Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
GPDQRAQKKGDIILGGLFPIHFGVAAKDQDLKSRPESVECIRYNFRGFRWLQAMIFAIEEINSSPALLPNLTLGYRIFDT
CNTVSKALEATLSFVAQNKIDSLNCSEHIPSTIAVVGATGSGVSTAVANLLGLFYIPQVSYASSSRLLSNKNQFKSFLRT
IPNDEHQATAMADIIEYFRWNWVGTIAADDDYGRPGIEKFREEAEERDICIDFSELISQYSDEEEIQHVVEVIQNSTAKV
IVVFSSGPDLEPLIKEIVRRNITGKIWLASEAWASSSLIAMPQYFHVVGGTIGFALKAGQIPGFREFLKKVHPRKSVHNG
FAKEFWEETFNCHLRPLCTGDENISSVETPYIDYTHLRISYNVYLAVYSIAHALQDIYTCLPGRGLFTNGSCADIKKVEA
WQVLKHLRHLNFTNNMGEQVTFDECGDLVGNYSIINWHLSPEDGSIVFKEVGYYNVYAKKGERLFINEEKILWSGFSREV
PFSNCSRDCLAGTRKGIIEGEPTCCFECVECPDGEYSDETDASACNKCPDDFWSNENHTSCIAKEIEFLSWTEPFGIALT
LFAVLGIFLTAFVLGVFIKFRNTPIVKATNRELSYLLLFSLLCCFSSSLFFIGEPQDWTCRLRQPAFGISFVLCISCILV
KTNRVLLVFEAKIPTSFHRKWWGLNLQFLLVFLCTFMQIVICVIWLYTAPPSSYRNQELEDEIIFITCHEGSLMALGFLI
GYTCLLAAICFFFAFKSRKLPENFNEAKFITFSMLIFFIVWISFIPAYASTYGKFVSAVEVIAILAASFGLLACIFFNKI
YIILFKPSRNTIEEVRCSTAAHAF

The query sequence (length=824) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 8szh:A 835 828 1.0000 0.9868 0.9952 0.0 9asb:Q, 9asb:R, 9avg:R, 9avl:Q, 9avl:R, 9axf:R, 9ayf:R, 7dd5:A, 7dd5:B, 7e6t:B, 7e6t:A, 5fbh:B, 5fbh:A, 5fbk:A, 5fbk:B, 5k5s:A, 5k5s:B, 7m3e:A, 7m3e:B, 7m3f:A, 7m3f:B, 7m3g:A, 7m3g:B, 8szg:A, 8szh:B, 8szi:A, 8wpg:B, 8wpg:A, 8wpu:B, 8wpu:A
2 8szi:B 802 821 0.9697 0.9963 0.9732 0.0 9avg:Q, 9axf:Q, 9ayf:Q, 7dd6:A, 7dd6:B, 7dd7:A, 7dd7:B, 7m3j:A, 7m3j:B, 7sil:A, 7sil:B, 7sim:A, 7sim:B, 7sin:A, 7sin:B, 8szf:A, 8szf:B, 8szg:B
3 7dtv:A 779 811 0.9333 0.9872 0.9482 0.0 7dtu:A, 7dtu:B, 7dtv:B
4 5k5t:A 578 578 0.6566 0.9360 0.9360 0.0
5 8jd6:R 774 819 0.3240 0.3450 0.3260 8.30e-136 7e9h:R, 7e9h:S, 8jd4:4, 8jd5:4, 8jd6:S
6 8jd5:2 785 821 0.3265 0.3427 0.3276 7.03e-135 5cni:A, 5cni:B, 5cnj:A, 5cnj:B, 7e9g:R, 7e9g:S, 8jcu:2, 8jcv:2, 8jcw:2, 8jcx:2, 8jcy:2, 8jcz:2, 8jd0:2, 8jd1:2, 8jd2:2, 8jd3:2, 5kzn:A, 5kzq:A, 7mtr:B, 7mtr:A, 7mts:A, 7mts:B, 4xaq:A, 4xaq:B, 4xas:A, 4xas:B
7 8jcu:3 765 819 0.3386 0.3647 0.3407 2.10e-129 6b7h:A, 5cnk:A, 5cnm:A, 8jcv:3, 8jcw:3, 8jcx:3, 8jcy:3, 8jcz:3, 8jd0:3, 8jd1:3, 8jd2:3, 8jd3:3, 3sm9:A, 8tr0:A, 7wih:A, 7wih:B, 4xar:A
8 7epb:A 779 823 0.3252 0.3440 0.3256 1.88e-128 7epb:B, 7mtq:A
