Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GKLADCQERDPALSELYLVEGDSAGGSAKQGRNRKNQAILPLKGKILNVEKARFDKMLSSQEVATLITALGCGIGRDEYN
PDKLRYHSIIIMTDADVDGSHIRTLLLTFFYRQMPEIVERGHVYIAQPPLYKVKKGKQEQYIKDDEAMDQYQISIALDGA
TLHTNASAPALAGEALEKLVSEYNATQKMINRMERRYPKAMLKELIYQPTLTEADLSDEQTVTRWVNALVSELNDKEQHG
SQWKFDVHTNAEQNLFEPIVRVRTHGVDTDYPLDHEFITGGEYRRICTLGEKLRGLLEEDAFIERGERRQPVASFEQALD
WLVKESRRGLSIQRYKGLGEMNPEQLWETTMDPESRRMLRVTVKDAIAADQLFTTLMGDAVEPRRAFIEENALKAANIDI
EN

The query sequence (length=402) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 9gbv:B 782 402 1.0000 0.5141 1.0000 0.0 1aj6:A, 7c7n:A, 7c7o:A, 7dor:A, 7dor:B, 7dpr:A, 7dpr:B, 7dps:A, 7dps:B, 7dqf:A, 7dqf:B, 7dqh:A, 7dqh:B, 7dqi:A, 7dqi:B, 7dqj:A, 7dqj:B, 7dql:A, 7dql:B, 7dqm:A, 7dqm:B, 7dqs:A, 7dqs:B, 7dqu:A, 7dqu:B, 7dqw:A, 7dqw:B, 4duh:A, 4duh:B, 1ei1:A, 1ei1:B, 6eng:A, 6eng:B, 6f86:A, 6f8j:A, 6f94:A, 6f96:A, 3g7e:A, 9gbv:D, 9ggq:D, 9ggq:B, 4hyp:A, 4hyp:B, 4hyp:C, 4hyp:D, 6j90:A, 4kfg:A, 4kfg:B, 1kzn:A, 6kzv:A, 6kzx:A, 6kzz:A, 6l01:A, 5l3j:A, 5mmn:A, 5mmo:A, 5mmp:A, 7p2m:A, 7p2n:A, 7p2w:A, 7p2x:A, 4prv:A, 4prx:A, 4pu9:A, 8qdx:B, 8qdx:D, 8qqi:D, 8qqi:B, 8qqs:B, 8qqs:D, 8qqu:D, 6rku:D, 6rku:B, 6rkv:D, 6rkv:B, 6rkw:D, 6rkw:B, 4wub:A, 4wuc:A, 4wud:A, 4xtj:A, 6yd9:A, 5z4h:A, 5z4h:B, 5z4o:A, 5z4o:B, 5z9b:A, 5z9b:B, 5z9e:A, 5z9e:B, 5z9f:A, 5z9f:B, 5z9l:A, 5z9l:B, 5z9m:A, 5z9m:B, 5z9n:A, 5z9q:A, 5z9q:B, 7z9c:D, 7z9c:B, 7z9g:D, 7z9g:B, 7z9k:B, 7z9k:D, 7z9m:B, 7z9m:D, 4zvi:A, 5zxm:A, 5zxm:B
2 6rks:D 200 152 0.3582 0.7200 0.9474 9.90e-99 6rks:B
3 6rks:D 200 54 0.1343 0.2700 1.0000 1.56e-30 6rks:B
4 2xcr:D 719 152 0.2313 0.1293 0.6118 2.79e-58 8bp2:AAA, 8bp2:CCC, 5cdm:A, 5cdm:C, 5cdn:C, 5cdn:A, 5cdn:T, 5cdn:R, 5cdo:A, 5cdo:C, 5cdo:R, 5cdo:T, 5cdp:A, 5cdp:C, 5cdq:A, 5cdq:C, 5cdq:R, 5cdq:T, 5cdr:A, 5cdr:C, 6fqm:A, 6fqm:C, 6fqm:a, 6fqm:c, 6fqs:A, 6fqs:C, 6fqv:A, 6fqv:C, 6fqv:R, 6fqv:T, 5iwi:A, 5iwi:C, 5iwm:A, 5iwm:C, 6qtk:A, 6qtk:C, 6qtp:A, 6qtp:C, 6qx1:A, 6qx1:C, 6qx2:A, 6qx2:C, 6qx2:J, 6qx2:L, 6qx2:R, 6qx2:T, 6qx2:a, 6qx2:c, 6qx2:j, 6qx2:l, 6qx2:r, 6qx2:t, 2xcr:B, 2xcr:S, 2xcr:U
