BioLiP

>protein
GKKPVKVKTPAGKEAELVPEKVWALAPKGRKGVKIGLFKDPETGKYFRHKLPDDYPI

The query sequence (length=57) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5k17:A	59	57	1.0000	0.9661	1.0000	1.93e-35	6a2h:A, 6a2i:A, 6a2i:B, 5k07:A, 5k17:B, 3kxt:A, 3lwh:A, 3lwi:A, 3lwi:B, 4r55:A, 4r56:A, 4r56:B, 5wvw:A, 5wvw:B, 5wvy:A, 5wvy:B, 5wvz:A, 5wvz:B, 5wwc:A, 5wwc:B
2	7lqy:A	659	26	0.2105	0.0182	0.4615	1.9	8gf8:A, 8gf8:B, 8gf8:C, 8gf8:D, 8gf9:A, 8gf9:B, 8gf9:C, 8gf9:D, 8gfa:A, 8gfa:B, 8gfa:C, 8gfa:D, 8jqr:A, 8jqr:B, 8jqr:C, 8jqr:D, 7l2h:A, 7l2h:D, 7l2h:B, 7l2h:C, 7l2i:A, 7l2i:C, 7l2i:D, 7l2i:B, 7l2j:A, 7l2j:B, 7l2j:C, 7l2j:D, 7l2p:A, 7l2p:B, 7l2p:D, 7l2p:C, 7l2r:A, 7l2r:B, 7l2r:C, 7l2r:D, 7l2s:D, 7l2s:A, 7l2s:B, 7l2s:C, 7l2t:A, 7l2t:D, 7l2t:B, 7l2t:C, 7l2u:A, 7l2u:B, 7l2u:D, 7l2u:C, 7l2v:A, 7l2v:D, 7l2v:B, 7l2v:C, 7l2w:A, 7l2w:D, 7l2w:B, 7l2w:C, 7l2x:A, 7l2x:D, 7l2x:B, 7l2x:C, 7lp9:A, 7lp9:B, 7lp9:C, 7lp9:D, 7lqy:B, 7lqy:C, 7lqy:D, 7lqz:A, 7lqz:B, 7lqz:C, 7lqz:D, 7lr0:A, 7lr0:B, 7lr0:C, 7lr0:D, 7mz6:A, 7mz6:B, 7mz6:D, 7mz6:C, 7mz7:A, 7mz7:D, 7mz7:B, 7mz7:C, 7mz9:A, 7mz9:D, 7mz9:C, 7mz9:B, 7mza:A, 7mza:D, 7mza:B, 7mza:C, 7mzb:A, 7mzb:D, 7mzb:B, 7mzb:C, 7mzc:A, 7mzc:D, 7mzc:C, 7mzc:B, 7mzd:A, 7mzd:D, 7mzd:B, 7mzd:C, 7mze:A, 7mze:D, 7mze:B, 7mze:C, 2nyj:A, 2pnn:A, 7rqw:A, 7rqw:C, 7rqw:D, 7rqw:B, 7rqy:A, 7rqy:C, 7rqy:B, 7rqy:D, 7rqz:A, 7rqz:C, 7rqz:B, 7rqz:D, 8t0c:A, 8t0c:D, 8t0c:B, 8t0c:C, 8t0e:A, 8t0e:D, 8t0e:B, 8t0e:C, 8u30:A, 8u30:D, 8u30:B, 8u30:C, 8u3a:D, 8u3c:D, 8u43:A, 8u43:B, 8u43:C, 8u43:D, 8u4d:A, 8u4d:D, 8u4d:C, 8u4d:B, 8x94:A, 8x94:B, 8x94:C, 8x94:D
3	2b1q:A	244	67	0.3158	0.0738	0.2687	2.7	2b1r:A, 2d2v:A, 1s2o:A, 1tj3:A, 1tj4:A, 1tj5:A, 1u2s:A, 1u2t:A
