BioLiP

>protein
GNMEASEVMKEKGNAAYKGKQWNKAVNFYTEAIKLNGANATYYCNRAAAFLELCCFQQAEQDCTKAMLIDKKNVKAYLRR
GTARESLVRYKEAAADFRHALVLEPQNKTAKVAEKRL

The query sequence (length=117) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6hpg:A	121	117	1.0000	0.9669	1.0000	1.62e-83	6hpg:B, 6hpg:C, 6hpg:D, 6hpg:E, 6hpg:F, 6q3q:A, 6q3q:B
2	6fdp:A	120	101	0.3846	0.3750	0.4455	1.36e-24	4cgw:B, 6fdt:A
3	4cgw:A	115	96	0.3590	0.3652	0.4375	6.03e-23
4	1wao:1	471	112	0.3419	0.0849	0.3571	5.10e-20	2bug:A, 8gae:E, 8gft:E, 3h60:A, 3h60:B, 3h61:A, 3h61:D, 3h62:C, 3h62:B, 3h63:A, 3h63:C, 3h64:A, 3h64:D, 3h66:A, 3h66:B, 3h67:A, 3h67:D, 3h68:A, 3h68:D, 3h69:A, 3h69:D, 5hpe:A, 4ja7:A, 4ja9:A, 1s95:A, 1s95:B, 5ui1:A, 5ui1:B, 5ui1:C, 5ui1:D, 1wao:2, 1wao:3, 1wao:4, 5wg8:A, 4zvz:A, 4zvz:B, 4zvz:C, 4zvz:D, 4zx2:A
5	7obe:A	480	109	0.3419	0.0833	0.3670	2.49e-19	7obe:B
6	4cgv:C	126	100	0.3333	0.3095	0.3900	1.15e-18	4cgv:D, 4cgv:A, 4cgv:B
7	4i2w:A	904	120	0.3846	0.0498	0.3750	3.70e-15	4i2z:A
8	5lyn:B	133	104	0.3419	0.3008	0.3846	8.24e-15	5lyn:A
9	3kd7:A	102	101	0.2991	0.3431	0.3465	1.99e-14	3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
10	3kd7:A	102	66	0.1624	0.1863	0.2879	0.056	3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
11	2c2l:A	281	99	0.2821	0.1174	0.3333	1.82e-11	2c2l:B, 2c2l:C, 2c2l:D, 6efk:B, 6efk:A, 8ehz:A, 8ehz:B, 8ei0:A, 8f14:A, 8f15:A, 8f15:B, 8f15:C, 8f16:A, 8f16:B, 8f17:A, 8f17:B, 8fyu:B, 8fyu:A, 8gck:B, 8gck:A, 6nsv:A, 6nsv:B, 3q47:B, 3q49:B, 3q4a:B, 8suv:A, 8suv:B, 8suv:C, 8suv:D, 7tb1:B, 7tb1:A
12	3uq3:A	258	92	0.2991	0.1357	0.3804	2.37e-11	3upv:A
13	3uq3:A	258	117	0.2821	0.1279	0.2821	0.029	3upv:A
14	6hft:A	312	112	0.3419	0.1282	0.3571	2.62e-11
15	1elw:A	117	103	0.3077	0.3077	0.3495	5.05e-11	1elw:B
16	4j8f:A	551	133	0.3504	0.0744	0.3083	1.05e-10	5aqw:A, 5aqx:A, 5aqy:A, 5aqz:A, 5ar0:A, 3atu:A, 3atv:A, 3ay9:A, 5bn8:A, 5bn9:A, 5bpl:A, 5bpm:A, 3d2f:B, 3d2f:D, 2e88:A, 2e8a:A, 7f4x:A, 7f4z:A, 7f50:A, 7fgm:A, 6fhk:A, 6fhk:B, 6g3r:A, 6g3s:A, 3gdq:A, 1hjo:A, 4io8:A, 3jxu:A, 7kw7:D, 5mkr:A, 5mks:A, 7q4r:A, 1s3x:A, 1xqs:C, 1xqs:D, 6zyi:A
17	1na0:B	119	107	0.2735	0.2689	0.2991	6.45e-10	1na3:A, 1na3:B
18	5njx:A	413	125	0.3077	0.0872	0.2880	2.78e-09	7a6w:AAA, 7a6w:BBB, 7a6x:AAA, 7aot:A, 7aou:A, 7apq:A, 7aps:A, 7aps:B, 7apt:A, 7apw:A, 7awf:A, 7awx:A, 7awx:B, 7b9y:A, 7b9z:A, 7ba0:A, 8ba6:A, 8baj:A, 5bxj:A, 8cca:A, 8ccb:A, 8ccc:A, 8ccd:A, 8cce:A, 8ccf:A, 8ccg:A, 8cch:A, 8chn:A, 8chp:A, 8chq:A, 8chr:A, 5dit:A, 5diu:A, 5div:A, 4drh:A, 4drh:D, 4dri:A, 4drk:A, 4drk:B, 4drm:A, 4drn:A, 4dro:A, 4drp:A, 4drq:A, 7ett:A, 7etu:A, 7etv:A, 9eu6:A, 9eu7:A, 9eu7:B, 9eu8:A, 9eu8:B, 9eu9:A, 9eu9:B, 9eua:A, 9eua:B, 9eub:A, 9eub:B, 9euc:A, 9euc:B, 9eud:A, 9eud:B, 9eue:A, 9eue:B, 9ey3:A, 9ey4:A, 4jfi:A, 4jfj:A, 4jfk:A, 4jfl:A, 4jfm:A, 3o5f:A, 3o5r:A, 5obk:A, 8pc2:G, 8pc2:H, 8pj8:A, 8pja:A, 7r0l:A, 8r5k:A, 6saf:A, 4tw6:A, 4tw7:A, 4tx0:A, 6tx4:A, 6tx5:A, 6tx6:A, 6tx7:A, 6tx9:A, 6txx:A, 4w9o:A, 4w9o:E, 4w9p:A, 4w9p:E, 4w9q:A
