Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GPHMSYQVLARKWRPQTFADVVGQEHVLTALANGLSLGRIHHAYLFSGTRGVGKTSIARLLAKGLNCETGITATPCGVCD
NCREIEQGRFVDLIEIDAASRTKVEDTRDLLDNVQYAPARGRFKVYLIDEVHMLSRHSFNALLKTLEEPPEHVKFLLATT
DPQKLPVTILSRCLQFHLKALDVEQIRHQLEHILNEEHIAHEPRALQLLARAAEGSLRDALSLTDQAIASGDGQVSTQAV
SAMLGTLDDDQALSLVEAMVEANGERVMALINEAAARGIEWEALLVEMLGLLHRIAMVQLSPAALGNDMAAIELRMRELA
RTIPPTDIQLYYQTLLIGRKELPYAPDRRMGVEMTLLRALAFHPRMPLPEP

The query sequence (length=371) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3glf:G 378 371 1.0000 0.9815 1.0000 0.0 8giy:B, 8giy:C, 8giy:D, 8giz:B, 8giz:C, 8giz:D, 8gj0:B, 8gj0:C, 8gj0:D, 8gj1:B, 8gj1:C, 8gj1:D, 8gj2:B, 8gj2:C, 8gj2:D, 8gj3:B, 8gj3:C, 8gj3:D, 3glf:B, 3glf:C, 3glf:D, 3glf:H, 3glf:I, 3glg:B, 3glg:C, 3glg:D, 3glg:G, 3glg:H, 3glg:I, 3gli:B, 3gli:C, 3gli:D, 3gli:G, 3gli:H, 3gli:I, 1jr3:A, 1jr3:B, 1jr3:C, 1njf:A, 1njf:B, 1njf:C, 1njf:D, 1njg:A, 1njg:B, 8val:B, 8val:C, 8val:D, 8vam:B, 8vam:C, 8vam:D, 8vap:B, 8vap:C, 8vap:D, 8vaq:B, 8vaq:C, 8vaq:D, 8var:B, 8var:C, 8var:D, 8vas:B, 8vas:C, 8vas:D, 8vat:B, 8vat:C, 8vat:D, 1xxh:B, 1xxh:C, 1xxh:D, 1xxh:G, 1xxh:H, 1xxh:I, 1xxi:B, 1xxi:C, 1xxi:D, 1xxi:G, 1xxi:H, 1xxi:I
2 1iqp:A 326 332 0.2345 0.2669 0.2620 1.91e-20 1iqp:B, 1iqp:C, 1iqp:E
3 8ui7:C 339 310 0.1995 0.2183 0.2387 1.98e-16 8ui8:C, 8ui9:C, 8uii:C, 8umt:C, 8umu:C, 8umv:C, 8umw:C, 8umy:C, 8un0:C, 8unj:C, 6vvo:C, 7z6h:G
4 2chq:A 313 258 0.1806 0.2141 0.2597 5.34e-16 2chg:A, 2chg:B, 2chg:C, 2chg:D, 2chq:B, 2chq:C
5 8dqx:C 330 227 0.1563 0.1758 0.2555 3.26e-15 8dqw:C, 8dqz:C, 8dr0:C, 8dr1:C, 8dr3:C, 8dr4:C, 8dr5:C, 8dr6:C, 8dr7:C, 8fs3:C, 8fs4:C, 8fs5:C, 8fs6:C, 8fs7:C, 8fs8:C, 7sgz:C, 7sh2:C, 7st9:C, 7stb:C, 7ste:C, 1sxj:C, 7tfh:C, 7tfi:C, 7tfj:C, 7tfk:C, 7tfl:C, 7thj:C, 7thv:C, 8thb:C, 8thc:C, 8thd:C, 7ti8:C, 7tib:C, 7tic:C, 7tid:C, 7tku:C, 8tw7:3, 8tw8:3, 8twa:3, 8twb:3, 7u19:C, 7u1a:C, 7u1p:C
