BioLiP

>protein
GPGFDFAQAIMKKNTVVARTEKGEFTMLGVHDRVAVIPTHASVGETIYINDVETKVLDACALRDLTDTNLEITIVKLDRN
QKFRDIRHFLPRYEDDYNDAVLSVHTSKFPNMYIPVGQVTNYGFLNLGGTPTHRILMYNFPTRAGQCGGVVTTTGKVIGI
HVGGNGAQGFAAMLLHSYFTDTQKHHHH

The query sequence (length=188) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3zv9:A	188	188	1.0000	1.0000	1.0000	1.11e-140	9ax9:A, 7gnv:B, 7gnw:A, 7gnx:A, 7gny:B, 7gnz:A, 7gnz:B, 7go0:B, 7go1:A, 7go1:B, 7go2:A, 7go3:A, 7go3:B, 7go4:B, 7go5:A, 7go5:B, 7go6:A, 7go6:B, 7go7:B, 7go8:A, 7go9:A, 7goa:B, 7gob:B, 7goc:B, 7god:B, 7goe:B, 7gof:B, 7gog:B, 7goh:A, 7goh:B, 7goi:A, 7goj:A, 7goj:B, 7gok:A, 7gok:B, 7gol:A, 7gom:B, 7gon:B, 7goo:A, 7goo:B, 7gop:B, 7goq:A, 7gor:A, 7gos:A, 7gos:B, 7got:B, 7gou:A, 7gou:B, 7gov:B, 7gow:A, 7gox:A, 7goy:A, 7goz:B, 7gp0:A, 7gp0:B, 7gp1:B, 7gp2:A, 7gp3:A, 7gp4:A, 7gp4:B, 7gp5:B, 7gp6:B, 7gp7:A, 7gp8:B, 7gp9:A, 7gpa:B, 7gpc:B, 7gpd:B, 7gpe:A, 7gpf:A, 7gpg:B, 7gph:B, 7gpi:B, 7gpj:B, 7gpk:B, 7gpl:A, 7gpm:B, 7gpn:A, 7gpo:B, 7gpp:A, 7gpq:A, 7gpr:A, 7gps:B, 7gpt:A, 7gpu:A, 7gpu:B, 7gpv:B, 7gpw:A, 7gpw:B, 7gpx:B, 7gpy:A, 7gpy:B, 7gpz:B, 7gq0:B, 7gq1:A, 7gq1:B, 7gq2:A, 7gq3:B, 7gq4:A, 7gq5:A, 7gq5:B, 7gq6:B, 7gq7:A, 7gq8:A, 7gq8:B, 7gq9:A, 7gqa:B, 7gqb:B, 7gqc:A, 7gqc:B, 7gqd:B, 7gqe:B, 7gqf:A, 7gqg:B, 7gqh:A, 7gqi:A, 7gqj:A, 7gqj:B, 7gqk:B, 7gql:A, 7gql:B, 7gqm:A, 7gqn:A, 7gqn:B, 7gqo:B, 7gqp:A, 7gqq:B, 7gqr:B, 7l8h:A, 7l8h:B, 3zva:A, 3zvb:A, 3zvc:A, 3zvd:A, 3zve:A, 3zvf:A, 3zvg:A
2	3ruo:A	184	181	0.6436	0.6576	0.6685	1.30e-88	5bpe:A, 5iyt:B, 5nfs:A, 3q3y:A, 3q3y:B, 7quw:AAA, 3ruo:B, 2ztx:A, 2zu3:A, 3zz5:A, 3zz6:A, 3zz7:A, 3zz8:A, 3zz9:A, 3zza:A, 3zzb:A, 3zzc:A, 3zzd:A
