Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GPIRKVLLLKEDHEGLGISITGGKEHGVPILISEIHPGQPADRAGGLHVGDAILAVNGVNLRDTKHKEAVTILSQQRGEI
EFEVVYV

The query sequence (length=87) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4e34:A 87 87 0.9885 0.9885 0.9885 4.18e-57 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
2 7p70:A 407 84 0.5172 0.1106 0.5357 3.47e-21 7pc4:A, 7qql:A
3 2pdz:A 86 84 0.4828 0.4884 0.5000 1.43e-20
4 7qqn:C 414 87 0.3793 0.0797 0.3793 6.44e-16 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
5 3jxt:A 96 85 0.4598 0.4167 0.4706 9.60e-13 3jxt:B
6 6xa7:B 96 82 0.3793 0.3438 0.4024 2.51e-11 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
7 5heb:A 119 75 0.4023 0.2941 0.4667 1.40e-10 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
8 2r4h:C 98 67 0.2299 0.2041 0.2985 4.58e-10
9 1n7f:A 86 64 0.3218 0.3256 0.4375 1.42e-09 1n7f:B
10 2qt5:A 194 84 0.3563 0.1598 0.3690 1.78e-09 2qt5:B
11 2qt5:A 194 81 0.3218 0.1443 0.3457 6.03e-08 2qt5:B
12 7x2e:A 163 64 0.3103 0.1656 0.4219 1.69e-08 2kbs:A
13 2m0z:A 97 76 0.3678 0.3299 0.4211 2.04e-08 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
14 8bq8:C 93 90 0.3908 0.3656 0.3778 3.06e-08 8bq8:A, 8bq8:B
15 4wyu:A 201 66 0.3678 0.1592 0.4848 4.99e-08 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
16 4wyu:A 201 80 0.3563 0.1542 0.3875 2.08e-04 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
17 8cn1:H 101 74 0.3218 0.2772 0.3784 7.56e-08 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
18 2ka9:A 189 94 0.4138 0.1905 0.3830 7.87e-08 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
19 2ka9:A 189 74 0.3218 0.1481 0.3784 4.63e-07 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
20 6kz1:A 97 91 0.3793 0.3402 0.3626 1.06e-07 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
21 2egn:A 83 84 0.3448 0.3614 0.3571 1.11e-07
22 7pc3:A 405 66 0.3333 0.0716 0.4394 1.59e-07 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
23 8b82:A 108 66 0.3678 0.2963 0.4848 2.84e-07 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
24 2i0i:A 81 59 0.3448 0.3704 0.5085 3.64e-07 2i0i:B, 2i0i:C
25 1ihj:B 95 88 0.3218 0.2947 0.3182 4.79e-07 1ihj:A
26 5wou:A 95 66 0.3333 0.3053 0.4394 4.84e-07
27 7pc5:A 405 68 0.3218 0.0691 0.4118 6.87e-07
28 8bv7:A 95 47 0.2299 0.2105 0.4255 7.69e-07 8buw:A, 8buw:B
29 7d6f:A 87 81 0.2989 0.2989 0.3210 1.08e-06
30 5zys:A 90 69 0.2759 0.2667 0.3478 1.72e-06
31 5ez0:D 95 71 0.2299 0.2105 0.2817 2.13e-06 5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
32 6hks:B 94 68 0.2414 0.2234 0.3088 2.48e-06 8cqy:A, 6hks:A, 6hks:C, 6hks:D, 6hks:E, 6hks:F, 8oep:A, 8oep:C, 6t36:A
33 6ar4:B 87 76 0.2644 0.2644 0.3026 2.92e-06 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
34 4ydp:A 83 54 0.2414 0.2530 0.3889 3.10e-06 4ydp:B
35 6nid:B 88 85 0.2874 0.2841 0.2941 4.78e-06 6nid:A, 6nid:C
36 7weg:B 96 72 0.3333 0.3021 0.4028 4.95e-06 7weg:A
37 6gbe:A 119 80 0.2644 0.1933 0.2875 1.23e-05
38 8c1t:A 90 83 0.2989 0.2889 0.3133 1.30e-05 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
