Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GISFRNEFFNPQTPVNIPVQGFSNGARLRLVLLPTSADSRFHINLRTPDDIVLHFNARFDEGAVVNNSTSGGGWQSEDRH
ANPFQQNKIYTLEFVSNGGIISIFVNGAHFADFVERTPSHGVHLIEIEGGVHVHSAHVSH

The query sequence (length=140) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3vv1:A 141 140 1.0000 0.9929 1.0000 5.18e-100 3vv1:B
2 5glt:A 278 115 0.3143 0.1583 0.3826 6.54e-18 5glt:B, 5glu:A, 5glu:B, 5glw:A, 5glz:A, 5glz:B, 5glz:C, 5gm0:A, 5gm0:B
3 5glt:A 278 139 0.2857 0.1439 0.2878 5.72e-10 5glt:B, 5glu:A, 5glu:B, 5glw:A, 5glz:A, 5glz:B, 5glz:C, 5gm0:A, 5gm0:B
4 2d6n:B 153 138 0.3071 0.2810 0.3116 9.49e-15 2d6m:A, 2d6m:B, 2d6n:A, 2d6o:X, 2d6p:A, 2d6p:B
5 3wv6:A 284 142 0.3143 0.1549 0.3099 1.41e-13 2eak:A, 2eak:C, 2eal:A, 2eal:B, 3lse:A, 3nv2:A, 3nv3:A, 3nv4:A, 3wlu:A, 3wlu:B, 3wlu:C, 3wlu:D, 3wv6:B, 2yy1:A, 2zhk:A, 2zhk:B, 2zhl:A, 2zhl:B, 2zhl:C, 2zhl:D, 2zhm:A, 2zhm:B, 2zhm:C, 2zhm:D, 2zhn:A
6 3wv6:A 284 123 0.2571 0.1268 0.2927 2.77e-09 2eak:A, 2eak:C, 2eal:A, 2eal:B, 3lse:A, 3nv2:A, 3nv3:A, 3nv4:A, 3wlu:A, 3wlu:B, 3wlu:C, 3wlu:D, 3wv6:B, 2yy1:A, 2zhk:A, 2zhk:B, 2zhl:A, 2zhl:B, 2zhl:C, 2zhl:D, 2zhm:A, 2zhm:B, 2zhm:C, 2zhm:D, 2zhn:A
7 7xbl:B 136 124 0.2857 0.2941 0.3226 4.43e-13 2gal:A, 2gal:B, 3gal:A, 3gal:B, 4gal:B, 5gal:B, 5h9q:B, 5h9s:B, 7n57:A, 7n57:B, 7n8d:A, 7n8d:B, 7rdg:C, 7rdg:B, 7rdg:A, 7rdg:D, 7tkx:A, 7tkx:B, 7tkz:B, 7tkz:A, 7tro:B, 4uw3:A, 4uw4:B, 4uw5:A, 4uw5:D, 4uw5:F, 4uw6:B, 6vto:A, 6vto:B, 6vtq:A, 6vtq:B, 6vts:A, 6vts:B, 7xac:A, 7xac:B, 4xbq:A, 4xbq:B, 7xbl:A, 4y26:A, 4y26:B, 3zxe:A, 3zxe:B
8 3i8t:A 140 134 0.2786 0.2786 0.2910 4.27e-12
9 5jpg:A 144 102 0.2214 0.2153 0.3039 5.89e-12 5jpg:B
10 4ylz:C 140 137 0.3000 0.3000 0.3066 4.14e-11 5cbl:A, 5cbl:B, 5cbl:C, 5cbl:D, 6wab:A, 6wab:B, 4ylz:A, 4ylz:B, 4ylz:D, 4ym0:D, 4ym0:A, 4ym0:B, 4ym0:C, 4ym1:A, 4ym1:B, 4ym1:C, 4ym2:A, 4ym2:B, 4ym2:C, 4ym2:D, 4ym3:A, 4ym3:B, 4ym3:C, 4ym3:D