3	2ijd:1	644	183	0.6330	0.1848	0.6503	2.05e-77	4dcd:A, 2ijd:2, 2ily:A, 2ilz:A, 2im0:A, 2im1:A, 2im2:A, 2im3:A, 4k4s:A, 4k4s:E, 4k4t:A, 4k4t:E, 4k4u:A, 4k4u:E, 4k4v:A, 4k4v:E, 4k4w:A, 4k4w:E, 3ol6:A, 3ol6:E, 3ol6:I, 3ol6:M, 3ol7:A, 3ol7:E, 3ol7:I, 3ol7:M, 3ol8:A, 3ol8:E, 3ol8:I, 3ol8:M, 3ol9:A, 3ol9:E, 3ol9:I, 3ol9:M, 3ola:A, 3ola:E, 3ola:I, 3ola:M, 3olb:A, 3olb:E, 3olb:I, 3olb:M, 1ra7:A
4	5hxf:A	182	179	0.5106	0.5275	0.5363	2.33e-70	5c1u:A, 5c1u:B, 5c1x:A, 5c1x:B, 5c1y:A, 5c20:A, 7dnc:A, 5dp3:A, 5dp4:A, 5dp4:B, 5dp4:C, 5dp4:D, 5dp5:A, 5dp6:A, 5dp6:B, 5dp7:A, 5dp8:A, 5dp9:A, 5dpa:A, 4ght:A, 4ght:B, 5gso:A, 5gso:B, 5gso:C, 5gso:D, 5gso:E, 5gsw:A, 5gsw:B, 5gsw:C, 5gsw:D, 5gsw:E, 6lka:A, 7qub:AAA, 3qzq:A, 3qzq:B, 3qzq:C, 3qzq:D, 3qzr:A, 3qzr:B, 3r0f:A, 3r0f:B, 3sj9:A, 3sji:A, 3sjk:A, 3sjo:A, 3sjo:B, 3sjo:C, 3sjo:D, 3sjo:E, 3sjo:F, 3sjo:G, 3sjo:H, 5wq2:A, 7wyl:A, 7wyo:A
5	6ku8:A	177	175	0.4574	0.4859	0.4914	1.27e-63
6	2b0f:A	182	184	0.4894	0.5055	0.5000	1.58e-60
7	6ffn:A	182	180	0.4681	0.4835	0.4889	1.62e-58	1cqq:A, 6ffs:A, 5fx5:A, 5fx6:A, 2xya:A
8	5xte:J	378	59	0.0798	0.0397	0.2542	0.17	5xte:V, 5xth:AJ, 5xth:AV, 5xti:AJ, 5xti:AV
9	1w4r:A	174	67	0.0904	0.0977	0.2537	0.41	2orv:A, 2orv:B, 1w4r:B, 1w4r:C, 1w4r:D, 1w4r:E, 1w4r:F, 1w4r:G, 1w4r:H, 2wvj:A, 2wvj:B, 2wvj:C, 2wvj:D, 2wvj:E, 2wvj:F, 2wvj:G, 2wvj:H, 1xbt:A, 1xbt:B, 1xbt:C, 1xbt:D, 1xbt:E, 1xbt:F, 1xbt:G, 1xbt:H
10	7dqx:D	770	45	0.0904	0.0221	0.3778	0.50	7dqx:A
11	6trf:A	1319	80	0.1117	0.0159	0.2625	0.92
12	5n2j:B	1381	80	0.1117	0.0152	0.2625	0.93	6fsn:A, 5mu1:A, 5mzo:A, 5n2j:A, 3wzs:A, 7zhb:A, 7zkc:A, 7zle:A, 7zll:A, 7zlu:A, 7zlu:B, 7zlu:C, 7zxw:A
13	2wv4:A	201	128	0.1649	0.1542	0.2422	1.6	2wv4:B, 2wv5:A, 2wv5:B, 2wv5:C, 2wv5:D
14	7s81:K	203	50	0.0745	0.0690	0.2800	1.6	7s81:P, 7s81:H
15	6lhr:C	344	52	0.0798	0.0436	0.2885	2.3	6lhr:A, 6lhr:B, 6lhr:D
16	7ara:A	139	79	0.1223	0.1655	0.2911	2.8	7ara:B, 2hrv:A, 2hrv:B
17	6az1:Y	88	54	0.0904	0.1932	0.3148	9.0	8rxh:SY, 8rxx:SY

[Back]