BioLiP

>protein
GMPKWRKTHLTYRIVNYTPDLPRDAVDSAIEKALKVWEEVTPLTFSRLYEGEADIMISFAVKEHGDNYSFDGPGHSLAHA
YPPGPGLYGDIHFDDDEKWTEDASGTNLFLVAAHELGHSLGLFHSANTEALMYPLYNSFTELAQFRLSQDDVNGIQSLYG

The query sequence (length=160) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1q3a:B	160	160	1.0000	1.0000	1.0000	4.43e-119	4ilw:D, 4ilw:F, 1q3a:A, 1q3a:C, 3v96:B
2	1slm:A	226	160	0.8562	0.6062	0.8562	7.39e-103	1b3d:A, 1b3d:B, 1b8y:A, 1biw:A, 1biw:B, 1bm6:A, 1bqo:A, 1bqo:B, 1c3i:A, 1c3i:B, 1c8t:A, 1c8t:B, 1caq:A, 1ciz:A, 1cqr:A, 1cqr:B, 2d1o:A, 2d1o:B, 1d5j:A, 1d5j:B, 1d7x:A, 1d7x:B, 1d8f:A, 1d8f:B, 1d8m:A, 1d8m:B, 4dpe:A, 4dpe:B, 1g05:A, 1g05:B, 1g49:A, 1g49:B, 1g4k:A, 1g4k:B, 1g4k:C, 4g9l:A, 4g9l:B, 1hfs:A, 1hy7:A, 1hy7:B, 4ja1:A, 4ja1:B, 2jnp:A, 2jt5:A, 2jt6:A, 6mav:A, 6n9d:A, 3ohl:A, 3oho:A, 1qia:A, 1qia:B, 1qia:C, 1qia:D, 1qic:A, 1qic:B, 1qic:C, 1qic:D, 7s7l:A, 7s7m:A, 1sln:A, 2srt:A, 1uea:A, 1uea:C, 1ums:A, 1umt:A, 1usn:A, 2usn:A, 3usn:A
3	4fu4:A	368	157	0.6188	0.2690	0.6306	4.26e-65	830c:A, 830c:B, 456c:A, 456c:B, 4a7b:A, 4a7b:B, 5b5o:A, 5b5o:B, 5b5p:A, 5b5p:B, 5bot:A, 5bot:B, 5boy:A, 5boy:B, 5bpa:A, 5bpa:B, 1cxv:A, 1cxv:B, 2d1n:A, 2d1n:B, 2e2d:A, 3elm:A, 3elm:B, 1eub:A, 1fls:A, 1fm1:A, 4fu4:B, 4fvl:A, 4fvl:B, 4g0d:A, 4g0d:B, 4g0d:C, 4g0d:D, 6hv2:A, 3i7g:A, 3i7g:B, 3i7i:A, 3i7i:B, 4jp4:A, 4jp4:B, 4jpa:A, 4jpa:B, 7ju8:A, 7ju8:B, 3kec:A, 3kec:B, 3kej:A, 3kej:B, 3kek:A, 3kek:B, 3kry:A, 3kry:B, 3kry:C, 3kry:D, 4l19:A, 4l19:B, 3ljz:A, 3ljz:B, 3ljz:C, 3ljz:D, 3o2x:A, 3o2x:B, 3o2x:C, 3o2x:D, 2ow9:A, 2ow9:B, 2ozr:A, 2ozr:B, 2ozr:C, 2ozr:D, 2ozr:E, 2ozr:F, 2ozr:G, 2ozr:H, 1pex:A, 2pjt:A, 2pjt:B, 2pjt:C, 2pjt:D, 3tvc:A, 5uwk:A, 5uwk:B, 5uwl:A, 5uwl:B, 5uwm:A, 5uwm:B, 5uwn:A, 5uwn:B, 5uwn:C, 5uwn:D, 5uwn:E, 3wv1:A, 3wv1:B, 3wv2:A, 3wv2:B, 3wv3:A, 3wv3:B, 1xuc:A, 1xuc:B, 1xud:A, 1xud:B, 1xur:A, 1xur:B, 2yig:A, 2yig:B, 1you:A, 1you:B, 1ztq:A, 1ztq:B, 1ztq:C, 1ztq:D, 3zxh:A, 3zxh:B
