BioLiP

>protein
GHSYEKYNNWETIEAWTKQVTSENPDLISRTAIGTTFLGNNIYLLKVGKPGPNKPAIFMDCGIHAREWISHAFCQWFVRE
AVLTYGYESHMTEFLNKLDFYVLPVLNIDGYIYTWTKNRMWRKTRSTNAGTTCIGTDPNRNFDAGWCTTGASTDPCDETY
CGSAAESEKETKALADFIRNNLSSIKAYLSIHSYSQHIVYPYSYDYKLPENNAELNNLAKAAVKELATLYGTKYTYGPGA
TTLYLAPGGGDDWAYDQGIKYSFTFELRDKGRYGFILPESQIQATCEETMLAIKYVTNYVLGHLY

The query sequence (length=305) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3glj:A	395	304	0.9705	0.7494	0.9737	0.0	5j1q:A, 5jc6:A, 2jew:A, 5lrg:A, 5lrg:B, 5lrg:C, 5lrj:A, 5lrj:B, 5lrj:C, 5lrk:A, 5lrk:B, 5lrk:C, 5lyd:A, 5lyf:A, 5lyi:A, 5lyl:A, 1nsa:A, 2piy:A, 2piy:B, 2piy:C, 2piz:A, 2piz:B, 2piz:C, 2pj0:A, 2pj0:B, 2pj0:C, 2pj1:A, 2pj1:B, 2pj1:C, 2pj2:A, 2pj2:B, 2pj2:C, 2pj3:A, 2pj3:B, 2pj3:C, 2pj4:A, 2pj4:B, 2pj5:A, 2pj5:B, 2pj5:C, 2pj6:A, 2pj7:A, 2pj7:B, 2pj7:C, 2pj8:A, 2pj8:B, 2pj8:C, 2pj9:A, 2pja:A, 2pja:B, 2pja:C, 2pjb:A, 2pjb:B, 2pjb:C, 2pjc:A, 2pjc:B, 2pjc:C, 4uia:A, 4uib:A, 3wab:A, 3wc5:A, 3wc6:A, 3wc7:A, 1z5r:A, 1z5r:B, 1z5r:C, 4z65:A, 5zeq:A, 1zg7:A, 1zg7:B, 1zg7:C, 1zg8:A, 1zg8:B, 1zg8:C, 1zg9:A, 1zg9:B, 1zg9:C
2	1kwm:A	402	305	0.8230	0.6244	0.8230	0.0	1kwm:B, 1zli:A
3	3dgv:A	401	304	0.4984	0.3791	0.5000	1.35e-111	3d4u:A, 3dgv:B, 3dgv:C, 3osl:A, 3osl:C
4	4p10:A	402	304	0.5213	0.3955	0.5230	6.30e-111	3d66:A, 3d66:B, 3d66:C, 3d67:A, 3d67:B, 3d67:C, 3d68:A, 3d68:B, 3d68:C, 5hvg:A, 5hvg:C, 5hvh:A, 3lms:A, 7nee:A, 7neu:A
5	5hvf:A	372	300	0.4918	0.4032	0.5000	9.47e-103
6	5om9:A	396	301	0.4787	0.3687	0.4850	6.67e-101	3fju:A, 6i6z:A, 6i6z:B, 5om9:B, 4uee:A, 4uee:B, 4uez:A, 4uez:B, 2v77:A, 2v77:B
7	5mrv:A	307	300	0.4721	0.4691	0.4800	1.00e-100	5mrv:B
8	1pyt:B	309	302	0.4623	0.4563	0.4669	8.47e-100	2abz:A, 2abz:B, 1arm:A, 1bav:A, 1bav:B, 1bav:C, 1bav:D, 1cbx:A, 1cps:A, 1cpx:A, 3cpa:A, 4cpa:A, 4cpa:B, 5cpa:A, 6cpa:A, 7cpa:A, 8cpa:A, 2ctb:A, 2ctc:A, 1ee3:P, 1ell:P, 1elm:P, 1f57:A, 3fvl:A, 3fvl:C, 3fvl:E, 3fx6:A, 3fx6:C, 3fx6:E, 1hdq:A, 1hdu:A, 1hdu:B, 1hdu:D, 1hdu:E, 1hee:A, 1hee:B, 1hee:D, 1hee:E, 3hlp:A, 3hlp:B, 3huv:A, 3i1u:A, 1iy7:A, 3kgq:A, 1m4l:A, 2rfh:A, 1yme:A, 1zlh:A
9	1pca:A	402	299	0.4623	0.3507	0.4716	7.59e-98
10	1aye:A	401	299	0.4492	0.3416	0.4582	7.92e-96	1dtd:A
