Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
GNHKAALTKQVFTFASELYAYGVREVVISPGSRSTPLALAFEAHPNIKTWIHPDERSAAFFAVGLIKGSERPVAILCTSG
TAAANYTPAIAESQISRIPLIVLTSDRPHELRSVGAPQAINQVNMFNNYVSYEFDMPIADDSKETINAIYYQMQIASQYL
YGPHKGPIHFNLPFRDPLTPDLNATELLTSEMKILPHYQKSIDASALRHILNKKKGLIIVGDMQHQEVDQILTYSTIYDL
PILADPLSHLRKFDHPNVICTYDLLFRSGLDLNVDFVIRVGKPVISKKLNQWLKKTDAFQILVQNNDKIDVFPIAPDISY
EISANDFFRSLMEDTTINRVSWLEKWQCLEKKGRKEIKCYLEQATDESAFVGELIKKTSEKDALFISNSMPIRDVDNLLL
NKNIDVYANRGANGIDGIVSTALGMAVHKRITLLIGDLSFYHDMNGLLMSKLNNIQMNIVLLNNDGGGIFSYLPQKESAT
DYFERLFGTPTGLDFEYTAKLYQFDFKRFNSVSEFKNATLLSETSTIYELITNREDNFKQHQILYQKLSEMIHDT

The query sequence (length=555) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 7tin:B 556 555 1.0000 0.9982 1.0000 0.0 7tin:A, 7tin:C, 7tin:D
2 2x7j:A 579 573 0.4072 0.3903 0.3944 6.45e-124 2x7j:B, 2x7j:C, 2x7j:D
3 5ej4:A 556 572 0.3045 0.3040 0.2955 1.03e-62 5ej4:B, 5ej4:C, 5ej4:D, 5ej4:E, 5ej4:F, 5ej4:G, 5ej4:H, 5ej5:A, 5ej5:B, 5ej5:C, 5ej5:D, 5ej5:E, 5ej5:F, 5ej5:G, 5ej5:H, 5ej6:A, 5ej6:B, 5ej6:C, 5ej6:D, 5ej6:E, 5ej6:F, 5ej6:G, 5ej6:H, 5ej7:A, 5ej7:B, 5ej7:C, 5ej7:D, 5ej7:E, 5ej7:F, 5ej7:G, 5ej7:H, 5ej8:A, 5ej8:B, 5ej8:C, 5ej8:D, 5ej8:E, 5ej8:F, 5ej8:G, 5ej8:H, 5ej9:A, 5ej9:B, 5ej9:C, 5ej9:D, 5ej9:E, 5ej9:F, 5ej9:G, 5ej9:H, 5eja:A, 5eja:B, 5eja:C, 5eja:D, 5eja:E, 5eja:F, 5eja:G, 5eja:H, 5ejm:A, 5ejm:B, 5ejm:C, 5ejm:D, 5ejm:E, 5ejm:F, 5ejm:G, 5ejm:H, 3hww:A, 3hwx:A, 3hwx:B, 3hwx:I, 3hwx:J, 3hwx:R, 3hwx:S, 3hwx:Z, 3hwx:1, 2jla:A, 2jla:B, 2jla:C, 2jla:D, 2jlc:A, 2jlc:B, 5z2p:A, 5z2p:B, 5z2p:C, 5z2p:D, 5z2p:E, 5z2p:G, 5z2p:F, 5z2p:H, 5z2r:A, 5z2r:B, 5z2r:C, 5z2r:D, 5z2r:E, 5z2r:F, 5z2r:G, 5z2r:H, 5z2u:A, 5z2u:H, 5z2u:B, 5z2u:G, 5z2u:C, 5z2u:D, 5z2u:E, 5z2u:F
4 5ess:A 551 537 0.2811 0.2831 0.2905 1.45e-54 5esd:A, 5esd:B, 5esd:C, 5esd:D, 5eso:D, 5eso:B, 5eso:C, 5ess:B, 5ess:C, 5ess:D, 5esu:A, 5esu:B, 5esu:C, 5esu:D, 6o04:A, 6o04:D, 6o04:B, 6o04:C, 6o0g:A, 6o0g:D, 6o0g:C, 6o0j:A, 6o0j:D, 6o0j:B, 6o0j:C, 6o0n:A, 6o0n:B
5 3hww:D 532 572 0.2847 0.2970 0.2762 9.64e-51
