BioLiP

>protein
GHMIKICIAGKNNIAVNSLQFILKNYFEADQIVVIPNKNDKGIDSWQKSLLKFALDNNIKIVTLDEIYNIEQIIFFSLEF
DQIIKIENFKSDRLFNIHFSALPKYKGVFTSITPILNNELESGVTLHRIDNGIDTGNIIDQHCFPIDINDTARDLYFNYL
KYGESIFKKNIQTIINNSYKDLKQTNINSSYFSRKDINLVHKINFKKTSFEIHNQIRAFIFQEYQLPIINNSKIIKSILA
NEFIGYNVFEEFENYFIISGIDGFKIIAQKLN

The query sequence (length=272) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4lxq:B	274	272	1.0000	0.9927	1.0000	0.0	4lxq:A, 4lxt:A, 4lxt:B, 4lxu:A, 4lxu:B, 4lxx:A, 4lxx:B, 4lxy:A, 4lxy:B, 4ly0:A, 4ly0:B, 4ly3:A, 4ly3:B
2	7n7b:B	271	270	0.7868	0.7897	0.7926	6.03e-158	7n7b:A, 7n7c:A, 7n7c:B
3	4xcz:A	397	263	0.4559	0.3123	0.4715	1.10e-69	4xd0:A, 4xd1:A
4	5uin:A	399	265	0.4596	0.3133	0.4717	2.62e-65	5uij:A, 5uij:B, 5uik:A, 5uik:B, 5uil:A, 5uil:B, 5uim:A, 5uim:B, 5uin:B
5	8gjh:A	639	220	0.2022	0.0861	0.2500	2.70e-12	8gjh:B, 8gjh:C, 8gjh:D, 8gjh:E, 8gjh:F
6	1z7e:D	644	174	0.1581	0.0668	0.2471	4.71e-12	2bln:A, 2bln:B, 5j63:A, 5j63:B, 5j63:C, 5j63:D, 1z7e:A, 1z7e:B, 1z7e:C, 1z7e:E, 1z7e:F
7	2fmt:A	314	127	0.1140	0.0987	0.2441	1.61e-09	2fmt:B
8	5vyt:C	256	240	0.2096	0.2227	0.2375	7.34e-08	5vyr:A, 5vyr:B, 5vys:A, 5vys:B, 5vyt:A, 5vyt:B, 5vyt:D, 5vyu:A, 5vyu:B
9	6edk:A	193	111	0.1397	0.1969	0.3423	2.71e-07	6ci4:A, 6ci5:A
10	3r8x:A	309	151	0.1176	0.1036	0.2119	1.73e-06
11	1c2t:A	209	65	0.0846	0.1100	0.3538	2.18e-06	1c2t:B, 1c3e:A, 1c3e:B, 1cde:A, 1cde:B, 1cde:C, 1cde:D, 1gar:A, 1gar:B, 1jkx:A, 1jkx:B, 1jkx:C, 1jkx:D
12	6nbp:A	246	143	0.1507	0.1667	0.2867	2.37e-06
13	2cfi:A	310	143	0.1360	0.1194	0.2587	2.42e-06	1s3i:A
14	4nv1:E	242	235	0.2390	0.2686	0.2766	4.85e-06	4nv1:C, 4nv1:D, 4nv1:F, 4nv1:B, 4nv1:A, 4nv1:G, 4nv1:H
15	4yfy:A	241	160	0.1654	0.1867	0.2812	7.18e-06	4yfy:B
16	6mg0:B	1687	103	0.1213	0.0196	0.3204	8.38e-06
17	6mfz:A	1789	103	0.1213	0.0184	0.3204	8.43e-06	5es7:A, 5es8:A, 5es8:B, 5es9:A, 6mfw:A, 6mfx:A, 6mfy:A, 6mg0:A, 6ulz:A
18	4qpd:A	308	123	0.1176	0.1039	0.2602	9.44e-06	4qpd:B, 4tt8:A, 4tts:A
19	2ywr:A	216	82	0.0809	0.1019	0.2683	3.04e-05
20	4ew2:A	205	88	0.0846	0.1122	0.2614	7.80e-05	4ew3:A, 8fdx:A, 8fdy:A, 8fdz:A, 8fe0:A, 8fjv:A, 8fjw:A, 8fjx:A, 8fjy:A, 5j9f:A, 7jg0:A, 7jg3:A, 7jg4:A, 1men:A, 1men:B, 1men:C, 1njs:A, 1njs:B, 1rbm:A, 1rbm:B, 1rbq:A, 1rbq:B, 1rbq:C, 1rbq:D, 1rby:A, 1rby:B, 1rby:C, 1rby:D, 1rbz:A, 1rbz:B, 1rc0:A, 1rc0:B, 1rc1:A, 1rc1:B, 1zly:A, 4zyt:A, 4zyu:A, 4zyv:A, 4zyw:A, 4zyx:A, 4zyy:A, 4zyz:A, 4zz0:A, 4zz1:A, 4zz2:A, 4zz3:A
21	6v33:A	246	119	0.1103	0.1220	0.2521	1.27e-04	6v33:B
22	5vyq:A	235	135	0.1140	0.1319	0.2296	1.40e-04	4q12:A, 4q12:B, 5vyq:B
23	3da8:A	213	54	0.0625	0.0798	0.3148	0.003	3da8:B, 3dcj:A, 3dcj:B
24	6v2t:B	251	107	0.1029	0.1116	0.2617	0.009	6v2t:A
25	1h7a:A	563	131	0.1213	0.0586	0.2519	1.00	1h78:A, 1h79:A, 1h7b:A, 1hk8:A
26	2b9i:A	338	43	0.0331	0.0266	0.2093	7.6	2b9f:A, 2b9h:A, 2b9j:A, 2f49:A, 2f49:B, 2f9g:A

[Back]