Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GKVNVAKLRYMSRDDFRVLTAVEMGMKNHEIVPGSLIASIASLKHGGCNKVLRELVKHKLIAWERTKTVQGYRLTNAGYD
YLALKTLSSRQVVESVGNQMGVGKESDIYIVANEEGQQFALKLHRLGRTSFRNLHNVSWLYLSRLSAMKEFAYMKALYER
KFPVPKPIDYNRHAVVMELINGYPLCQIHHVEDPASVYDEAMELIVKLANHGLIHGDFNEFNLILDESDHITMIDFPQMV
STSHPNAEWYFDRDVKCIKDFFMKRFSYESELFPTFKDIRREDTLDVEVS

The query sequence (length=290) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6g18:v 325 281 0.9483 0.8462 0.9786 0.0 6fdm:A, 6fdm:C, 6g51:v, 6hk6:A, 6hk6:B, 6hk6:I, 6hk6:C, 6hk6:D, 6hk6:E, 6hk6:F, 6hk6:G, 6hk6:H, 6hk6:J, 7vbt:A, 7vbt:B, 7wu0:v
2 4gyi:A 339 301 0.5517 0.4720 0.5316 7.37e-105
3 8cbj:l 286 277 0.4483 0.4545 0.4693 3.28e-86 6eml:r, 6fai:l, 6rbd:l, 6y7c:l
4 8c01:r 239 281 0.4000 0.4854 0.4128 3.63e-59 8c00:r
5 1zao:A 271 281 0.2724 0.2915 0.2811 8.15e-30 1tqm:A, 1tqp:A, 1zar:A
6 4jin:A 254 208 0.1897 0.2165 0.2644 2.08e-13 3re4:A, 3re4:B, 1zp9:A, 1zp9:B, 1zp9:C, 1zp9:D, 1ztf:A, 1zth:A, 1zth:B, 1zth:C, 1zth:D
7 6zxd:z 292 183 0.1586 0.1575 0.2514 1.08e-10 4otp:A, 6zv6:h, 6zxe:z
8 6zxf:z 373 197 0.1552 0.1206 0.2284 1.67e-09 6zxg:z, 6zxh:z
9 3fz3:A 388 99 0.1069 0.0799 0.3131 0.012 3fz3:D, 3fz3:E
10 3fz3:B 410 99 0.1069 0.0756 0.3131 0.012 3fz3:C, 3fz3:F
11 4d2s:A 249 161 0.1310 0.1526 0.2360 0.027 4c4h:A
12 4q5h:A 169 58 0.0690 0.1183 0.3448 0.037
13 5j5t:A 298 68 0.0690 0.0671 0.2941 0.040
14 5yk1:A 401 98 0.0966 0.0698 0.2857 0.055 5yk0:A, 5yk2:A
15 5ntt:A 277 164 0.1207 0.1264 0.2134 0.061 5ap0:A, 5ap1:A, 5ap2:A, 5ap3:A, 5ap4:A, 5ap5:A, 5ap6:A, 5ap7:A, 6b4w:A, 4bhz:A, 4bi0:A, 4bi1:A, 4bi2:A, 4c4e:A, 4c4f:A, 4c4g:A, 4c4i:A, 4c4j:A, 7chm:A, 7chn:A, 7cht:A, 7cil:A, 7cja:A, 7clh:A, 4cv8:A, 4cv9:A, 4cva:A, 5eh0:A, 5ehl:A, 5eho:A, 5ehy:A, 5ei2:A, 5ei6:A, 5ei8:A, 3gfw:A, 6h3k:A, 3h9f:A, 3hmn:A, 3hmo:A, 3hmp:A, 4js8:A, 4jt3:A, 5ljj:A, 7lqd:A, 5mrb:A, 6n6o:A, 5n7v:A, 5n84:A, 5n87:A, 5n93:A, 5n9s:A, 5na0:A, 5nad:A, 4o6l:A, 4o6l:B, 5o91:A, 6tn9:A, 6tnb:A, 6tnc:A, 6tnd:A, 3vqu:A, 3w1f:A, 3wyx:A, 3wyy:A, 3wzj:A, 3wzk:A, 2x9e:A, 4zeg:A, 2zmd:A
