BioLiP

>protein
GMIQIDALPAFNDNYIWLLQDATSRRCAVVDPGDAKPVEAWLAAHPDWRLSDILVTHHHHDHVGGVAALKELTGARVLGP
ANEKIPARDLALEDGERVEVLGLVFEIFHVPGHTLGHIAYYHPAETPLLFCGDTLFAAGCGRLFEGTPAQMHHSLARLAA
LPANTRVYCTHEYTLSNLRFALAVEPDNAALRERFEEATRLRERDRITLPSEISLELSTNPFLRVSENSVKKKADQRSGQ
QNRTPEEVFAVLRAWKDQF

The query sequence (length=259) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8ewo:A	259	259	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	8ewo:B, 8ewo:C
2	6rz0:A	251	258	0.4556	0.4701	0.4574	1.50e-68	6s0i:A
3	2q42:A	254	264	0.4093	0.4173	0.4015	1.85e-65	2q42:B, 1xm8:A, 1xm8:B
4	2qed:A	252	258	0.4286	0.4405	0.4302	6.92e-65
5	1qh3:A	260	263	0.3900	0.3885	0.3840	8.04e-53	1qh3:B, 1qh5:A, 1qh5:B
6	2p18:A	283	258	0.3320	0.3039	0.3333	1.13e-35	2p1e:A
7	4ysb:A	225	163	0.2124	0.2444	0.3374	4.85e-18	4ysb:B
8	2xf4:A	210	162	0.2162	0.2667	0.3457	1.08e-16
9	2zwr:B	207	172	0.2394	0.2995	0.3605	8.38e-16	2zwr:A, 2zzi:A, 2zzi:B
10	2gcu:A	244	176	0.2162	0.2295	0.3182	1.33e-13	2gcu:B, 2gcu:C, 2gcu:D
11	4chl:B	237	220	0.2239	0.2447	0.2636	1.72e-13	4chl:A
12	7ev5:A	209	165	0.1969	0.2440	0.3091	3.92e-12
13	5ve5:A	350	171	0.2008	0.1486	0.3041	4.75e-10	5ve3:B, 5ve3:A, 5ve4:A, 5ve4:B, 5ve4:C, 5ve5:B, 5ve5:C
14	4ysk:A	294	193	0.2201	0.1939	0.2953	7.24e-10	4ysk:B, 4ysl:A, 4ysl:B
15	6k4t:A	260	116	0.1583	0.1577	0.3534	2.22e-07	5axo:A, 5axr:A, 5aya:A, 5b15:A, 5b1u:A, 6k4x:A, 3vpe:A, 3vqz:A
16	3tp9:A	473	179	0.2085	0.1142	0.3017	1.46e-06	3tp9:B
17	4efz:A	295	203	0.2162	0.1898	0.2759	2.66e-06	4efz:B
18	6e0s:A	264	143	0.1660	0.1629	0.3007	9.32e-06
19	6mfi:A	264	186	0.1892	0.1856	0.2634	1.16e-05
20	6u10:A	269	94	0.1351	0.1301	0.3723	1.88e-05	7l52:A, 7l91:A, 6u0y:A, 6u0y:B, 6u0y:C, 6u0y:D, 6u0z:A, 6u13:A, 6u2y:A, 6u2z:A, 6uac:A, 6uaf:A, 6uah:A, 7uhh:A, 7uhi:A, 7uhj:A, 7uhk:A, 7uhl:A, 7uhm:A, 7uhn:A, 7uho:A, 7uhp:A, 7uhq:A, 7uhr:A, 7uht:A
21	4ad9:A	288	157	0.1544	0.1389	0.2548	4.02e-05	4ad9:B, 4ad9:C, 4ad9:D, 4ad9:E, 4ad9:F