5 2xcr:D 719 70 0.1144 0.0640 0.6571 1.00e-20 8bp2:AAA, 8bp2:CCC, 5cdm:A, 5cdm:C, 5cdn:C, 5cdn:A, 5cdn:T, 5cdn:R, 5cdo:A, 5cdo:C, 5cdo:R, 5cdo:T, 5cdp:A, 5cdp:C, 5cdq:A, 5cdq:C, 5cdq:R, 5cdq:T, 5cdr:A, 5cdr:C, 6fqm:A, 6fqm:C, 6fqm:a, 6fqm:c, 6fqs:A, 6fqs:C, 6fqv:A, 6fqv:C, 6fqv:R, 6fqv:T, 5iwi:A, 5iwi:C, 5iwm:A, 5iwm:C, 6qtk:A, 6qtk:C, 6qtp:A, 6qtp:C, 6qx1:A, 6qx1:C, 6qx2:A, 6qx2:C, 6qx2:J, 6qx2:L, 6qx2:R, 6qx2:T, 6qx2:a, 6qx2:c, 6qx2:j, 6qx2:l, 6qx2:r, 6qx2:t, 2xcr:B, 2xcr:S, 2xcr:U
6 4z2c:C 198 130 0.2065 0.4192 0.6385 3.20e-54 4z2c:D, 4z2d:D, 4z2d:C, 4z2e:D, 4z2e:C
7 4z2c:C 198 56 0.0970 0.1970 0.6964 1.22e-18 4z2c:D, 4z2d:D, 4z2d:C, 4z2e:D, 4z2e:C
8 7mvs:B 675 128 0.2065 0.1230 0.6484 4.90e-50 8bp2:BBB, 8bp2:DDD, 5bs3:B, 5bs3:D, 4bul:A, 4bul:C, 5cdm:B, 5cdm:D, 5cdn:D, 5cdn:B, 5cdn:U, 5cdn:S, 5cdo:B, 5cdo:D, 5cdo:S, 5cdo:U, 5cdp:B, 5cdp:D, 5cdq:B, 5cdq:D, 5cdq:S, 5cdq:U, 5cdr:B, 5cdr:D, 6fm4:B, 6fm4:D, 6fqm:D, 6fqs:B, 6fqs:D, 6fqv:B, 6fqv:D, 6fqv:S, 6fqv:U, 7fvs:A, 7fvs:B, 7fvt:A, 7fvt:B, 5iwi:B, 5iwi:D, 5iwm:B, 5iwm:D, 7mvs:A, 5npk:B, 5npk:D, 5npk:b, 5npk:d, 5npp:B, 5npp:D, 4plb:B, 4plb:D, 6qtk:B, 6qtk:D, 6qtp:B, 6qtp:D, 6qx1:B, 6qx1:D, 6qx2:B, 6qx2:D, 6qx2:K, 6qx2:M, 6qx2:S, 6qx2:U, 6qx2:b, 6qx2:d, 6qx2:k, 6qx2:m, 6qx2:s, 6qx2:u, 2xcs:B, 2xcs:D, 2xct:B, 2xct:D, 2xct:S, 2xct:U, 6z1a:B, 6z1a:D
