Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GNDTSEVMLLDTGWEFSQSGTEKWMPATVPGTVHQDLISHELLPNPFYGMNEKKIQWVENEDWEYRTSFIVSEEQLNRDG
IQLIFEGLDTYADVYLNGSLLLKADNMFVGYTLPVKSVLRKGENHLYIYFHSPIRQTLPQYASNGFNYPADNDHHEKHLS
VFSRKAPYSYGWDWGIRMVTSGVWRPVTLRFYDIATISDYYVRQLSLTDENARLSNELIVNQIVPQKIPAEVRVNVSLNG
TTVTEVKQQVTLQPGINHITLPAEVTNPVRWMPNGWGTPTLYDFSAQIACGDRIVAEQSHRIGLRTIRVVNEKDKDGESF
YFEVNGIPMFAKGANYIPQDALLPNVTTERYQTLFRDMKEANMNMVRIWGGGTYENNLFYDLADENGILVWQDFMFACTP
YPSDPTFLKRVEAEAVYNIRRLRNHASLAMWCGNNEILEALKYWGFEKKFTPEVYQGLMHGYDKLFRELLPSTVKEFDSD
RFYVHSSPYLANWGRPESWGTGDSHNWGVWYGKKPFESLDTDLPRFMSEFGFQSFPEMKTIAAFAAPEDYQIESEVMNAH
QKSSIGNSLIRTYMERDYIIPESFEDFVYVGLVLQGQGMRHGLEAHRRNRPYCMGTLYWQLNDSWPVVSWSSIDYYGNWK
ALHYQAKRAFAPVLINPIQQNDSLSVYLISDRLDTMEQMTLEMKVVDFDGKTLGKKIQVHSLEVPANTSKCVYRAKLDGW
LTPEDCRRSFLKLILKDKSGHQVAESVHFFRKTKDLQLPPTSVSYQMKQTDGKCELTLFSSMLAKDIFIETPLQGARYSD
NFFDLLPGERKKVIITSPRIKKGEELPVNIKHIRETY

The query sequence (length=837) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2vl4:B 841 837 1.0000 0.9952 1.0000 0.0 7op6:A, 7op6:B, 7op7:A, 7op7:B, 2vjx:A, 2vjx:B, 2vl4:A, 2vmf:A, 2vmf:B, 2vo5:A, 2vo5:B, 2vot:A, 2vot:B, 2vqt:A, 2vqt:B, 2vqu:A, 2vqu:B, 2vr4:A, 2vr4:B, 2wbk:A, 2wbk:B
2 6bye:A 861 809 0.3763 0.3659 0.3894 0.0 6bye:B, 6byg:A, 6byg:B, 6byi:A, 6byi:B
3 5n6u:A 811 820 0.3692 0.3810 0.3768 1.51e-178 5n6u:B, 5n6u:C, 5n6u:D
4 6ddt:A 862 878 0.3130 0.3039 0.2984 2.36e-113 6ddu:A
5 4uoj:A 917 905 0.2784 0.2541 0.2575 9.45e-66 4cvu:A, 4uoj:B
6 2vzs:A 857 783 0.2055 0.2007 0.2197 4.09e-18 2vzs:B, 2vzt:A, 2vzt:B, 2vzu:A, 2vzu:B, 2vzv:A, 2vzv:B, 2x05:A, 2x05:B, 2x09:A, 2x09:B
7 6d50:B 840 244 0.0705 0.0702 0.2418 8.84e-08 6d50:A, 6nzg:A, 6nzg:B, 5uj6:A, 5uj6:B
