BioLiP

>protein
GHWAPGSHILWRYRENGGPHVHIARPVTVVRDDADLLAVWLAPGTECVKPVLADGTPVHLEPLATRYTKPRTVQRDQWFG
TGVLKLARPGEAWSVWLFWDPGWRFKNWYVNLERPLTRWEGGVDSEDHFLDISVHPDRTWHWRDEDEFAQALRDGLMDPA
SAGRVRRAGRSAVAEIRAWGSPFADGWEHWRPDPAWPVPSLPGDWDRTPA

The query sequence (length=210) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3cbt:A	210	210	1.0000	1.0000	1.0000	8.06e-151	3exm:A
2	5zdm:A	198	176	0.2762	0.2929	0.3295	7.81e-16	5zdn:A
3	7d8g:A	174	78	0.1095	0.1322	0.2949	7.01e-04	7d8i:A, 7d8l:A, 7d8q:A
4	8qp8:A	1918	106	0.1143	0.0125	0.2264	0.17
5	8qcj:A	458	32	0.0762	0.0349	0.5000	0.56	8qcj:B
6	5fwt:A	293	37	0.0571	0.0410	0.3243	0.68	5fws:A, 5fww:B
7	8ro0:A	2231	111	0.1429	0.0134	0.2703	0.92	8ro1:A
8	7abg:A	2174	108	0.1190	0.0115	0.2315	1.2	7abi:A, 8q91:A, 8rc0:A
9	8i0p:A	2149	110	0.1238	0.0121	0.2364	2.2	8q7q:A, 8q7v:A, 8q7w:A
10	8h6k:5B	2253	113	0.1286	0.0120	0.2389	2.7	8h6l:5B, 8i0u:A, 8i0v:A, 8q7n:A, 8qo9:A, 8qpe:A, 7qtt:a, 8qzs:A
11	7mgm:A	2274	33	0.0524	0.0048	0.3333	4.5
12	8dzz:A	2363	33	0.0524	0.0047	0.3333	4.5	8dzz:D, 8e00:A
13	4w8f:B	2609	33	0.0524	0.0042	0.3333	4.5	220l:A, 223l:A, 225l:A, 227l:A, 148l:E, 258l:A, 259l:A, 260l:A, 182l:A, 183l:A, 184l:A, 185l:A, 186l:A, 187l:A, 188l:A, 2a4t:A, 1c61:A, 1c62:A, 1c65:A, 1c66:A, 1c67:A, 1c68:A, 1c6a:A, 1c6b:A, 1c6d:A, 1c6e:A, 1c6g:A, 1c6h:A, 1c6j:A, 1c6k:A, 1c6m:A, 1c6n:A, 1c6q:A, 1c6t:A, 2cuu:A, 3dmx:A, 3dmz:A, 3dn0:A, 3dn1:A, 3dn2:A, 3dn3:A, 3dn4:A, 3dn6:A, 3dn8:A, 3dna:A, 1epy:A, 5g27:A, 3g3v:A, 3g3w:A, 3g3x:A, 3guj:A, 3guk:A, 3gul:A, 3gul:B, 3gum:A, 3gum:B, 3gun:A, 3gun:B, 3guo:A, 3guo:B, 3gup:A, 3gup:B, 3hh3:A, 3hh5:A, 3hh6:A, 3ht6:A, 3ht7:A, 3ht8:A, 3ht9:A, 3htb:A, 3htd:A, 3htf:A, 3htg:A, 3hu8:A, 3hu9:A, 3hua:A, 3huk:A, 3huq:A, 3hwl:A, 2igc:A, 5jdt:A, 5jgn:A, 5jgr:A, 5jgv:A, 5jgz:A, 