Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
GKPKILIVGANGQIGSELALALAERYGRTNVITSDVVPTGRHVHLTHEMLNATDRGELATVVERHGITQVYLLAAALSAT
GEKAPQWAWNLNMTSLLNVLELARQTGLERVFWPSSIAAFGPTTPAGQTPQKTVMEPTTVYGISKQAGEGWCRWYHANHG
VDVRSVRYPGLISHKTPPGGGTTDYAVDIFHAAVTGEPYTCFLKEDEALPMMYMPDAIRATIELMEAPADKLSERGSYNI
AGMSFTPAQIAAAIREQVPGFQIRYEPDYRQAIAQGWPDSIDDSVARADWGWKAQYGLKEMVADMLANLK

The query sequence (length=310) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 7eps:A 310 308 0.9645 0.9645 0.9708 0.0 7eps:B, 7eps:C, 7eps:D, 3wmx:A, 3wmx:B, 3wmx:C, 3wmx:D
2 3wmw:B 278 309 0.8968 1.0000 0.8997 0.0 3wmw:A
3 7epr:B 310 309 0.8548 0.8548 0.8576 0.0 7epr:A, 7epr:C, 7epr:D
4 5z75:A 306 303 0.6387 0.6471 0.6535 5.87e-148 5z75:B, 5z75:D
5 7cgv:A 310 306 0.6355 0.6355 0.6438 1.36e-147 7cgv:B, 7cgv:C, 7cgv:D
6 2yy7:A 312 310 0.5710 0.5673 0.5710 2.01e-129 2yy7:B
7 6jyg:D 307 306 0.4742 0.4788 0.4804 3.88e-103 6jyg:A, 6jyg:B, 6jyg:C, 6jyg:E, 6jyg:F
8 3a1n:A 315 307 0.4484 0.4413 0.4528 4.02e-100 3a1n:B, 3a4v:A, 3a4v:B, 3a9w:A, 3a9w:B, 3ajr:A, 3ajr:B
9 5y1f:A 311 310 0.4581 0.4566 0.4581 8.55e-96 5y1e:A, 5y1g:A
10 4yr9:A 308 307 0.4613 0.4643 0.4658 2.77e-84 4yr9:B, 4yr9:C, 4yr9:D, 4yr9:E, 4yr9:F
11 8gjb:A 320 313 0.4419 0.4281 0.4377 5.17e-84 8gjb:B
12 5k4w:C 321 312 0.4161 0.4019 0.4135 1.30e-77 5k4q:A, 5k4q:B, 5k4q:C, 5k4q:D, 5k4q:E, 5k4q:F, 5k4u:A, 5k4u:C, 5k4v:A, 5k4v:C, 5k4w:A, 5k4y:A, 5k4y:B, 5k4y:C, 5k4y:D, 5k4y:E, 5k4y:F, 5k50:A, 5k50:C, 5k50:E, 5k50:G, 5k50:I, 5k50:J, 5lc1:A, 5lc1:B, 5lc1:C, 5lc1:D, 5lc1:E, 5lc1:F
13 4yrb:C 249 306 0.3645 0.4538 0.3693 2.44e-50 4yrb:A, 4yrb:D, 4yrb:E
14 4yrb:B 215 306 0.3194 0.4605 0.3235 5.42e-35 4yrb:F
15 4zrn:A 309 310 0.2516 0.2524 0.2516 3.30e-12 4zrm:A, 4zrm:B, 4zrn:B
16 7yst:A 312 209 0.1806 0.1795 0.2679 3.47e-10 7ys8:A, 7ys8:B, 7ys9:A, 7ys9:B, 7ysa:A, 7ysa:B, 7ysm:A, 7ysm:B, 7yst:B, 7ysy:A, 7ysy:B, 7yt0:A, 7yt0:B
17 3aw9:A 304 291 0.2581 0.2632 0.2749 4.43e-10 3aw9:B, 3aw9:C, 3icp:A, 3ko8:A
18 6wj9:B 308 235 0.1839 0.1851 0.2426 4.79e-09 6wj9:A, 6wja:A, 6wja:B, 6wjb:A, 6wjb:B
19 3sxp:D 314 312 0.2226 0.2197 0.2212 1.48e-08 3sxp:A, 3sxp:B, 3sxp:C, 3sxp:E