8 7btk:C 1023 398 0.1159 0.0948 0.2437 1.19e-07 5a1a:A, 5a1a:B, 5a1a:C, 5a1a:D, 7brs:A, 7brs:B, 7brs:C, 7brs:D, 7btk:A, 7btk:B, 7btk:D, 6cvm:A, 6cvm:B, 6cvm:C, 6cvm:D, 3czj:A, 3czj:B, 3czj:C, 3czj:D, 1dp0:A, 1dp0:B, 1dp0:C, 1dp0:D, 4duv:A, 4duv:B, 4duv:C, 4duv:D, 4duw:A, 4duw:B, 4duw:C, 4duw:D, 4dux:A, 4dux:B, 4dux:C, 4dux:D, 3dym:A, 3dym:B, 3dym:C, 3dym:D, 3dyo:A, 3dyo:B, 3dyo:C, 3dyo:D, 3dyp:A, 3dyp:B, 3dyp:C, 3dyp:D, 3e1f:1, 3e1f:2, 3e1f:3, 3e1f:4, 1f4a:A, 1f4a:B, 1f4a:C, 1f4a:D, 1f4h:A, 1f4h:B, 1f4h:C, 1f4h:D, 1hn1:A, 1hn1:B, 1hn1:C, 1hn1:D, 3i3b:A, 3i3b:B, 3i3b:C, 3i3b:D, 3i3d:A, 3i3d:B, 3i3d:C, 3i3d:D, 3i3e:A, 3i3e:B, 3i3e:C, 3i3e:D, 3iap:A, 3iap:B, 3iap:C, 3iap:D, 3iaq:A, 3iaq:B, 3iaq:C, 3iaq:D, 3j7h:A, 3j7h:B, 3j7h:C, 3j7h:D, 1jyn:A, 1jyn:B, 1jyn:C, 1jyn:D, 1jyv:A, 1jyv:B, 1jyv:C, 1jyv:D, 1jyw:A, 1jyw:B, 1jyw:C, 1jyw:D, 1jyx:A, 1jyx:B, 1jyx:C, 1jyx:D, 1jz2:A, 1jz2:B, 1jz2:C, 1jz2:D, 1jz3:A, 1jz3:B, 1jz3:C, 1jz3:D, 1jz4:A, 1jz4:B, 1jz4:C, 1jz4:D, 1jz5:A, 1jz5:B, 1jz5:C, 1jz5:D, 1jz6:A, 1jz6:B, 1jz6:C, 1jz6:D, 1jz7:A, 1jz7:B, 1jz7:C, 1jz7:D, 1jz8:A, 1jz8:B, 1jz8:C, 1jz8:D, 6kuz:A, 6kuz:B, 6kuz:C, 6kuz:D, 3muy:1, 3muy:2, 3muy:3, 3muy:4, 3muz:1, 3muz:2, 3muz:3, 3muz:4, 3mv0:1, 3mv0:2, 3mv0:3, 3mv0:4, 3mv1:1, 3mv1:2, 3mv1:3, 3mv1:4, 1px3:A, 1px3:B, 1px3:C, 1px3:D, 1px4:A, 1px4:B, 1px4:C, 1px4:D, 3sep:A, 3sep:B, 3sep:C, 3sep:D, 3t08:A, 3t08:B, 3t08:C, 3t08:D, 3t09:A, 3t09:B, 3t09:C, 3t09:D, 3t0a:A, 3t0a:B, 3t0a:C, 3t0a:D, 3t0b:A, 3t0b:B, 3t0b:C, 3t0b:D, 3t0d:A, 3t0d:B, 3t0d:C, 3t0d:D, 3t2o:A, 3t2o:B, 3t2o:C, 3t2o:D, 3t2p:A, 3t2p:B, 3t2p:C, 3t2p:D, 3t2q:A, 3t2q:B, 3t2q:C, 3t2q:D, 6tsh:A, 6tsh:B, 6tsh:C, 6tsh:D, 6tsk:A, 6tsk:B, 6tsk:C, 6tsk:D, 4ttg:A, 4ttg:B, 4ttg:C, 4ttg:D, 6tte:A, 6tte:B, 6tte:C, 6tte:D, 4v40:A, 4v40:B, 4v40:C, 4v40:D, 4v40:E, 4v40:F, 4v40:G, 4v40:H, 4v40:I, 4v40:J, 4v40:K, 4v40:L, 4v40:M, 4v40:N, 4v40:O, 4v40:P, 4v41:A, 4v41:B, 4v41:C, 4v41:D, 4v41:E, 4v41:F, 4v41:G, 4v41:H, 4v41:I, 4v41:J, 4v41:K, 4v41:L, 4v41:M, 4v41:N, 4v41:O, 4v41:P, 4v44:A, 4v44:B, 4v44:C, 4v44:D, 4v44:E, 4v44:F, 4v44:G, 4v44:H, 4v44:I, 4v44:J, 4v44:K, 4v44:L, 4v44:M, 4v44:N, 4v44:O, 4v44:P, 4v45:A, 4v45:B, 4v45:C, 4v45:D, 4v45:E, 4v45:F, 4v45:G, 4v45:H, 