11 4xzp:A 148 134 0.2857 0.2703 0.2985 4.28e-11 5duu:A, 5duu:B, 5duu:C, 5duu:D, 5duv:A, 5duv:B, 5duv:C, 5duv:D, 5duw:A, 5duw:B, 5duw:C, 5duw:D, 5dux:B, 5dux:D, 5dux:A, 5dux:C
12 6e20:B 133 125 0.2571 0.2707 0.2880 1.39e-08 6e20:A
13 6a62:A 138 122 0.2214 0.2246 0.2541 7.10e-07 6a63:A, 6a64:A, 5xg8:A
14 2ymz:B 130 102 0.2286 0.2462 0.3137 9.68e-07 2ymz:D
15 7df6:A 139 132 0.2286 0.2302 0.2424 1.74e-06 7cxb:A, 7cxc:A, 7cxc:B, 7cxd:A, 7cxd:B, 7cxd:D, 7cxd:E, 7df6:B, 8ilu:A, 8ilu:B, 8iu1:A
16 7xxy:A 137 100 0.1929 0.1971 0.2700 6.10e-06 7xxv:A
17 4han:A 293 111 0.2143 0.1024 0.2703 7.16e-06 7aen:A, 7aen:B, 7als:A, 7als:B, 3ap4:A, 3ap4:B, 3ap4:C, 3ap4:D, 3ap6:A, 3ap6:B, 3ap6:C, 3ap6:D, 3ap7:A, 3ap9:A, 4bmb:A, 4bme:A, 4bme:B, 8cm8:A, 8cm8:B, 4fqz:A, 4gxl:A, 5gzc:A, 5gzd:A, 5gze:A, 5gzf:A, 5gzg:A, 4han:B, 7p11:A, 7p11:B, 7p1m:A, 7p1m:B, 5t7i:A, 5t7s:A, 5t7t:A, 5t7u:A, 3vkl:A, 3vkl:B, 3vkm:A, 3vkm:B, 3vko:A, 3vko:B, 5vwg:A, 6w4z:A, 6w4z:B, 2yxs:A, 6z6y:A
18 4han:A 293 87 0.1714 0.0819 0.2759 0.001 7aen:A, 7aen:B, 7als:A, 7als:B, 3ap4:A, 3ap4:B, 3ap4:C, 3ap4:D, 3ap6:A, 3ap6:B, 3ap6:C, 3ap6:D, 3ap7:A, 3ap9:A, 4bmb:A, 4bme:A, 4bme:B, 8cm8:A, 8cm8:B, 4fqz:A, 4gxl:A, 5gzc:A, 5gzd:A, 5gze:A, 5gzf:A, 5gzg:A, 4han:B, 7p11:A, 7p11:B, 7p1m:A, 7p1m:B, 5t7i:A, 5t7s:A, 5t7t:A, 5t7u:A, 3vkl:A, 3vkl:B, 3vkm:A, 3vkm:B, 3vko:A, 3vko:B, 5vwg:A, 6w4z:A, 6w4z:B, 2yxs:A, 6z6y:A
19 6l6a:A 142 101 0.1929 0.1901 0.2673 7.54e-06 6a1t:A, 1g86:A, 6gku:A, 1hdk:A, 6l64:A, 6l67:A, 6l68:A, 6l6b:A, 6l6c:A, 1qkq:A, 6qrn:A, 5xrg:A, 5xri:A, 5xrk:A, 5xrl:A, 5xrm:A, 5xrn:A, 5xro:A, 5xrp:A, 5yt4:A
