Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GIITCICDLNDDDGFTIQCDHCNRWQHAICYGIKDIGMAPDDYLCNSCDPREVDINLARKIQQERINVK

The query sequence (length=69) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 5tdr:A 70 69 1.0000 0.9857 1.0000 9.99e-47 5tdw:A
2 2lv9:A 80 64 0.4058 0.3500 0.4375 4.09e-12 4l58:A
3 7y0i:A 56 53 0.3768 0.4643 0.4906 8.14e-11
4 5tab:A 53 48 0.2464 0.3208 0.3542 3.18e-09
5 5tbn:A 57 47 0.2464 0.2982 0.3617 4.19e-08
6 1wee:A 72 47 0.2609 0.2500 0.3830 4.76e-05
7 8f8y:B 433 50 0.2754 0.0439 0.3800 2.11e-04 8f8y:A, 8f8z:A, 8f8z:B, 3kqi:A, 7m10:A, 3pu3:A, 3pu3:B, 3pu8:B, 3pu8:A, 3pua:A, 3pus:A, 3pus:B
8 3kv4:A 432 49 0.2609 0.0417 0.3673 3.59e-04 4do0:A, 3k3n:A, 3k3o:A, 2wwu:A
9 2f6j:A 168 52 0.2754 0.1131 0.3654 0.002 8ag2:A, 6aze:A, 7dmy:A, 7dn4:A, 7dn4:B, 7dn4:C, 7dn4:D, 7dn4:E, 7dn4:F, 7f5c:A, 7f5d:A, 7f5e:A, 2f6j:B, 2f6j:C, 2f6n:A, 2f6n:B, 8f6g:A, 2fsa:A, 2fsa:B, 2fsa:C, 2fuu:A, 5h6y:A, 7k6r:A, 7k6s:A, 7kdw:A, 7kdw:B, 7kdz:A, 7lp0:A, 7lp0:B, 7lpk:A, 7lpk:B, 7lrk:A, 7lrk:B, 7lro:A, 7lro:B, 6lu5:A, 6lu6:A, 7m2e:A, 8ou2:A, 8ou2:B, 3qzs:A, 3qzs:B, 3qzt:A, 3qzv:A, 5r4g:A, 5r4h:A, 5r4i:A, 5r4j:A, 5r4k:A, 5r4l:A, 5r4m:A, 5r4n:A, 2ri7:A, 7rwn:A, 7rwo:A, 7rwp:A, 7rwq:A, 7vd4:A
10 6o7g:B 60 46 0.2609 0.3000 0.3913 0.003 8u2y:B
11 4q6f:A 56 52 0.2464 0.3036 0.3269 0.004 6fap:A, 6fap:B, 6fap:C, 6fap:D, 6fhu:A, 6fhu:B, 6fhu:D, 6fhu:C, 6fi0:A, 6fi0:B, 6fi0:C, 6fi0:D, 6fkp:A, 6fkp:D, 6fkp:C, 6fkp:B, 4q6f:B, 4q6f:C, 4q6f:D, 4qf2:A, 4qf2:B, 4qf2:C, 4qf2:D, 5t8r:D, 5t8r:A, 5t8r:B, 5t8r:C
12 1wem:A 76 51 0.2464 0.2237 0.3333 0.004 4l7x:A, 2m3h:A
13 3o70:A 55 48 0.2029 0.2545 0.2917 0.004 3o7a:A
14 9c0o:A 63 53 0.2464 0.2698 0.3208 0.006
15 3kv6:D 448 48 0.2319 0.0357 0.3333 0.008 3kv5:D, 3kv5:A, 3kv6:A, 3kv9:A, 3kva:A, 3u78:A
16 2ma5:A 61 33 0.1884 0.2131 0.3939 0.011
17 6wxk:B 51 48 0.2319 0.3137 0.3333 0.027 6wxk:A, 6wxk:C, 6wxk:D, 6wxk:E
18 8han:K 500 55 0.2319 0.0320 0.2909 0.086 4n4f:A
19 8ham:K 517 55 0.2319 0.0309 0.2909 0.093 6alb:A, 8hal:K