16 3f69:B 283 69 0.0655 0.0671 0.2754 0.095 6b2p:A, 3f61:A, 3f69:A, 2fum:A, 2fum:B, 2fum:C, 2fum:D, 6i2p:A, 6i2p:B, 1mru:A, 1mru:B, 1o6y:A, 3ori:A, 3ori:B, 3ori:C, 3ori:D, 3ork:A, 3orl:A, 3orm:A, 3oro:A, 3orp:A, 3ort:A, 5u94:A
17 6bdn:A 307 160 0.1276 0.1205 0.2313 0.12
18 3pfq:A 523 73 0.0793 0.0440 0.3151 0.17 1a25:A, 1a25:B, 2i0e:A, 2i0e:B
19 3en9:A 519 81 0.0793 0.0443 0.2840 0.26 3en9:B, 3enh:A, 3enh:B, 5jmv:A, 5jmv:B, 5jmv:C, 2vwb:A, 2vwb:B
20 3iw4:C 334 73 0.0793 0.0689 0.3151 0.31 3iw4:A, 3iw4:B, 4ra4:A, 8u37:A, 8uak:A
21 5w94:A 617 111 0.0966 0.0454 0.2523 0.66 5w94:C
22 4bqk:A 424 84 0.0897 0.0613 0.3095 0.68 4b8o:A, 4b8p:A, 4b8p:B, 4bpl:A, 4bqk:B, 2yns:A, 2yns:B
23 1zy5:A 271 90 0.0759 0.0812 0.2444 0.88 1zy5:B, 1zyd:A, 1zyd:B
24 7sza:A 233 140 0.1103 0.1373 0.2286 0.93 7sza:C, 7szb:A, 7szb:C, 7szc:A, 7szc:C, 7szd:A, 7szd:C, 6wqx:C, 6wqx:D
25 5ckw:B 400 67 0.0759 0.0550 0.3284 0.94 5ckw:A
26 7ovi:A 262 27 0.0414 0.0458 0.4444 0.97 7ovk:A, 6yg5:A
27 4uw0:A 501 69 0.0621 0.0359 0.2609 1.0 4azw:A
28 2x8d:A 279 44 0.0517 0.0538 0.3409 1.0 7akm:A, 7ako:A, 7ako:B, 2ayp:A, 7bjd:A, 7bje:A, 7bjh:A, 7bjj:A, 7bjm:A, 7bjo:A, 7bjr:A, 7bjx:A, 7bjx:B, 7bk1:A, 7bk2:A, 7bk3:A, 7bkn:A, 7bko:A, 2br1:A, 2brb:A, 2brg:A, 2brh:A, 2brm:A, 2brn:A, 2bro:A, 2c3j:A, 2c3k:A, 2c3l:A, 9ce4:A, 2cgu:A, 2cgv:A, 2cgw:A, 2cgx:A, 5dls:A, 8e80:A, 8e81:A, 2e9n:A, 2e9o:A, 2e9p:A, 2e9u:A, 2e9v:A, 2e9v:B, 5f4n:A, 3f9n:A, 6fc8:A, 6fcf:A, 6fck:A, 4fsm:A, 4fsn:A, 4fsq:A, 4fsr:A, 4fst:A, 4fsu:A, 4fsw:A, 4fsy:A, 4fsz:A, 4ft0:A, 4ft3:A, 4ft5:A, 4ft7:A, 4ft9:A, 4fta:A, 4ftc:A, 4fti:A, 4ftj:A, 4ftk:A, 4ftl:A, 4ftm:A, 4ftn:A, 4fto:A, 4ftq:A, 4ftr:A, 4ftt:A, 4ftu:A, 2gdo:A, 2ghg:A, 4gh2:A, 2hog:A, 2hxl:A, 2hxq:A, 2hy0:A, 4hyh:A, 4hyi:A, 4jik:A, 3jvr:A, 3jvs:A, 7mck:A, 3nlb:A, 1nvq:A, 1nvr:A, 1nvs:A, 5oop:A, 5oor:A, 5oot:A, 5op2:A, 5op4:A, 5op5:A, 5op7:A, 5opb:A, 5opr:A, 5ops:A, 5opu:A, 5opv:A, 5oq5:A, 5oq6:A, 5oq7:A, 5oq7:B, 5oq8:A, 3ot3:A, 3ot8:A, 3pa3:A, 3pa4:A, 