4	3a4z:A	402	17	0.1579	0.0224	0.5294	3.1	3a4g:A, 3a4h:A, 3a4z:B, 3a4z:C, 3a4z:D, 3a4z:E, 3a50:A, 3a50:B, 3a50:C, 3a50:D, 3a50:E, 3a51:A, 3a51:B, 3a51:C, 3a51:D, 3a51:E, 5gnl:A, 5gnm:A, 5gnm:B, 5gnm:C, 5gnm:D, 3vrm:A
5	6oq5:A	2346	23	0.1930	0.0047	0.4783	3.4	6oq7:A, 7s0z:B, 7s0z:A
6	8qen:A	2363	23	0.1930	0.0047	0.4783	3.4	9bja:A, 9bja:B, 2bvl:A, 2bvm:A, 6c0b:A, 7lou:A, 7lou:B, 7lov:A, 7lov:B, 3pa8:A, 3pa8:B, 3pee:B, 3pee:A, 7s0y:A, 5uqm:A, 5uqn:A, 5uqt:A, 5uqt:B
7	1ja9:A	259	35	0.2281	0.0502	0.3714	3.5
8	8fgw:B	1152	42	0.2807	0.0139	0.3810	3.5	8fh3:B
9	8x2i:A	2303	33	0.1754	0.0043	0.3030	3.8
10	8x2h:A	2363	33	0.1754	0.0042	0.3030	3.8	8jb5:A, 2vkd:A, 2vkd:B, 2vkd:C, 2vkh:A, 2vkh:B, 2vkh:C, 2vl8:A, 2vl8:B, 2vl8:C
11	8v05:A	426	32	0.2105	0.0282	0.3750	4.2	8q1k:A, 8q1k:B, 8q1x:A, 8q1x:B, 8v06:B, 8v07:C, 8v07:B
12	8p5d:LH0	183	24	0.1930	0.0601	0.4583	4.7	8p60:LH0, 8p60:KH0, 7qca:LH0
13	1w3h:A	348	38	0.1930	0.0316	0.2895	5.0	1clx:A, 1clx:B, 1clx:C, 1clx:D, 1e5n:A, 1e5n:B, 1w2p:A, 1w2p:B, 1w2v:A, 1w2v:B, 1w32:A, 1w32:B, 1w3h:B
14	8c3a:F	223	33	0.1930	0.0493	0.3333	5.5	8c3a:CQ, 8cq7:F, 8cq7:CQ, 8cqw:F, 8cqw:CQ, 8cre:F, 8cre:CQ, 8oeq:F, 8oeq:CQ, 7pzy:E, 7q08:E, 7q0f:E, 7q0p:E, 7q0r:E, 8q5i:E
15	6ncg:B	287	37	0.2105	0.0418	0.3243	5.9
16	5uu1:A	315	37	0.2105	0.0381	0.3243	6.3	9fet:A, 6ncg:A, 8q1z:A
17	1awd:A	94	31	0.1754	0.1064	0.3226	7.3
18	1fay:A	236	22	0.1579	0.0381	0.4091	8.2	1f9k:A, 1f9k:B, 1fay:B, 1fay:C, 1fay:D, 1fay:E, 1fay:F, 1fay:G, 1fay:H
19	2i1o:A	389	34	0.1930	0.0283	0.3235	8.3	1yte:A, 1ytk:A
20	6nb3:A	1169	25	0.1754	0.0086	0.4000	9.1	5gmq:A, 6j11:A, 6j11:B, 6j11:C, 7m5e:C, 7m5e:E, 7m5e:A, 6nb4:A, 6pxh:A, 6pxh:B, 6q04:C, 6q04:A, 6q04:B, 6q05:C, 6q05:A, 6q05:B, 6q06:C, 6q06:A, 6q06:B, 6q07:C, 6q07:A, 6q07:B, 7ymt:B, 7ymt:C, 7ymv:A, 7ymv:B, 7ymy:B, 7ymz:B, 7yn0:A, 7yn0:B, 7yn0:C
21	2x5f:A	428	27	0.1930	0.0257	0.4074	10.0	2x5f:B

[Back]