20 5u7g:A 547 55 0.2319 0.0293 0.2909 0.094 4a9k:A, 4a9k:B, 6alc:B, 6axq:A, 6axq:B, 6axq:C, 6axq:D, 6ay3:A, 6ay3:B, 6ay5:A, 5cgp:A, 8cmz:A, 8cn0:A, 8cna:A, 8cnb:A, 8cnd:A, 2d82:A, 5dbm:A, 5dbm:B, 5dbm:C, 6dmk:A, 5eic:B, 5eng:A, 5ep7:A, 7evj:A, 6fqo:A, 6fqo:B, 6fqt:A, 6fqu:A, 6fr0:A, 6fr0:B, 6frf:A, 6frf:B, 6frf:C, 6frf:D, 8fup:A, 8fup:B, 8fv2:A, 8fv2:B, 8fv2:C, 8fv2:D, 8fvs:A, 8fvs:B, 8fxa:A, 8fxa:B, 8fxe:A, 8fxn:A, 8fxo:A, 8g6t:A, 8g6t:B, 8g6t:C, 8g6t:D, 8ga2:A, 8ga2:D, 8ga2:C, 8ga2:B, 5gh9:A, 5h85:A, 5i83:A, 5i86:A, 5i86:B, 5i89:A, 5j0d:A, 1jsp:B, 7juo:A, 7juo:B, 7juo:D, 7juo:C, 7juo:F, 7juo:E, 7juo:G, 7juo:H, 7kpy:A, 7kpy:B, 5ktu:A, 5ktu:B, 5ktw:A, 5ktw:B, 5ktw:C, 5ktx:A, 2l84:A, 2l85:A, 5lpj:A, 5lpl:A, 6lqx:B, 5mme:A, 5mme:B, 5mmg:A, 5mpk:A, 5mpk:B, 5mpn:A, 5mpz:A, 5mqe:A, 5mqe:B, 5mqg:A, 5mqg:B, 5mqk:A, 5mqk:B, 2n1a:B, 4n3w:A, 5nlk:A, 4nr4:A, 4nr4:B, 4nr5:A, 4nr6:A, 4nr7:A, 5nrw:A, 5nu3:A, 4nyv:A, 4nyv:B, 4nyv:C, 4nyv:D, 4nyw:A, 4nyx:A, 8og2:A, 5owk:A, 3p1c:A, 3p1d:A, 3p1f:A, 3p1f:B, 6qst:A, 6qst:B, 6qst:C, 6qst:D, 2rny:A, 6sqe:A, 6sqf:A, 6sqm:A, 6sqm:B, 6sqm:C, 3svh:A, 3svh:B, 6sxx:A, 6sxx:B, 5tb6:A, 1tot:A, 4tqn:A, 4ts8:A, 5u7g:B, 7uge:A, 7uge:B, 7ugl:A, 7ugl:B, 5w0e:A, 5w0f:A, 5w0i:A, 5w0l:A, 5w0l:B, 5w0q:A, 4whu:A, 7wx2:A, 7xh6:A, 7xh6:B, 7xhe:A, 7xhe:B, 7xi0:A, 7xi0:B, 7xm7:A, 7xm7:D, 7xm7:C, 7xne:A, 7xne:B, 7xng:A, 7xng:B, 5xxh:A, 6yij:A, 6yij:B, 6yij:C, 6yij:D, 6yij:E, 6yij:F, 6yij:G, 6yik:A, 6yik:C, 6yik:B, 6yil:A, 6yim:A, 4yk0:A, 4yk0:B, 4yk0:C, 4yk0:D
21 5wlf:A 60 31 0.1739 0.2000 0.3871 0.11 5wle:A
22 5z8l:A 204 58 0.2319 0.0784 0.2759 0.13 5z8n:A, 5z8n:B, 5z8n:C
23 3n9m:A 503 35 0.1594 0.0219 0.3143 0.18 3n9l:A, 3n9m:C, 3n9n:A, 3n9o:A, 3n9p:A, 3n9q:A, 3puq:A, 3puq:C, 3pur:A, 3pur:C
24 2k16:A 75 42 0.2029 0.1867 0.3333 0.21 5c13:A, 5c13:C, 5c13:E, 5c13:G, 2k17:A, 5wxg:A, 5wxh:C, 5wxh:A, 5xmy:A, 5xmy:C
25 5c11:A 52 33 0.1739 0.2308 0.3636 0.29 3gl6:A, 2kgg:A, 2kgi:A
26 2m85:A 65 48 0.2174 0.2308 0.3125 0.30
27 8j59:B 388 52 0.2319 0.0412 0.3077 0.42 8j59:A
28 6fhq:A 58 43 0.1739 0.2069 0.2791 0.70 6fhq:B, 6fi1:A, 6fi1:B, 4qf3:A, 4qf3:B
29 6mlc:C 85 22 0.1159 0.0941 0.3636 0.71 6mlc:A, 6mlc:B, 6mlc:D
30 3lqi:C 181 56 0.2319 0.0884 0.2857 0.74 2kyu:A, 3lqh:A, 3lqi:A, 3lqi:B, 3lqj:A, 3lqj:B, 7zey:B, 7zez:B
31 5gnx:A 451 22 0.1304 0.0200 0.4091 0.79 5gnx:B, 5gny:A, 5gny:B, 5gny:C, 5gny:D, 5gnz:A, 5gnz:B, 5gnz:C, 5gnz:D, 5gnz:H, 5gnz:I, 5gnz:J, 5gnz:K
