmh:E, 3tmh:I
62 3tsz:A 341 84 0.2759 0.0704 0.2857 0.053 3shw:A
63 8blu:B 195 77 0.2644 0.1179 0.2987 0.055 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
64 5hj1:A 97 44 0.1724 0.1546 0.3409 0.057
65 5t63:A 283 34 0.1724 0.0530 0.4412 0.059 5b6l:A, 5gnd:A
66 2kpl:A 129 65 0.2069 0.1395 0.2769 0.084
67 7ufg:A 1151 78 0.2529 0.0191 0.2821 0.23
68 7ufg:B 1182 78 0.2529 0.0186 0.2821 0.23 8d8o:B
69 8a7e:C 1524 78 0.2529 0.0144 0.2821 0.23 8a7d:C, 8a7e:Q, 7y5n:C, 7y5q:B
70 6q0m:B 94 56 0.1609 0.1489 0.2500 0.25
71 5izu:A 124 93 0.3448 0.2419 0.3226 0.38 6exj:A, 6exj:C, 5izu:C, 5ovc:A, 5ovp:A, 5ovv:A
72 1rzx:A 98 48 0.1954 0.1735 0.3542 0.39 5i7z:A, 1x8s:A
73 3bpu:A 86 35 0.1609 0.1628 0.4000 0.42
74 6ku3:B 318 86 0.2759 0.0755 0.2791 0.45 6ku3:A, 6ku3:D, 6ku3:C
75 7w6z:A 414 47 0.2184 0.0459 0.4043 0.56 7w6y:A
76 3vqg:A 85 33 0.1609 0.1647 0.4242 0.63
77 3pv3:A 392 42 0.1724 0.0383 0.3571 0.73 3pv3:B, 3pv3:C, 3pv3:D
78 7ykg:A 188 54 0.1954 0.0904 0.3148 1.5 7ykf:A, 7ykf:C, 7ykg:C, 7ykh:A, 7ykh:C, 7yki:A, 7yki:C
79 4you:B 199 48 0.2069 0.0905 0.3750 2.0
80 2ps1:A 224 35 0.1494 0.0580 0.3714 2.2 2prz:A, 2prz:B, 2prz:C, 2prz:D, 2ps1:B, 4wml:A, 4wn3:A
81 8jb3:A 419 39 0.1724 0.0358 0.3846 2.3
82 8j6h:D 407 39 0.1724 0.0369 0.3846 2.3 8j6h:A, 8j6h:B, 8j6h:C
83 2joa:A 105 50 0.1954 0.1619 0.3400 2.6
84 3ju2:A 275 40 0.1494 0.0473 0.3250 2.9 3qc0:A
85 7aoh:B 1134 36 0.1494 0.0115 0.3611 4.9 7amv:B, 7aof:B, 7aoz:B, 7ap8:B, 7ap9:B, 8c8h:B, 6rfl:B, 6ric:B, 6rid:B, 6rie:B
86 8p0j:B 1155 36 0.1494 0.0113 0.3611 4.9 8p0k:B, 8p0n:B
87 5gtj:B 168 32 0.1494 0.0774 0.4062 5.1 5gtj:A, 5gtj:C, 5gtj:D
88 6ko5:A 398 25 0.1264 0.0276 0.4400 6.7 7f9y:R, 7f9z:R, 7na7:R, 7na8:R, 7w2z:R
89 5jb3:R 113 43 0.1724 0.1327 0.3488 8.2 5jbh:R, 6sw9:R, 6swc:R, 6swd:R, 4v4n:BR, 4v6u:AR, 7zag:R, 7zah:R, 7zai:R, 7zhg:R
90 3j31:Q 220 47 0.2184 0.0864 0.4043 9.4
91 1p9e:A 294 46 0.2184 0.0646 0.4130 10.0 1p9e:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218