9 7mvs:B 675 61 0.1020 0.0607 0.6721 6.86e-19 8bp2:BBB, 8bp2:DDD, 5bs3:B, 5bs3:D, 4bul:A, 4bul:C, 5cdm:B, 5cdm:D, 5cdn:D, 5cdn:B, 5cdn:U, 5cdn:S, 5cdo:B, 5cdo:D, 5cdo:S, 5cdo:U, 5cdp:B, 5cdp:D, 5cdq:B, 5cdq:D, 5cdq:S, 5cdq:U, 5cdr:B, 5cdr:D, 6fm4:B, 6fm4:D, 6fqm:D, 6fqs:B, 6fqs:D, 6fqv:B, 6fqv:D, 6fqv:S, 6fqv:U, 7fvs:A, 7fvs:B, 7fvt:A, 7fvt:B, 5iwi:B, 5iwi:D, 5iwm:B, 5iwm:D, 7mvs:A, 5npk:B, 5npk:D, 5npk:b, 5npk:d, 5npp:B, 5npp:D, 4plb:B, 4plb:D, 6qtk:B, 6qtk:D, 6qtp:B, 6qtp:D, 6qx1:B, 6qx1:D, 6qx2:B, 6qx2:D, 6qx2:K, 6qx2:M, 6qx2:S, 6qx2:U, 6qx2:b, 6qx2:d, 6qx2:k, 6qx2:m, 6qx2:s, 6qx2:u, 2xcs:B, 2xcs:D, 2xct:B, 2xct:D, 2xct:S, 2xct:U, 6z1a:B, 6z1a:D
10 8c41:A 720 136 0.2065 0.1153 0.6103 1.92e-48 8c41:B
11 8c41:A 720 74 0.1020 0.0569 0.5541 1.17e-19 8c41:B
12 4i3h:A 1037 136 0.2065 0.0800 0.6103 3.64e-48 3foe:D, 3foe:C, 3fof:C, 3fof:D, 4i3h:B, 4juo:A, 4juo:C, 3k9f:A, 3k9f:C, 3k9f:D, 3k9f:B, 4koe:A, 4koe:C, 4koe:D, 4koe:B, 4kpe:A, 4kpe:C, 4kpe:D, 4kpe:B, 4kpf:A, 4kpf:C, 4kpf:D, 4kpf:B, 3ksa:A, 3ksa:C, 3ksa:D, 3ksa:B, 3ksb:A, 3ksb:B, 3ksb:C, 3ksb:D, 3ltn:A, 3ltn:C, 3ltn:D, 3ltn:B, 3rad:A, 3rad:C, 3rad:D, 3rad:B, 3rae:A, 3rae:C, 3rae:D, 3rae:B, 3raf:A, 3raf:C, 3raf:D, 3raf:B, 4z3o:B, 4z3o:A, 4z4q:A, 4z4q:B, 4z53:A, 4z53:B
13 4i3h:A 1037 63 0.0945 0.0366 0.6032 2.38e-18 3foe:D, 3foe:C, 3fof:C, 3fof:D, 4i3h:B, 4juo:A, 4juo:C, 3k9f:A, 3k9f:C, 3k9f:D, 3k9f:B, 4koe:A, 4koe:C, 4koe:D, 4koe:B, 4kpe:A, 4kpe:C, 4kpe:D, 4kpe:B, 4kpf:A, 4kpf:C, 4kpf:D, 4kpf:B, 3ksa:A, 3ksa:C, 3ksa:D, 3ksa:B, 3ksb:A, 3ksb:B, 3ksb:C, 3ksb:D, 3ltn:A, 3ltn:C, 3ltn:D, 3ltn:B, 3rad:A, 3rad:C, 3rad:D, 3rad:B, 3rae:A, 3rae:C, 3rae:D, 3rae:B, 3raf:A, 3raf:C, 3raf:D, 3raf:B, 4z3o:B, 4z3o:A, 4z4q:A, 4z4q:B, 4z53:A, 4z53:B
14 2xco:A 636 152 0.2090 0.1321 0.5526 4.51e-48
15 2xco:A 636 31 0.0572 0.0362 0.7419 8.96e-08
16 6gau:A 1088 134 0.2164 0.0800 0.6493 8.41e-47 5bs8:A, 5bs8:B, 5bs8:C, 5bs8:D, 5bta:A, 5bta:B, 5bta:C, 5bta:D, 5btc:A, 5btc:B, 5btc:C, 5btc:D, 5btd:A, 5btd:B, 5btd:C, 5btd:D, 5btf:A, 5btf:B, 5btf:C, 5btf:D, 5btg:A, 5btg:B, 5btg:C, 5btg:D, 5bti:A, 5bti:B, 5bti:C, 5bti:D, 5btl:A, 5btl:B, 5btl:C, 5btl:D, 5btn:A, 5btn:B, 5btn:C, 5btn:D, 9foy:A, 9foy:B, 6gau:B, 7ugw:A, 7ugw:B, 7ugw:C, 7ugw:D
