BioLiP

>protein
GPALYEDPPDQKTSPSGKPATLKICSWNVDGLRAWIKKKGLDWVKEEAPDILCLQETKCSENKLPAELQELPGLSHQYWS
APSEGYSGVGLLSRQCPLKVSYGIGDEEHDQEGRVIVAEFDSFVLVTAYVPNAGRGLVRLEYRQRWDEAFRKFLKGLASR
KPLVLCGDLNVAHEEIDLRNPKGNKKNAGFTPQERQGFGELLQAVPLADSFRHLYPNTPYAYTFWTYMMNARSKNVGWRL
DYFLLSHSLLPALCDSKIRSKALGSDHCPITLYLAL

The query sequence (length=276) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6mkk:A	282	278	0.9964	0.9752	0.9892	0.0	6boq:A, 6bor:A, 6bos:A, 6bot:A, 6bou:A, 6bov:A, 6bow:A, 7cd5:A, 7cd6:A, 5cfg:A, 1de8:B, 1de8:A, 1de9:A, 1de9:B, 1dew:B, 1dew:A, 5dff:A, 5dfh:A, 5dfi:A, 5dfj:A, 5dg0:A, 4iem:A, 4iem:B, 4iem:C, 4iem:D, 2isi:A, 2isi:B, 2isi:C, 4lnd:A, 4lnd:B, 4lnd:C, 7lpg:D, 7lph:D, 7lpi:D, 7lpj:D, 7mcr:A, 7mev:A, 6p93:A, 6p94:A, 4qh9:A, 4qhe:A, 7suv:B, 7svb:B, 7tc2:A, 7tc2:B, 7tc2:C, 7tc2:D, 7tr7:A, 7u50:K, 3u8u:A, 3u8u:B, 3u8u:C, 3u8u:D, 3u8u:E, 3u8u:F, 6w0q:A, 6w2p:A, 6w3l:B, 6w3n:B, 6w3q:B, 6w3u:B, 6w43:A, 6w4i:A, 6w4i:B, 6w4t:A, 6w4t:B, 5wn0:A, 5wn1:A, 5wn2:A, 5wn3:B, 5wn4:B, 5wn5:B, 5wn5:A
2	5cfe:A	252	257	0.4674	0.5119	0.5019	6.33e-93
3	8igi:A	251	255	0.4638	0.5100	0.5020	5.72e-89	8igi:B
4	8ka5:A	297	263	0.4565	0.4242	0.4791	1.43e-75	8ka3:A, 8ka4:B, 8ka4:C
5	5j8n:A	258	254	0.4022	0.4302	0.4370	5.94e-68
6	3fzi:A	258	258	0.3877	0.4147	0.4147	1.55e-64	3g00:A, 3g00:B, 3g0a:A, 3g0r:A, 3g0r:B, 3g1k:A, 3g1k:B, 3g2c:A, 3g2c:B, 3g2d:A, 3g2d:B, 3g38:A, 3g3c:A, 3g3c:B, 3g3y:B, 3g3y:A, 3g4t:A, 3g4t:B, 3ga6:A, 3ga6:B, 3w2x:A, 3w2y:A, 3w2y:D
7	4b5g:A	259	252	0.3225	0.3436	0.3532	1.14e-55	4b5f:A, 4b5g:B, 4b5g:C, 4b5h:A, 4b5i:A, 4b5j:A, 4b5m:A, 4b5m:B, 4b5m:C, 2jc5:A
8	6fk4:A	257	258	0.2935	0.3152	0.3140	5.02e-31	6fk5:A, 6fke:A, 2jc4:A
9	2voa:A	257	257	0.2935	0.3152	0.3152	1.32e-30	2voa:B
10	8bvh:H	262	253	0.2609	0.2748	0.2846	4.60e-29	8bvh:I, 8bvh:B, 8bvh:G, 8bvj:Q, 8bvj:G, 8bvj:C, 8bvj:A, 8bvm:A, 8bvm:H, 8bvm:N, 6o1k:A, 6o1k:B, 6o1l:A, 6o1l:B, 6o1l:R, 6o1m:A, 6o1m:B, 6o1m:S, 6o1m:R
11	6wcd:A	314	294	0.2899	0.2548	0.2721	1.95e-20
12	7n3z:A	379	352	0.3188	0.2322	0.2500	1.19e-09	7n3y:B, 7n3y:C, 7n3y:A, 7n3y:D
13	8uw3:A	1265	262	0.2210	0.0482	0.2328	6.23e-06	7n8s:A, 7n94:A, 7n94:B, 8sp5:A, 8sp5:B, 8sp7:A, 8sxt:A, 8sxu:A, 1vyb:B
14	6ca4:C	229	86	0.0942	0.1135	0.3023	0.21
15	4fpv:B	257	84	0.0942	0.1012	0.3095	0.27	6ca4:A, 6ca4:B, 4f1h:A, 4f1h:B, 4fpv:A
16	8e59:A	1230	69	0.0761	0.0171	0.3043	0.35	8e5a:A, 8e5b:A, 7uhf:A, 7uhg:A
17	4ruw:A	386	187	0.1667	0.1192	0.2460	0.38
18	1epv:A	382	139	0.1377	0.0995	0.2734	2.1	1bd0:A, 1bd0:B, 1epv:B, 1ftx:A, 1ftx:B, 1l6f:A, 1l6f:B, 1l6g:A, 1l6g:B, 1niu:A, 1niu:B, 1sft:A, 1sft:B, 2sfp:A, 2sfp:B, 1xqk:A, 1xqk:B, 1xql:A, 1xql:B
19	4fva:C	251	81	0.0942	0.1036	0.3210	2.2	4fva:A, 4fva:B, 4fva:D
20	6zll:A	321	26	0.0435	0.0374	0.4615	2.4	6zl6:A, 6zl6:B, 6zla:A, 6zla:B, 6zla:C, 6zla:D, 6zld:A, 6zld:B, 6zlj:A, 6zlj:B, 6zlk:A, 6zlk:B, 6zlk:C, 6zlk:D, 6zll:B, 6zll:C, 6zll:D
21	8hsa:A	248	57	0.0725	0.0806	0.3509	4.1	8hs4:A, 8hs4:B, 8hs5:A, 8hs5:B, 8hsa:G, 8hsa:B, 8hsa:C, 8hsa:D, 8hsa:E, 8hsa:F, 8hsa:H
22	8cip:A	665	30	0.0507	0.0211	0.4667	4.7	8cip:B, 8cip:C, 8cip:D
23	6voy:A	276	65	0.0616	0.0616	0.2615	5.2	6voy:C, 6voy:B, 6voy:D
24	8r3q:D	676	36	0.0471	0.0192	0.3611	6.0	8r3q:B, 8r3q:A, 8r3q:C

[Back]