4v45:I, 4v45:J, 4v45:K, 4v45:L, 4v45:M, 4v45:N, 4v45:O, 4v45:P, 3vd3:A, 3vd3:B, 3vd3:C, 3vd3:D, 3vd4:A, 3vd4:B, 3vd4:C, 3vd4:D, 3vd5:A, 3vd5:C, 3vd5:D, 3vd5:B, 3vd7:A, 3vd7:B, 3vd7:C, 3vd7:D, 3vd9:A, 3vd9:B, 3vd9:C, 3vd9:D, 3vda:A, 3vda:B, 3vda:C, 3vda:D, 3vdb:A, 3vdb:B, 3vdb:C, 3vdb:D, 3vdc:A, 3vdc:B, 3vdc:C, 3vdc:D, 8vt0:A, 8vt0:B, 8vt0:C, 8vt0:D, 6x1q:A, 6x1q:B, 6x1q:C, 6x1q:D
9 6ed2:A 591 452 0.1326 0.1878 0.2456 1.43e-07
10 6s6z:A 1083 276 0.0884 0.0683 0.2681 2.02e-07 6s6z:D, 6s6z:B, 6s6z:H, 6s6z:F, 6s6z:G, 6s6z:E, 6s6z:C, 6sd0:A, 6sd0:B, 6sd0:C, 6sd0:D
11 6mvg:A 637 476 0.1278 0.1680 0.2248 2.12e-07 6mvg:B, 6mvg:C
12 5z1b:A 627 468 0.1207 0.1611 0.2158 5.45e-07 6ld0:A, 6ld0:B, 6ld0:C, 6ld0:D, 6ldb:A, 6ldb:B, 6ldb:C, 6ldb:D, 6ldc:A, 6ldc:B, 6ldc:C, 6ldc:D, 6ldd:A, 6ldd:B, 6ldd:C, 6ldd:D, 5z1b:B, 5z1b:C, 5z1b:D
13 3bga:A 1003 450 0.1195 0.0997 0.2222 5.73e-07 3bga:B
14 5z1a:A 655 375 0.0908 0.1160 0.2027 8.33e-07
15 7vqm:A 584 378 0.1004 0.1438 0.2222 1.59e-06 7vqm:B, 7vqm:C, 7vqm:D
16 7kgy:A 593 389 0.1111 0.1568 0.2391 1.27e-05 7kgy:B, 7kgy:C, 7kgy:D
17 6ncz:C 589 216 0.0681 0.0968 0.2639 1.40e-05 6ncz:A, 6ncz:B, 6ncz:D, 6ncz:E, 6ncz:F
18 5t9g:C 811 285 0.0848 0.0875 0.2491 3.66e-05 5t9g:A, 5t9g:B, 5t9g:D
19 5t99:A 757 386 0.1051 0.1162 0.2280 7.04e-05 5t99:B
20 7kgz:B 634 375 0.1051 0.1388 0.2347 1.13e-04 7kgz:A
21 8dhl:B 853 526 0.1374 0.1348 0.2186 1.27e-04 8dhl:A
22 6d41:B 579 375 0.1016 0.1468 0.2267 1.28e-04 6d41:A, 6d6w:A, 6d6w:B, 6d6w:C, 6d6w:D, 6d7f:A, 6d7f:B, 6d7f:C, 6d7f:D, 6d7f:E, 6d7f:F
23 6se9:A 989 382 0.1099 0.0930 0.2408 1.73e-04 6sea:A, 6seb:A, 6sec:A, 6sed:A, 6zjq:A, 6zjr:A, 6zjs:A, 6zjt:A, 6zju:A, 6zjw:A, 6zjx:A
24 7xyr:A 546 448 0.1099 0.1685 0.2054 6.16e-04
25 8get:C 659 451 0.1111 0.1411 0.2062 0.001 8ges:A, 8ges:D, 8ges:C, 8ges:B, 8get:A, 8get:B, 8get:D, 6mvh:A, 6mvh:B, 6mvh:C
26 6w25:A 468 124 0.0335 0.0598 0.2258 0.001 8wky:A, 8wkz:A
27 6ncx:B 559 182 0.0526 0.0787 0.2418 0.001 6ncx:D, 6ncx:A, 6ncx:C