6 6o0g:B 530 491 0.2595 0.2717 0.2933 8.77e-47 5eso:A, 6o0n:C, 6o0n:D
7 6lpi:B 539 118 0.0577 0.0594 0.2712 2.30e-06 6lpi:A, 6lpi:C, 6lpi:D
8 4k9q:A 531 506 0.1802 0.1883 0.1976 1.05e-05 4k9q:B
9 5k2o:A 585 479 0.1640 0.1556 0.1900 6.78e-05 3e9y:A, 3ea4:A, 8et4:A, 8et5:A, 5k3s:A, 5k6q:A, 5k6r:A, 5k6t:A, 7stq:A, 7tzz:A, 7u1d:A, 7u1u:A, 7u25:A, 6u9h:A, 6u9h:B, 6u9h:H, 6u9h:I, 6u9h:L, 6u9h:M, 6u9h:P, 6u9h:Q, 6vz8:E, 6vz8:I, 6vz8:M, 6vz8:Q, 5wj1:A, 1ybh:A, 1yhy:A, 1yhz:A, 1yi0:A, 1yi1:A, 1z8n:A
10 6vz8:D 531 90 0.0432 0.0452 0.2667 8.37e-05 6vz8:H, 6vz8:L, 6vz8:P
11 1t9b:A 583 235 0.1027 0.0978 0.2426 0.002 1t9d:B, 1t9d:C
12 6u9d:B 607 245 0.1045 0.0956 0.2367 0.002 6bd3:A, 6bd3:B, 6bd9:A, 6bd9:B, 5fem:A, 5fem:B, 5ims:A, 5ims:B, 1jsc:A, 1jsc:B, 1n0h:A, 1n0h:B, 1t9a:A, 1t9a:B, 1t9b:B, 1t9c:A, 1t9c:B, 1t9d:A, 1t9d:D, 6u9d:A, 6u9d:E, 6u9d:F, 6u9d:I, 6u9d:J, 6u9d:M, 6u9d:N, 6u9d:Q, 6u9d:U, 6u9d:V, 5wkc:A, 5wkc:D, 5wkc:B, 5wkc:E
13 6u9d:R 416 119 0.0523 0.0697 0.2437 0.011
14 6deq:A 601 54 0.0306 0.0283 0.3148 0.016 6dek:A, 6del:A, 6dem:A, 6den:A, 6deo:A, 6dep:A, 6der:A, 6des:A
15 6wo1:A 551 206 0.0865 0.0871 0.2330 0.021
16 4rji:C 555 146 0.0631 0.0631 0.2397 0.057 4rji:A, 4rji:B, 4rji:D, 4rjj:A, 4rjj:B, 4rjj:C, 4rjj:D, 4rjj:E, 4rjj:F, 4rjj:G, 4rjj:H, 4rjk:A, 4rjk:B, 4rjk:C, 4rjk:D, 4rjk:E, 4rjk:F, 4rjk:G, 4rjk:H
17 7pt4:B 584 171 0.0739 0.0702 0.2398 0.11 7pt1:A, 7pt1:B, 7pt2:A, 7pt2:B, 7pt3:A, 7pt3:B, 7pt4:A
18 3jce:x 586 106 0.0486 0.0461 0.2547 0.41 3deg:C
19 7egv:A 590 98 0.0468 0.0441 0.2653 0.53 7egv:B, 7ehe:A, 7ehe:B
20 5ceo:A 269 95 0.0468 0.0967 0.2737 0.78 5cep:A, 5ceq:A, 8deg:A, 8our:A, 8ous:A, 8out:A, 5vo1:A, 5vo2:A
21 8x2i:A 2303 73 0.0414 0.0100 0.3151 0.91
22 8x2i:A 2303 70 0.0414 0.0100 0.3286 4.0
23 8x2h:A 2363 73 0.0414 0.0097 0.3151 0.93 8jb5:A, 2vkd:A, 2vkd:B, 2vkd:C, 2vkh:A, 2vkh:B, 2vkh:C, 2vl8:A, 2vl8:B, 2vl8:C
24 8x2h:A 2363 70 0.0414 0.0097 0.3286 3.9 8jb5:A, 2vkd:A, 2vkd:B, 2vkd:C, 2vkh:A, 2vkh:B, 2vkh:C, 2vl8:A, 2vl8:B, 2vl8:C
