BioLiP

>protein
GIQGLAKLIADVAPSAIRENDIKSYFGRKVAIDASMSIYQFLIAVRQGGDVLQNEEGETTSHLMGMFYRTIRMMENGIKP
VYVFDGKVKVTKQHNDECKHLLSLMGIPYLDAPSEAEASCAALVKAGKVYAAATEDMACLTFGSPVLMRHLTASEAKKLP
IQEFHLSRILQELGLNQEQFVDLCILLGSDYCESIRGIGPKRAVDLIQKHKSIEEIVRRLDPNKYPVPENWLHKEAHQLF
LEPEVLDPESVELKWSEPNEEELIKFMCGEKQFSEERIRSGVKRLSKSRQ

The query sequence (length=290) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5zog:A	316	305	0.9931	0.9114	0.9443	0.0	1ul1:X, 5zoe:A, 5zof:A
2	5k97:A	341	332	0.9931	0.8446	0.8675	0.0	5kse:A, 3q8k:A, 3q8l:A, 3q8m:B, 3q8m:A, 5um9:A
3	5fv7:A	283	298	0.9276	0.9505	0.9027	0.0	5fv7:B
4	5zod:A	260	288	0.8828	0.9846	0.8889	0.0
5	1rxv:A	305	309	0.3586	0.3410	0.3366	9.81e-50	1rxv:B, 1rxw:A
6	1a76:A	315	303	0.3379	0.3111	0.3234	1.87e-49	1a77:A
7	4q0z:A	322	317	0.2966	0.2671	0.2713	1.12e-32	4q0w:A, 4q0z:B, 4q0z:E, 4q0z:F
8	4q0w:B	301	303	0.2759	0.2658	0.2640	3.01e-31	4q0r:A, 4q10:A, 4q10:B
9	6tux:A	330	244	0.2483	0.2182	0.2951	9.78e-23	6tuw:A, 6tux:B
10	6grd:A	407	256	0.2517	0.1794	0.2852	3.46e-20	5cnq:A, 5co8:C, 5co8:A, 6grb:A, 6grc:A
11	5t9j:B	391	234	0.2207	0.1637	0.2735	4.25e-19	5t9j:A
12	7mxw:Z	350	300	0.2724	0.2257	0.2633	5.75e-15	7mxq:Z, 7mxr:Z, 7mxs:Z, 7mxt:Z, 7mxu:Z, 7mxv:Z, 7mxx:Z, 3qe9:Y, 3qe9:Z, 3qea:Z, 3qeb:Z, 5uzv:Z, 5v04:Z, 5v05:Z, 5v06:Z, 5v07:Z, 5v08:Z, 5v09:Z, 5v0a:Z, 5v0b:Z, 5v0c:Z, 5v0d:Z, 5v0e:Z
13	1taq:A	807	204	0.1621	0.0582	0.2304	2.31e-04	4bwj:A, 4bwm:A, 4c8k:A, 4c8l:A, 4c8m:A, 4c8n:A, 4c8o:A, 4cch:A, 4df4:A, 4df8:A, 4dfj:A, 4dfk:A, 4dfm:A, 4dfp:A, 4dle:A, 4dlg:A, 5e41:A, 4elt:A, 4elu:A, 4elv:A, 6fbc:A, 6fbd:A, 6fbe:A, 6fbf:A, 6fbg:A, 6fbh:A, 6fbi:A, 2ktq:A, 3ktq:A, 4ktq:A, 5ktq:A, 3lwl:A, 3lwm:A, 3m8r:A, 3m8s:A, 4n5s:A, 5nkl:A, 5o7t:A, 3ojs:A, 3oju:A, 7owf:A, 5oxj:A, 3po4:A, 3po5:A, 3py8:A, 6q4u:A, 6q4v:A, 1qss:A, 1qsy:A, 1qtm:A, 3rr7:A, 3rr8:A, 3rrg:A, 3rrh:A, 3rtv:A, 3sv3:A, 3sv4:A, 3syz:A, 3sz2:A, 5szt:A, 3t3f:A, 1tau:A, 5w6k:A, 5w6q:C, 5w6q:G, 4xiu:A, 5ytc:A, 5ytd:A, 5yte:A, 5ytf:A, 5ytg:A, 5yth:A, 5z3n:A
14	3zd9:A	249	73	0.0897	0.1044	0.3562	0.083	3zd8:A, 3zd8:B, 3zda:A, 3zdb:A, 3zdc:A, 3zdd:A
15	3k9t:A	422	48	0.0552	0.0379	0.3333	0.51
16	6yjo:A	475	37	0.0448	0.0274	0.3514	1.6
17	6c33:A	317	40	0.0517	0.0473	0.3750	2.3	6c34:A, 6c35:A, 6c36:A
18	3bm3:A	259	43	0.0517	0.0579	0.3488	3.0	3bm3:B
19	5uls:A	650	48	0.0517	0.0231	0.3125	3.4	6aol:A, 6aom:A, 6aom:B, 6asp:A, 6asp:B, 6asq:A, 6asq:B, 6baw:B, 6baw:A, 6baw:C, 6baw:D, 6c91:C, 6c91:B, 6cyi:A, 6d1x:A, 6d28:A, 2esa:A, 2exl:A, 2exl:B, 2fyp:A, 2fyp:B, 2gfd:A, 2gfd:B, 2gqp:A, 2gqp:B, 2h8m:A, 2h8m:B, 2hch:A, 2hch:B, 2hg1:A, 2hg1:B, 5in9:A, 5in9:B, 4nh9:A, 3o2f:A, 3o2f:B, 1qy8:A, 1qye:A, 1tbw:A, 1tc0:A, 1tc6:A, 5ttz:A, 5ttz:B, 1u0z:A, 1u0z:B, 1u2o:A, 1u2o:B, 5uls:B, 7ull:A, 7ull:B, 5wmt:A, 5wmt:B, 5wmt:C, 5wmt:D, 1ysz:A
20	2qcu:B	501	79	0.0759	0.0439	0.2785	5.3	2qcu:A, 2r45:A, 2r45:B, 2r46:A, 2r46:B, 2r4e:A, 2r4e:B, 2r4j:A, 2r4j:B
21	5xvu:A	321	32	0.0414	0.0374	0.3750	6.4	5xvu:B, 5xvu:C
22	7v3x:O	461	36	0.0483	0.0304	0.3889	8.2	7dy2:D, 7dy2:G, 7dy2:H, 7dy2:L, 7dye:A, 7dye:B, 7dyi:A, 7dyi:B, 7dyj:A, 7dyj:B, 7dyk:A, 7dyk:B, 7v3x:N, 7v3x:P, 7v3x:X, 7v3x:S, 7wdc:A, 7wdc:B, 8wv8:A, 8wv8:B, 8wve:A, 8wve:B
23	8jj9:B	299	70	0.0655	0.0635	0.2714	8.7	8jj9:A
24	7xn7:m	1187	49	0.0552	0.0135	0.3265	9.2	7xse:m, 7xsx:m, 7xsz:m, 7xt7:m, 7xtd:m, 7xti:m
25	4bts:A0	99	40	0.0552	0.1616	0.4000	9.5	4bts:B0, 4bts:C0, 4bts:D0
26	9biw:B	528	70	0.0828	0.0455	0.3429	9.9	9biw:A

[Back]