BioLiP

>protein
GKQLTILGSTGSIGCSTLDVVRHNPEHFRVVALVAGKNVTRMVEQCLEFSPRYAVMDDEASAKLLKTMLQQQGSRTEVLS
GQQAACDMAALEDVDQVMAAIVGAAGLLPTLAAIRAGKTILLANKESLVTCGRLFMDAVKQSKAQLLPVDSEHNAIFQSL
PQPIQHNLGYADLEQNGVVSILLTGSGGPFRETPLRDLATMTPDQACRHPNWSMGRKISVDSATMMNKGLEYIEARWLFN
ASASQMEVLIHPQSVIHSMVRYQDGSVLAQLGEPDMRTPIAHTMAWPNRVNSGVKPLDFCKLSALTFAAPDYDRYPCLKL
AMEAFEQGQAATTALNAANEITVAAFLAQQIRFTDIAALNLSVLEKMDMREPQCVDDVLSVDANAREVARKEVMRLAS

The query sequence (length=398) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3anl:A	400	398	1.0000	0.9950	1.0000	0.0	3anl:B, 3anm:A, 3anm:B, 3ann:A, 3ann:B, 2egh:A, 2egh:B, 1jvs:A, 1jvs:B, 1ono:A, 1ono:B, 1onp:A, 1onp:B, 1q0h:A, 1q0l:A, 1q0q:A, 1q0q:B, 3r0i:A, 3r0i:B, 1t1r:A, 1t1r:B, 1t1s:A, 1t1s:B
2	5dul:B	390	395	0.7010	0.7154	0.7063	0.0	5dul:A, 5dul:D, 3iie:A, 3iie:B
3	5dul:C	367	394	0.6482	0.7030	0.6548	8.87e-176
4	5kqo:A	398	366	0.5980	0.5980	0.6503	2.30e-164	5kqo:B, 5krr:A, 5krr:B, 5ks1:A, 5ks1:B
5	7s04:A	396	395	0.5126	0.5152	0.5165	1.11e-133
6	1r0l:B	379	385	0.4824	0.5066	0.4987	1.60e-123	1r0l:A, 1r0l:C, 1r0l:D
7	4zqg:A	408	404	0.4673	0.4559	0.4604	3.53e-117	4zqf:A, 4zqf:B, 4zqg:B, 4zqh:A, 4zqh:B
8	6mh5:B	375	381	0.3819	0.4053	0.3990	2.10e-100	6mh5:A
9	8s65:B	411	414	0.4372	0.4234	0.4203	2.85e-94	8s65:A
10	4gae:A	416	381	0.3568	0.3413	0.3727	1.55e-91	3au8:A, 3au8:B, 3au9:A, 3au9:B, 3aua:A, 3aua:B, 4gae:B, 5jaz:A, 5jaz:B, 5jbi:A, 5jbi:B, 5jc1:A, 5jc1:B, 5jmp:A, 5jmp:B, 5jmw:A, 5jmw:B, 5jnl:A, 5jnl:B, 8jnv:A, 8jnv:B, 8jnw:A, 8jnw:B, 5jo0:A, 5jo0:B, 4kp7:A, 4kp7:B, 3wqq:A, 3wqq:B, 3wqr:A, 3wqr:B, 3wqs:B, 4y67:A, 4y67:B, 4y6p:A, 4y6p:B, 4y6r:A, 4y6r:B, 4y6s:A, 4y6s:B
11	4aic:A	379	394	0.3970	0.4169	0.4010	2.52e-77	4a03:A, 4a03:B, 4aic:B, 2c82:A, 2c82:B, 2jcv:A, 2jcv:B, 2jcx:A, 2jcx:B, 2jd0:A, 2jd1:A, 2jd1:B, 2jd2:A, 2jd2:B, 4ooe:A, 4ooe:B, 4ooe:C, 4ooe:D, 4oof:A, 4oof:B, 3ras:A, 3ras:B, 4rcv:A, 4rcv:B, 2y1c:A, 2y1c:B, 2y1d:B, 2y1e:A, 2y1e:B, 2y1f:A, 2y1f:B, 2y1g:A, 2y1g:B, 3zhx:A, 3zhx:B, 3zhy:A, 3zhy:B, 3zhz:A, 3zi0:A, 3zi0:B
12	2y1d:A	359	401	0.3869	0.4290	0.3840	1.57e-67
13	3a06:B	373	399	0.3342	0.3566	0.3333	2.12e-63	3a06:A, 3a14:A, 3a14:B
14	7m1z:B	425	44	0.0477	0.0447	0.4318	0.38	7m1z:A, 7m1z:C, 7m1z:D, 7m3h:A, 7m3h:B, 7m66:A, 7m66:C, 7m66:B, 7m66:D
15	3cd3:A	353	62	0.0452	0.0510	0.2903	2.5
16	3bkb:A	373	62	0.0452	0.0483	0.2903	2.7	3cbl:A, 4e93:A, 6jmf:A, 7t1k:A, 7t1l:A, 7t1l:B
17	4v58:G	2060	123	0.0779	0.0150	0.2520	3.5	4v58:H, 4v58:I, 4v58:J, 4v58:K, 4v58:L, 4v59:G, 4v59:H, 4v59:I, 4v59:J, 4v59:K, 4v59:L
18	1qo8:A	564	63	0.0452	0.0319	0.2857	5.9	1qo8:D
19	3j8g:X	418	79	0.0503	0.0478	0.2532	9.0

[Back]