39 6yx0:B 112 96 0.3563 0.2768 0.3229 1.34e-05 7a00:A, 7a00:B, 1q3p:A, 1q3p:B, 3qjm:A, 3qjm:B, 3qjn:A, 3qjn:B, 3qjn:C, 3qjn:D, 3qjn:E, 3qjn:F, 3qjn:G, 3qjn:H, 8s1r:AAA, 8s1r:BBB, 8s1r:CCC, 8s1r:DDD, 6ywz:B, 6ywz:A, 6yx0:A, 6yx1:A, 6yx1:B, 6yx2:A, 6yx2:B
40 4xh7:A 110 64 0.2644 0.2091 0.3594 3.71e-05
41 2os6:A 89 73 0.2184 0.2135 0.2603 9.76e-05
42 4wsi:A 372 56 0.2184 0.0511 0.3393 1.96e-04 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
43 7p73:A 420 64 0.2644 0.0548 0.3594 2.91e-04 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
44 1zub:A 109 85 0.2759 0.2202 0.2824 3.64e-04
45 5oak:A 90 56 0.2414 0.2333 0.3750 3.84e-04 5oak:C
46 7qqm:A 413 82 0.2874 0.0605 0.3049 4.88e-04
47 1u38:A 89 61 0.2299 0.2247 0.3279 8.38e-04
48 4xhv:A 94 82 0.2874 0.2660 0.3049 0.001
49 2ejy:A 85 83 0.2529 0.2588 0.2651 0.001
50 7pcb:A 415 56 0.2529 0.0530 0.3929 0.002 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
51 1n7t:A 103 78 0.2759 0.2330 0.3077 0.002 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
52 3ch8:A 190 78 0.2759 0.1263 0.3077 0.002 2qbw:A
53 5f67:A 98 65 0.2759 0.2449 0.3692 0.002 5f67:B
54 2exg:A 101 91 0.2759 0.2376 0.2637 0.003 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
55 6x23:A 89 79 0.2299 0.2247 0.2532 0.004
56 1b8q:A 127 69 0.2644 0.1811 0.3333 0.005
57 2m0u:A 117 40 0.1839 0.1368 0.4000 0.007
58 2l4t:A 124 51 0.1954 0.1371 0.3333 0.008 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
59 6ezi:A 86 67 0.2759 0.2791 0.3582 0.011 3tmh:A, 3tmh:E, 3tmh:I
60 3cyy:B 81 55 0.1724 0.1852 0.2727 0.012 3cyy:A
61 5n7d:A 423 65 0.2069 0.0426 0.2769 0.019 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
62 5t63:A 283 34 0.1839 0.0565 0.4706 0.025 5b6l:A, 5gnd:A
63 8blu:B 195 80 0.2874 0.1282 0.3125 0.032 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
64 3tsz:A 341 84 0.2759 0.0704 0.2857 0.042 3shw:A
65 2kpl:A 129 65 0.2069 0.1395 0.2769 0.047
66 5hj1:A 97 44 0.1724 0.1546 0.3409 0.050
67 7ufg:A 1151 78 0.2529 0.0191 0.2821 0.12
68 7ufg:B 1182 78 0.2529 0.0186 0.2821 0.12 8d8o:B
69 8a7e:C 1524 78 0.2529 0.0144 0.2821 0.12 8a7d:C, 8a7e:Q, 7y5n:C, 7y5q:B
70 3bpu:A 86 35 0.1609 0.1628 0.4000 0.30
71 6ku3:B 318 86 0.2759 0.0755 0.2791 0.31 6ku3:A, 6ku3:D, 6ku3:C
72 6q0m:B 94 56 0.1609 0.1489 0.2500 0.42
73 3pv3:A 392 42 0.1839 0.0408 0.3810 0.46 3pv3:B, 3pv3:C, 3pv3:D
74 5izu:A 124 93 0.3448 0.2419 0.3226 0.49 6exj:A, 6exj:C, 5izu:C, 5ovc:A, 5ovp:A, 5ovv:A
75 1rzx:A 98 48 0.1954 0.1735 0.3542 0.49 5i7z:A, 1x8s:A
76 3vqg:A 85 33 0.1609 0.1647 0.4242 0.64
77 3ju2:A 275 40 0.1609 0.0509 0.3500 0.69 3qc0:A
78 2joa:A 105 50 0.2069 0.1714 0.3600 0.89
79 7ykg:A 188 54 0.1954 0.0904 0.3148 0.95 7ykf:A, 7ykf:C, 7ykg:C, 7ykh:A, 7ykh:C, 7yki:A, 7yki:C
80 7w6z:A 414 68 0.2529 0.0531 0.3235 1.2 7w6y:A
81 8j6h:D 407 39 0.1724 0.0369 0.3846 1.3 8j6h:A, 8j6h:B, 8j6h:C
82 8jb3:A 419 39 0.1724 0.0358 0.3846 1.3
83 2ps1:A 224 35 0.1494 0.0580 0.3714 2.3 2prz:A, 2prz:B, 2prz:C, 2prz:D, 2ps1:B, 4wml:A, 4wn3:A
84 4you:B 199 48 0.2069 0.0905 0.3750 3.0
85 5gtj:B 168 32 0.1494 0.0774 0.4062 5.9 5gtj:A, 5gtj:C, 5gtj:D
86 6ko5:A 398 25 0.1264 0.0276 0.4400 6.7 7f9y:R, 7f9z:R, 7na7:R, 7na8:R, 7w2z:R
87 3j31:Q 220 47 0.2184 0.0864 0.4043 9.6

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218