19	1qz2:A	285	125	0.3504	0.1439	0.3280	2.81e-09	1qz2:B
20	3fp2:A	483	97	0.2650	0.0642	0.3196	5.14e-09	3fp4:A, 3lca:A
21	3fp2:A	483	43	0.1282	0.0311	0.3488	8.1	3fp4:A, 3lca:A
22	1elr:A	128	113	0.2991	0.2734	0.3097	3.32e-08	3esk:A, 3fwv:A, 3fwv:B
23	8chy:A	272	106	0.2393	0.1029	0.2642	1.20e-06	8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
24	8chy:A	272	106	0.2393	0.1029	0.2642	1.20e-06	8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
25	8chy:A	272	106	0.2393	0.1029	0.2642	1.20e-06	8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
26	8chy:A	272	106	0.2393	0.1029	0.2642	1.20e-06	8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
27	8chy:A	272	98	0.2308	0.0993	0.2755	1.58e-06	8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
28	8chy:A	272	103	0.2308	0.0993	0.2621	1.98e-06	8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
29	5mgx:G	266	117	0.3077	0.1353	0.3077	2.80e-05	5mgx:F, 5mgx:E, 5mgx:H
30	4cgu:A	112	65	0.1795	0.1875	0.3231	7.77e-05	4cgq:A, 2l6j:A, 2lsv:A
31	5l0y:C	150	114	0.2393	0.1867	0.2456	3.65e-04	5l0y:F, 5l0y:G, 5l0y:D, 5l0y:B
32	4apo:B	154	33	0.1368	0.1039	0.4848	0.020	4aif:A, 4aif:B, 4apo:A
33	5lwv:A	711	82	0.2051	0.0338	0.2927	0.028	5bnw:A, 6e37:A, 8fe6:A, 8fe6:C, 8fe6:E, 8fe6:G, 4gyw:A, 4gyy:A, 4gyy:C, 4gz3:A, 5hgv:A, 5nps:A, 6tka:AAA, 5vie:A, 5vie:C, 5vif:A
34	8q1b:A	443	57	0.1709	0.0451	0.3509	0.097	8q1b:L
35	7yeh:A	1020	82	0.2051	0.0235	0.2927	0.098	4ay5:A, 4ay5:B, 4ay5:C, 4ay5:D, 4ay6:A, 4ay6:B, 4ay6:C, 4ay6:D, 5c1d:A, 4cdr:A, 4cdr:B, 4cdr:C, 4cdr:D, 8cm9:A, 8cm9:B, 8cm9:D, 8cm9:C, 8fe7:A, 8fe7:C, 8fe7:E, 8fe7:G, 8fuf:A, 8fuf:C, 8fuf:E, 8fuf:G, 4gyw:C, 4gz3:C, 4gz5:A, 4gz5:B, 4gz5:C, 4gz5:D, 4gz6:A, 4gz6:B, 4gz6:C, 4gz6:D, 5hgv:C, 6ibo:A, 5lvv:A, 6ma1:A, 6ma2:A, 6ma3:A, 6ma4:A, 6ma5:A, 4n39:A, 4n3a:A, 4n3b:A, 4n3c:A, 5npr:A, 3pe3:A, 3pe3:B, 3pe3:C, 3pe3:D, 3pe4:A, 3pe4:C, 6q4m:A, 3tax:A, 3tax:C, 1w3b:A, 4xi9:A, 4xi9:B, 4xi9:C, 4xi9:D, 4xif:A, 4xif:B, 4xif:C, 4xif:D
36	5a01:A	681	82	0.1966	0.0338	0.2805	0.46	5a01:B, 5a01:C
37	6jhf:A	653	19	0.0855	0.0153	0.5263	0.66	6jeq:A, 6jfj:A, 6jfx:A, 6jhg:A, 6jhh:A, 6jhi:A
38	2ycd:A	213	43	0.1282	0.0704	0.3488	3.3
39	4eqf:A	281	104	0.1709	0.0712	0.1923	4.6
40	1po0:A	661	33	0.1111	0.0197	0.3939	4.7	1po3:A, 1po3:B
41	1hr6:D	443	49	0.1111	0.0293	0.2653	5.1	1hr6:B, 1hr6:F, 1hr6:H, 1hr7:B, 1hr7:D, 1hr7:F, 1hr7:H, 1hr8:B, 1hr8:D, 1hr8:F, 1hr8:H, 1hr9:B, 1hr9:D, 1hr9:F, 1hr9:H
42	8qoy:A	1036	52	0.1368	0.0154	0.3077	8.0
43	6t7y:A	238	41	0.1026	0.0504	0.2927	9.6

[Back]