11	2boa:A	404	305	0.4623	0.3490	0.4623	1.01e-94	4a94:A, 4a94:B, 4bd9:A, 2bo9:A, 2bo9:C, 2boa:B, 2pcu:A
12	7eqx:C	299	293	0.3574	0.3645	0.3720	1.12e-56	7eqx:D, 7eqz:A
13	2c1c:A	312	298	0.3475	0.3397	0.3557	1.01e-54	2c1c:B
14	1jqg:A	409	304	0.2951	0.2200	0.2961	2.96e-40
15	7aqp:A	323	304	0.2918	0.2755	0.2928	1.66e-29	7aru:A, 4djl:A, 4duk:A, 6f6q:A, 6f75:A, 6f79:A, 4f8z:A, 4gm5:A, 6go2:A, 4iav:A, 4ihm:A, 4ik2:A, 1obr:A, 3prt:A, 7q87:A, 3qnv:A, 8qvo:A, 6sn6:A, 6t9y:A, 6tnk:A, 3v38:A, 3v7z:A, 6z28:A
16	1h8l:A	380	284	0.1902	0.1526	0.2042	1.22e-04	1qmu:A
17	3l2n:A	376	89	0.0885	0.0718	0.3034	1.36e-04	3l2n:B
18	1uwy:A	393	109	0.0820	0.0636	0.2294	5.54e-04
19	3mn8:B	386	116	0.0689	0.0544	0.1810	0.056	3mn8:A, 3mn8:C, 3mn8:D
20	2fgh:A	721	146	0.1148	0.0485	0.2397	1.2	3a5l:S, 3a5m:S, 3a5n:S, 3a5o:S, 1c0f:S, 1c0g:S, 4cbu:G, 4cbw:G, 4cbx:G, 3ci5:G, 3cip:G, 3cjb:G, 3cjc:G, 1d4x:G, 1dej:S, 1eqy:S, 1esv:S, 2ff3:A, 2ff6:G, 3ffk:A, 3ffk:D, 2fgh:B, 2fh1:A, 2fh1:B, 2fh1:C, 2fh2:A, 2fh2:B, 2fh2:C, 2fh3:A, 2fh3:B, 2fh3:C, 1h1v:G, 6i4d:G, 6i4e:G, 6i4f:G, 6i4g:G, 6i4g:H, 6i4h:G, 6i4i:G, 6i4j:G, 6i4k:G, 6i4l:G, 6i4m:G, 6lje:A, 6lje:B, 6ljf:A, 6ljf:B, 1mdu:A, 1mdu:D, 5mvv:G, 1nlv:G, 1nm1:G, 1nmd:G, 1nph:A, 1p8x:A, 1p8x:B, 1p8x:C, 1p8z:G, 4pkh:E, 4pkh:J, 1rgi:G, 3tu5:B, 5ubo:S, 1yag:G, 1yvn:G, 5zz0:G, 5zz0:A
21	6dbi:C	622	55	0.0492	0.0241	0.2727	3.9	6dbi:A, 6dbj:A, 6dbj:C, 6dbl:A, 6dbl:C, 6dbo:A, 6dbo:C, 6dbq:A, 6dbq:C, 6dbr:A, 6dbr:C, 6dbt:A, 6dbt:C, 6dbu:A, 6dbu:C, 6dbv:A, 6dbv:C, 6dbw:A, 6dbw:C, 6dbx:A, 6dbx:C, 3jbw:A, 3jbw:C, 3jbx:A, 3jbx:C, 3jby:A, 3jby:C
22	4uxh:A	173	42	0.0492	0.0867	0.3571	4.9	4uxh:B, 4uxi:A, 4uxi:B, 4uxj:A, 4uxj:B, 4uxj:C, 4uxj:D, 4uxj:E, 4uxj:F, 4uxj:G, 4uxj:H
23	6oet:C	623	51	0.0492	0.0241	0.2941	6.1	6cg0:A, 6cg0:C, 6cij:A, 6cij:C, 6cik:A, 6cik:C, 6cil:A, 6cil:C, 6cim:A, 6cim:C, 3gna:A, 3gnb:A, 6oem:A, 6oem:C, 6oen:A, 6oen:C, 6oeo:A, 6oeo:C, 6oep:A, 6oep:C, 6oeq:A, 6oeq:C, 6oer:A, 6oer:C, 6oes:A, 6oes:C, 6oet:A, 6v0v:A, 4wwx:B, 4wwx:E, 6xnx:A, 6xnx:C, 6xny:A, 6xny:C, 6xnz:A, 6xnz:C, 5zdz:A, 5zdz:C, 5ze0:A, 5ze0:C, 5ze1:A, 5ze1:C, 5ze2:A, 5ze2:C
24	6qj6:A	265	85	0.0787	0.0906	0.2824	8.3	6qj6:E, 6rcz:A, 6rcz:E
25	6l8n:A	810	47	0.0492	0.0185	0.3191	8.5

[Back]