17 6gau:A 1088 70 0.1045 0.0386 0.6000 6.30e-18 5bs8:A, 5bs8:B, 5bs8:C, 5bs8:D, 5bta:A, 5bta:B, 5bta:C, 5bta:D, 5btc:A, 5btc:B, 5btc:C, 5btc:D, 5btd:A, 5btd:B, 5btd:C, 5btd:D, 5btf:A, 5btf:B, 5btf:C, 5btf:D, 5btg:A, 5btg:B, 5btg:C, 5btg:D, 5bti:A, 5bti:B, 5bti:C, 5bti:D, 5btl:A, 5btl:B, 5btl:C, 5btl:D, 5btn:A, 5btn:B, 5btn:C, 5btn:D, 9foy:A, 9foy:B, 6gau:B, 7ugw:A, 7ugw:B, 7ugw:C, 7ugw:D
18 6fqm:b 160 126 0.1816 0.4562 0.5794 2.12e-43 6fqm:B, 6fqm:d
19 6fqm:b 160 55 0.0721 0.1812 0.5273 1.81e-08 6fqm:B, 6fqm:d
20 2xkk:C 711 149 0.1816 0.1027 0.4899 1.94e-39 2xkk:A
21 2xkk:C 711 47 0.0572 0.0323 0.4894 6.24e-06 2xkk:A
22 7lhz:C 714 141 0.1841 0.1036 0.5248 2.40e-38 5eix:A, 5eix:B, 7lhz:A, 6waa:B, 6waa:F
23 7lhz:C 714 68 0.0697 0.0392 0.4118 1.84e-07 5eix:A, 5eix:B, 7lhz:A, 6waa:B, 6waa:F
24 7lhz:B 631 139 0.1866 0.1189 0.5396 4.94e-37
25 7lhz:B 631 89 0.0846 0.0539 0.3820 2.32e-07
26 6waa:H 656 133 0.1791 0.1098 0.5414 8.61e-37 6waa:D
27 6waa:H 656 63 0.0672 0.0412 0.4286 2.39e-06 6waa:D
28 5eix:J 679 133 0.1791 0.1060 0.5414 8.75e-37 5eix:G, 7lhz:D
29 5eix:J 679 73 0.0746 0.0442 0.4110 3.93e-07 5eix:G, 7lhz:D
30 7yq8:A 730 146 0.1244 0.0685 0.3425 8.95e-17 7yq8:B, 5zad:A, 5zad:B, 5zen:A, 5zqf:A
31 6zy7:B 1160 141 0.1269 0.0440 0.3617 9.34e-17 4fm9:A, 5gwk:A, 5gwk:B, 4r1f:B, 4r1f:C, 4r1f:D, 1zxm:A, 1zxm:B, 1zxn:B, 1zxn:C, 1zxn:D, 6zy5:B, 6zy5:A, 6zy6:A, 6zy6:B, 6zy7:A, 6zy8:A, 6zy8:B
32 5gwj:A 677 132 0.1119 0.0665 0.3409 9.39e-15 4g0u:A, 4g0u:B, 4g0v:A, 4g0v:B, 4g0w:A, 4g0w:B, 5gwi:A, 5gwi:B, 5gwj:B, 4j3n:A, 4j3n:B, 3qx3:A, 3qx3:B, 5zrf:A, 5zrf:B
33 8yon:C 605 132 0.1144 0.0760 0.3485 1.05e-13 9imj:A, 8ylu:C, 8ylu:D, 8yo1:C, 8yo1:D, 8yo7:D, 8yo7:C, 8yod:C, 8yod:D, 8yon:D
