Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
GMIQEKIKELEVKRALAQSWFSDPDKRKISSNYDNRETPFTRFLSAETFTSYYQLTFKKTPVSILDIGCGQGQMLEYISK
QLPLADLTGIDSSEEAIHCANKLNIKANFICTDIKNFSSHAKIYDVILIHLCFGLFENPIELLEQLLPYLSNESMIYIVD
LNRDSIESGLSSVQSKEEELYIYDQYHASLTLSEFEQLLTYITKPREDMMYKIGTSIIGGFSPFSMEFLSLIGNGNLQQT
LRQAPDVLLHAWLIKNR

The query sequence (length=257) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 5dm2:A 258 258 0.9922 0.9884 0.9884 0.0 5dm1:A, 5dm4:A, 4kwc:A
2 5dm0:B 272 266 0.5019 0.4743 0.4850 6.27e-87 5dly:A, 5dm0:A, 4kvz:A
3 6p3o:A 341 105 0.1051 0.0792 0.2571 0.001 6p3m:A, 6p3n:A
4 5f8f:B 361 112 0.1051 0.0748 0.2411 0.001 5f8e:A, 5f8e:B, 5f8f:A, 5f8f:C
5 6gkv:A 351 100 0.0895 0.0655 0.2300 0.001 6gkv:B, 6gky:A, 6gky:B, 6gkz:A, 6gkz:B, 6gkz:C, 6gkz:D
6 3dh0:B 190 142 0.1245 0.1684 0.2254 0.002 3dh0:A
7 3bxo:A 236 90 0.1012 0.1102 0.2889 0.002 3bxo:B
8 2p35:A 245 93 0.0856 0.0898 0.2366 0.003 2p35:B
9 3dtn:A 220 195 0.1946 0.2273 0.2564 0.003 3dtn:B
10 4kif:B 339 119 0.1167 0.0885 0.2521 0.004 4kib:A, 4kib:B, 4kic:A, 4kic:B, 4kif:A, 4kig:A, 4kig:B, 4m6x:A, 4m6x:B, 4m6y:A, 4m6y:B, 4m71:A, 4m71:B, 4m72:A, 4m72:B, 4m73:A, 4m73:B, 4m74:A, 4m74:B
11 4kdr:A 208 112 0.0973 0.1202 0.2232 0.006 5dpm:A
12 6mro:A 194 58 0.0817 0.1082 0.3621 0.009 8gdu:A
13 7ux7:A 378 107 0.1051 0.0714 0.2523 0.017 7ux6:A, 7ux6:B, 7ux7:B, 7ux8:A, 7ux8:B
14 7pd7:B 250 41 0.0700 0.0720 0.4390 0.034 7pd7:A, 7pd7:C, 7pd7:D
15 5gm2:B 282 40 0.0661 0.0603 0.4250 0.041 5gm1:A, 5gm1:B, 5gm1:C, 5gm1:D, 5gm1:E, 5gm1:F, 5gm1:G, 5gm1:H, 5gm1:I, 5gm1:J, 5gm1:K, 5gm1:L, 5gm1:M, 5gm1:N, 5gm1:O, 5gm1:P, 5gm1:Q, 5gm1:R, 5gm2:A, 5gm2:C, 5gm2:D, 5gm2:E, 5gm2:F, 5gm2:G, 5gm2:H, 5gm2:I, 5gm2:J, 5gm2:L, 5gm2:M, 5gm2:N, 5gm2:O, 5gm2:P, 5gm2:Q, 5gm2:R
16 3jwh:A 191 39 0.0506 0.0681 0.3333 0.047 3jwh:B
17 4iv8:A 245 114 0.1245 0.1306 0.2807 0.048 4iv8:B
18 1p91:A 268 48 0.0661 0.0634 0.3542 0.058 1p91:B
19 4oqd:C 241 109 0.0895 0.0954 0.2110 0.15 6m81:A, 6m81:B, 6m81:C, 6m81:D, 6m82:A, 6m83:A, 4oqd:A, 4oqd:B, 4oqd:D, 4oqe:A, 4oqe:B, 3pfg:A, 3pfh:A, 3pfh:D, 3px2:A, 3px2:D, 3px3:A, 3px3:D
20 4mwz:B 265 144 0.1362 0.1321 0.2431 0.16 4iv0:A, 4iv0:B, 4mwz:A
21 4pne:B 272 145 0.1245 0.1176 0.2207 0.18 4pne:A
22 5mgz:A 230 40 0.0467 0.0522 0.3000 0.24 5mgz:B
