Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
GPGSASCLELALEGERLCKSGDCRAGVSFFEAAVQVGTEDLKTLSAIYSQLGNAYFYLHDYAKALEYHHHDLTLARTIGD
QLGEAKASGNLGNTLKVLGNFDEAIVCCQRHLDISRELNDKVGEARALYNLGNVYHAKGKSFGCPFPEDVRNALQAAVDL
YEENLSLVTALGDRAAQGRAFGNLGNTHYLLGNFRDAVIAHEQRLLIAKEFGDKAAERRAYSNLGNAYIFLGEFETASEY
YKKTLLLARQLKDRAVEAQSCYSLGNTYTLLQDYEKAIDYHLKHLAIAQELKDRIGEGRACWSLGNAYTALGNHDQAMHF
AEKHLEI

The query sequence (length=327) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 4wng:A 330 327 0.9725 0.9636 0.9725 0.0 7ep7:A, 4g2v:A, 3ro2:A, 3ro3:A, 4wnd:A, 4wne:A, 4wnf:A
2 4a1s:B 342 329 0.6850 0.6550 0.6809 6.78e-167
3 8chy:A 272 315 0.3333 0.4007 0.3460 2.54e-37 8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
4 8chy:A 272 278 0.3089 0.3713 0.3633 2.30e-33 8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
5 8chy:A 272 243 0.2691 0.3235 0.3621 7.87e-29 8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
6 1na0:B 119 109 0.1223 0.3361 0.3670 1.45e-13 1na3:A, 1na3:B
7 1na0:B 119 89 0.1040 0.2857 0.3820 8.36e-09 1na3:A, 1na3:B
8 1na0:B 119 143 0.1315 0.3613 0.3007 6.10e-08 1na3:A, 1na3:B
9 1na0:B 119 70 0.0765 0.2101 0.3571 9.53e-07 1na3:A, 1na3:B
10 1na0:B 119 86 0.0826 0.2269 0.3140 7.72e-04 1na3:A, 1na3:B
11 3kd7:A 102 108 0.1193 0.3824 0.3611 1.50e-11 3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
12 3kd7:A 102 101 0.0979 0.3137 0.3168 8.09e-07 3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
13 3kd7:A 102 92 0.0948 0.3039 0.3370 8.49e-07 3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
14 3kd7:A 102 123 0.1193 0.3824 0.3171 3.09e-05 3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
15 3kd7:A 102 70 0.0734 0.2353 0.3429 4.57e-05 3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
16 7t7t:A 466 253 0.1896 0.1330 0.2451 7.29e-08 7t7t:B
17 7t7t:A 466 236 0.1621 0.1137 0.2246 8.64e-08 7t7t:B
18 7t7t:A 466 101 0.0887 0.0622 0.2871 1.08e-05 7t7t:B
19 7t7t:A 466 321 0.2171 0.1524 0.2212 1.54e-05 7t7t:B
20 7t7t:A 466 188 0.1315 0.0923 0.2287 4.35e-05 7t7t:B
21 7t7t:A 466 92 0.0795 0.0558 0.2826 0.016 7t7t:B
22 6mfv:A 641 163 0.1254 0.0640 0.2515 1.41e-04 6mfv:B, 6mfv:C, 6mfv:D
23 6mfv:A 641 127 0.0979 0.0499 0.2520 0.004 6mfv:B, 6mfv:C, 6mfv:D
24 6mfv:A 641 151 0.1009 0.0515 0.2185 0.18 6mfv:B, 6mfv:C, 6mfv:D
25 6mfv:A 641 89 0.0581 0.0296 0.2135 7.5 6mfv:B, 6mfv:C, 6mfv:D