6 8dr0:D 344 286 0.1833 0.1977 0.2378 6.46e-14 8dqw:D, 8dqx:D, 8dqz:D, 8dr1:D, 8dr3:D, 8dr4:D, 8dr5:D, 8dr6:D, 8dr7:D, 8fs3:D, 8fs4:D, 8fs5:D, 8fs6:D, 8fs7:D, 8fs8:D, 7sgz:D, 7sh2:D, 7st9:D, 7stb:D, 7ste:D, 1sxj:D, 7tfh:D, 7tfi:D, 7tfj:D, 7tfk:D, 7tfl:D, 7thj:D, 7thv:D, 8thb:D, 8thc:D, 8thd:D, 7ti8:D, 7tib:D, 7tic:D, 7tid:D, 7tku:D, 8tw7:2, 8tw8:2, 8twa:2, 8twb:2, 7u19:D, 7u1a:D, 7u1p:D
7 8val:E 337 188 0.1509 0.1662 0.2979 2.32e-12 1a5t:A, 8giy:E, 8giz:E, 8gj0:E, 8gj1:E, 8gj2:E, 8gj3:E, 3glf:E, 3glf:J, 3glg:E, 3glg:J, 3gli:E, 3gli:J, 1jr3:E, 8vam:E, 8vap:E, 8vaq:E, 8var:E, 8vas:E, 8vat:E, 1xxh:E, 1xxh:J, 1xxi:E, 1xxi:J
8 3pvs:D 424 196 0.1375 0.1203 0.2602 1.95e-10 3pvs:A, 3pvs:B
9 8umv:D 329 279 0.1563 0.1763 0.2079 3.23e-10 8ui7:D, 8ui8:D, 8ui9:D, 8uii:D, 8umt:D, 8umw:D, 8umy:D, 8un0:D, 8unj:D, 6vvo:D, 7z6h:D
10 7tfh:B 320 235 0.1456 0.1688 0.2298 4.19e-10 8dqw:B, 8dqx:B, 8dqz:B, 8dr0:B, 8dr1:B, 8dr3:B, 8dr4:B, 8dr5:B, 8dr6:B, 8dr7:B, 8fs3:B, 8fs4:B, 8fs5:B, 8fs6:B, 8fs7:B, 8fs8:B, 7sgz:B, 7sh2:B, 7st9:B, 7stb:B, 7ste:B, 1sxj:B, 7tfi:B, 7tfj:B, 7tfk:B, 7tfl:B, 7thj:B, 7thv:B, 8thb:B, 8thc:B, 8thd:B, 7ti8:B, 7tib:B, 7tic:B, 7tid:B, 7tku:B, 8tw7:4, 8tw8:4, 8twa:4, 8twb:4, 7u19:B, 7u1a:B, 7u1p:B
11 8ui7:B 319 232 0.1429 0.1661 0.2284 3.32e-09 8ui8:B, 8ui9:B, 8uii:B, 8umt:B, 8umu:B, 8umv:B, 8umw:B, 8umy:B, 8un0:B, 8unj:B, 6vvo:B, 7z6h:F
12 8ui7:E 348 103 0.0809 0.0862 0.2913 1.35e-04 8ui8:E, 8ui9:E, 8uii:E, 8umt:E, 8umu:E, 8umv:E, 8umw:E, 8umy:E, 8un0:E, 8unj:E, 6vvo:E, 7z6h:E
13 3uk6:L 233 157 0.1267 0.2017 0.2994 1.38e-04
14 8a8w:F 552 136 0.0997 0.0670 0.2721 1.70e-04 8a8u:F, 8a8v:F