22	8hxi:B	268	94	0.1313	0.1269	0.3617	4.39e-05	7a63:A, 7afz:A, 2aio:A, 7bj8:A, 5dpx:A, 5dpx:B, 5evb:A, 5evd:A, 5evk:A, 2fm6:A, 2fm6:B, 2fu7:A, 2fu7:B, 2fu8:A, 2fu8:B, 2fu9:A, 2fu9:B, 2gfj:A, 2gfj:B, 2gfk:A, 2gfk:B, 2h6a:A, 2h6a:B, 2hb9:A, 5hh5:A, 5hh6:A, 8hxe:A, 8hxe:B, 8hxi:A, 7o0o:A, 2qdt:A, 2qin:A, 2qin:B, 2qin:C, 2qin:D, 2qjs:A, 2qjs:B, 2qjs:C, 2qjs:D, 1sml:A, 7zo2:A, 7zo3:A, 7zo4:A, 7zo5:A, 7zo6:A, 7zo7:A
23	7l0b:A	202	119	0.1351	0.1733	0.2941	1.29e-04	7l0b:B, 7l0b:C, 7l0b:D
24	6n36:A	265	159	0.1583	0.1547	0.2579	2.94e-04
25	6sg9:FL	320	71	0.1158	0.0938	0.4225	3.16e-04	6sgb:FL
26	2zo4:A	301	126	0.1429	0.1229	0.2937	5.92e-04
27	6auf:B	273	157	0.1544	0.1465	0.2548	0.001
28	5ngg:A	274	109	0.1236	0.1168	0.2936	0.002	2gmn:A, 2gmn:B, 3lvz:A, 3lvz:B, 5ngg:B, 5njw:A, 5njw:B, 5wcm:A, 5wcm:B
29	6nc5:A	259	141	0.1467	0.1467	0.2695	0.004	6dqh:A, 6dr8:A
30	8u00:A	242	77	0.0965	0.1033	0.3247	0.005	8u00:B
31	5aeb:B	266	98	0.1004	0.0977	0.2653	0.006	5aeb:A
32	7luu:A	266	90	0.1004	0.0977	0.2889	0.017
33	1l9y:A	263	94	0.1081	0.1065	0.2979	0.019	1jt1:A, 1k07:A, 1k07:B, 1l9y:B, 5w90:A, 5wck:A, 5wck:B
34	3r2u:A	348	141	0.1274	0.0948	0.2340	0.027	3r2u:B, 3r2u:C, 3r2u:D
35	2m5c:A	227	23	0.0425	0.0485	0.4783	0.079	1bc2:A, 1bc2:B, 2bc2:A, 2bc2:B, 3bc2:A, 2bfk:A, 2bfk:B, 2bfl:A, 2bfl:B, 2bfz:A, 2bfz:B, 2bg2:A, 2bg2:B, 2bg6:A, 2bg6:B, 2bg7:A, 2bg7:B, 2bg8:A, 2bg8:B, 2bga:A, 2bga:B, 1bmc:A, 1bvt:A, 4c09:A, 4c1c:A, 4c1h:A, 6dja:A, 1dxk:A, 6eum:A, 6ewe:A, 6f2n:A, 3fcz:A, 3fcz:B, 5fqa:A, 5fqb:A, 3i11:A, 3i13:A, 3i14:A, 3i15:A, 5jmx:A, 3knr:A, 3knr:B, 3knr:C, 3knr:D, 3kns:A, 3kns:B, 3kns:C, 3kns:D, 2m5d:A, 4nq4:A, 4nq5:A, 4nq6:A, 2nxa:A, 2nyp:A, 2nze:A, 2nze:B, 2nzf:A, 4tyt:A, 2uyx:A, 5w8w:A
36	6v3q:A	226	162	0.1660	0.1903	0.2654	0.082	6v3q:B
37	7u2r:A	244	75	0.0888	0.0943	0.3067	0.14
38	7e3w:B	239	29	0.0579	0.0628	0.5172	0.19	7e3v:A, 7e3v:B, 7e3v:C, 7e3v:D, 7e3v:E, 7e3v:F, 7e3w:A, 7e3w:C, 7e3w:D, 7e3w:E, 7e3w:F
39	2p4z:B	276	77	0.0811	0.0761	0.2727	0.24	2p4z:A
