Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GHYGIHEEMLKDKIRTESYRDFIYQNPHIFKDKVVLDVGCGTGILSMFAAKAGAKKVLGVDQSEILYQAMDIIRLNKLED
TITLIKGKIEEVHLPVEKVDVIISEWMGYFLLFESMLDSVLYAKNKYLAKGGSVYPDICTISLVAVSDVNKHADRIAFWD
DVYGFKMSCMKKAVIPEAVVEVLDPKTLISEPCGIKHIDCHTTSISDLEFSSDFTLKITRTSMCTAIAGYFDIYFEKNCH
NRVVFSTGPQSTKTHWKQTVFLLEKPFSVKAGEALKGKVTVHKNSLTVTLTLNNSTQTYGL

The query sequence (length=301) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1f3l:A 321 306 0.9236 0.8660 0.9085 0.0 2fyt:A, 8g2f:A, 8g2g:A, 8g2g:B, 4hsg:A, 4qqn:A, 4ryl:A, 8shb:A, 8shr:A, 8sio:A, 8sio:B, 3smq:A
2 6nt2:A 330 285 0.4917 0.4485 0.5193 1.48e-107 6nt2:D, 6nt2:B, 6nt2:C, 1or8:A, 1orh:A, 1ori:A, 3q7e:A
3 5dst:C 317 288 0.4751 0.4511 0.4965 1.11e-103 5dst:A, 5dst:B, 5dst:D, 5dst:E, 5dst:F, 5dst:G, 5dst:H, 5dst:I, 5dst:J, 5dst:K, 5dst:L, 5dst:M, 5dst:N, 5dst:O, 4x41:A
4 6cu5:A 314 285 0.4452 0.4268 0.4702 1.11e-91 6cu5:B, 8ft7:A, 8ft7:B
5 6dnz:A 317 288 0.4186 0.3975 0.4375 3.49e-79 6dnz:C
6 8pjd:A 347 320 0.3887 0.3372 0.3656 3.10e-67 8bva:A, 8c1j:A, 5ful:A, 5fwa:A, 5fwd:A, 5jmq:A
7 5fub:A 337 315 0.3588 0.3205 0.3429 4.09e-60 5g02:A
8 3r0q:G 353 300 0.3488 0.2975 0.3500 1.01e-55 3r0q:C, 3r0q:A, 3r0q:E
9 4y2h:B 352 291 0.3455 0.2955 0.3574 1.42e-55 4c03:A, 4c03:B, 4c04:A, 4c05:A, 4c07:A, 4c08:A, 5e8r:A, 5e8r:B, 5egs:A, 5egs:B, 5egs:C, 5egs:D, 5fqn:A, 5fqo:A, 4hc4:A, 5hzm:A, 5lv4:A, 5lv5:A, 7nr4:A, 7nr4:B, 7nr4:C, 7nr4:D, 7nud:A, 7nud:B, 7nue:A, 7nue:B, 7p2r:A, 7p2r:B, 6p7i:A, 6p7i:B, 6p7i:C, 6p7i:D, 4qpp:B, 4qpp:C, 4qpp:A, 4qqk:A, 6sq3:A, 6sq3:B, 6sq4:A, 6sq4:B, 6sqi:A, 6sqk:B, 6sqk:A, 6w6d:A, 6wad:A, 5wcf:A, 4y2h:A, 4y30:A, 4y30:B
10 7qrd:C 364 288 0.3422 0.2830 0.3576 5.98e-51 6arj:A, 6arj:B, 6arj:C, 6arj:D, 6arv:A, 6arv:B, 6arv:C, 6arv:D, 3b3f:A, 3b3f:B, 3b3f:C, 3b3f:D, 6d2l:A, 6d2l:B, 6d2l:C, 6d2l:D, 6d2l:E, 6d2l:F, 6dvr:A, 6dvr:B, 5dwq:B, 5dwq:D, 5dwq:A, 5dwq:C, 5dx0:A, 5dx0:B, 5dx0:C, 5dx0:D, 5dx1:A, 5dx1:B, 5dx1:C, 5dx1:D, 5dx8:A, 5dx8:B, 5dx8:C, 5dx8:D, 5dxa:A, 5dxa:B, 5dxa:D, 5dxa:C, 5dxj:A, 5dxj:B, 5dxj:C, 5dxj:D, 7fai:A, 7fai:B, 7fai:C, 7fai:D, 7faj:A, 7faj:B, 7faj:C, 7faj:D, 8g2h:A, 8g2i:A, 5ih3:A, 5ih3:B, 5ih3:C, 5ih3:D, 4ikp:A, 4ikp:B, 4ikp:C, 4ikp:D, 