15 2xsz:E 315 235 0.1779 0.2095 0.2809 2.80e-04 6fo1:D, 6fo1:E, 6fo1:F, 6k0r:D, 6k0r:E, 6k0r:F, 6k0r:J, 6k0r:K, 6k0r:L, 6qi8:D, 3uk6:A, 3uk6:D, 3uk6:E, 3uk6:F, 3uk6:H, 3uk6:I, 3uk6:J, 3uk6:K, 2xsz:D, 2xsz:F
16 8dqw:E 354 101 0.0728 0.0763 0.2673 3.04e-04 8dqx:E, 8dqz:E, 8dr0:E, 8dr1:E, 8dr3:E, 8dr4:E, 8dr5:E, 8dr6:E, 8dr7:E, 8fs3:E, 8fs4:E, 8fs5:E, 8fs6:E, 8fs7:E, 7sgz:E, 7sh2:E, 7st9:E, 7stb:E, 7ste:E, 7tfh:E, 7tfi:E, 7tfj:E, 7tfk:E, 7tfl:E, 7thj:E, 7thv:E, 8thb:E, 8thc:E, 8thd:E, 7ti8:E, 7tib:E, 7tic:E, 7tid:E, 7tku:E, 8tw7:5, 8tw8:5, 8twa:5, 8twb:5, 7u19:E, 7u1a:E, 7u1p:E
17 8a8w:D 577 144 0.1024 0.0659 0.2639 5.73e-04 8a8u:B, 8a8u:C, 8a8u:D, 8a8u:E, 8a8u:A, 8a8v:B, 8a8v:C, 8a8v:D, 8a8v:E, 8a8v:A, 8a8w:A, 8a8w:B, 8a8w:C, 8a8w:E
18 8fs8:E 332 102 0.0701 0.0783 0.2549 0.001 1sxj:E
19 1in5:A 301 293 0.1806 0.2226 0.2287 0.002 1in4:A, 1in6:A, 1in7:A, 1in8:A, 1j7k:A
20 6gej:Y 447 113 0.0863 0.0716 0.2832 0.015 8ets:W, 8ets:U, 8ets:Y, 8etu:W, 8etu:U, 8etu:Y, 8etw:W, 8etw:U, 8etw:Y, 8eu9:W, 8eu9:U, 8eu9:Y, 8euf:W, 8euf:U, 8euf:Y, 6gej:U, 6gej:W, 6gen:U, 6gen:W, 6gen:Y
21 3pfi:A 301 66 0.0512 0.0631 0.2879 0.023 3pfi:B
22 7p09:F 520 95 0.0836 0.0596 0.3263 0.026 7ksl:C, 7ksl:E, 7p0m:F
23 9emc:F 337 257 0.1833 0.2018 0.2646 0.029 9ema:D, 9ema:E, 9ema:F, 9emc:D, 9emc:E, 6qi8:E, 6qi8:F, 6qi9:E, 6qi9:F, 3uk6:B, 3uk6:C, 3uk6:G
24 8oo7:E 443 120 0.0970 0.0813 0.3000 0.031 8av6:E, 8av6:D, 8av6:F, 6fhs:E, 6fhs:D, 6fhs:F, 6fml:E, 6fml:D, 6fml:F, 8oo7:D, 8oo7:F, 8ooc:D, 8ooc:E, 8ooc:F, 8oop:D, 8oop:E, 8oop:F, 8oor:D, 8oor:E, 8oor:F, 4ww4:B
25 3u5z:B 320 124 0.0889 0.1031 0.2661 0.041 3u5z:C, 3u5z:D, 3u5z:E, 3u5z:L, 3u5z:M, 3u5z:N, 3u5z:O, 3u60:B, 3u60:C, 3u60:D, 3u60:E, 3u61:C, 3u61:D, 3u61:E, 3u61:B, 8uh7:B, 8uh7:C, 8uh7:D, 8uh7:E, 8uk9:B, 8uk9:C, 8uk9:D, 8uk9:E, 8uk9:K, 8uk9:L, 8uk9:M, 8uk9:N, 8unf:E, 8unf:D, 8unf:C, 8unf:B, 8unh:B, 8unh:E