40	9c3d:A	224	109	0.1042	0.1205	0.2477	0.33
41	5iqk:B	270	90	0.0965	0.0926	0.2778	0.36	5iqk:A
42	5k0w:B	271	89	0.0772	0.0738	0.2247	0.36	5k0w:A
43	4le6:A	257	89	0.1042	0.1051	0.3034	0.85	4le6:B, 4le6:C, 4le6:D, 4le6:E
44	4awy:B	270	90	0.0965	0.0926	0.2778	0.87	4awz:A, 4awz:B, 4awz:C, 4ax0:B, 4ax1:B, 4p62:A
45	8fmw:AX	181	90	0.0849	0.1215	0.2444	2.0	8fn2:X
46	5jcs:s	2003	45	0.0618	0.0080	0.3556	2.3
47	7wnu:B	554	52	0.0772	0.0361	0.3846	3.1	7wnt:A, 7wnu:A
48	5esv:L	214	100	0.1004	0.1215	0.2600	3.3	5esv:B, 5esv:D, 5esz:L
49	3h3e:A	256	27	0.0502	0.0508	0.4815	3.5
50	7sn8:K	588	51	0.0618	0.0272	0.3137	3.6	8uic:K
51	7t28:A	238	38	0.0541	0.0588	0.3684	3.7
52	7u2s:A	248	38	0.0541	0.0565	0.3684	3.8	7u2s:B
53	3zq4:A	550	33	0.0425	0.0200	0.3333	3.9	3zq4:C, 3zq4:D, 3zq4:E
54	6b9v:A	254	72	0.1004	0.1024	0.3611	4.2	6b9v:B
55	1p9e:A	294	59	0.0734	0.0646	0.3220	5.1	1p9e:B
56	6lfl:A	471	39	0.0618	0.0340	0.4103	5.2
57	6c2c:A	299	56	0.0772	0.0669	0.3571	5.2	6c2c:B, 5hif:A, 5hif:B
58	2bib:A	540	21	0.0463	0.0222	0.5714	5.8	1wra:A, 1wra:B
59	8c8b:A	341	148	0.1429	0.1085	0.2500	5.9	5ahr:A, 4b87:A, 8c8d:A, 8c8s:A, 8cew:A, 8cf0:A, 8cg9:A, 5nzw:A, 5nzx:A, 5nzy:A, 5q1j:A, 5q1k:A, 5q1l:A, 5q1m:A, 5q1n:A, 5q1o:A, 5q1p:A, 5q1q:A, 5q1r:A, 5q1s:A, 5q1t:A, 5q1u:A, 5q1v:A, 5q1w:A, 5q1x:A, 5q1y:A, 5q1z:A, 5q20:A, 5q22:A, 5q23:A, 5q24:A, 5q25:A, 5q26:A, 5q27:A, 5q28:A, 5q29:A
60	4d1t:A	229	90	0.1197	0.1354	0.3444	6.2	4d1u:A, 4d1v:A, 4d1w:A, 2y87:A, 2y8a:A, 2y8b:A
61	5a0t:A	454	52	0.0772	0.0441	0.3846	8.0	5a0t:B, 5a0v:A, 5a0v:B
62	4zo2:B	294	29	0.0463	0.0408	0.4138	8.7	4zo2:A, 4zo3:A, 4zo3:B
63	6k6s:A	443	65	0.0618	0.0361	0.2462	9.8	6k6s:B
64	6xyw:Bf	136	26	0.0309	0.0588	0.3077	9.9
65	3g1p:B	250	37	0.0541	0.0560	0.3784	9.9	3g1p:A, 3p2u:A, 3p2u:B
66	8uto:N	389	59	0.0695	0.0463	0.3051	9.9	2hxh:C, 1i5s:A, 8utn:K, 8utn:N, 8uto:K, 8utp:K, 8utp:N, 8utq:K, 8utr:K, 8utt:K, 8utt:N, 8utu:K, 8utv:K, 8uty:K, 8uty:N, 4uxp:C, 1vfz:A

[Back]