9 8tao:B 771 812 0.3058 0.3268 0.3103 1.42e-121 7fd8:A, 7fd8:B, 7fd9:A, 7fd9:B, 3lmk:A, 3lmk:B, 8t8m:A
10 6n51:B 793 818 0.3095 0.3216 0.3117 3.08e-121 6n4x:B, 6n4y:C, 6n50:A, 6n50:B, 6n50:C, 6n51:A, 8t6j:B, 8t6j:A, 8t7h:A, 8t7h:B, 8t8m:B, 8tao:A
11 8tr2:A 745 814 0.3252 0.3597 0.3292 3.47e-118 2e4u:A, 2e4u:B, 2e4v:A, 2e4v:B, 2e4w:A, 2e4w:B, 2e4x:A, 2e4x:B, 2e4y:A, 2e4y:B, 8tqb:A, 8tqb:B, 8tr0:B, 8tr2:B, 8trc:A, 8trc:B, 8trd:A, 8trd:B, 7wi6:A, 7wi6:B, 7wi8:A, 7wi8:B
12 7dge:A 784 821 0.3046 0.3202 0.3057 3.04e-116 1ewk:A, 1ewk:B, 1isr:A, 1iss:A, 1iss:B, 3ks9:A, 3ks9:B
13 7mtq:B 744 813 0.3167 0.3508 0.3210 2.40e-115 8jd4:2
14 5c5c:A 432 454 0.1772 0.3380 0.3216 1.32e-66
15 6e5v:B 447 478 0.1845 0.3400 0.3180 1.80e-64 6bsz:A, 6bsz:B, 6bt5:A, 6bt5:B, 6e5v:A
16 5x2n:C 433 472 0.1772 0.3372 0.3093 1.07e-60 5x2m:A, 5x2m:C, 5x2n:A, 5x2o:A, 5x2o:C, 5x2p:A, 5x2p:C, 5x2q:A, 5x2q:C
17 5x2n:B 459 485 0.1772 0.3181 0.3010 6.51e-56 5x2m:B, 5x2n:D, 5x2o:B, 5x2o:D, 5x2p:B, 5x2q:B, 5x2q:D
18 3mq4:A 386 430 0.1711 0.3653 0.3279 8.13e-56
19 5x2m:D 422 475 0.1614 0.3152 0.2800 8.86e-40 5x2p:D
20 4or2:B 366 265 0.0971 0.2186 0.3019 2.61e-36 4or2:A
21 6ffh:A 414 144 0.0607 0.1208 0.3472 3.92e-17 5cgc:A, 5cgd:A, 6ffi:A, 4oo9:A, 7p2l:A
22 6ffh:A 414 99 0.0425 0.0845 0.3535 2.43e-13 5cgc:A, 5cgd:A, 6ffi:A, 4oo9:A, 7p2l:A
23 7epe:A 389 100 0.0473 0.1003 0.3900 2.97e-16 7epf:A
24 7epe:A 389 135 0.0583 0.1234 0.3556 9.95e-16 7epf:A
25 7lzh:A 798 172 0.0546 0.0564 0.2616 1.50e-10 7lzh:B, 7lzh:C, 7lzh:D, 7lzi:A, 7lzi:B, 7lzi:C, 7lzi:D
26 4tlm:C 750 178 0.0558 0.0613 0.2584 2.26e-09 4tll:C
27 4tlm:A 796 178 0.0558 0.0578 0.2584 2.60e-09 6e7r:A, 6e7r:C, 6e7s:A, 6e7s:C, 6e7t:A, 6e7t:C, 6e7u:A, 6e7u:C, 6e7v:A, 6e7v:C, 6e7w:A, 6e7w:C, 6e7x:A, 6e7x:C, 5ewj:A, 5ewj:C, 5ewl:A, 5ewl:C, 5ewm:A, 5ewm:C, 8g18:A, 8g18:C, 3qel:A, 3qem:A, 3qem:C, 4tll:A, 5tq2:A, 5un1:G, 5un1:A, 5un1:C
28 6uo8:B 696 139 0.0449 0.0532 0.2662 4.25e-09 7ca3:B, 7eb2:D
29 7cum:B 675 139 0.0449 0.0548 0.2662 4.29e-09 7c7q:B, 6w2x:B, 6wiv:B
30 7yfr:A 691 178 0.0522 0.0622 0.2416 1.04e-08 7yfr:C
31 7yfr:A 691 71 0.0279 0.0333 0.3239 1.5 7yfr:C
32 7eor:B 770 365 0.0934 0.1000 0.2110 2.03e-08 8e96:A, 8e96:C, 7eor:D, 4pe5:A, 4pe5:C, 8usw:A, 8usw:C