20 6zll:A 321 280 0.2226 0.2150 0.2464 1.68e-08 6zl6:A, 6zl6:B, 6zla:A, 6zla:B, 6zla:C, 6zla:D, 6zld:A, 6zld:B, 6zlj:A, 6zlj:B, 6zlk:A, 6zlk:B, 6zlk:C, 6zlk:D, 6zll:B, 6zll:C, 6zll:D
21 2c59:A 364 185 0.1742 0.1484 0.2919 3.48e-08 2c54:A, 2c54:B, 2c59:B, 2c5a:A, 2c5a:B, 2c5e:A, 2c5e:B, 8sg0:A, 8sg0:B, 8skb:A, 8skb:B, 8skb:C, 8skb:D
22 2c20:A 329 180 0.1516 0.1429 0.2611 9.25e-07 2c20:B, 2c20:C, 2c20:D, 2c20:E, 2c20:F
23 6dnt:A 310 264 0.1935 0.1935 0.2273 2.00e-06
24 8vr2:B 321 306 0.2419 0.2336 0.2451 9.80e-06 8vr2:A, 8vr2:C, 8vr2:D
25 2ggs:A 273 293 0.2290 0.2601 0.2423 5.13e-05 2ggs:B
26 3ehe:A 290 183 0.1387 0.1483 0.2350 5.98e-05 3ehe:B
27 1bsv:A 317 171 0.1452 0.1420 0.2632 2.20e-04 1bws:A, 1e6u:A, 1e7q:A, 1e7r:A, 1e7s:A, 1fxs:A
28 3lu1:A 336 159 0.1097 0.1012 0.2138 8.08e-04 3lu1:B, 3lu1:C, 3lu1:D, 3ru7:A, 3ru7:B, 3ru7:C, 3ru7:D, 3ru9:A, 3ru9:B, 3ru9:C, 3ru9:D, 3rua:A, 3rua:B, 3rua:C, 3rua:D, 3ruc:A, 3ruc:B, 3ruc:C, 3ruc:D, 3rud:A, 3rud:B, 3rud:C, 3rud:D, 3rue:A, 3rue:B, 3rue:S, 3rue:b, 3ruf:A, 3ruf:B, 3ruf:S, 3ruf:b, 3ruh:A, 3ruh:B, 3ruh:C, 3ruh:D
29 7xpo:A 344 166 0.1323 0.1192 0.2470 0.002 7xpo:B, 7xpp:B, 7xpp:A, 7xpq:A, 7xpq:B
30 3sc6:D 283 164 0.1355 0.1484 0.2561 0.002 3sc6:A, 3sc6:B, 3sc6:C, 3sc6:E, 3sc6:F
31 1i3k:A 347 138 0.1161 0.1037 0.2609 0.002 1ek5:A, 1ek6:A, 1ek6:B, 1hzj:A, 1hzj:B, 1i3k:B, 1i3l:A, 1i3l:B, 1i3m:A, 1i3m:B, 1i3n:A, 1i3n:B
32 5uzh:A 345 159 0.1452 0.1304 0.2830 0.003
33 6vo6:D 311 319 0.2194 0.2186 0.2132 0.003 6vo6:A, 6vo6:B, 6vo6:C, 6vo8:A, 6vo8:B
34 1sb8:A 341 183 0.1226 0.1114 0.2077 0.004 1sb9:A
35 8v4h:B 342 332 0.2226 0.2018 0.2078 0.004 8v4g:A, 8v4g:B, 8v4h:A
36 6pnl:A 336 227 0.1452 0.1339 0.1982 0.008 6pmh:A
37 1r66:A 322 141 0.1226 0.1180 0.2695 0.009 1r6d:A
38 2p5u:A 311 265 0.2194 0.2186 0.2566 0.021 2p5u:B, 2p5u:C, 2p5u:D, 2p5y:A
39 2pzm:A 316 323 0.2516 0.2468 0.2415 0.024 2pzk:A, 2pzk:B, 2pzl:A, 2pzl:B, 2pzm:B
40 4lis:A 364 160 0.1290 0.1099 0.2500 0.027 4lis:B, 4lis:C
41 3rfv:A 265 76 0.0742 0.0868 0.3026 0.032 3rfv:B, 3rfv:C, 3rfx:A, 3rfx:B, 3rfx:C
42 6kv9:A 299 311 0.2452 0.2542 0.2444 0.038 6kvc:A
43 8fem:A 327 168 0.1516 0.1437 0.2798 0.043 8fen:A