26 6n8z:B 723 137 0.0916 0.0470 0.2482 0.042 6ahf:F, 5kne:A, 5kne:B, 6n8t:C, 6n8t:D, 6n8t:E, 6n8v:A, 6n8v:B, 6n8v:C, 6n8v:E, 6n8v:F, 6n8z:A, 6n8z:C, 6n8z:D, 6n8z:E, 6n8z:F, 5vjh:A, 5vjh:B, 5vjh:C, 5vjh:D, 5vjh:E, 5vjh:F, 5vy8:A, 5vy8:B, 5vy8:F, 5vy9:C, 5vy9:D, 5vya:A, 5vya:B, 5vya:C, 5vya:D, 5vya:E, 5vya:F
27 8ets:V 443 112 0.1024 0.0858 0.3393 0.042 8ets:X, 8ets:T, 8etu:V, 8etu:X, 8etu:T, 8etw:V, 8etw:X, 8etw:T, 8eu9:V, 8eu9:X, 8eu9:T, 8euf:V, 8euf:X, 8euf:T, 6gej:T, 6gej:V, 6gej:X, 6gen:T, 6gen:V, 6gen:X
28 5fm7:B 422 120 0.0970 0.0853 0.3000 0.042
29 6dju:F 531 136 0.0916 0.0640 0.2500 0.055 6w6g:F
30 6ahf:C 865 137 0.0916 0.0393 0.2482 0.057 6ahf:D, 6ahf:E, 6n8t:A, 6n8t:B, 6n8t:F, 5vy8:C, 5vy8:D, 5vy8:E, 5vy9:A, 5vy9:B, 5vy9:E, 5vy9:F
31 1qvr:A 803 136 0.0970 0.0448 0.2647 0.090 4fcv:A, 4fcv:B, 4fcv:C, 4fcw:A, 4fcw:C, 4fcw:F, 4fd2:A, 4fd2:B, 4fd2:D, 4lj5:A, 4lj6:A, 4lj7:A, 4lj7:B, 4lj7:C, 4lj8:A, 4lj9:A, 4lja:A, 1qvr:B, 1qvr:C
32 7zi4:D 439 112 0.0889 0.0752 0.2946 0.10 9c57:D, 9c57:F, 9c62:D, 9c62:F, 6hts:B, 6hts:D, 6hts:F, 5oaf:B, 7ole:B, 7ole:D, 7ole:F, 8x15:P, 8x15:R, 8x19:P, 8x19:R, 8x1c:N, 8x1c:P, 8x1c:R, 8xvg:D, 8xvg:F, 8xvt:D, 8xvt:F, 7zi4:B, 7zi4:F
33 5oaf:D 411 116 0.0916 0.0827 0.2931 0.11 9c62:B, 5oaf:F, 8x15:N, 8x19:N, 8xvg:B, 8xvt:B
34 9c57:B 389 116 0.0916 0.0874 0.2931 0.13 6h7x:A
35 5kne:D 770 142 0.1024 0.0494 0.2676 0.13 5kne:C, 5kne:E, 5kne:F, 6n8v:D
36 1ixs:B 315 140 0.0916 0.1079 0.2429 0.19 8efv:C, 8efv:B, 8efv:A, 8efv:D, 8efv:F, 8efv:E, 8efy:B, 8efy:C, 8efy:A, 8efy:D, 8efy:J, 8efy:K, 8efy:I, 8efy:L, 8efy:E, 8efy:F, 8efy:M, 8efy:N, 1hqc:A, 1hqc:B, 1ixr:C