26 7yeh:A 1020 266 0.1988 0.0637 0.2444 1.55e-04 4ay5:A, 4ay5:B, 4ay5:C, 4ay5:D, 4ay6:A, 4ay6:B, 4ay6:C, 4ay6:D, 5c1d:A, 4cdr:A, 4cdr:B, 4cdr:C, 4cdr:D, 8cm9:A, 8cm9:B, 8cm9:D, 8cm9:C, 8fe7:A, 8fe7:C, 8fe7:E, 8fe7:G, 8fuf:A, 8fuf:C, 8fuf:E, 8fuf:G, 4gyw:C, 4gz3:C, 4gz5:A, 4gz5:B, 4gz5:C, 4gz5:D, 4gz6:A, 4gz6:B, 4gz6:C, 4gz6:D, 5hgv:C, 6ibo:A, 5lvv:A, 6ma1:A, 6ma2:A, 6ma3:A, 6ma4:A, 6ma5:A, 4n39:A, 4n3a:A, 4n3b:A, 4n3c:A, 5npr:A, 3pe3:A, 3pe3:B, 3pe3:C, 3pe3:D, 3pe4:A, 3pe4:C, 6q4m:A, 3tax:A, 3tax:C, 1w3b:A, 4xi9:A, 4xi9:B, 4xi9:C, 4xi9:D, 4xif:A, 4xif:B, 4xif:C, 4xif:D
27 7yeh:A 1020 297 0.2141 0.0686 0.2357 0.002 4ay5:A, 4ay5:B, 4ay5:C, 4ay5:D, 4ay6:A, 4ay6:B, 4ay6:C, 4ay6:D, 5c1d:A, 4cdr:A, 4cdr:B, 4cdr:C, 4cdr:D, 8cm9:A, 8cm9:B, 8cm9:D, 8cm9:C, 8fe7:A, 8fe7:C, 8fe7:E, 8fe7:G, 8fuf:A, 8fuf:C, 8fuf:E, 8fuf:G, 4gyw:C, 4gz3:C, 4gz5:A, 4gz5:B, 4gz5:C, 4gz5:D, 4gz6:A, 4gz6:B, 4gz6:C, 4gz6:D, 5hgv:C, 6ibo:A, 5lvv:A, 6ma1:A, 6ma2:A, 6ma3:A, 6ma4:A, 6ma5:A, 4n39:A, 4n3a:A, 4n3b:A, 4n3c:A, 5npr:A, 3pe3:A, 3pe3:B, 3pe3:C, 3pe3:D, 3pe4:A, 3pe4:C, 6q4m:A, 3tax:A, 3tax:C, 1w3b:A, 4xi9:A, 4xi9:B, 4xi9:C, 4xi9:D, 4xif:A, 4xif:B, 4xif:C, 4xif:D
28 7yeh:A 1020 126 0.1101 0.0353 0.2857 0.013 4ay5:A, 4ay5:B, 4ay5:C, 4ay5:D, 4ay6:A, 4ay6:B, 4ay6:C, 4ay6:D, 5c1d:A, 4cdr:A, 4cdr:B, 4cdr:C, 4cdr:D, 8cm9:A, 8cm9:B, 8cm9:D, 8cm9:C, 8fe7:A, 8fe7:C, 8fe7:E, 8fe7:G, 8fuf:A, 8fuf:C, 8fuf:E, 8fuf:G, 4gyw:C, 4gz3:C, 4gz5:A, 4gz5:B, 4gz5:C, 4gz5:D, 4gz6:A, 4gz6:B, 4gz6:C, 4gz6:D, 5hgv:C, 6ibo:A, 5lvv:A, 6ma1:A, 6ma2:A, 6ma3:A, 6ma4:A, 6ma5:A, 4n39:A, 4n3a:A, 4n3b:A, 4n3c:A, 5npr:A, 3pe3:A, 3pe3:B, 3pe3:C, 3pe3:D, 3pe4:A, 3pe4:C, 6q4m:A, 3tax:A, 3tax:C, 1w3b:A, 4xi9:A, 4xi9:B, 4xi9:C, 4xi9:D, 4xif:A, 4xif:B, 4xif:C, 4xif:D
29 7yeh:A 1020 173 0.1162 0.0373 0.2197 1.6 4ay5:A, 4ay5:B, 4ay5:C, 4ay5:D, 4ay6:A, 4ay6:B, 4ay6:C, 4ay6:D, 5c1d:A, 4cdr:A, 4cdr:B, 4cdr:C, 4cdr:D, 8cm9:A, 8cm9:B, 8cm9:D, 8cm9:C, 8fe7:A, 8fe7:C, 8fe7:E, 8fe7:G, 8fuf:A, 8fuf:C, 8fuf:E, 8fuf:G, 4gyw:C, 4gz3:C, 4gz5:A, 4gz5:B, 4gz5:C, 4gz5:D, 4gz6:A, 4gz6:B, 4gz6:C, 4gz6:D, 5hgv:C, 6ibo:A, 5lvv:A, 6ma1:A, 6ma2:A, 6ma3:A, 6ma4:A, 6ma5:A, 4n39:A, 4n3a:A, 4n3b:A, 4n3c:A, 5npr:A, 3pe3:A, 3pe3:B, 3pe3:C, 3pe3:D, 3pe4:A, 3pe4:C, 6q4m:A, 3tax:A, 3tax:C, 1w3b:A, 4xi9:A, 4xi9:B, 4xi9:C, 4xi9:D, 4xif:A, 4xif:B, 4xif:C, 4xif:D