5is6:A, 5is6:B, 5is6:C, 5is6:D, 5is7:A, 5is7:B, 5is7:C, 5is7:D, 5is8:A, 5is8:B, 5is8:D, 5is8:C, 5is9:A, 5is9:B, 5is9:C, 5is9:D, 5isa:C, 5isa:D, 5isa:A, 5isa:B, 5isb:A, 5isb:B, 5isb:C, 5isb:D, 5isc:A, 5isc:B, 5isc:C, 5isc:D, 5isd:A, 5isd:B, 5isd:C, 5isd:D, 5ise:A, 5ise:B, 5ise:C, 5ise:D, 5isf:A, 5isf:B, 5isf:C, 5isf:D, 5isg:A, 5isg:B, 5isg:C, 5isg:D, 5ish:A, 5ish:B, 5ish:C, 5ish:D, 5isi:A, 5isi:B, 5isi:C, 5isi:D, 6izq:A, 5k8v:A, 5k8v:B, 5k8v:C, 5k8v:D, 5k8w:A, 5k8w:B, 5k8w:C, 5k8w:D, 5k8x:A, 5k8x:B, 5k8x:C, 5k8x:D, 5lgp:A, 5lgp:B, 5lgp:C, 5lgp:D, 5lgq:B, 5lgq:A, 5lgq:C, 5lgq:D, 5lgr:A, 5lgr:B, 5lgr:C, 5lgr:D, 5lgs:A, 5lgs:B, 5lgs:C, 5lgs:D, 5lkj:A, 5lkj:B, 5lkj:C, 5lkj:D, 5lv2:A, 5lv2:B, 5lv2:C, 5lv2:D, 5lv2:E, 5lv2:F, 5lv2:G, 5lv2:H, 5lv3:A, 5lv3:B, 5lv3:C, 5lv3:D, 5ntc:A, 5ntc:B, 5ntc:C, 5ntc:D, 7okp:A, 7okp:B, 7okp:C, 7okp:D, 7os4:A, 7os4:B, 7os4:C, 7os4:D, 7ppq:A, 7ppq:B, 7ppq:C, 7ppq:D, 7ppy:A, 7ppy:B, 7ppy:C, 7ppy:D, 7pu8:A, 7pu8:B, 7pu8:C, 7pu8:D, 7puc:A, 7puc:B, 7puc:C, 7puc:D, 7puq:A, 7puq:B, 7puq:C, 7puq:D, 7pv6:A, 7pv6:B, 7pv6:C, 7pv6:D, 7qph:A, 7qph:D, 7qph:C, 7qph:B, 7qrd:A, 7qrd:B, 7qrd:D, 6s70:A, 6s70:B, 6s70:C, 6s70:D, 6s71:A, 6s71:B, 6s71:C, 6s71:D, 6s74:A, 6s74:B, 6s74:C, 6s74:D, 6s77:A, 6s77:B, 6s77:C, 6s77:D, 6s79:A, 6s79:B, 6s79:C, 6s79:D, 6s7a:A, 6s7a:B, 6s7a:C, 6s7a:D, 6s7b:A, 6s7b:B, 6s7b:C, 6s7b:D, 6s7c:A, 6s7c:B, 6s7c:C, 6s7c:D, 8sig:A, 8sih:A, 5tbh:A, 5tbh:B, 5tbh:C, 5tbh:D, 5tbi:A, 5tbi:B, 5tbi:C, 5tbi:D, 5tbj:A, 5tbj:B, 5tbj:C, 5tbj:D, 5u4x:A, 5u4x:B, 5u4x:C, 5u4x:D, 7u9i:A, 7u9i:B, 2v74:B, 2v74:D, 2v74:F, 2v74:H, 2y1w:A, 2y1w:B, 2y1w:C, 2y1w:D, 2y1x:A, 2y1x:D, 2y1x:B, 2y1x:C
11 4lwp:B 342 317 0.3023 0.2661 0.2871 2.01e-28 4lwp:A
12 5eku:B 347 281 0.2458 0.2133 0.2633 2.82e-17 5eku:A, 4m37:A, 4m38:A, 4m38:B
13 7rbq:A 614 277 0.2625 0.1287 0.2852 8.11e-14 7t39:A
14 7rbq:A 614 106 0.0764 0.0375 0.2170 0.002 7t39:A
15 4c4a:A 641 305 0.2326 0.1092 0.2295 2.62e-08 6ogn:A
16 4c4a:A 641 150 0.1329 0.0624 0.2667 0.001 6ogn:A
17 3kkz:A 256 134 0.1362 0.1602 0.3060 3.75e-06 3kkz:B
18 3sxj:A 245 136 0.1196 0.1469 0.2647 6.17e-06 3sxj:B, 3t0i:A, 3t0i:B