37 1ksf:X 714 56 0.0512 0.0266 0.3393 0.33 1mbu:A, 1mbu:B, 1mbx:A, 1mbx:B, 1r6b:X, 1r6o:A, 1r6o:B, 1r6q:A, 1r6q:B, 7uiv:B, 7uiv:C, 7uiv:D, 7uiv:E, 7uiv:A, 7uiv:F, 7uiw:A, 7uiw:B, 7uiw:C, 7uiw:D, 7uiw:E, 7uix:B, 7uix:C, 7uix:D, 7uix:E, 7uix:F, 7uix:A, 7uiy:B, 7uiy:C, 7uiy:D, 7uiy:E, 7uiy:A, 7uiy:F, 7uiz:B, 7uiz:C, 7uiz:D, 7uiz:E, 7uiz:A, 7uiz:F, 7uj0:B, 7uj0:C, 7uj0:D, 7uj0:E, 7uj0:A, 7uj0:F, 6uqe:A, 6uqe:B, 6uqe:C, 6uqe:D, 6uqe:E, 6uqe:F, 6uqo:C, 6uqo:D, 6uqo:A, 6uqo:B, 6uqo:E, 6uqo:F, 6w1z:A, 6w1z:B, 6w1z:C, 6w1z:D, 6w1z:E, 6w1z:F, 6w20:A, 6w20:B, 6w20:C, 6w20:D, 6w20:E, 6w20:F, 6w21:A, 6w21:B, 6w21:C, 6w21:D, 6w21:E, 6w21:F, 6w22:A, 6w22:B, 6w22:C, 6w22:D, 6w22:E, 6w22:F, 6w23:A, 6w23:B, 6w23:C, 6w23:D, 6w23:E, 6w23:F, 6w24:A, 6w24:B, 6w24:C, 6w24:D, 6w24:E, 6w24:F
38 7pbl:D 313 68 0.0539 0.0639 0.2941 0.38 7pbl:B, 7pbl:A, 7pbl:C, 7pbl:E, 7pbl:F, 7pbm:A, 7pbm:B, 7pbm:D, 7pbm:C, 7pbm:E, 7pbm:F, 7pbn:A, 7pbn:B, 7pbn:C, 7pbn:D, 7pbn:E, 7pbn:F, 7pbo:A, 7pbo:B, 7pbo:C, 7pbo:D, 7pbo:E, 7pbo:F, 7pbp:B, 7pbp:A, 7pbp:C, 7pbp:D, 7pbp:E, 7pbp:F, 7pbq:A, 7pbq:B, 7pbq:C, 7pbq:D, 7pbq:E, 7pbq:F, 7pbr:B, 7pbr:A, 7pbr:C, 7pbr:D, 7pbr:E, 7pbr:F, 7pbs:A, 7pbs:B, 7pbs:C, 7pbs:D, 7pbs:E, 7pbs:F, 7pbt:B, 7pbt:C, 7pbt:D, 7pbt:A, 7pbt:E, 7pbt:F
39 7sxo:F 549 44 0.0458 0.0310 0.3864 0.39 7sxo:A, 7sxo:E, 7sxo:B, 7sxo:C, 7sxo:D
40 8ojl:A 777 44 0.0512 0.0245 0.4318 0.48 9cc0:A, 9cc0:C, 9cc0:E, 9cc0:B, 9cc0:D, 9cc0:F, 9cc3:B, 9cc3:C, 9cc3:D, 9cc3:E, 7krz:A, 7krz:C, 7krz:B, 7krz:D, 7krz:E, 7krz:F, 7ksl:B, 7ksl:A, 7ksl:F, 7ksm:B, 7ksm:A, 7ksm:C, 7ksm:D, 7ksm:E, 7ksm:F, 7nfy:A, 7nfy:B, 7nfy:C, 7nfy:E, 7nfy:D, 7nfy:F, 7ng4:B, 7ng4:C, 7ng4:D, 7ng4:A, 7ng4:E, 7ng4:F, 7ng5:A, 7ng5:D, 7ng5:B, 7ng5:C, 7ng5:E, 7ng5:F, 7ngc:A, 7ngc:B, 7ngc:C, 7ngc:D, 7ngc:E, 7ngc:F, 7ngf:A, 7ngf:F, 7ngf:B, 7ngf:C, 7ngf:D, 7ngf:E, 7ngl:A, 7ngl:B, 