20 6fof:A 153 131 0.2286 0.2092 0.2443 1.15e-05 1a3k:A, 3aya:A, 3aya:B, 3ayc:B, 3ayd:A, 3aye:A, 3aye:B, 6b8k:A, 4bli:A, 4blj:A, 4bm8:A, 8bz3:A, 7cxa:A, 7cxa:B, 7df5:A, 5e88:A, 5e89:A, 5e8a:A, 6eog:A, 6eol:A, 5exo:A, 6exy:A, 6eym:A, 6f6y:A, 6fk2:A, 6fof:C, 6fof:D, 6fof:E, 6fof:G, 6fof:B, 6fof:F, 6fof:H, 6fof:I, 6fof:J, 6fof:K, 6fof:L, 6g0v:A, 6h64:A, 6h64:F, 6h64:B, 6h64:E, 6h64:C, 6h64:D, 5h9p:A, 5h9r:A, 6i74:A, 6i75:A, 6i76:A, 6i77:A, 6i78:A, 8itx:A, 8itx:B, 8itz:A, 5iuq:A, 4jc1:A, 4jck:A, 1kjl:A, 1kjr:A, 6kxa:A, 6kxb:A, 4lbj:A, 4lbk:A, 4lbl:A, 4lbm:A, 4lbn:A, 4lbo:A, 5nf7:A, 5nf9:A, 5nfa:A, 5nfb:A, 2nmn:A, 2nmo:A, 2nn8:A, 5oax:A, 5ody:A, 8oji:A, 8ojk:A, 8ojm:A, 8ojo:A, 8pbf:A, 8pf9:A, 8pff:A, 8ppn:A, 6q0q:A, 6q17:A, 6qge:A, 6qgf:A, 6qln:A, 6qlo:A, 6qlp:A, 6qlq:B, 6qlr:A, 6qls:A, 6qlt:A, 6qlu:A, 4r9a:A, 4r9b:A, 4r9c:A, 4r9d:A, 7rdo:A, 7rdp:A, 7rgx:A, 7rgy:A, 7rgz:A, 6rhl:A, 6rhm:A, 7rh0:A, 7rh1:A, 7rh3:A, 7rh4:A, 4rl7:A, 6rzf:A, 6rzg:A, 6rzh:A, 6rzi:A, 6rzj:A, 6rzk:A, 6rzl:A, 6rzm:A, 3t1l:A, 3t1m:A, 6tf6:A, 6tf7:A, 4xbn:A, 7xfa:A, 2xg3:A, 6y4c:A, 6y78:A, 7zqx:A, 3zsj:A, 3zsk:A
21 6n3r:C 136 83 0.1500 0.1544 0.2530 2.90e-05 6n3r:B, 6n3r:D, 6n3r:F, 6n3r:H
22 2wt0:A 300 110 0.2571 0.1200 0.3273 2.91e-05 2wsv:A, 2wt1:A, 2wt2:A, 2wt2:B
23 2wt0:A 300 111 0.2071 0.0967 0.2613 0.002 2wsv:A, 2wt1:A, 2wt2:A, 2wt2:B
24 6m5y:A 270 115 0.2071 0.1074 0.2522 4.37e-05 8b0w:A, 8b0w:B, 8b0z:A, 8b0z:B, 6b94:A, 6b94:B, 6f83:A, 6f83:B, 1gzw:A, 1gzw:B, 7lta:A, 5mwt:A, 5mwt:B, 5mwx:A, 5mwx:B, 7nml:B, 8ojp:A, 8ojp:B, 3oy8:A, 3oy8:B, 3oyw:A, 3oyw:B, 4q1p:A, 4q1p:B, 4q1r:A, 4q1r:B, 4q26:A, 4q26:B, 4q26:G, 4q26:H, 4q27:A, 4q27:B, 4q2f:A, 4q2f:B, 8r74:A, 8r74:B, 3t2t:A, 4xbl:A, 4xbl:B, 4y1u:B, 4y1u:A, 4y1v:A, 4y1v:B, 4y1x:A, 4y1x:B, 4y1y:A, 4y1y:B, 4y1z:A, 4y1z:B, 4y20:A, 4y20:B, 4y22:B, 4y24:A, 4y24:B