19 3wst:I 644 114 0.1130 0.0528 0.2982 2.22e-05 3wst:A, 3wst:D, 3wst:B, 3wst:C, 3wst:F, 3wst:E, 3wst:G, 3wst:H, 3wst:M, 3wst:N, 3wst:O, 3wst:P, 3wst:Q, 3wst:R, 3wst:J, 3wst:K, 3wst:L, 3x0d:A
20 4g56:A 617 291 0.2159 0.1053 0.2234 2.89e-05 4g56:C
21 7cta:A 329 135 0.1395 0.1277 0.3111 3.15e-05 7ct9:A, 7ct9:B, 7cta:B
22 7wzg:B 243 109 0.1063 0.1317 0.2936 3.19e-05 7wzg:A, 7wzg:C, 7wzg:D, 7wzg:E, 7wzg:F
23 7bo7:AAA 625 297 0.2159 0.1040 0.2189 2.37e-04 7boc:A, 5c9z:A, 6ckc:A, 8csg:A, 8ctb:A, 8cyi:A, 5emj:A, 5emk:A, 5eml:A, 5emm:A, 9eyu:A, 9eyv:A, 9eyw:A, 9eyx:A, 5fa5:A, 8g1u:A, 8g1u:E, 8g1u:I, 8g1u:M, 4gqb:A, 6k1s:A, 7kib:A, 7kic:A, 7kid:A, 7l1g:A, 7m05:A, 7m05:C, 7m05:E, 7m05:G, 7mx7:A, 7mxa:A, 7mxc:A, 7mxg:A, 7mxg:C, 7mxn:A, 6rll:A, 6rlq:A, 7s0u:A, 7s1p:A, 7s1q:A, 7s1r:A, 7s1s:A, 7ser:A, 7ses:A, 7u30:A, 7uoh:A, 6uxx:A, 6uxy:A, 7uy1:A, 7uyf:A, 6v0n:A, 6v0o:A, 6v0p:A, 8veo:A, 8vet:A, 8veu:A, 8vew:A, 8vex:A, 8vey:A, 4x60:A, 4x61:A, 4x63:A, 7zup:A, 7zuq:A, 7zuu:A, 7zuy:A, 7zv2:A, 7zvl:A, 7zvu:A
24 7slp:A 239 86 0.0797 0.1004 0.2791 0.001 7slq:A
25 3t7s:A 246 105 0.0997 0.1220 0.2857 0.005 3t7s:B, 3t7s:C, 3t7s:D, 3t7t:A, 3t7t:B, 3t7t:C, 3t7t:D
26 4kdr:A 208 52 0.0698 0.1010 0.4038 0.011 5dpm:A
27 5z9o:A 373 41 0.0664 0.0536 0.4878 0.011 5z9o:B
28 6h2v:A 210 55 0.0731 0.1048 0.4000 0.013 6h2u:A, 6h2v:C
29 6dcb:A 225 50 0.0598 0.0800 0.3600 0.016 6dcc:A, 5una:C, 5una:A, 5una:B, 5una:D, 5una:E, 5una:F
30 4qnu:A 323 159 0.1429 0.1331 0.2704 0.018 4qnu:B, 4qnu:C, 4qnu:D, 4qnu:E, 4qnu:F, 4qnu:G, 4qnu:H, 4qnv:A, 4qnv:B
31 5fad:A 160 68 0.0731 0.1375 0.3235 0.025 5fa8:A
32 1wy7:D 204 73 0.0831 0.1225 0.3425 0.032 1wy7:A, 1wy7:B, 1wy7:C
33 7wm6:A 240 62 0.0631 0.0792 0.3065 0.045 7wm6:C, 7wm6:D
34 3cjt:A 254 78 0.0831 0.0984 0.3205 0.046 3cjq:A, 3cjq:D, 3cjq:G, 3cjr:A, 3cjt:C, 3cjt:E, 3cjt:G, 3cjt:I, 3cjt:K, 3cjt:M, 3cjt:O, 3egv:A, 2nxe:A, 2nxe:B, 2zbp:A, 2zbq:A, 2zbr:A
35 4rfq:A 270 28 0.0465 0.0519 0.5000 0.053
36 7qcb:A 240 45 0.0664 0.0833 0.4444 0.055
37 6sg9:F4 541 29 0.0498 0.0277 0.5172 0.078 6sgb:F4
38 1l3i:A 186 106 0.0930 0.1505 0.2642 0.100 1l3i:B, 1l3i:C, 1l3i:D, 1l3i:E, 1l3i:F
39 5je1:A 244 82 0.0831 0.1025 0.3049 0.11 5jdy:A, 5jdy:B, 5jdz:A, 5jdz:B, 5je0:A, 5je0:B, 5je1:B, 5je2:A, 5je2:B, 5je3:A, 5je3:B, 5je4:A, 5je4:B, 5je5:A