7ngl:C, 7ngl:D, 7ngl:E, 7ngl:F, 7ngp:A, 7ngp:B, 7ngp:C, 7ngp:D, 7ngp:E, 7ngp:F, 7ngq:A, 7ngq:B, 7ngq:C, 7ngq:D, 7ngq:E, 7ngq:F, 8ojl:B, 8ojl:C, 8ojl:D, 8ojl:E, 8ojl:F, 8oka:A, 8oka:B, 8oka:C, 8oka:D, 8oka:E, 8oka:F, 8om7:A, 8om7:B, 8om7:C, 8om7:D, 8om7:E, 8om7:F, 8ovf:A, 8ovf:B, 8ovf:C, 8ovf:D, 8ovf:E, 8ovf:F, 7oxo:A, 7oxo:B, 7oxo:C, 7oxo:D, 7oxo:E, 7oxo:F, 7p09:A, 7p09:B, 7p09:D, 7p09:C, 7p09:E, 7p0b:A, 7p0b:B, 7p0b:C, 7p0b:D, 7p0b:E, 7p0b:F, 7p0m:A, 7p0m:B, 7p0m:C, 7p0m:D, 7p0m:E, 6wzv:A, 6wzv:B, 6x1m:A, 6x1m:B, 6x27:A, 6x27:B, 6x27:C, 6x27:D, 6x27:E, 6x27:F, 6x27:G, 6x27:H, 6x27:I, 6x27:J, 6x27:K, 6x27:L
41 3pt6:B 915 77 0.0512 0.0208 0.2468 0.49 4da4:A, 3pt6:A, 6w8v:A
42 8xoo:O 572 136 0.0889 0.0577 0.2426 0.51
43 8hr8:G 830 45 0.0350 0.0157 0.2889 0.61 8hr9:G, 8hr9:N
44 8xon:O 593 136 0.0889 0.0556 0.2426 0.62 8xon:S, 8xon:R, 8xon:Q, 8xon:P, 8xon:T, 8xoo:R, 8xoo:Q, 8xoo:P, 8xoo:T, 8xoo:S
45 6oay:F 558 136 0.0889 0.0591 0.2426 0.77 6og2:F
46 3av4:A 1140 77 0.0539 0.0175 0.2597 0.98 3av5:A, 3av6:A, 4da4:B, 5gut:A, 5guv:A, 3pt9:A, 6w8v:B, 6w8w:A, 6w8w:B, 5wy1:A
47 7x5b:A 312 71 0.0539 0.0641 0.2817 1.0 6blb:A, 7x7p:M, 7x7p:P, 7x7q:M, 7x7q:P
48 4cw7:A 181 23 0.0377 0.0773 0.6087 1.1 4cvn:A, 4cvn:B, 4cvn:C, 4cvn:D, 4cw7:C, 4cw7:E, 4cw7:G
49 5vqa:A 368 151 0.1024 0.1033 0.2517 1.2 5wc2:A
50 6w6i:F 605 53 0.0485 0.0298 0.3396 1.3 6w6j:F
51 7l6n:C 675 50 0.0458 0.0252 0.3400 1.3 7l6n:A, 7l6n:B, 6w6e:A
52 6w6h:C 636 50 0.0458 0.0267 0.3400 1.5 6w6e:B, 6w6e:C, 6w6g:A, 6w6g:B, 6w6g:C, 6w6h:A, 6w6h:B, 6w6h:F, 6w6i:A, 6w6i:B, 6w6i:C, 6w6j:A, 6w6j:B, 6w6j:C
53 6djv:C 615 50 0.0458 0.0276 0.3400 1.6 6dju:A, 6dju:B, 6dju:C, 6djv:A, 6djv:B
54 6w6j:D 707 50 0.0458 0.0240 0.3400 1.7 6dju:D, 6dju:E, 6djv:D, 6djv:E, 6djv:F, 7l6n:D, 7l6n:E, 7l6n:F, 6w6e:D, 6w6e:E, 6w6e:F, 6w6g:D, 6w6g:E, 6w6h:D, 6w6h:E, 6w6i:D, 6w6i:E, 6w6j:E
