BioLiP

>protein
GLTHRKFGGSGGSPFSGLSSIAVRSGSALDAIIIDGVHHGGSGGNLSPTFTFGSGEYISNMTIRSGDAIDNISFETNMGR
RFGPYGGSGGSANTLSNVKVIQINGSAGDALDSLDIYYEQY

The query sequence (length=121) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3ll2:A	123	121	0.9587	0.9431	0.9587	2.71e-76	2guc:A, 2guc:B, 2gud:A, 2gud:B, 2hyq:A, 2hyq:B, 2hyr:A, 2hyr:B, 2nuo:A, 2nuo:B, 7ria:A, 7ria:B, 7rib:A, 7rib:B, 7rib:C, 7rkg:A, 7rkg:B, 7rki:A, 7rki:B
2	6fly:A	144	121	0.2810	0.2361	0.2810	1.26e-05	6fly:B, 6flz:A, 6flz:B
3	1zgs:A	442	139	0.2975	0.0814	0.2590	3.95e-04	4mq0:A, 1zgs:B
4	1zgs:A	442	93	0.2314	0.0633	0.3011	0.017	4mq0:A, 1zgs:B
5	1zgs:A	442	65	0.1818	0.0498	0.3385	0.12	4mq0:A, 1zgs:B
6	5m6o:A	150	62	0.1736	0.1400	0.3387	5.57e-04	5m6o:B, 5m6o:C, 5m6o:D, 5tqz:A, 5tqz:B, 5tqz:C, 5tqz:D
7	1j4u:A	149	52	0.1570	0.1275	0.3654	5.63e-04	1j4u:B, 1j4u:C, 1j4u:D, 1vbo:A, 1vbo:B, 1vbo:C, 1vbo:E, 1vbo:G, 1vbo:H, 1vbo:D, 1vbo:F, 1vbp:A, 1vbp:B
8	4pit:B	144	133	0.2975	0.2500	0.2707	7.97e-04	2bmz:A, 2bmz:B, 2bn0:A, 2bn0:B, 8hyf:A, 3mit:A, 3mit:B, 3miu:A, 3miu:B, 3miv:B, 4pik:B, 4pik:C, 4pik:D, 4pik:A, 4pit:A, 4pit:C, 4pit:D, 1x1v:A, 1x1v:B
9	4pit:B	144	78	0.1818	0.1528	0.2821	8.4	2bmz:A, 2bmz:B, 2bn0:A, 2bn0:B, 8hyf:A, 3mit:A, 3mit:B, 3miu:A, 3miu:B, 3miv:B, 4pik:B, 4pik:C, 4pik:D, 4pik:A, 4pit:A, 4pit:C, 4pit:D, 1x1v:A, 1x1v:B
10	5yrf:B	142	45	0.1074	0.0915	0.2889	0.65	5yrf:A, 5yrg:A, 5yrg:B, 5yri:B, 5yri:A, 5yrj:A, 5yrj:B, 5yrl:A, 5yrl:B, 5yrm:B
11	3gd7:A	378	55	0.1570	0.0503	0.3455	1.1	3gd7:B, 3gd7:C, 3gd7:D, 6uk1:A, 6uk1:B, 6uk1:C, 6uk1:D
12	8v7z:A	1104	55	0.1570	0.0172	0.3455	1.3
13	5uak:A	1139	55	0.1570	0.0167	0.3455	1.3	2bbs:B, 7svr:A, 8v81:A
14	6msm:A	1181	55	0.1570	0.0161	0.3455	1.3	8eig:A, 8eio:A, 8eiq:A, 8fzq:A, 6gjq:A, 6gjq:C, 6gjq:E, 6gjq:G, 6gjs:A, 6gk4:A, 6gk4:D, 6gkd:A, 6gkd:L, 6gkd:F, 6gkd:I, 6gkd:O, 6gkd:R, 8gls:A, 6o1v:A, 6o2p:A, 2pze:A, 2pze:B, 2pzf:A, 2pzf:B, 2pzg:A, 2pzg:B, 7sv7:A, 7svd:A, 5tf7:A, 5tf8:A, 5tfa:A, 5tfb:A, 5tfc:A, 5tfd:A, 5tff:A, 5tfg:A, 5tfi:A, 5tfj:A, 5tgk:A, 8ubr:A, 6wbs:A, 6wbs:B, 6ze1:A
15	2vr5:A	715	87	0.2149	0.0364	0.2989	2.3	2vr5:B
16	2xq1:B	494	59	0.1488	0.0364	0.3051	5.5	2xq1:C, 2xq1:D, 2xq1:E, 2xq1:F, 2xq1:G, 2xq1:H, 2xq1:I, 2xq1:J, 2xq1:K, 2xq1:L, 2xq1:M, 2xq1:N, 2xq1:O, 2xq1:P
17	3cp0:A	63	28	0.0909	0.1746	0.3929	6.2
18	8j5q:D	611	32	0.1157	0.0229	0.4375	7.2	8j5r:D, 8j5s:D, 8j5t:D
19	7p18:A	558	40	0.1240	0.0269	0.3750	7.4	7p18:B

[Back]