5jws:A, 5jwt:A, 5jwu:A, 5jwv:A, 5jww:A, 3k2r:A, 3l2x:A, 7l3b:A, 7l3c:A, 7l3d:A, 7l3e:A, 7l3f:A, 7l3g:A, 7l3h:A, 7l3i:A, 7l3j:A, 7l3k:A, 1l83:A, 1l84:A, 1lgw:A, 1lgx:A, 1li3:A, 1li6:A, 7loa:A, 7lob:A, 7loc:A, 7lod:A, 7loe:A, 7lof:A, 7log:A, 7loj:A, 5lwo:A, 7lx6:A, 7lx7:A, 7lx8:A, 7lx9:A, 7lxa:A, 4lzm:A, 5lzm:A, 6lzm:A, 7lzm:A, 1nhb:A, 2ntg:A, 2nth:A, 2oty:X, 2otz:X, 2ou0:X, 2ou8:A, 2ou9:A, 1ov5:A, 1ov7:A, 1ovh:A, 1ovj:A, 1ovk:A, 1owy:A, 1owz:A, 6pgy:A, 6pgz:A, 6pgz:B, 4pjz:A, 4pk0:A, 2q9d:A, 2q9e:B, 2q9e:C, 2ray:X, 2raz:X, 2rb0:X, 2rb1:X, 2rb2:X, 2rbn:A, 2rbo:A, 2rbp:A, 2rbq:A, 2rbr:A, 2rbs:A, 3run:A, 3sb5:B, 3sb5:A, 3sb5:C, 3sb5:D, 3sb6:A, 3sb6:B, 3sb8:A, 3sb8:B, 3sb9:A, 3sb9:B, 3sba:B, 3sba:C, 3sba:F, 8tat:A, 6v51:A, 4w52:A, 4w53:A, 4w54:A, 4w55:A, 4w56:A, 4w57:A, 4w58:A, 4w59:A, 4w8f:A, 1xep:A, 1zur:A, 1zwn:A, 1zyt:A
14	4ai6:A	2650	33	0.0524	0.0042	0.3333	4.5	4ai6:B, 4akg:A, 4akg:B, 4akh:A, 4akh:B, 4aki:A, 4aki:B, 3crt:A, 3cru:A, 3d0z:A, 1dug:A, 1dug:B, 1gne:A, 1gtb:A, 8gyd:A, 8gyd:B, 5gzz:B, 5gzz:C, 5gzz:D, 5gzz:E, 5gzz:F, 5gzz:G, 6ji6:A, 1m99:A, 1m9a:A, 1m9b:A, 7mi3:A, 7mi6:A, 6rwd:A, 6rwd:B, 1u87:A, 1u88:A, 1ua5:A, 4wr4:A, 4wr5:A
15	8q7x:A	1914	106	0.1143	0.0125	0.2264	4.7
16	8y6o:C	2227	108	0.1143	0.0108	0.2222	5.5	8h6e:5B, 8h6j:5B, 8qp9:A, 6qw6:5A, 6qx9:5A, 8qxd:A, 8r08:A
17	5z56:A	2232	111	0.1333	0.0125	0.2523	6.9	7aav:A, 7abf:A, 8ch6:a, 7dvq:A, 8i0s:A, 5z58:A
18	8c6j:A	2261	111	0.1333	0.0124	0.2523	6.9	6ah0:A, 6ahd:A, 8bc8:J, 6ff4:A, 6ff7:A, 9fmd:A, 8i0r:A, 8i0t:A, 8i0w:A, 6icz:A, 6id0:A, 6id1:A, 4jk9:A, 4jk9:B, 4jka:A, 4jka:B, 5mqf:A, 5o9z:A, 6qdv:A, 8qoz:A, 8qpa:A, 8qpb:A, 8qpk:A, 8r09:A, 8r0a:A, 8r0b:A, 8rm5:A, 8ro2:A, 7w59:A, 7w5a:A, 7w5b:A, 5xjc:A, 5yzg:A, 6zym:A
19	5z57:A	1978	111	0.1333	0.0142	0.2523	8.2

[Back]