25 6m5y:A 270 115 0.2071 0.1074 0.2522 4.37e-05 8b0w:A, 8b0w:B, 8b0z:A, 8b0z:B, 6b94:A, 6b94:B, 6f83:A, 6f83:B, 1gzw:A, 1gzw:B, 7lta:A, 5mwt:A, 5mwt:B, 5mwx:A, 5mwx:B, 7nml:B, 8ojp:A, 8ojp:B, 3oy8:A, 3oy8:B, 3oyw:A, 3oyw:B, 4q1p:A, 4q1p:B, 4q1r:A, 4q1r:B, 4q26:A, 4q26:B, 4q26:G, 4q26:H, 4q27:A, 4q27:B, 4q2f:A, 4q2f:B, 8r74:A, 8r74:B, 3t2t:A, 4xbl:A, 4xbl:B, 4y1u:B, 4y1u:A, 4y1v:A, 4y1v:B, 4y1x:A, 4y1x:B, 4y1y:A, 4y1y:B, 4y1z:A, 4y1z:B, 4y20:A, 4y20:B, 4y22:B, 4y24:A, 4y24:B
26 4ga9:A 134 115 0.2214 0.2313 0.2696 5.93e-05 4ga9:B, 3m2m:A, 3m2m:C, 3m2m:D, 3m2m:E, 3m2m:H, 4no4:A, 4no4:B, 4no4:C, 4no4:D, 4no4:E, 4no4:F
27 7cya:A 139 134 0.2571 0.2590 0.2687 6.71e-05
28 6ljq:A 140 100 0.1786 0.1786 0.2500 7.14e-05 6ljr:A
29 3wud:A 132 104 0.2143 0.2273 0.2885 2.69e-04
30 3ajz:A 132 114 0.2357 0.2500 0.2895 4.46e-04 3ak0:A, 3ak0:B
31 3ajy:A 133 103 0.2000 0.2105 0.2718 5.30e-04 3ajy:C
32 1sla:A 134 108 0.2071 0.2164 0.2685 5.42e-04 1slb:A, 1slb:C, 1slc:A, 1slc:B, 1slt:A, 1slt:B
33 6k2z:A 138 117 0.1929 0.1957 0.2308 6.33e-04 6k2z:B
34 1a78:A 134 97 0.2286 0.2388 0.3299 6.76e-04 1a78:B, 1gan:A, 1gan:B
35 5dg2:B 131 57 0.1500 0.1603 0.3684 6.93e-04 5dg1:C, 5dg1:H, 5dg1:D, 5dg1:I, 5ews:C, 5ews:D, 5ews:A, 5ews:G, 5ews:H, 5ews:I, 5ews:J, 5ews:K, 5ews:M, 5ews:N, 1hlc:A, 1hlc:B
36 1w6m:A 134 115 0.1929 0.2015 0.2348 0.001 1w6m:B, 1w6o:A, 1w6o:B, 1w6p:A, 1w6p:B, 2zkn:A
37 7bqo:A 451 61 0.1500 0.0466 0.3443 0.10
38 7bqk:A 459 61 0.1429 0.0436 0.3279 0.40 7bqk:B, 7bql:A, 7bql:B
39 7mq8:NH 1066 31 0.0929 0.0122 0.4194 0.65 7mqa:NH
40 7smk:A 455 31 0.0714 0.0220 0.3226 2.4 7snv:A
41 5g2v:A 494 57 0.1071 0.0304 0.2632 3.7
42 7qsw:C 467 31 0.0714 0.0214 0.3226 4.9 7qsw:A, 7qsw:E, 7qsw:G
43 1zvr:A 514 28 0.0929 0.0253 0.4643 7.0 1zsq:A
44 4uf2:A 136 32 0.0786 0.0809 0.3438 8.2 4uf1:A, 4uf3:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218