BioLiP

>protein
GKAMLNLLFSPRATKPSALSRAVKVFETFEAKIHHLETRPAQRPRAGGPHLEYFVRLEVRRGDLAALLSGVRQVSEDVRS
PAGPKVPWFPRKVSELDKCHHLVTKFDPDLDLDHPGFSDQVYRQRRKLIAEIAFQYRHGDPIPRVEYTAEEIATWKEVYT
TLKGLYATHACGEHLEAFALLERFSGYREDNIPQLEDVSRFLKERTGFQLRPVAGLLSARDFLASLAFRVFQCTQYIRHA
SSPMHSPEPDCCHELLGHVPMLADRTFAQFSQDIGLASLGASDEEIEKLSTLYWFTVEFGLCKQNGEVKAYGAGLLSSYG
ELLHCLSEEPEIRAFDPEAAAVQPYQDQTYQSVYFVSESFSDAKDKLRSYASRIQRPFSVKFDPYTLAIDVLDSPQAVRR
SLEGVQDELDTLAHALSAIG

The query sequence (length=420) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6zvp:D	458	420	1.0000	0.9170	1.0000	0.0	7a2g:A, 7a2g:B, 7a2g:C, 7a2g:D, 7pim:B, 7pim:A, 7pim:D, 7pim:F, 1toh:A, 2toh:A, 2xsn:A, 2xsn:B, 2xsn:C, 2xsn:D, 6zn2:A, 6zn2:C, 6zn2:E, 6zn2:G, 6zvp:A, 6zvp:B, 6zvp:C, 6zzu:B, 6zzu:A, 6zzu:C, 6zzu:D
2	5fgj:A	428	421	0.5357	0.5257	0.5344	3.74e-160	4anp:A, 5den:A, 5den:B, 5den:C, 5den:D, 1dmw:A, 5fgj:B, 5fgj:C, 5fgj:D, 6hpo:A, 6hyc:D, 6hyc:C, 6hyc:B, 1j8t:A, 1j8u:A, 1kw0:A, 1lrm:A, 1mmk:A, 1mmt:A, 6n1k:A, 6n1k:B, 6n1k:C, 6n1k:D, 1pah:A, 2pah:A, 2pah:B, 3pah:A, 4pah:A, 5pah:A, 6pah:A, 1phz:A, 2phm:A, 1tdw:A, 1tg2:A
3	4v06:A	349	335	0.4786	0.5759	0.6000	2.18e-154	4v06:B, 7wiy:B, 7wiy:C, 7wiy:D, 7wiy:A
4	3e2t:A	307	307	0.4548	0.6221	0.6221	2.38e-148	8cji:A, 8cjj:A, 8cjk:A, 8cjl:A, 8cjm:A, 8cjn:A, 8cjo:A, 3hf6:A, 3hf8:A, 3hfb:A, 5j6d:A, 5l01:A, 1mlw:A, 7zif:A, 7zig:A, 7zih:A, 7zii:A, 7zij:A, 7zik:A, 7zik:B
5	5jk5:A	400	392	0.4524	0.4750	0.4847	5.28e-132	5jk5:B, 5jk6:A, 5jk6:B, 5jk8:A, 5jk8:B
6	5tpg:A	271	290	0.4048	0.6273	0.5862	5.61e-125
7	5j6d:B	248	286	0.3571	0.6048	0.5245	2.36e-94
8	2v27:B	272	227	0.1762	0.2721	0.3260	1.55e-34	2v27:A
9	4etl:A	277	227	0.1881	0.2852	0.3480	9.11e-33	4esm:A, 4jpx:A, 4jpy:A, 1ltv:A, 1ltz:A, 4q3w:A, 4q3x:A, 4q3y:A, 4q3z:A, 3tcy:A, 3tk2:A, 3tk4:A
10	7vgm:A	571	235	0.1548	0.1138	0.2766	1.48e-19
11	5fii:B	78	74	0.0476	0.2564	0.2703	0.28	5fii:A, 5fii:C, 5fii:D
12	7pkt:x	167	38	0.0310	0.0778	0.3421	0.55
13	3cir:A	541	69	0.0548	0.0425	0.3333	0.79
14	6b58:C	544	69	0.0548	0.0423	0.3333	0.82	6b58:A
15	5vpn:E	585	69	0.0548	0.0393	0.3333	0.87	6awf:A, 2b76:A, 2b76:M, 1kf6:A, 1kf6:M, 1kfy:A, 1kfy:M, 4kx6:A, 4kx6:M, 1l0v:A, 1l0v:M, 3p4p:A, 3p4p:M, 3p4q:A, 3p4q:M, 3p4r:A, 3p4r:M, 3p4s:A, 3p4s:M, 5vpn:A
16	4n78:F	156	81	0.0500	0.1346	0.2593	1.2
17	3ppz:A	267	145	0.0857	0.1348	0.2483	2.7	3p86:A
18	5zjp:B	230	44	0.0357	0.0652	0.3409	3.5	5zjn:A, 5zjn:B, 5zjp:A
19	6uh5:M	222	28	0.0286	0.0541	0.4286	4.4	6chg:C
20	5zi5:A	850	78	0.0476	0.0235	0.2564	7.1	5zi5:B, 5zi7:A, 5zi7:B, 5zie:A, 5zie:B

[Back]