33 7yfg:C 659 365 0.0947 0.1184 0.2137 2.63e-08 2a5t:A, 5dex:A, 5h8f:B, 5h8h:B, 5h8n:B, 5h8q:B, 5i2k:B, 5i2n:B, 5i56:A, 5i57:A, 5i59:A, 5kcj:B, 5kdt:B, 4kfq:A, 4kfq:B, 4nf4:A, 4nf5:A, 4nf6:A, 4nf8:A, 6ovd:A, 6ove:A, 1pb7:A, 1pb8:A, 1pb9:A, 1pbq:A, 5tp9:B, 5tpa:B, 5u8c:A, 6usu:A, 6usv:A, 6uz6:A, 6uzg:A, 6uzr:A, 6uzw:A, 6uzx:A, 5vih:A, 5vii:A, 5vij:A, 1y1m:A, 1y1z:A, 1y20:A, 7yfg:A, 7yfh:A, 7yfh:C
34 7yfl:A 708 150 0.0449 0.0523 0.2467 4.76e-08 7yfl:C
35 9arh:A 802 181 0.0498 0.0511 0.2265 2.58e-07 9are:A, 9are:C, 9arf:A, 9arf:C, 9arh:C, 9bib:A, 9bib:C, 7eot:B, 7eot:D, 7eou:B, 7eou:D, 7eu7:A, 7eu7:C, 7saa:A, 7saa:C, 7sac:A, 7sac:C, 5uow:C, 6whu:A, 6whu:C, 6whv:C, 6why:A, 6why:C, 6wi0:A, 6wi0:C, 7yff:A, 7yff:C, 7yfi:A, 7yfi:C
36 9arh:A 802 72 0.0267 0.0274 0.3056 6.4 9are:A, 9are:C, 9arf:A, 9arf:C, 9arh:C, 9bib:A, 9bib:C, 7eot:B, 7eot:D, 7eou:B, 7eou:D, 7eu7:A, 7eu7:C, 7saa:A, 7saa:C, 7sac:A, 7sac:C, 5uow:C, 6whu:A, 6whu:C, 6whv:C, 6why:A, 6why:C, 6wi0:A, 6wi0:C, 7yff:A, 7yff:C, 7yfi:A, 7yfi:C
37 6uo8:A 689 213 0.0619 0.0740 0.2394 7.91e-06 7c7q:A, 7c7s:A, 7ca3:A, 7cum:A, 7eb2:C, 4mqf:A, 4mr7:A, 4mr8:A, 4mr9:A, 4mrm:A, 4ms1:A, 4ms3:A, 4ms4:A, 6uo9:A, 6w2x:A, 6w2y:A, 6w2y:B, 6wiv:A
38 9b36:A 842 251 0.0740 0.0724 0.2430 1.41e-05 9b35:A, 9b35:B, 9b35:C, 9b35:D, 9b36:C, 9b36:D, 9b36:B, 9b37:A, 9b37:D, 9b37:B, 9b37:C, 9b39:A, 9b39:B, 9b39:C, 9b39:D, 8fwq:A, 8fwq:D, 8fwq:B, 8fwq:C, 8fws:A, 8fws:D, 8fws:B, 8fws:C, 8fwu:A, 8fwu:B, 8fwu:C, 8fwu:D, 8fww:A, 8fww:D, 8fww:B, 8fww:C, 3h6g:A, 3h6g:B, 3h6h:A, 3h6h:B
39 4uqq:A 693 251 0.0716 0.0851 0.2351 1.42e-05 9b38:A, 9b38:B, 9b38:C, 9b38:D, 4uqq:B, 4uqq:C, 4uqq:D
40 5kuh:A 636 251 0.0740 0.0959 0.2430 1.76e-05 4bdl:A, 4bdl:B, 4bdm:A, 4bdm:B, 4bdm:C, 4bdm:D, 4bdn:A, 4bdn:B, 4bdn:C, 4bdn:D, 4bdo:A, 4bdo:B, 4bdo:C, 4bdo:D, 4bdq:A, 4bdq:B, 4bdr:A, 4bdr:B, 5cmk:A, 5cmk:B, 5cmm:A, 3g3f:A, 3g3f:B, 3g3g:A, 3g3g:B, 3g3h:A, 3g3h:B, 3g3i:A, 3g3i:B, 3g3j:A, 3g3j:B, 3g3k:A, 3g3k:B, 4h8i:A, 2i0b:A, 2i0b:B, 2i0b:C, 2i0c:A, 2i0c:B, 5kuh:B, 5kuh:C, 5kuh:D, 3qxm:A, 3qxm:B, 8r32:A, 8r32:B, 1s50:A, 1s7y:A, 1s7y:B, 1s9t:A, 1s9t:B, 1sd3:A, 1sd3:B, 1tt1:A, 1tt1:B, 2xxr:A, 2xxr:B, 2xxt:A, 2xxt:B, 2xxu:A, 2xxu:B, 2xxv:A, 2xxv:B, 2xxw:A, 2xxw:B, 2xxx:A, 2xxx:B, 2xxx:C, 2xxx:D, 2xxy:A, 2xxy:B, 2xxy:C, 2xxy:D, 1yae:A, 1yae:B, 1yae:C, 1yae:D, 1yae:E