23 5kok:A 348 79 0.0895 0.0661 0.2911 0.29 5koc:A, 5koc:B, 5kok:B, 5kpc:A, 5kpc:B, 5kpg:A, 5kpg:B
24 6uak:A 297 92 0.0856 0.0741 0.2391 0.35
25 8bir:A 321 81 0.0973 0.0779 0.3086 0.37 8big:A, 8big:B, 8big:C, 8big:D, 8big:E, 8big:F, 8big:G, 8big:H, 8bii:A, 8bii:B, 8bii:C, 8bii:D, 8bii:E, 8bii:F, 8bii:G, 8bii:H, 8bir:B
26 7uch:A 636 64 0.0661 0.0267 0.2656 0.39 6b39:A, 6b3a:A, 6b3b:A
27 3e8s:A 220 116 0.0973 0.1136 0.2155 0.39
28 3gu3:A 276 92 0.1051 0.0978 0.2935 0.47 3gu3:B
29 4qnu:A 323 116 0.1245 0.0991 0.2759 0.74 4qnu:B, 4qnu:C, 4qnu:D, 4qnu:E, 4qnu:F, 4qnu:G, 4qnu:H, 4qnv:A, 4qnv:B
30 5m58:A 230 39 0.0428 0.0478 0.2821 0.75 5m58:B
31 8rpr:A 338 95 0.0817 0.0621 0.2211 0.78 8ftr:A, 8fts:A, 8ftv:A, 8rww:A, 8rxf:A, 8rxg:A
32 1ri1:A 252 87 0.0973 0.0992 0.2874 0.90 2hv9:A, 1ri2:A, 1ri3:A, 1ri4:A, 1z3c:A
33 5zw4:A 216 112 0.1167 0.1389 0.2679 1.3 5zw3:A
34 5gm2:K 267 40 0.0623 0.0599 0.4000 1.5
35 5zw3:B 193 112 0.1167 0.1554 0.2679 1.6
36 3jwg:A 195 43 0.0545 0.0718 0.3256 1.7
37 6ecx:A 283 106 0.0895 0.0813 0.2170 2.4 6ect:A
38 5z9o:A 373 93 0.1012 0.0697 0.2796 2.5 5z9o:B
39 8r4z:A 341 53 0.0700 0.0528 0.3396 2.6 8r4z:B, 8rvc:A, 8rvc:B, 8rvs:A, 8rvs:B, 8rwm:A, 8rwm:B
40 5dpl:A 520 95 0.1012 0.0500 0.2737 2.6 5doo:A, 5dpl:B
41 4dcm:A 360 46 0.0545 0.0389 0.3043 2.7
42 7uci:A 686 72 0.0700 0.0262 0.2500 3.0 7uci:B
43 7ucl:A 616 72 0.0700 0.0292 0.2500 3.0 7ucl:B
44 4ax8:A 450 44 0.0661 0.0378 0.3864 3.1 4azs:A, 4azt:A, 4azv:A
45 4uw0:A 501 44 0.0661 0.0339 0.3864 3.8 4azw:A
46 7veo:B 255 62 0.0623 0.0627 0.2581 3.9
47 2b3t:A 276 46 0.0428 0.0399 0.2391 4.0 1t43:A
48 7qw6:A 556 52 0.0700 0.0324 0.3462 4.0 7qw5:A, 7qw7:A
49 5bsz:A 247 66 0.0661 0.0688 0.2576 4.0
50 2eer:B 347 39 0.0506 0.0375 0.3333 4.6 2eer:A
51 5dpd:A 511 44 0.0661 0.0333 0.3864 5.2 5dnk:A, 5dnk:B, 5dpd:B
52 3eld:A 277 39 0.0506 0.0469 0.3333 5.3 3elu:A, 3elw:A, 3ely:A, 3emb:A, 3emd:A
53 6dcb:A 225 51 0.0545 0.0622 0.2745 5.8 6dcc:A, 5una:C, 5una:A, 5una:B, 5una:D, 5una:E, 5una:F
54 3htx:D 795 65 0.0739 0.0239 0.2923 6.2 3htx:A
55 8y4u:A 298 60 0.0739 0.0638 0.3167 6.5
56 5fad:A 160 37 0.0389 0.0625 0.2703 6.6 5fa8:A
57 6bqc:A 348 37 0.0467 0.0345 0.3243 8.3
58 7slp:A 239 43 0.0506 0.0544 0.3023 8.7 7slq:A
59 9fce:B 209 35 0.0467 0.0574 0.3429 9.0 9fce:A
60 7nii:A 663 46 0.0545 0.0211 0.3043 9.1 7nii:D, 7nii:F