3pa5:A, 2qhm:A, 2qhn:A, 4qye:A, 4qyf:A, 4qyg:A, 4qyg:B, 4qyh:A, 4qyh:B, 2r0u:A, 4rvk:A, 4rvl:A, 4rvm:A, 8siv:A, 8siw:A, 8siw:B, 8six:A, 7suf:A, 7sug:A, 7suh:A, 7sui:A, 7suj:A, 7suj:B, 3tkh:A, 3tki:A, 3u9n:A, 2wmq:A, 2wmr:A, 2wms:A, 2wmt:A, 2wmu:A, 2wmv:A, 2wmw:A, 2wmx:A, 2x8e:A, 2x8i:A, 2xey:A, 2xez:A, 2xf0:A, 2ydi:A, 2ydj:A, 2ydj:B, 2ydk:A, 2yer:A, 2yex:A, 2ym3:A, 2ym4:A, 2ym5:A, 2ym6:A, 2ym7:A, 2ym8:A, 2ywp:A, 1zlt:A, 1zys:A
29 5z1e:A 296 27 0.0414 0.0405 0.4444 1.0 7cbx:A, 6ib0:A, 6ib2:A, 7ovj:A, 7ovl:A, 7ovm:A, 7ovn:A, 6qft:A, 6qg4:A, 6qg7:A, 6qho:A, 6qhr:A, 3wzu:A, 6yg2:A, 6yg3:A, 6yg4:A, 6yg6:A, 6yg6:B, 6yg7:A, 6yg7:B, 6yz4:A, 5z1d:A
30 4ax8:A 450 38 0.0414 0.0267 0.3158 1.3 4azs:A, 4azt:A, 4azv:A
31 6b2q:B 267 71 0.0621 0.0674 0.2535 1.5 6b2q:A, 6b2q:C, 6b2q:D
32 7qq6:B 275 51 0.0448 0.0473 0.2549 1.6 7qq6:A, 7qq6:C, 7qq6:D, 7qwk:B, 7qwk:H, 7qwk:D, 7qwk:G
33 3nie:A 369 41 0.0448 0.0352 0.3171 2.4 3nie:B
34 6n3l:A 231 52 0.0414 0.0519 0.2308 2.4 6n3l:B
35 6cmj:A 288 67 0.0724 0.0729 0.3134 2.5 6bku:A, 6ble:A, 6bql:A, 6bqp:A, 6bqq:A, 6brc:A, 6brc:B, 6cmj:B, 8tuc:A, 5uy6:A, 5uyj:A, 5vt1:A, 5yv8:A, 5yv9:A, 5yva:A, 5yvb:A, 5yvc:A, 2zv2:A
36 5m06:B 248 97 0.0897 0.1048 0.2680 2.7
37 4gki:A 272 55 0.0655 0.0699 0.3455 3.0 4ej7:A, 4ej7:B, 4ej7:C, 4feu:A, 4feu:B, 4feu:C, 4feu:D, 4feu:E, 4feu:F, 4fev:A, 4fev:B, 4fev:C, 4fev:D, 4fev:E, 4fev:F, 4few:A, 4few:B, 4few:C, 4few:D, 4few:E, 4few:F, 4fex:A, 4fex:B, 4fex:C, 4fex:D, 4fex:E, 4gkh:A, 4gkh:B, 4gkh:C, 4gkh:D, 4gkh:E, 4gkh:F, 4gkh:G, 4gkh:H, 4gkh:I, 4gkh:J, 4gkh:K, 4gkh:L, 4gki:B, 4gki:C, 4gki:D, 4gki:E, 4gki:F, 4gki:G, 4gki:H, 4gki:I, 4gki:J, 4gki:K, 4gki:L
38 7qwk:F 254 40 0.0379 0.0433 0.2750 3.1 6n3n:A, 6n3o:A, 7qwk:A, 7qwk:C, 7qwk:E
39 7m6a:A 4306 40 0.0483 0.0033 0.3500 3.2 7m6a:G, 7m6a:B, 7m6a:I, 7m6l:A, 7m6l:G, 7m6l:B, 7m6l:I
40 4wad:A 498 32 0.0483 0.0281 0.4375 3.7 4x6l:A, 4x6l:B, 4x6l:C, 4x7m:A, 4x7m:B, 4x7r:A, 4x7r:B
41 6imm:d 325 57 0.0552 0.0492 0.2807 4.5
42 4fr4:A 350 29 0.0414 0.0343 0.4138 4.6 4fr4:B, 4fr4:C, 4fr4:D, 4fr4:E, 4fr4:F
