BioLiP

>protein
GKRLFIIKPSGFYDKRFLKLLRFYILLTGIPVVIGITLINVFIGEAELAEIPEGYVPEHWEYFKHPISRWIARTFFDAPE
KNYERTMAILQIESEKAELRLKELEVRRLMRAKGDGPWFQYPTIDKALIDHSPKATPDN

The query sequence (length=139) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7v2d:a	140	139	0.9137	0.9071	0.9137	6.61e-95	5lnk:W, 7r41:h, 7r42:h, 7r44:h, 7r45:h, 7r47:h, 7r48:h, 7r4c:h, 7r4d:h, 7r4g:h, 8ud1:1h, 8ugh:1h, 8ugi:1h, 8ugj:1h, 8ugn:1h, 8ugn:5h, 8ugr:1h, 7v2e:a, 7v2f:a, 7v2h:a, 7v2k:a, 7v2r:a, 7v30:a, 7v31:a, 7v32:a, 7v33:a, 7v3m:a, 7vbl:a, 7vbp:a, 7vc0:a, 7vwl:a, 7vxs:a, 7vy1:a, 7vye:a, 7vyg:a, 7vyi:a, 7vys:a, 7vz8:a, 7vzv:a, 7vzw:a, 7w0h:a, 7w0r:a, 7w0y:a, 7w1o:a, 7w1p:a, 7w1t:a, 7w1u:a, 7w1v:a, 7w1z:a, 7w20:a, 7w2l:a, 7w2r:a, 7w2u:a, 7w2y:a, 7w4c:a, 7w4d:a, 7w4e:a, 7w4f:a, 7w4k:a, 7w4l:a, 7w4m:a, 6zkm:W, 6zkn:W, 6zku:W, 6zkv:W
2	8iaq:h	138	138	0.7914	0.7971	0.7971	6.02e-85	8ib6:h, 8ibb:h, 8ibf:h, 8ic4:h
3	5xtc:a	138	138	0.8129	0.8188	0.8188	1.06e-83	5xtd:a, 5xth:a, 5xti:a, 5xti:Ba
4	1j70:A	512	52	0.1367	0.0371	0.3654	0.11	1g8f:A, 1g8g:A, 1g8g:B, 1g8h:A, 1g8h:B, 1j70:B, 1j70:C, 1jec:A, 1jed:A, 1jed:B, 1jee:A, 1jee:B, 1r6x:A
5	7v2c:m	175	123	0.2446	0.1943	0.2764	0.19	7v2e:m, 7v2h:m, 7v2r:m, 7v33:m, 7vbl:m, 7vc0:m, 7vxs:m, 7vy9:m, 7vys:m, 7vzv:m, 7vzw:m, 7w0r:m, 7w0y:m, 7w1t:m, 7w1v:m, 7w1z:m, 7w20:m, 7w2r:m, 7w2u:m, 7w2y:m, 7w4c:m, 7w4d:m, 7w4e:m, 7w4f:m, 7w4g:m
6	1ct9:A	497	44	0.1151	0.0322	0.3636	0.24	1ct9:B, 1ct9:C, 1ct9:D
7	5lnk:J	175	115	0.2230	0.1771	0.2696	2.1
8	8qlp:E	419	45	0.1079	0.0358	0.3333	2.3	8qlp:A, 8qlp:I, 8qlp:M
9	8isz:B	450	46	0.1007	0.0311	0.3043	3.5	8ifk:A, 8ifl:A, 8ifl:F, 8ifl:J, 8ifl:N, 8ifm:A, 8ifm:F, 8ifm:J, 8ifm:N, 8it0:B, 8it0:F, 8it1:J, 8it1:N, 8it1:B, 8it1:F, 8j8h:B, 8j9g:B, 8j9p:B, 8j9p:D, 8jay:B, 8jay:D, 8jay:J, 8jay:N, 8k9g:B, 8k9g:F, 8u72:B, 8u72:D, 8u72:H, 8u72:F, 8u7b:B
10	8hw1:A	241	48	0.1079	0.0622	0.3125	4.3	8hw1:K, 8hw1:B, 8hw1:C, 8hw1:D, 8hw1:E, 8hw1:F, 8hw1:G, 8hw1:H, 8hw1:I, 8hw1:J
11	7k1n:A	3634	78	0.1367	0.0052	0.2436	4.6	7z88:A
12	7k0y:A	3669	78	0.1367	0.0052	0.2436	4.6
13	1m8p:A	573	44	0.1007	0.0244	0.3182	8.3	1i2d:A, 1i2d:B, 1i2d:C, 1m8p:B, 1m8p:C
14	1duv:G	333	14	0.0791	0.0330	0.7857	9.3	1duv:H, 1duv:I, 2otc:A, 2otc:B, 2otc:C, 2otc:D, 2otc:E, 2otc:F, 2otc:G, 2otc:H, 2otc:I
15	4qrz:A	383	107	0.2086	0.0757	0.2710	9.9	4qsc:A, 4qsd:A

[Back]