61 6hp2:A 297 204 0.1907 0.1650 0.2402 9.3
62 7qrd:C 364 45 0.0506 0.0357 0.2889 9.7 6arj:A, 6arj:B, 6arj:C, 6arj:D, 6arv:A, 6arv:B, 6arv:C, 6arv:D, 3b3f:A, 3b3f:B, 3b3f:C, 3b3f:D, 6d2l:A, 6d2l:B, 6d2l:C, 6d2l:D, 6d2l:E, 6d2l:F, 6dvr:A, 6dvr:B, 5dwq:B, 5dwq:D, 5dwq:A, 5dwq:C, 5dx0:A, 5dx0:B, 5dx0:C, 5dx0:D, 5dx1:A, 5dx1:B, 5dx1:C, 5dx1:D, 5dx8:A, 5dx8:B, 5dx8:C, 5dx8:D, 5dxa:A, 5dxa:B, 5dxa:D, 5dxa:C, 5dxj:A, 5dxj:B, 5dxj:C, 5dxj:D, 7fai:A, 7fai:B, 7fai:C, 7fai:D, 7faj:A, 7faj:B, 7faj:C, 7faj:D, 8g2h:A, 8g2i:A, 5ih3:A, 5ih3:B, 5ih3:C, 5ih3:D, 4ikp:A, 4ikp:B, 4ikp:C, 4ikp:D, 5is6:A, 5is6:B, 5is6:C, 5is6:D, 5is7:A, 5is7:B, 5is7:C, 5is7:D, 5is8:A, 5is8:B, 5is8:D, 5is8:C, 5is9:A, 5is9:B, 5is9:C, 5is9:D, 5isa:C, 5isa:D, 5isa:A, 5isa:B, 5isb:A, 5isb:B, 5isb:C, 5isb:D, 5isc:A, 5isc:B, 5isc:C, 5isc:D, 5isd:A, 5isd:B, 5isd:C, 5isd:D, 5ise:A, 5ise:B, 5ise:C, 5ise:D, 5isf:A, 5isf:B, 5isf:C, 5isf:D, 5isg:A, 5isg:B, 5isg:C, 5isg:D, 5ish:A, 5ish:B, 5ish:C, 5ish:D, 5isi:A, 5isi:B, 5isi:C, 5isi:D, 6izq:A, 5k8v:A, 5k8v:B, 5k8v:C, 5k8v:D, 5k8w:A, 5k8w:B, 5k8w:C, 5k8w:D, 5k8x:A, 5k8x:B, 5k8x:C, 5k8x:D, 5lgp:A, 5lgp:B, 5lgp:C, 5lgp:D, 5lgq:B, 5lgq:A, 5lgq:C, 5lgq:D, 5lgr:A, 5lgr:B, 5lgr:C, 5lgr:D, 5lgs:A, 5lgs:B, 5lgs:C, 5lgs:D, 5lkj:A, 5lkj:B, 5lkj:C, 5lkj:D, 5lv2:A, 5lv2:B, 5lv2:C, 5lv2:D, 5lv2:E, 5lv2:F, 5lv2:G, 5lv2:H, 5lv3:A, 5lv3:B, 5lv3:C, 5lv3:D, 5ntc:A, 5ntc:B, 5ntc:C, 5ntc:D, 7okp:A, 7okp:B, 7okp:C, 7okp:D, 7os4:A, 7os4:B, 7os4:C, 7os4:D, 7ppq:A, 7ppq:B, 7ppq:C, 7ppq:D, 7ppy:A, 7ppy:B, 7ppy:C, 7ppy:D, 7pu8:A, 7pu8:B, 7pu8:C, 7pu8:D, 7puc:A, 7puc:B, 7puc:C, 7puc:D, 7puq:A, 7puq:B, 7puq:C, 7puq:D, 7pv6:A, 7pv6:B, 7pv6:C, 7pv6:D, 7qph:A, 7qph:D, 7qph:C, 7qph:B, 7qrd:A, 7qrd:B, 7qrd:D, 6s70:A, 6s70:B, 6s70:C, 6s70:D, 6s71:A, 6s71:B, 6s71:C, 6s71:D, 6s74:A, 6s74:B, 6s74:C, 6s74:D, 6s77:A, 6s77:B, 6s77:C, 6s77:D, 6s79:A, 6s79:B, 6s79:C, 6s79:D, 6s7a:A, 6s7a:B, 6s7a:C, 6s7a:D, 6s7b:A, 6s7b:B, 6s7b:C, 6s7b:D, 6s7c:A, 6s7c:B, 6s7c:C, 6s7c:D, 8sig:A, 8sih:A, 5tbh:A, 5tbh:B, 5tbh:C, 5tbh:D, 5tbi:A, 5tbi:B, 5tbi:C, 5tbi:D, 5tbj:A, 5tbj:B, 5tbj:C, 5tbj:D, 5u4x:A, 5u4x:B, 5u4x:C, 5u4x:D, 7u9i:A, 7u9i:B, 2v74:B, 2v74:D, 2v74:F, 2v74:H, 2y1w:A, 2y1w:B, 2y1w:C, 2y1w:D, 2y1x:A, 2y1x:D, 2y1x:B, 2y1x:C

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218