43 2f57:B 300 67 0.0690 0.0667 0.2985 5.2
44 5loh:B 250 72 0.0724 0.0840 0.2917 5.4 5loh:A
45 2z7r:A 265 25 0.0379 0.0415 0.4400 6.0 8xov:A, 2z7q:A, 2z7s:A
46 3g51:A 280 25 0.0379 0.0393 0.4400 6.2 8xfy:B, 8xfy:C, 8xfy:D, 8xfy:E, 8xfy:F, 8xfy:I, 8xfy:J
47 8dqt:A 290 29 0.0414 0.0414 0.4138 6.2 4a06:A, 4a07:A, 5ack:A, 4aw0:A, 4aw1:A, 2biy:A, 4ct1:A, 4ct2:A, 1h1w:A, 3h9o:A, 5hkm:A, 5hng:A, 5ho7:A, 5ho8:A, 3hrc:A, 3hrf:A, 3ion:A, 3iop:A, 5lvl:A, 5lvm:A, 5lvn:A, 5lvo:A, 5lvp:C, 5lvp:A, 5lvp:B, 5lvp:D, 5mrd:A, 3nax:A, 3nay:A, 3nay:B, 3nun:A, 3nus:A, 3nuu:A, 3nuy:A, 1oky:A, 1okz:A, 3orx:A, 3orx:B, 3orx:C, 3orx:D, 3orx:E, 3orx:F, 3orx:G, 3orx:H, 3orz:A, 3orz:B, 3orz:C, 3orz:D, 3otu:A, 2pe0:A, 2pe1:A, 2pe2:A, 3pwy:A, 3qc4:A, 3qc4:B, 3qcq:A, 3qcs:A, 3qcx:A, 3qcy:A, 3qd0:A, 3qd3:A, 3qd4:A, 2r7b:A, 3rcj:A, 4rqk:A, 4rqv:A, 4rrv:A, 3rwp:A, 3rwq:A, 3sc1:A, 1uu3:A, 1uu7:A, 1uu8:A, 1uu9:A, 1uvr:A, 2xch:A, 2xck:A, 4xx9:A, 1z5m:A
48 5f9e:A 336 67 0.0759 0.0655 0.3284 6.2 5f9e:B, 2jed:A, 2jed:B, 4q9z:A, 4q9z:B, 4ra5:A, 4ra5:B, 1xjd:A
49 4nw5:A 302 25 0.0379 0.0364 0.4400 6.3 5d9k:A, 5d9k:B, 5d9l:A, 4el9:A, 8eq5:A, 4gue:A, 4nus:A, 4nw6:A, 7opo:A, 7opo:C, 7opo:E, 7opo:G, 7opo:I, 7opo:K, 3ubd:A, 8xfy:A, 8xfy:G, 8xfy:H
50 5d9h:B 293 42 0.0448 0.0444 0.3095 6.5 5d9h:A, 5dbx:A, 5dbx:B
51 5y7z:A 312 42 0.0483 0.0449 0.3333 6.8 4c57:A, 4c57:B, 5y7z:B, 5y80:A
52 8r9b:A 301 39 0.0483 0.0465 0.3590 6.9 7b5o:J, 7b5q:J, 8orm:J, 8p4z:A, 8p4z:B, 8p6v:J, 8p6w:J, 8p6x:J, 8p6y:J, 8p6z:J, 8p70:J, 8p71:J, 8p72:J, 8p73:J, 8p74:J, 8p75:J, 8p76:J, 8p77:J, 8p78:J, 8p7l:J, 8plz:J, 8r99:A, 8r9a:A, 8r9b:B, 8r9b:C, 8r9b:D, 8r9o:A, 8r9o:B, 8r9s:A, 8r9s:B, 8r9u:A, 8r9u:B, 1ua2:A, 1ua2:B, 1ua2:C, 1ua2:D, 6xbz:J, 6xd3:J
53 7p6n:H 366 44 0.0448 0.0355 0.2955 7.2 7jnt:D, 7jov:D
54 7xdv:A 283 94 0.0724 0.0742 0.2234 7.9 7xdv:B, 7xdw:A, 7xdw:B, 7xdx:A, 7xdx:B, 7xdy:A, 7xdy:B
55 5wne:B 352 25 0.0379 0.0312 0.4400 9.3

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218