BioLiP

>protein
GNKLFNIAQRILDTNSVLLTERGDHIVWINNSWKFNSEEPLITKLILSIRHQLPKEYSSELLCPRKRKTVEANIRDMLVD
SVETDTYPDKLPFKNGVLDLVDGMFYSGDDAKKYTCTVSTGFKFDDTKFVEDSPEMEELMNIINDIQPLTDENKKNRELY
EKTLSSCLCGATKGCLTFFFGETATGKSTTKRLLKSAIGDLFVETGQTILPFIANMHLKRSVFCRSDNIKKLTEPCVNRN
HATIIIDNALMRRIAVVRFRTHFSYDKVKLLDEGLDGKIQNNRYRFAFLYLLVKWYKKYHIPIMKLYP

The query sequence (length=308) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8hwe:A	329	328	0.9903	0.9271	0.9299	0.0	8hwd:A, 8hwe:F, 8xj7:F
2	8xj6:D	589	351	0.9968	0.5212	0.8746	0.0	8hwd:C, 8xif:A, 8xig:A, 8xj6:A, 8xj7:E
3	8wh6:E	751	366	1.0000	0.4101	0.8415	0.0	8apm:A, 8apm:F, 8apm:E, 8hwa:A, 8hwa:C, 8hwa:D, 8hwa:E, 8hwa:F, 8hwa:B, 8hwb:A, 8hwb:C, 8hwb:D, 8hwb:E, 8hwb:B, 8hwd:B, 8hwe:D, 8hwe:E, 8hwe:C, 8hwe:B, 8hwf:C, 8hwf:B, 8hwf:E, 8hwf:D, 8hwf:A, 8hwf:F, 8hwg:C, 8hwg:B, 8hwg:D, 8hwg:A, 8hwg:E, 8hwg:F, 8hwh:C, 8wh4:B, 8wh4:C, 8wh4:F, 8wh6:C, 8wh6:A, 8wh6:B, 8wh6:D, 8xj6:B, 8xj6:C, 8xj6:E, 8xj6:F, 8xj7:B, 8xj7:C, 8xj7:D, 8xj7:A, 8xj8:A, 8xj8:B, 8xj8:C
4	8hwh:A	353	353	0.9610	0.8385	0.8385	0.0	8xj8:D
5	8hwd:D	299	321	0.9221	0.9498	0.8847	0.0	8hwd:F, 8hwd:E
6	4n4w:A	457	67	0.0617	0.0416	0.2836	1.4	4jkv:A, 4jkv:B
7	5v57:A	645	67	0.0617	0.0295	0.2836	1.7	1akq:A, 1akr:A, 1akt:A, 1aku:A, 1akv:A, 1akw:A, 1azl:A, 1bu5:A, 1bu5:B, 1c7e:A, 1c7e:B, 1c7f:A, 1c7f:B, 1f4p:A, 1fx1:A, 2fx2:A, 3fx2:A, 4fx2:A, 5fx2:A, 1i1o:A, 1j8q:A, 1j9e:A, 1j9g:A, 5v56:A, 5v56:B, 5v57:B, 1wsb:A, 1wsw:A, 1xt6:A, 1xyv:A, 1xyy:A, 5yob:A, 5yoc:A, 5yoe:A, 5yog:A
8	6lpi:B	539	155	0.1039	0.0594	0.2065	2.0	6lpi:A, 6lpi:C, 6lpi:D
9	7ola:B	446	123	0.1039	0.0717	0.2602	2.0	7ola:A, 7ola:C, 7ola:D, 7om0:A, 7om0:B, 7om0:C, 7om0:F, 7om0:D, 7om0:E
10	7zi0:A	593	67	0.0617	0.0320	0.2836	4.4	256b:A, 256b:B, 5l7d:A, 5l7i:A, 5l7i:B, 4o9r:A, 4qim:A, 4qin:A, 1qpu:A, 7zi0:B
11	3bdz:A	397	51	0.0487	0.0378	0.2941	4.8	3bdz:B, 3be0:A, 3be0:B, 4fb2:A, 4fb2:B, 4fb2:C, 4fb2:D, 4fmx:A, 4fmx:B, 4fyz:A, 4fyz:B, 4l6g:A, 4l6g:B, 4l77:A, 4l77:B, 4lht:A, 4lht:B, 1t2b:A, 1t2b:B
12	5gvi:A	326	120	0.0812	0.0767	0.2083	7.5
13	1pz7:A	188	45	0.0519	0.0851	0.3556	8.7	1pz7:B, 1pz8:A, 1pz8:B, 1pz8:C, 1pz8:D
14	3taz:B	433	122	0.1006	0.0716	0.2541	8.8	3tal:A, 3tal:B, 3taz:A

[Back]