4	1fbl:A	367	160	0.6000	0.2616	0.6000	9.85e-65
5	1su3:B	416	158	0.6062	0.2332	0.6139	3.11e-64	966c:A, 4auo:A, 4auo:B, 1ayk:A, 2ayk:A, 3ayk:A, 4ayk:A, 1cge:A, 1cgf:A, 1cgf:B, 1cgl:A, 1cgl:B, 2clt:A, 2clt:B, 1hfc:A, 2j0t:A, 2j0t:B, 2j0t:C, 3shi:A, 3shi:G, 3shi:M, 1su3:A, 2tcl:A
6	3ba0:A	365	158	0.5687	0.2493	0.5759	6.18e-61	8b2n:A, 8b2n:C, 5cxa:A, 5czm:A, 5d2b:A, 5d3c:A, 4efs:A, 3ehx:A, 3ehy:A, 6ekn:A, 6ela:A, 6ela:B, 6ela:C, 6ela:D, 6enm:A, 6enm:B, 6eox:A, 3f15:A, 3f16:A, 3f17:A, 3f18:A, 3f19:A, 3f1a:A, 4gql:A, 4gr0:A, 4gr3:A, 4gr8:A, 4guy:A, 4h30:A, 4h30:B, 4h49:A, 4h49:B, 4h49:C, 4h49:D, 4h76:A, 4h84:A, 4h84:B, 2hu6:A, 4i03:A, 5i0l:A, 5i0l:B, 5i2z:A, 5i2z:B, 5i2z:C, 5i2z:D, 5i3m:A, 5i3m:B, 5i3m:C, 5i3m:D, 5i43:A, 5i43:B, 5i43:C, 5i43:D, 5i4o:A, 5i4o:C, 5i4o:B, 5i4o:D, 4ijo:A, 1jiz:A, 1jiz:B, 1jk3:A, 2jxy:A, 2k2g:A, 2k9c:A, 2krj:A, 5l79:A, 5l7f:A, 5l7f:B, 5lab:A, 3lik:A, 3lil:A, 3lir:A, 3ljg:A, 3lk8:A, 3lka:A, 2mlr:A, 2mls:A, 3n2u:A, 3n2v:A, 5n5j:A, 5n5k:A, 2n8r:A, 3nx7:A, 1os2:A, 1os2:B, 1os2:C, 1os2:D, 1os2:E, 1os2:F, 1os9:A, 1os9:B, 1os9:C, 1os9:D, 1os9:E, 1os9:F, 7ovy:A, 2oxu:A, 2oxw:A, 2oxz:A, 2poj:A, 6rd0:A, 8rij:A, 6rly:A, 1rmz:A, 1ros:A, 1ros:B, 3rts:A, 3rtt:A, 3ts4:A, 3tsk:A, 1utt:A, 1utz:A, 1utz:B, 3uvc:A, 3uvc:B, 2w0d:A, 2w0d:B, 2w0d:C, 2w0d:D, 2wo8:A, 2wo8:B, 2wo8:C, 2wo8:D, 2wo9:A, 2wo9:B, 2wo9:C, 2wo9:D, 2woa:A, 2woa:B, 2woa:C, 2woa:D, 1y93:A, 1ycm:A, 2z2d:A, 1z3j:A
7	2jsd:A	160	160	0.5687	0.5687	0.5687	7.90e-61
8	1bzs:A	165	160	0.5500	0.5333	0.5500	8.59e-61	1a85:A, 1a86:A, 3dng:A, 3dng:B, 3dpe:A, 3dpf:A, 3dpf:B, 5h8x:A, 1i73:A, 1i76:A, 1jan:A, 1jao:A, 1jap:A, 1jaq:A, 1jh1:A, 1jj9:A, 1kbc:A, 1kbc:B, 1mmb:A, 1mnc:A, 2oy2:A, 2oy2:F, 2oy4:A, 2oy4:F, 4qkz:A, 3tt4:A, 1zp5:A, 1zs0:A, 1zvx:A