55 4dpv:Z 559 42 0.0404 0.0268 0.3571 1.9 1c8d:A, 1c8f:A, 1c8g:A, 1ijs:P, 1p5w:A, 4qyk:K, 4qyk:V, 4qyk:E, 4qyk:J, 4qyk:S, 4qyk:B, 4qyk:c, 4qyk:W, 4qyk:H, 4qyk:I, 4qyk:T, 4qyk:L, 4qyk:M, 4qyk:C, 4qyk:R, 4qyk:A, 4qyk:b, 4qyk:Y, 4qyk:d, 4qyk:F
56 8et3:C 353 136 0.0943 0.0992 0.2574 2.1 8e7v:A, 8e7v:B, 8e7v:C, 8e7v:D, 8e7v:E, 8e7v:F, 8e8q:A, 8e8q:B, 8e8q:C, 8e8q:D, 8e8q:E, 8e8q:F, 8e91:A, 8e91:B, 8e91:C, 8e91:D, 8e91:E, 8e91:F, 8et3:A, 8et3:B, 8et3:D, 8et3:E, 8et3:F, 6po1:A, 6po1:B, 6po1:C, 6po1:D, 6po1:E, 6po3:A, 6po3:B, 6po3:C, 6po3:D, 6po3:E, 6po3:F, 6pod:B, 6pod:C, 6pod:D, 6pod:E, 6pod:F, 6pos:B, 6pos:A, 6pos:C, 6pos:D, 6pos:E, 6pos:F, 6pp5:A, 6pp5:B, 6pp5:C, 6pp5:D, 6pp5:E, 6pp6:A, 6pp6:B, 6pp6:C, 6pp6:D, 6pp6:E, 6pp6:F, 6pp7:B, 6pp7:C, 6pp7:D, 6pp7:E, 6pp7:F, 6pp8:B, 6pp8:A, 6pp8:C, 6pp8:D, 6pp8:E, 6pp8:F, 6wrf:B, 6wrf:C, 6wrf:A, 6wrf:D, 6wrf:E, 6wrf:F, 6wsg:B, 6wsg:C, 6wsg:D, 6wsg:E, 6wsg:F
57 7oar:B 413 212 0.1375 0.1235 0.2406 2.2
58 7oar:A 442 212 0.1375 0.1154 0.2406 2.2 7bil:A, 7bil:B, 6s3h:A, 6s3h:B, 6s3i:A, 6s3m:A, 6s3m:B, 6s3n:A, 6s3n:B, 6s3o:A, 6s3p:A
59 2o2s:A 303 91 0.0701 0.0858 0.2857 2.5 3nj8:A, 3nj8:B, 4o1m:A, 4o1m:B, 4o1m:C, 4o1m:D, 4o1m:E, 4o1m:F, 2o2s:B
60 5d4w:A 688 52 0.0458 0.0247 0.3269 3.2 5d4w:B, 5d4w:C, 5zui:A
61 1a82:A 224 29 0.0404 0.0670 0.5172 3.2 1bs1:A, 1dad:A, 1dae:A, 1daf:A, 1dag:A, 1dah:A, 1dai:A, 1dak:A, 1dam:A
62 5z2l:K 244 138 0.0809 0.1230 0.2174 3.3 5z2l:A, 5z2l:D, 5z2l:B, 5z2l:C, 5z2l:E, 5z2l:J, 5z2l:H, 5z2l:I, 5z2l:F, 5z2l:G, 5z2l:L
63 6vvo:A 448 228 0.1267 0.1049 0.2061 3.5
64 5og1:A 819 50 0.0458 0.0208 0.3400 3.8 5ofo:C, 5ofo:F, 5ofo:E, 5ofo:D, 5ofo:B, 5ofo:A, 5og1:E, 6rn2:A, 6rn2:B, 6rn2:C, 6rn2:D, 6rn2:F, 6rn2:E, 6rn3:A, 6rn3:B, 6rn3:C, 6rn3:D, 6rn3:E, 6rn4:B, 6rn4:C, 6rn4:D, 6rn4:E
