BioLiP

>protein
GLYPSYNTSPAAPDSTGMQSTAVQLAGKIRLGWNIGNTMEAIGGETAWGNPMVSNELLKLVKDSGFDAVRIPVAWDQYAN
QESAEISAAWLNRVKQVVQMAIDNELYVLINIHWDGGWLENNITPAKKDENNAKQKAFWEQIATHLRDFDEHLLFAGTNA
PNAENAEQMDVLNSYLQTFVDAVRSTGGKNAYRVLVLQGPVTDIEKTNELWTHMPADTATDRLMAEVHFYTPYNFALMRQ
DESWGKQFYYWGEGFLSTTDTERNPTWGEEATIDQLFDLMKTKFVDQGIPVVLGEFSAMRRTNLTGDALTLHLAGRAYYH
KYVTQQALARGLLPFYWDNGGNDNFSSGIFNRQQNTVFDQQVLDALLEGA

The query sequence (length=370) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8oz1:A	373	370	0.9973	0.9893	0.9973	0.0	6ha9:A, 6ha9:B, 6haa:A, 6haa:B, 5oyd:A, 5oyd:B, 5oye:A, 5oye:B
2	3zmr:A	469	384	0.3892	0.3070	0.3750	1.65e-80	3zmr:B
3	4w8b:A	386	375	0.3757	0.3601	0.3707	9.63e-73
4	2jeq:A	359	374	0.3676	0.3788	0.3636	1.87e-61
5	6wqp:B	354	373	0.3405	0.3559	0.3378	2.22e-61	6wqv:A, 6wqv:B, 6wqv:C, 6wqv:D
6	3ndz:A	345	364	0.3054	0.3275	0.3104	2.57e-58	3ndz:C, 3ndz:B, 3ndz:D
7	5h4r:A	375	388	0.3189	0.3147	0.3041	9.44e-49
8	8ghy:A	362	373	0.3027	0.3094	0.3003	9.82e-47	8ghy:B
9	3ays:A	357	378	0.3027	0.3137	0.2963	6.23e-45
10	4yhg:A	389	362	0.3135	0.2982	0.3204	1.30e-44
11	4yzt:A	512	329	0.2730	0.1973	0.3070	2.52e-43
12	6gl0:A	331	333	0.2757	0.3082	0.3063	2.67e-40	6gl0:B, 6gl0:C
13	4v2x:A	534	346	0.2946	0.2041	0.3150	5.36e-40
14	5d9n:A	349	319	0.2703	0.2865	0.3135	7.34e-40	5d9m:A, 5d9m:B, 5d9n:B, 5d9o:A, 5d9o:B, 5d9p:A, 5d9p:B
15	4w88:B	340	375	0.3000	0.3265	0.2960	2.54e-39	4w86:A, 4w86:B, 4w87:A, 4w87:B, 4w88:A, 4w89:A, 4w89:B
16	4u5k:A	304	346	0.2568	0.3125	0.2746	2.24e-25	4u5i:A, 4u5i:B, 4u5k:B
17	6ujf:A	301	352	0.2568	0.3156	0.2699	3.11e-24
18	3nco:A	313	352	0.2378	0.2812	0.2500	8.44e-19	3nco:B, 3rjy:A
19	3amg:A	311	345	0.2243	0.2669	0.2406	3.03e-17	3aof:B, 3aof:A, 3azr:A, 3azr:B, 3azs:A, 3azs:B, 3azt:A, 3azt:D, 3mmw:A, 3mmw:B, 3mmw:C, 3mmw:D
20	3amg:B	291	340	0.2243	0.2852	0.2441	7.94e-16
21	7vt5:A	311	285	0.1892	0.2251	0.2456	2.55e-14	7vt6:A, 7vt7:A
22	4w7v:A	313	130	0.0865	0.1022	0.2462	1.73e-05	4w7w:A
23	5ecu:A	350	151	0.0919	0.0971	0.2252	0.002
24	3pzt:B	296	153	0.0973	0.1216	0.2353	0.035	3pzt:A
25	3aiq:A	491	109	0.0649	0.0489	0.2202	0.053	3air:A, 3ais:A, 3aiv:A, 3aiw:A
26	5d8z:A	324	150	0.0919	0.1049	0.2267	0.074	5d8z:B
27	8ivy:A	451	104	0.0595	0.0488	0.2115	0.097	8ivy:B
28	5ljf:A	321	137	0.0811	0.0935	0.2190	0.21	5ljf:B, 4m24:A, 7p6h:A, 7p6h:B, 7p6j:A, 7p6j:B, 7p6j:C, 7p6j:D, 6zz3:A, 6zz3:B, 6zz3:C, 6zz3:D
29	1e5j:A	302	143	0.0919	0.1126	0.2378	0.27	2a3h:A, 3a3h:A, 4a3h:A, 5a3h:A, 6a3h:A, 8a3h:A, 1h11:A, 1h2j:A, 1h5v:A, 1hf6:A, 1ocq:A, 1qhz:A, 1qi0:A, 1qi2:A, 2v38:A, 1w3k:A, 1w3l:A
30	8rwk:A	495	179	0.1216	0.0909	0.2514	0.29	8rwk:B, 8rwk:C, 8rwk:D
31	3hbz:A	341	114	0.0811	0.0880	0.2632	0.81
32	4c3s:A	435	82	0.0568	0.0483	0.2561	0.90	5dbv:A
33	5w10:A	173	33	0.0378	0.0809	0.4242	1.1	5w10:B, 5w10:C, 5w10:D
34	6m6l:B	445	72	0.0568	0.0472	0.2917	1.6
35	1e55:A	492	62	0.0459	0.0346	0.2742	1.6	1e1f:A, 1e1f:B, 1e4n:A, 1e4n:B, 1e55:B, 1e56:A, 1e56:B, 1h49:B, 1h49:A, 1v08:A, 1v08:B
36	6koz:A	436	79	0.0649	0.0550	0.3038	1.7	6a8z:A, 6a8z:B, 6iff:A, 6iff:B, 6ifg:A, 6ifg:B, 6koy:A, 6koy:B, 6koz:B, 6kp0:A, 6kp0:B, 6kp1:A, 6kp1:B
37	6r2j:D	329	189	0.1000	0.1125	0.1958	1.7	6r2j:A
38	3gnr:A	478	129	0.0784	0.0607	0.2248	1.7	3wba:A, 3wbe:A
39	2ch6:A	343	64	0.0649	0.0700	0.3750	1.8	2ch6:B, 2ch6:C, 2ch6:D
40	7mix:A	1326	26	0.0324	0.0090	0.4615	2.1	7miy:A
41	8bqa:AAA	298	94	0.0595	0.0738	0.2340	4.2
42	4jie:A	484	97	0.0514	0.0393	0.1959	8.0	4re2:A, 4re3:A, 4re4:A
43	2v82:A	205	63	0.0622	0.1122	0.3651	8.5
44	1v03:A	487	80	0.0514	0.0390	0.2375	9.0

[Back]