44 2pk3:A 309 193 0.1613 0.1618 0.2591 0.048 2pk3:B
45 4twr:A 325 171 0.1323 0.1262 0.2398 0.048 4wok:A
46 8du0:A 286 152 0.1161 0.1259 0.2368 0.051 7ll6:A
47 3ps9:A 668 66 0.0742 0.0344 0.3485 0.069 3awi:A, 3awi:B, 3awi:C, 3awi:D, 3awi:E, 3awi:F
48 3enk:A 340 166 0.1516 0.1382 0.2831 0.074 3enk:B
49 3m2p:B 255 171 0.1129 0.1373 0.2047 0.18
50 8br8:SH 184 86 0.0645 0.1087 0.2326 0.85 8brm:SH, 8bsi:SH, 8bsj:SH, 8btd:SH, 8btr:SH, 8fvy:H, 8g4s:H
51 6bi4:C 311 172 0.1129 0.1125 0.2035 1.4 6bi4:B, 6bi4:D, 6bi4:A
52 1bxk:B 344 81 0.0774 0.0698 0.2963 1.9 1bxk:A
53 8gym:a9 340 49 0.0548 0.0500 0.3469 2.5 8b6f:A1, 8bqs:A1, 8gym:A9, 8gzu:a9, 8gzu:A9, 7tgh:A9
54 1zq1:A 437 103 0.1032 0.0732 0.3107 2.9 1zq1:B
55 6vxe:A 789 39 0.0484 0.0190 0.3846 2.9 6vxe:B, 6vxe:C, 6vxe:D, 6vxe:E, 6vxe:F, 6vxe:G, 6vxe:H
56 6vlo:A 319 166 0.1129 0.1097 0.2108 3.4 6vlo:B, 6vlo:C, 6vlo:D
57 1vl0:A 281 33 0.0516 0.0569 0.4848 3.7 1vl0:B, 1vl0:C
58 2hun:A 329 176 0.1290 0.1216 0.2273 4.7 2hun:B
59 5yjy:B 465 94 0.0774 0.0516 0.2553 4.8 5yjw:A, 5yjx:A, 5yjx:B, 5yjy:A
60 7x5r:A 386 49 0.0516 0.0415 0.3265 5.6 7cjk:A, 7cqr:A, 7cqs:A, 7e0x:A, 7ezq:A, 8gwd:A, 8h6a:A, 8h6b:A, 8how:A, 8hwr:A, 8hx2:A, 8hx4:A, 8hxf:A, 8hxg:A, 8hxh:A, 8hym:A, 8hyo:A, 8hyp:A, 8hys:A, 8hz6:A, 8hz7:A, 8hz9:A, 8hza:A, 8hzu:A, 8i0g:A, 8i0y:A, 8i15:A, 8i2p:A, 8i2s:A, 8i2u:A, 8i36:A, 8iok:A, 6isd:A, 6isd:B, 8j3c:A, 6j63:A, 6j63:B, 6j63:C, 6j63:D, 8j8w:A, 8j8x:A, 6jx9:A, 6lgt:A, 6m6d:A, 1sp9:B, 1sqd:A, 1tfz:A, 1tg5:A, 7v6x:A, 7vc8:A, 7vo8:A, 8who:A, 8whp:A, 8whq:A, 8wi6:A, 7wj8:A, 7wjj:A, 7wjk:A, 8wqm:A, 7x5s:A, 7x5u:A, 7x5w:A, 7x5x:A, 7x5y:A, 7x5z:A, 7x62:A, 7x64:A, 7x67:A, 7x69:A, 7x6m:A, 7x6n:A, 7x8d:A, 7x8h:A, 7x8i:A, 5xgk:B, 5xgk:C, 5xgk:D, 7xvh:A, 5ywg:A, 5ywg:B, 5ywh:A, 5ywh:B, 5ywi:A, 5ywk:A, 5ywk:B, 5yy6:A, 5yy7:A, 5yy7:B
61 7dn3:B 1044 79 0.0742 0.0220 0.2911 5.8 7du2:B
62 8qve:A 495 34 0.0516 0.0323 0.4706 8.6
63 5l3z:A 280 22 0.0419 0.0464 0.5909 9.2 5l4l:A
64 7lzh:A 798 52 0.0581 0.0226 0.3462 9.3 7lzh:B, 7lzh:C, 7lzh:D, 7lzi:A, 7lzi:B, 7lzi:C, 7lzi:D

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218