65 1ii0:B 553 64 0.0620 0.0416 0.3594 4.4 1f48:A, 1ihu:A, 1ii0:A, 1ii9:A, 1ii9:B
66 6rn4:F 680 50 0.0458 0.0250 0.3400 4.5 6rn3:F, 6rn4:A
67 4ciu:A 657 50 0.0458 0.0259 0.3400 4.6
68 6qs4:C 630 51 0.0458 0.0270 0.3333 4.7 5og1:C, 5og1:D, 6qs4:D, 6qs4:E, 6qs6:C, 6qs6:D, 6qs7:C, 6qs7:D, 6qs7:E, 6qs8:C, 6qs8:D, 6qs8:E
69 8om2:V 286 122 0.0755 0.0979 0.2295 5.2 8d8j:V, 8d8k:V, 8d8l:V, 5mrc:VV, 5mre:VV, 5mrf:VV, 8om3:V, 8om4:V
70 8fcy:A 2864 141 0.1024 0.0133 0.2695 5.5 8fd6:A, 8fdt:A
71 6qs4:B 582 51 0.0458 0.0292 0.3333 5.8 6oax:C, 6oax:E, 6oax:D, 6oax:B, 6oax:A, 6oax:F, 6oay:C, 6oay:E, 6oay:D, 6oay:B, 6oay:A, 5og1:B, 6og1:F, 6og1:A, 6og2:A, 6qs4:A, 6qs4:F, 6qs6:A, 6qs6:B, 6qs6:E, 6qs6:F, 6qs7:A, 6qs7:B, 6qs7:F, 6qs8:A, 6qs8:B, 6qs8:F
72 8sl1:A 843 47 0.0431 0.0190 0.3404 5.9
73 6lt4:A 623 50 0.0431 0.0257 0.3200 5.9 6lt4:B, 6lt4:C, 6lt4:D, 6lt4:E, 6lt4:F, 6lt4:G, 6lt4:H, 6lt4:I, 6lt4:J, 6lt4:K, 6lt4:L, 6lt4:M, 6lt4:N
74 8dyu:A 2562 93 0.0755 0.0109 0.3011 6.8 8dyv:A
75 6hyp:A 2272 149 0.0997 0.0163 0.2483 7.4
76 4wxx:B 1178 73 0.0539 0.0170 0.2740 7.5 3epz:A, 3epz:B, 7lmk:A, 7lmk:B, 7lmk:C, 7lmk:D, 7lmm:A, 7lmm:B, 7lmm:C, 7lmm:D, 3pta:A, 7sfc:A, 7sfd:A, 7sfe:A, 7sff:A, 7sfg:A, 5wvo:C, 4wxx:A, 6x9i:A, 6x9j:A, 6x9k:A, 7xi9:A, 7xib:A, 5ydr:B, 4yoc:A
77 8pqw:A 2892 93 0.0755 0.0097 0.3011 7.6 8pqy:A, 8pqz:A, 8pqz:J
78 5nug:A 2920 93 0.0755 0.0096 0.3011 8.0 5nug:B
79 7z8g:A 3047 93 0.0755 0.0092 0.3011 8.1 8fdu:A, 7z8l:f
80 7abr:F 536 107 0.0728 0.0504 0.2523 9.0
81 1w5s:B 396 297 0.1887 0.1768 0.2357 9.0 1w5s:A, 1w5t:A, 1w5t:B, 1w5t:C
82 3swr:A 965 54 0.0431 0.0166 0.2963 9.6

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218