BioLiP

>protein
GHTPEEALALLKRGAEEIVPEEELLAKLKEGRPLTVKLGADPTRPDLHLGHAVVLRKMRQFQELGHKVVLIIGDFTGMIT
LEETRENAKTYVAQAGKILRQEPHLFELRYNSEWLEGLTFKEVVRLTSLMTVAQMLEREDFKKRYEAGIPISLHELLYPF
AQAYDSVAIRADVEMGGTDQRFNLLVGREVQRAYGQSPQVCFLMPLLVGLDGREKMSKSLDNYIGLTEPPEAMFKKLMRV
PDPLLPSYFRLLTDLEEEEIEALLKAGPVPAHRVLARLLTAAYALPQIPPRIDRAFYESLGYAWEAFGRDKEAGPEEVRR
AEARYDEIPEVTIPASELKEGRIWVARLFTLAGLTPSNAEARRLIQNRGLRLDGEVLTDPMLQVDLSRPRILQRGKDRFV
RVRLSD

The query sequence (length=406) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1h3f:B	406	406	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	1h3f:A
2	1h3e:A	427	427	0.9975	0.9485	0.9485	0.0
3	6bqz:A	215	215	0.2783	0.5256	0.5256	1.17e-75	6bqz:B
4	6otj:B	431	398	0.2660	0.2506	0.2714	1.92e-25	6otj:A
5	6hb5:B	417	428	0.2709	0.2638	0.2570	1.43e-23	7ap3:A, 7ap3:B, 6hb5:A, 6hb6:A, 6hb6:B, 6hb7:A, 6hb7:B, 6i5y:A, 6i5y:B, 4oud:A, 1vbm:A, 1vbm:B, 1vbn:A, 1vbn:B, 6wn2:A, 6wn2:B, 1wq3:A, 1wq4:A, 1x8x:A, 2yxn:A
6	2cyb:A	319	247	0.1847	0.2351	0.3036	6.90e-23	2cyb:B
7	1jil:A	323	265	0.1897	0.2384	0.2906	8.32e-20	1jii:A, 1jij:A, 1jik:A
8	3ts1:A	317	279	0.1921	0.2461	0.2796	2.24e-19	4ts1:A, 4ts1:B, 1tya:E, 1tyb:E, 1tyd:E
9	4nx2:A	313	251	0.1749	0.2268	0.2829	5.23e-15	2ag6:A, 7ckg:B, 3d6u:A, 3d6v:A, 2hgz:A, 4hjx:A, 4hjx:B, 4hpw:A, 1j1u:A, 5l7p:B, 3n2y:A, 3n2y:B, 5n5u:A, 4nda:A, 5nsf:B, 5nsf:A, 5nsf:C, 5nsf:D, 4pbr:A, 4pbs:A, 4pbt:A, 2pxh:A, 3qe4:A, 3qe4:B, 6wrk:A, 6wrn:A, 6wrq:A, 6wrt:A, 7ynw:A, 7ynw:B, 1zh0:A, 1zh6:A, 2zp1:A
10	5ijx:A	365	196	0.1330	0.1479	0.2755	2.13e-12
11	4ojm:X	382	286	0.1749	0.1859	0.2483	7.83e-12	2rkj:B, 2rkj:F, 2rkj:J, 2rkj:N, 1y42:X
12	5ihx:A	360	316	0.1773	0.2000	0.2278	1.49e-11
13	7rou:A	335	237	0.1650	0.2000	0.2827	3.70e-09	1q11:A, 4q93:A, 4qbt:A, 5thh:A
14	2pid:B	324	271	0.1527	0.1914	0.2288	1.04e-07	2pid:A, 3zxi:A, 3zxi:B
15	2dlc:X	339	249	0.1478	0.1770	0.2410	8.82e-07
16	2a4m:C	331	129	0.1010	0.1239	0.3178	1.50e-05	1yi8:C, 1yia:B, 1yid:B
17	5tew:A	333	259	0.1626	0.1982	0.2548	4.89e-05
18	2cyc:A	371	236	0.1379	0.1509	0.2373	1.55e-04	2cyc:B
19	2g36:A	322	224	0.1453	0.1832	0.2634	1.81e-04
20	3p0j:A	657	163	0.1084	0.0670	0.2699	0.003	3p0h:B, 3p0i:B, 3p0j:B
21	6ncr:A	342	248	0.1429	0.1696	0.2339	0.004	6ncr:B
22	5usf:A	682	326	0.1798	0.1070	0.2239	0.009	3p0h:A, 3p0i:A, 3p0j:C, 3p0j:D, 5usf:B
23	6dfu:A	332	121	0.0813	0.0994	0.2727	0.009	6dfu:B
24	7sc6:A	349	235	0.1232	0.1433	0.2128	0.013	7scq:A, 7scq:B
25	8i1w:B	333	126	0.0837	0.1021	0.2698	0.015	8i1y:A, 8i1y:B, 8i1z:A, 8i1z:B, 8i27:A, 8i27:B, 8i2a:B, 8i2a:A, 8i2c:A, 8i2c:B, 8i2j:A, 8i2j:B, 8i2l:B, 8i2l:A, 8i2m:A, 8i2m:B, 8i4i:A, 8i4i:B, 5v0i:A, 5v0i:B
26	3a04:A	367	236	0.1453	0.1608	0.2500	0.025	3a05:A
27	7ror:B	362	80	0.0616	0.0691	0.3125	0.25	7ror:A, 7ros:A, 7ros:B, 7rot:A, 7rot:B, 3vgj:A, 3vgj:B
28	3fhj:D	286	223	0.1379	0.1958	0.2511	0.59	3fhj:C
29	3hv0:A	352	153	0.0936	0.1080	0.2484	0.68	3hv0:B
30	3kt8:D	410	119	0.0665	0.0659	0.2269	1.2	3kt0:A, 3kt3:A, 3kt3:B, 3kt3:C, 3kt3:D, 3kt6:A, 3kt6:B, 3kt6:C, 3kt6:D, 3kt8:A, 3kt8:B, 3kt8:C
31	7cms:A	328	207	0.1084	0.1341	0.2126	1.9	7cki:A, 7cms:B, 5dk4:A, 7eer:A, 7eer:B, 7eer:C, 7eer:D, 1i6k:A, 1i6l:A, 1i6m:A, 1m83:A, 1mau:A, 1maw:A, 1maw:B, 1maw:C, 1maw:D, 1maw:E, 1maw:F, 1mb2:A, 1mb2:B, 1mb2:C, 1mb2:D, 1mb2:E, 1mb2:F, 2ov4:A
32	4a35:A	441	55	0.0394	0.0363	0.2909	7.4
33	7w54:B	518	82	0.0591	0.0463	0.2927	8.0	7w54:A
34	5oeu:C	412	86	0.0640	0.0631	0.3023	8.1
35	8x6f:C	1153	74	0.0591	0.0208	0.3243	8.9
36	3tze:A	360	49	0.0320	0.0361	0.2653	10.0	3tze:B

[Back]