34 8gcc:A 707 124 0.0995 0.0566 0.3226 3.48e-12 8gcc:B
35 4gfh:A 1102 122 0.1045 0.0381 0.3443 1.63e-11 4gfh:F, 3l4j:A, 3l4k:A, 1pvg:A, 1pvg:B, 1qzr:A, 1qzr:B, 2rgr:A
36 8yo4:C 284 60 0.0522 0.0739 0.3500 0.001 5np6:C, 8yo4:D
37 8yo4:C 284 68 0.0522 0.0739 0.3088 0.005 5np6:C, 8yo4:D
38 8kgn:A 1190 161 0.1144 0.0387 0.2857 0.002 8j9v:A, 8j9v:B, 8j9w:B, 8j9w:A, 8j9x:A, 8j9x:B, 8ja1:A, 8ja2:A, 8kgm:A, 8kgm:B, 8kgn:B, 8kgq:A, 8kgq:B, 8kgr:A, 8kgr:B, 8kgs:A, 8kgt:A, 8wwo:A, 8wwo:B, 8wwo:C, 8wwo:D, 8xrf:A, 8xrf:B, 8xrg:A, 8xrh:A, 8xri:A, 8xri:B, 8yge:A, 8yge:B
39 8wq5:A 99 47 0.0498 0.2020 0.4255 0.21 8wq5:B, 8wq5:C, 8wq5:D
40 4kho:A 268 86 0.0697 0.1045 0.3256 0.26 4kho:B
41 2j0k:A 598 124 0.0920 0.0619 0.2984 0.53 4gu9:A, 4kab:A, 4kao:A, 1mp8:A, 4q9s:A
42 6ty4:A 621 124 0.0920 0.0596 0.2984 0.61 4brx:A, 3bz3:A, 4c7t:A, 4d4s:B, 4d4v:B, 4d58:B, 4d5h:A, 4ebv:A, 4ebw:A, 2etm:A, 2etm:B, 6gcr:A, 6gcw:A, 6gcw:B, 6gcx:A, 4gu6:A, 4gu6:B, 4gu9:B, 4i4e:A, 4i4f:A, 6i8z:A, 2ijm:A, 2ijm:B, 2j0j:A, 2j0k:B, 2j0l:A, 2j0m:B, 2jkk:A, 2jkm:A, 2jko:A, 2jkq:A, 4k8a:A, 4k8a:B, 4k9y:A, 4kab:B, 4kao:B, 7pi4:DDD, 3pxk:A, 3pxk:B, 6ty4:B, 6yoj:A, 6yq1:A, 6yq1:B, 6yq1:C, 6yq1:D, 6yr9:A, 6yr9:B, 6yr9:C, 6yr9:D, 6yt6:A, 6yt6:B, 6yvs:A, 6yvs:B, 6yvs:C, 6yvs:D, 6yvy:A, 6yvy:B, 6yvy:C, 6yvy:D, 6yxv:A, 6yxv:B, 6yxv:C, 6yxv:D
43 7v9x:A 314 70 0.0448 0.0573 0.2571 3.3 8qbk:A, 8qbk:U, 8qbk:K, 8qbk:P, 8qbl:A, 8qbl:K, 8qbl:P, 8qbl:I, 8qbl:U, 8qbl:Z, 8qbm:A, 8qbm:K, 8qbm:I, 8qbm:P, 8qbm:U, 8qbm:Z, 7v9u:A, 7v9u:B, 7v9x:B, 7xjg:A, 7xjg:B
44 5wzk:A 513 105 0.0572 0.0448 0.2190 8.3
45 5vx6:A 209 50 0.0398 0.0766 0.3200 8.3 5vx6:B
46 7t7t:A 466 52 0.0373 0.0322 0.2885 8.3 7t7t:B
47 5wzg:A 534 105 0.0572 0.0431 0.2190 9.0 5wzh:A, 5wzi:A, 5wzj:A
48 4n8g:A 325 53 0.0423 0.0523 0.3208 9.5 4n8g:B, 4n8g:C, 4n8g:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218