40 5dpl:A 520 40 0.0565 0.0327 0.4250 0.19 5doo:A, 5dpl:B
41 5u1e:A 321 63 0.0698 0.0654 0.3333 0.38 5tyq:A, 5u0n:A, 5u0t:A, 5u18:A, 5u19:A, 5u1i:A, 5u4t:A
42 3a25:A 264 53 0.0565 0.0644 0.3208 0.47 3a26:A
43 3dlc:A 219 101 0.0831 0.1142 0.2475 0.70
44 7qos:A 352 77 0.0698 0.0597 0.2727 1.2 7qos:B
45 4qdk:A 219 89 0.0897 0.1233 0.3034 1.3 4qdj:A, 4qdk:B
46 3grr:A 263 72 0.0864 0.0989 0.3611 1.3 3gru:A, 3grv:A, 3gry:A
47 3e8s:A 220 115 0.1130 0.1545 0.2957 1.9
48 8fzb:A 318 84 0.0698 0.0660 0.2500 2.1 8fzb:B, 8fzb:C
49 7pd7:B 250 54 0.0532 0.0640 0.2963 2.1 7pd7:A, 7pd7:C, 7pd7:D
50 2oxt:A 265 70 0.0698 0.0792 0.3000 2.1 2oxt:B, 2oxt:C, 2oxt:D
51 3u52:F 118 42 0.0565 0.1441 0.4048 2.9
52 4pne:B 272 99 0.0864 0.0956 0.2626 2.9 4pne:A
53 5gm2:B 282 44 0.0465 0.0496 0.3182 3.3 5gm1:A, 5gm1:B, 5gm1:C, 5gm1:D, 5gm1:E, 5gm1:F, 5gm1:G, 5gm1:H, 5gm1:I, 5gm1:J, 5gm1:K, 5gm1:L, 5gm1:M, 5gm1:N, 5gm1:O, 5gm1:P, 5gm1:Q, 5gm1:R, 5gm2:A, 5gm2:C, 5gm2:D, 5gm2:E, 5gm2:F, 5gm2:G, 5gm2:H, 5gm2:I, 5gm2:J, 5gm2:L, 5gm2:M, 5gm2:N, 5gm2:O, 5gm2:P, 5gm2:Q, 5gm2:R
54 4mtl:B 219 37 0.0432 0.0594 0.3514 3.4 4mtl:A
55 4iv8:A 245 76 0.0698 0.0857 0.2763 4.2 4iv8:B
56 1wzn:A 244 56 0.0664 0.0820 0.3571 4.2 1wzn:B, 1wzn:C
57 6uv6:C 264 57 0.0631 0.0720 0.3333 4.8 6uv6:A, 6uv6:B
58 2avn:A 247 70 0.0598 0.0729 0.2571 5.0 2avn:B
59 2cd9:A 363 67 0.0664 0.0551 0.2985 5.3 2cd9:B, 2cda:A, 2cda:B, 2cdb:A, 2cdb:B, 2cdb:C, 2cdb:D, 2cdc:A, 2cdc:B, 2cdc:C, 2cdc:D
60 5h02:A 252 71 0.0831 0.0992 0.3521 5.4 5gwx:A, 5hik:A, 5hil:A, 5him:A
61 4krg:A 466 115 0.0864 0.0558 0.2261 6.3 4krg:B
62 2zwv:A 373 36 0.0465 0.0375 0.3889 6.7 3dmf:A, 3dmg:A, 3dmh:A, 2zul:A
63 6cx6:B 333 89 0.0864 0.0781 0.2921 6.7 6cx6:A, 5eg5:A, 4fr0:A, 4fsd:A, 4kw7:A, 4rsr:A
64 4qpn:A 203 25 0.0365 0.0542 0.4400 7.2
65 3bu1:A 144 31 0.0432 0.0903 0.4194 7.4
66 3jwg:A 195 48 0.0565 0.0872 0.3542 8.0
67 1ri1:A 252 31 0.0432 0.0516 0.4194 9.2 2hv9:A, 1ri2:A, 1ri3:A, 1ri4:A, 1z3c:A
68 6lyh:A 358 104 0.0930 0.0782 0.2692 9.5 6lyh:B, 6lyh:C, 6lyh:D, 6lyh:E, 6lyh:F, 6lyh:G, 6lyh:H
69 2b3t:A 276 72 0.0498 0.0543 0.2083 9.7 1t43:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218