41 8gc2:D 760 174 0.0485 0.0526 0.2299 2.80e-05 8f0o:B, 8gc2:A, 8gc2:B, 8gc2:C, 8gc3:B, 8gc3:C, 8gc3:D, 8gc3:A, 8gc4:A, 8gc4:B, 8gc4:C, 8gc4:D, 8gc5:A, 8gc5:B, 8gc5:C, 8gc5:D, 5kuf:A, 5kuf:B, 5kuf:C, 5kuf:D
42 7she:A 541 314 0.0850 0.1294 0.2229 0.004 7she:B, 7shf:B
43 9b4h:A 1908 37 0.0170 0.0073 0.3784 0.81 9b4h:B, 8wa2:A, 8wa2:D, 8wa2:F, 8wa2:B, 8wa2:C, 8wa2:E
44 9b4h:A 1908 38 0.0170 0.0073 0.3684 1.5 9b4h:B, 8wa2:A, 8wa2:D, 8wa2:F, 8wa2:B, 8wa2:C, 8wa2:E
45 9b4h:A 1908 37 0.0146 0.0063 0.3243 6.4 9b4h:B, 8wa2:A, 8wa2:D, 8wa2:F, 8wa2:B, 8wa2:C, 8wa2:E
46 6njl:A 785 212 0.0534 0.0561 0.2075 1.2 8aym:C, 8aym:A, 7ldd:A, 7ldd:C, 7lde:A, 7lde:C, 6njl:C, 6njn:A, 7oca:A, 7oca:C, 7oce:A, 7oce:C, 6qkz:C
47 4dqd:A 361 207 0.0510 0.1163 0.2029 1.3 3sg0:A
48 5hvn:A 354 75 0.0267 0.0621 0.2933 1.6
49 6jsj:A 625 42 0.0170 0.0224 0.3333 2.7 6jsj:B, 6jsj:C
50 7sgr:E 700 39 0.0194 0.0229 0.4103 3.0 3b5j:A, 8dck:A, 8dck:B, 8dck:I, 8dck:J, 8dck:E, 8dck:F, 2ff7:A, 2ffa:A, 2ffb:A, 2fgj:A, 2fgj:B, 2fgj:C, 2fgj:D, 2fgk:A, 2fgk:B, 2fgk:C, 2fgk:D, 2pmk:A, 7sgr:J, 7sgr:A, 7sgr:F, 1xef:A, 1xef:B, 1xef:C, 1xef:D
51 6so5:A 313 169 0.0425 0.1118 0.2071 3.1 7ru9:A, 7ru9:B, 7rua:A, 7rua:B, 7ruc:A, 7ruc:B
52 2r2d:A 276 97 0.0279 0.0833 0.2371 3.2 2r2d:B, 2r2d:C, 2r2d:D, 2r2d:E, 2r2d:F
53 7n4y:B 2455 73 0.0267 0.0090 0.3014 3.7 7n4y:A
54 7shf:A 296 230 0.0631 0.1757 0.2261 3.9
55 7pkq:b 241 51 0.0158 0.0539 0.2549 4.0
56 8xfc:D 517 23 0.0170 0.0271 0.6087 4.1 8wdb:D
57 5uow:B 795 67 0.0206 0.0214 0.2537 4.7
58 3l43:B 246 47 0.0182 0.0610 0.3191 5.2 3l43:A, 3l43:C, 3l43:D
59 8dzg:A 420 39 0.0194 0.0381 0.4103 6.5 8dze:A, 8dze:B, 8dze:C, 8dze:D, 8dze:E, 8dze:F, 8dzf:A, 8dzf:B, 8dzf:C, 8dzf:D, 8dzf:E, 8dzf:F, 8dzg:B, 8dzg:C, 8dzg:D, 8dzg:E, 8dzg:F
60 6raf:A 588 26 0.0170 0.0238 0.5385 7.5 6rag:A, 6rah:A, 6rai:A, 6raj:A, 6rak:A, 6ral:A, 6ram:A
61 6yxx:EA 532 51 0.0231 0.0357 0.3725 8.6 7aoi:XL, 6yxy:EA

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218