9	8h78:A	168	159	0.5813	0.5536	0.5849	1.67e-60	3ayu:A, 8h78:B, 1hov:A, 1qib:A, 7xgj:A, 7xgj:B, 7xgj:C, 7xjo:A, 7xjo:B
10	8k5v:B	232	158	0.5687	0.3922	0.5759	1.53e-56	5cuh:A, 5cuh:B, 6esm:A, 1gkc:A, 1gkc:B, 1gkd:A, 1gkd:B, 4h1q:A, 4h1q:B, 4h2e:A, 4h2e:B, 4h3x:A, 4h3x:B, 4h82:A, 4h82:B, 4h82:C, 4h82:D, 4hma:A, 4hma:B, 5i12:A, 4jij:A, 4jij:B, 4jqg:A, 4jqg:B, 8k5v:A, 8k5w:A, 8k5w:B, 8k5x:A, 8k5x:B, 8k5y:A, 8k5y:B, 2ovx:A, 2ovx:B, 2ovz:A, 2ovz:B, 2ow0:A, 2ow0:B, 2ow1:A, 2ow1:B, 2ow2:A, 2ow2:B, 5th6:A, 5th6:B, 5th6:C, 5th6:D, 5th9:A, 5th9:B, 5th9:C, 5ue3:A, 5ue3:B, 5ue4:A, 5ue4:B, 4wzv:A, 4wzv:B, 4xct:A
11	2mze:A	250	159	0.5375	0.3440	0.5409	6.70e-56	2ddy:A, 8jud:A, 8juf:A, 8jug:A, 8k4z:A, 1mmp:A, 1mmp:B, 1mmq:A, 1mmr:A, 2mzh:A, 2mzi:A, 5ue2:A, 5ue5:A, 7wxx:A, 2y6c:A, 2y6d:A
12	1hv5:E	165	158	0.5312	0.5152	0.5380	7.36e-50	1hv5:A, 1hv5:B, 1hv5:C, 1hv5:D, 1hv5:F
13	1rm8:A	169	167	0.5188	0.4911	0.4970	2.88e-46
14	1bqq:M	174	168	0.5125	0.4713	0.4881	3.94e-46	1buv:M, 5h0u:A, 3ma2:D, 3ma2:A
15	1gxd:A	624	98	0.3688	0.0946	0.6020	3.87e-35	1ck7:A, 1eak:A, 1eak:B, 1eak:D, 1eak:C, 1gen:A, 1gxd:B, 1rtg:A
16	1gxd:A	624	70	0.2375	0.0609	0.5429	4.20e-15	1ck7:A, 1eak:A, 1eak:B, 1eak:D, 1eak:C, 1gen:A, 1gxd:B, 1rtg:A
17	1l6j:A	405	97	0.3438	0.1358	0.5670	3.49e-34
18	1l6j:A	405	70	0.2562	0.1012	0.5857	1.50e-14
19	4r3v:A	179	161	0.4188	0.3743	0.4161	6.74e-33	8b2q:A, 4in9:A, 4r3v:B, 2xs3:A, 2xs3:B, 2xs4:A
20	1af0:A	470	167	0.3063	0.1043	0.2934	0.003	5d7w:A, 4i35:A, 1sat:A, 1smp:A, 1srp:A
21	3hda:P	382	170	0.2812	0.1178	0.2647	0.031	3hbv:P
22	8h3x:C	357	29	0.0875	0.0392	0.4828	0.069	8h3y:A, 8h3y:B, 8h3y:C, 3p24:A, 3p24:B, 3p24:C, 3p24:D, 7pnd:A, 7pnd:B, 7pol:A, 7poo:A, 7poo:B, 7poq:A, 7poq:B, 7pou:A, 7pou:B, 8wem:C, 8wem:A, 8weo:B, 8weo:A