32 5y20:A 52 38 0.2174 0.2885 0.3947 0.97
33 7ss8:A 484 55 0.1884 0.0269 0.2364 1.0 6gyt:A, 6gyt:B, 7ssk:A
34 4bhw:A 563 55 0.1884 0.0231 0.2364 1.3 4bhw:B, 3biy:A, 8gzc:A, 8gzc:B, 8haj:K, 5kj2:A, 7lje:A, 7lje:B, 7lje:C, 7lje:D, 5lkt:A, 5lku:A, 5lkx:A, 5lkz:A, 6pf1:A, 6pf1:B, 6pgu:A, 6pgu:B, 7szq:A, 6v8b:A, 6v8k:A, 7vhy:A, 7vhy:B, 7vhz:A, 7vhz:B, 7vi0:A, 7vi0:B
35 6gyr:A 588 55 0.1884 0.0221 0.2364 1.4 5bt3:A, 8fvf:A, 8fvf:B, 6gyr:B, 6gyr:C, 6gyr:D, 5i8b:A, 5i8g:A, 5lpk:A, 5lpk:B, 5lpk:C, 5lpk:D, 5lpk:E, 5lpk:G, 5lpk:F, 5lpm:A, 5lpm:B, 5nu5:A, 5nu5:B, 4pzr:A, 4pzs:A, 4pzt:A, 7ugi:A, 7ugi:B, 6v8n:A, 6v90:A
36 1f62:A 51 45 0.1739 0.2353 0.2667 1.4
37 4gkv:B 336 31 0.1159 0.0238 0.2581 1.5 4gkv:C, 4gkv:A, 4gkv:D
38 8hai:K 533 55 0.1884 0.0244 0.2364 1.5 8hag:K, 8hah:K, 8hak:N
39 7d87:A 202 34 0.2029 0.0693 0.4118 1.6 7d86:A, 7d8a:A
40 6lrg:B 681 36 0.2029 0.0206 0.3889 1.7 6lrg:A, 6lrh:A, 6lrh:B
41 8ge0:A 188 48 0.2174 0.0798 0.3125 1.7 8gdx:A, 8ge0:B, 8ge0:C
42 5ofb:B 541 38 0.1884 0.0240 0.3421 1.9 5of9:A, 5of9:B, 5ofa:B, 5ofa:A, 5ofb:A
43 6j2p:A 98 33 0.1594 0.1122 0.3333 2.4 6j2p:B, 6j2p:D, 6j2p:C
44 7uba:A 187 17 0.1159 0.0428 0.4706 2.7
45 1wep:A 79 21 0.1304 0.1139 0.4286 3.0
46 5znp:B 186 48 0.1739 0.0645 0.2500 3.7 5znp:A, 5znr:A, 5znr:B
47 2jal:B 444 20 0.1449 0.0225 0.5000 4.1 2cbu:A, 2cbu:B, 2cbv:A, 2cbv:B, 2ces:A, 2ces:B, 2cet:A, 2cet:B, 2j75:A, 2j75:B, 2j77:A, 2j77:B, 2j78:A, 2j78:B, 2j79:A, 2j79:B, 2j7b:A, 2j7b:B, 2j7c:A, 2j7c:B, 2j7d:A, 2j7d:B, 2j7e:A, 2j7e:B, 2j7f:A, 2j7f:B, 2j7g:A, 2j7g:B, 2j7h:A, 2j7h:B, 2jal:A, 5n6s:A, 5n6s:B, 5n6s:C, 5n6s:D, 5n6t:A, 5n6t:B, 1oif:A, 1oif:B, 1oim:A, 1oim:B, 1oin:A, 1oin:B, 5oss:B, 1uz1:A, 1uz1:B, 2vrj:A, 2vrj:B, 1w3j:A, 1w3j:B, 2wbg:A, 2wbg:B, 2wbg:C, 2wbg:D, 2wc3:A, 2wc3:B, 2wc3:C, 2wc3:D, 2wc4:A, 2wc4:B, 2wc4:C, 2wc4:D
48 3nnn:A 119 25 0.1449 0.0840 0.4000 5.9 3nnn:B
49 8bpa:C 213 47 0.1884 0.0610 0.2766 6.8 8c60:C
50 4b09:A 218 16 0.1159 0.0367 0.5000 8.9 4b09:B, 4b09:C, 4b09:D, 4b09:E, 4b09:F, 4b09:G, 4b09:I, 4b09:K
51 6uek:D 585 43 0.1884 0.0222 0.3023 9.0
52 5yc3:A 60 43 0.2174 0.2500 0.3488 9.3 5yc4:A
53 6u04:A 168 59 0.2754 0.1131 0.3220 9.6 5erc:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218