28 6hpd:A 955 399 0.1039 0.0911 0.2180 0.002
29 6mvf:A 643 265 0.0765 0.0995 0.2415 0.005 6mvf:B, 6mvf:C, 6mvf:D, 6mvf:E, 6mvf:F
30 1yq2:A 1020 391 0.1063 0.0873 0.2276 0.006 1yq2:B, 1yq2:C, 1yq2:D, 1yq2:E, 1yq2:F
31 6cxs:B 599 448 0.1123 0.1569 0.2098 0.023 6cxs:A
32 7cwd:A 803 285 0.0789 0.0822 0.2316 0.030
33 6jz4:A 576 379 0.1063 0.1545 0.2348 0.064 6jz5:A, 6jz5:B, 6jz7:A, 6jz7:B, 6jz8:B
34 8e72:B 598 389 0.1051 0.1472 0.2262 0.086 8dhw:A, 8dhw:B, 8e72:A
35 6d7j:A 799 174 0.0502 0.0526 0.2414 0.17 6d7j:D
36 4jkl:A 587 357 0.0944 0.1346 0.2213 0.25 4jkl:B
37 4cu7:A 848 410 0.1063 0.1050 0.2171 0.30 4cu8:A, 4cuc:A
38 7sf2:A 586 406 0.1039 0.1485 0.2143 0.87 7sf2:B, 7sf2:C, 7sf2:D, 7sf2:E, 7sf2:F
39 6joj:A 338 106 0.0358 0.0888 0.2830 1.1 5grn:A, 6jok:A, 6jol:A, 8pqh:A
40 8pqi:A 299 106 0.0358 0.1003 0.2830 1.1 6joi:A
41 3c0a:A 289 44 0.0191 0.0554 0.3636 1.6
42 1bo7:A 316 44 0.0191 0.0506 0.3636 1.8 3bnz:A, 1bo8:A, 1bp0:A, 1bp6:A, 1bpj:A, 3byx:A, 3bz0:A, 3c06:A, 2g86:A, 2g89:A, 2g8a:A, 2g8d:A, 3ijz:A, 3ik0:A, 3ik1:A, 1jmf:A, 1jmg:A, 1jmh:A, 1jmi:A, 1lca:A, 1lcb:A, 1lce:A, 1nja:A, 1njb:A, 1njc:A, 1njd:A, 1nje:A, 1tdb:A, 1tdc:A, 2tdd:A, 2tdm:A, 1thy:A, 1tsl:A, 1tsm:A, 1tsv:A, 1tsx:A, 1tsy:A, 1tsz:A, 1tvu:A, 1tvv:A, 1tvw:A, 1vza:A, 1vzb:A, 1vzc:A, 1vzd:A, 1vze:A
43 7bjt:A 727 45 0.0215 0.0248 0.4000 2.0 7bjt:B, 7bm6:A, 7bm6:B
44 4h0u:A 260 92 0.0251 0.0808 0.2283 3.8 4h0u:B, 4h0u:C, 4h0u:D
45 4fog:D 263 92 0.0239 0.0760 0.2174 5.2 4foa:A, 4foa:B, 4foa:C, 4foa:D, 4fog:A, 4fog:B, 4fog:C, 4fox:A, 4fox:B, 4fox:C, 4fox:D, 4fox:E, 4fox:F, 4fox:G, 4fox:H, 4fqs:A, 4fqs:B, 3qj7:A, 3qj7:C, 3qj7:B, 3qj7:D
46 6bjq:A 598 78 0.0263 0.0368 0.2821 5.6 6d4o:A, 8gen:A, 8geo:A, 8geq:A, 8ger:A, 8ugt:A
47 6bo6:A 493 127 0.0370 0.0629 0.2441 6.9
48 2cww:B 382 136 0.0418 0.0916 0.2574 7.7 2cww:A
49 6efi:B 208 54 0.0263 0.1058 0.4074 9.7 6efi:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218