23	5gwd:A	239	99	0.1562	0.1046	0.2525	0.11	5czw:A, 5gwd:B, 5zjk:A, 5zjk:B, 5zjk:C, 5zjk:D, 5zjk:E, 5zjk:F, 5zjk:G, 5zjk:H, 5zjk:I, 5zjk:J, 5zjk:K, 5zjk:L, 5zjk:M, 5zjk:N, 5zjk:O, 5zjk:P, 5zjk:Q, 5zjk:R
24	5gxe:A	331	71	0.1187	0.0574	0.2676	0.15	5gxe:B
25	7pol:B	336	50	0.1187	0.0565	0.3800	0.17	8wen:C, 8wen:A
26	2q78:F	136	75	0.1313	0.1544	0.2800	0.19	2q78:A, 2q78:B, 2q78:D, 2q78:G, 2q78:C, 2q78:E, 2q78:H
27	4j4m:B	200	41	0.1000	0.0800	0.3902	0.65	4j4m:A
28	9clp:A	420	18	0.0625	0.0238	0.5556	0.82
29	4f4c:A	1250	41	0.0938	0.0120	0.3659	1.1
30	1go7:P	462	134	0.2062	0.0714	0.2463	1.2	1go8:P, 3hb2:P, 3hbu:P, 1k7g:A, 1k7i:A, 1k7q:A
31	3gbo:A	200	51	0.0938	0.0750	0.2941	1.3
32	4on1:A	334	25	0.0813	0.0389	0.5200	1.3	4on1:B
33	3lmc:A	191	97	0.1688	0.1414	0.2784	1.5
34	6sga:FA	579	35	0.0875	0.0242	0.4000	1.9	6sgb:FA
35	4axq:A	163	22	0.0625	0.0613	0.4545	2.1	4a3w:A, 3zvs:A, 3zvs:B, 3zvs:C
36	3dsl:A	416	27	0.0813	0.0312	0.4815	2.3	3dsl:B
37	6o38:A	573	20	0.0625	0.0175	0.5000	2.4	6o38:B, 6o38:C, 6o38:D, 6o38:E, 6o38:F
38	1yp1:A	199	15	0.0625	0.0503	0.6667	2.4
39	3hdb:A	417	26	0.0813	0.0312	0.5000	2.5
40	6qig:A	581	25	0.0813	0.0224	0.5200	2.8	3ghm:A, 3ghn:A, 3vn4:A
41	1wni:A	198	21	0.0750	0.0606	0.5714	3.6
42	6fvt:L	388	53	0.1000	0.0412	0.3019	3.6	6ef0:L, 6ef1:L, 6ef2:L, 6ef3:L, 6fvu:L, 6fvv:L, 6fvw:L, 6fvx:L, 6fvy:L, 5mp9:L, 5mpa:L, 5mpb:L, 5mpc:L, 7qo4:L, 7qo5:L, 7qo6:L
43	4l63:A	249	40	0.1000	0.0643	0.4000	3.9	4l6t:A
44	4q1l:A	202	28	0.0875	0.0693	0.5000	4.5
45	8hgg:C	1484	11	0.0563	0.0061	0.8182	6.6	8hgg:D, 8hgh:A, 8hgh:B
46	2dw1:A	415	28	0.0750	0.0289	0.4286	6.6	2dw0:A, 2dw0:B, 2dw1:B, 2dw2:B, 2dw2:A
47	4jz6:A	484	37	0.0938	0.0310	0.4054	6.8
48	1dth:A	202	27	0.0813	0.0644	0.4815	6.9	1atl:A, 1atl:B, 1dth:B, 1htd:A, 1htd:B
49	3wp6:A	228	70	0.1125	0.0789	0.2571	7.0
50	2aig:P	201	27	0.0813	0.0647	0.4815	8.7	3aig:A, 4aig:A, 1iag:A
51	2e3x:A	416	32	0.0625	0.0240	0.3125	8.9

[Back]