30 7yeh:A 1020 104 0.0765 0.0245 0.2404 7.2 4ay5:A, 4ay5:B, 4ay5:C, 4ay5:D, 4ay6:A, 4ay6:B, 4ay6:C, 4ay6:D, 5c1d:A, 4cdr:A, 4cdr:B, 4cdr:C, 4cdr:D, 8cm9:A, 8cm9:B, 8cm9:D, 8cm9:C, 8fe7:A, 8fe7:C, 8fe7:E, 8fe7:G, 8fuf:A, 8fuf:C, 8fuf:E, 8fuf:G, 4gyw:C, 4gz3:C, 4gz5:A, 4gz5:B, 4gz5:C, 4gz5:D, 4gz6:A, 4gz6:B, 4gz6:C, 4gz6:D, 5hgv:C, 6ibo:A, 5lvv:A, 6ma1:A, 6ma2:A, 6ma3:A, 6ma4:A, 6ma5:A, 4n39:A, 4n3a:A, 4n3b:A, 4n3c:A, 5npr:A, 3pe3:A, 3pe3:B, 3pe3:C, 3pe3:D, 3pe4:A, 3pe4:C, 6q4m:A, 3tax:A, 3tax:C, 1w3b:A, 4xi9:A, 4xi9:B, 4xi9:C, 4xi9:D, 4xif:A, 4xif:B, 4xif:C, 4xif:D
31 7y4i:A 822 194 0.1651 0.0657 0.2784 7.92e-04 8dti:A, 8dti:B
32 7y4i:A 822 261 0.1835 0.0730 0.2299 0.054 8dti:A, 8dti:B
33 3uq3:A 258 60 0.0673 0.0853 0.3667 0.001 3upv:A
34 3uq3:A 258 55 0.0581 0.0736 0.3455 2.3 3upv:A
35 3uq3:A 258 27 0.0336 0.0426 0.4074 6.3 3upv:A
36 5lwv:A 711 192 0.1407 0.0647 0.2396 0.001 5bnw:A, 6e37:A, 8fe6:A, 8fe6:C, 8fe6:E, 8fe6:G, 4gyw:A, 4gyy:A, 4gyy:C, 4gz3:A, 5hgv:A, 5nps:A, 6tka:AAA, 5vie:A, 5vie:C, 5vif:A
37 5lwv:A 711 173 0.1162 0.0534 0.2197 1.7 5bnw:A, 6e37:A, 8fe6:A, 8fe6:C, 8fe6:E, 8fe6:G, 4gyw:A, 4gyy:A, 4gyy:C, 4gz3:A, 5hgv:A, 5nps:A, 6tka:AAA, 5vie:A, 5vie:C, 5vif:A
38 1elr:A 128 61 0.0550 0.1406 0.2951 0.031 3esk:A, 3fwv:A, 3fwv:B
39 1elr:A 128 108 0.0795 0.2031 0.2407 2.2 3esk:A, 3fwv:A, 3fwv:B
40 8h4q:N 488 80 0.0765 0.0512 0.3125 0.36 8h4h:N, 8h4h:A, 8h4q:A
41 8gl8:I 624 82 0.0642 0.0337 0.2561 0.51
42 4gpk:J 347 79 0.0703 0.0663 0.2911 2.2 4gpk:A, 4gpk:B, 4gpk:C, 4gpk:D, 4gpk:E, 4gpk:F, 4gpk:G, 4gpk:H, 4gpk:I, 4gpk:K, 4gpk:L
43 3juc:A 149 28 0.0367 0.0805 0.4286 3.2
44 6sek:A 504 99 0.0887 0.0575 0.2929 3.3 6sek:B
45 5a01:A 681 155 0.1131 0.0543 0.2387 3.7 5a01:B, 5a01:C
46 5a01:A 681 104 0.0795 0.0382 0.2500 6.1 5a01:B, 5a01:C
47 3muo:A 684 39 0.0581 0.0278 0.4872 3.8 3iuq:A, 3iur:A, 3ivm:A
48 8fn9:A 219 31 0.0459 0.0685 0.4839 4.0 8fn9:C, 8fn9:E, 8fn9:G, 8fna:A
49 6lxn:A 110 32 0.0398 0.1182 0.4062 4.6 6lxn:B
50 5ze8:A 385 95 0.0765 0.0649 0.2632 5.0
51 7qe7:K 531 88 0.0673 0.0414 0.2500 5.9 5a31:J, 5a31:K, 5g04:J, 5g04:K, 5g05:J, 5g05:K, 9gaw:Q, 9gaw:K, 3hym:B, 3hym:D, 3hym:F, 3hym:H, 3hym:J, 3hym:L, 5lcw:J, 5lcw:K, 8pkp:Q, 8pkp:K, 6q6g:Q, 6q6g:K, 6q6h:Q, 6q6h:K, 7qe7:Q, 8s4g:Q, 8s4g:K, 6tlj:J, 6tlj:K, 6tm5:J, 6tm5:K, 6tnt:J, 6tnt:K, 4ui9:J, 4ui9:K
52 1gmw:A 138 28 0.0336 0.0797 0.3929 7.2 1gmw:B, 1gmw:C, 1gmw:D
53 3wd7:A 401 76 0.0612 0.0499 0.2632 9.5 7cct:A, 6l7j:A, 3wd7:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218