25 6a50:A 527 522 0.1838 0.1935 0.1954 1.1 6a50:B, 1bfd:A, 5dei:A, 5dei:C, 5dei:D, 5dei:B, 5dgd:A, 5dgt:A, 3f6b:X, 3f6e:X, 2fn3:A, 3fsj:X, 2fwn:A, 3fzn:A, 3fzn:B, 3fzn:D, 3fzn:C, 4gg1:A, 4gm0:A, 4gm1:A, 4gm4:A, 4gp9:A, 4gpe:A, 4jd5:A, 4ju8:A, 4ju9:A, 4jua:A, 4jub:A, 4jub:D, 4jub:B, 4jub:C, 4juc:A, 4juc:C, 4juc:B, 4juc:D, 4jud:X, 4juf:A, 4juf:C, 4juf:B, 4juf:D, 4k9k:A, 4k9l:A, 4k9m:A, 4k9n:A, 4k9n:C, 4k9n:B, 4k9n:D, 4k9o:A, 4k9o:C, 4k9o:B, 4k9o:D, 4k9p:A, 4k9p:C, 4k9p:B, 4k9p:D, 6m2y:A, 6m2z:A, 1mcz:A, 1mcz:B, 1mcz:C, 1mcz:D, 1mcz:E, 1mcz:F, 1mcz:G, 1mcz:H, 1mcz:I, 1mcz:J, 1mcz:K, 1mcz:L, 1mcz:M, 1mcz:N, 1mcz:O, 1mcz:P, 4mpj:A, 4mpp:A, 4mpr:A, 4mq5:A, 4mzx:A, 1pi3:A, 1po7:A, 1q6z:A, 4qel:A, 2v3w:A, 2v3w:C, 2v3w:B, 2v3w:D, 1yno:A
26 5t2u:A 241 39 0.0324 0.0747 0.4615 1.2 5t2u:B, 5t2u:C, 5t2u:D
27 8sbz:A 245 42 0.0306 0.0694 0.4048 2.0 8sby:A, 8sby:B, 8sbz:B, 8sc0:C, 8sc0:D
28 6ojt:B 481 121 0.0432 0.0499 0.1983 2.6 6ojr:A, 6ojt:A, 6ojw:B, 6ojw:A
29 8e9h:D 407 65 0.0324 0.0442 0.2769 3.5 8e9g:D
30 8i01:A 594 90 0.0396 0.0370 0.2444 3.8 8beo:A, 8beo:B, 8beo:C, 8beo:E, 8beo:D, 8beo:F, 8i01:B, 8i01:C, 8i01:E, 8i01:D, 8i01:F, 8i05:A, 8i05:B, 8i05:C, 8i05:E, 8i05:D, 8i05:F, 8i07:A, 8i07:B, 8i07:C, 8i07:E, 8i07:D, 8i07:F, 8i08:A, 8i08:B, 8i08:C, 8i08:E, 8i08:D, 8i08:F, 2pan:A, 2pan:B, 2pan:C, 2pan:D, 2pan:E, 2pan:F
31 6v73:A 228 46 0.0270 0.0658 0.3261 4.2 6v3u:A, 6v3u:B, 6v72:A
32 3ujh:A 566 59 0.0342 0.0336 0.3220 4.4 3ujh:B
33 2cke:A 301 60 0.0324 0.0598 0.3000 4.6 2cke:B, 2cke:C, 2cke:D, 2yaa:A, 2yaa:B, 2yab:A, 2yab:B
34 6yxy:EB 663 27 0.0234 0.0196 0.4815 5.1 7aoi:XB, 6yxx:EB
35 8pe3:A 386 37 0.0234 0.0337 0.3514 5.3 8pe3:B
36 2dji:A 590 116 0.0450 0.0424 0.2155 5.7 1v5e:A, 1v5f:A, 1v5g:A
37 2q28:A 550 450 0.1622 0.1636 0.2000 7.6 2q27:A, 2q27:B, 2q28:B, 2q29:A, 2q29:B
38 6gt9:A 283 98 0.0450 0.0883 0.2551 7.7 6gt9:B, 6gt9:C, 6gt9:D, 6guq:A
39 8u9a:A 220 38 0.0306 0.0773 0.4474 7.9 8sbv:B, 8u9a:B
40 1z93:A 263 168 0.0685 0.1445 0.2262 9.9 1flj:A, 2hfw:A, 3uyn:A, 3uyq:A, 1z97:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218