BioLiP

>protein
GGGVPTDEEQATGLEREIMIAAQKGLDPYNMLPPKAASGTKEDPNLVPSISNKRIVGCICEEDNCTVIWFWLHKGESQRC
PNCGTHYKLVPHQM

The query sequence (length=94) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7o37:f	95	94	1.0000	0.9895	1.0000	1.77e-68	7o3c:f, 7o3e:f, 8pw5:s, 8pw5:f, 8pw6:s, 8pw7:s
2	3abk:F	98	94	0.8723	0.8367	0.8723	1.86e-61	3abk:S, 3abl:F, 3abl:S, 3abm:F, 3abm:S, 3ag1:F, 3ag1:S, 3ag2:F, 3ag2:S, 3ag3:F, 3ag3:S, 3ag4:F, 3ag4:S, 3asn:F, 3asn:S, 3aso:F, 3aso:S, 5b1a:F, 5b1a:S, 5b1b:F, 5b1b:S, 5b3s:F, 5b3s:S, 7coh:F, 7coh:S, 7cp5:F, 7cp5:S, 8d4t:S, 7d5w:F, 7d5w:S, 7d5x:F, 7d5x:S, 7dgq:A5, 7dgr:A6, 7dgs:B2, 7dkf:F3, 2dyr:F, 2dyr:S, 2dys:F, 2dys:S, 2eij:F, 2eij:S, 2eik:F, 2eik:S, 2eil:F, 2eil:S, 2eim:F, 2eim:S, 2ein:F, 2ein:S, 7ev7:F, 7ev7:S, 8gbt:F, 8gbt:S, 8gcq:F, 8gcq:S, 5gup:Ap, 8gvm:F, 8gvm:S, 8h8r:F, 8h8r:S, 8h8s:F, 8h8s:S, 8ijn:F, 8ijn:S, 5iy5:F, 5iy5:S, 6j8m:F, 6j8m:S, 6juw:F, 6juw:S, 6jy3:F, 6jy4:F, 5luf:3, 6nkn:F, 6nkn:S, 6nmf:F, 6nmf:S, 6nmp:F, 6nmp:S, 1occ:F, 1occ:S, 1oco:F, 1oco:S, 1ocr:F, 1ocr:S, 1ocz:F, 1ocz:S, 2occ:F, 2occ:S, 7thu:F, 7thu:S, 7tie:F, 7tie:S, 7tih:F, 7tih:S, 7tii:F, 7tii:S, 8ugh:4F, 8ugi:4F, 8ugj:4F, 8ugj:8F, 8ugl:4F, 8ugn:4F, 8ugn:8F, 8ugr:4F, 8ugr:8F, 1v54:F, 1v54:S, 1v55:F, 1v55:S, 7vuw:F, 7vuw:S, 7vvr:F, 7vvr:S, 7w3e:F, 7w3e:S, 5w97:F, 5w97:f, 5wau:F, 5wau:f, 3wg7:F, 3wg7:S, 5x19:F, 5x19:S, 5x1b:F, 5x1b:S, 5x1f:F, 5x1f:S, 3x2q:F, 3x2q:S, 5xdq:F, 5xdq:S, 5xdx:F, 5xdx:S, 7xma:F, 7xma:S, 7xmb:F, 7xmb:S, 5xth:2, 5xti:2, 5xti:B2, 7y44:F, 7y44:S, 2y69:F, 2y69:S, 2ybb:Q, 7ypy:F, 7ypy:S, 5z84:F, 5z84:S, 5z85:F, 5z85:S, 5z86:F, 5z86:S, 5zco:F, 5zco:S, 5zcp:F, 5zcp:S, 5zcq:F, 5zcq:S, 2zxw:F, 2zxw:S
3	8c8q:D	121	90	0.4043	0.3140	0.4222	8.24e-17	8q1b:d
4	7jro:e	94	81	0.3617	0.3617	0.4198	3.81e-15	7jrp:e
5	8dh6:d	121	92	0.3511	0.2727	0.3587	9.83e-12	6hu9:d, 6hu9:p, 6t0b:d, 6t0b:q, 6t15:d, 6ymx:d, 6ymy:d, 7z10:d
6	8b6h:DD	558	73	0.2766	0.0466	0.3562	0.018	8b6h:Dd, 8bqs:DD, 8bqs:Dd, 8gym:vb, 8gym:VB, 8gzu:29, 8gzu:84, 8gzu:vb, 8gzu:VB, 7w5z:5B, 7w5z:5b
7	7ob9:A	1535	35	0.1170	0.0072	0.3143	0.78	7oba:A
8	7vbc:A	1477	35	0.1170	0.0074	0.3143	0.86	7vba:A, 7vbb:A
9	7obb:A	1510	35	0.1170	0.0073	0.3143	0.88
10	5dap:A	288	56	0.1702	0.0556	0.2857	3.7	5daq:A, 5dav:A, 5daw:A, 5dax:A, 6eoz:A, 6jzm:B, 6k0e:B, 6k0f:B, 6k30:B, 6kd9:B, 6kd9:F, 5oa4:A, 5oa7:A, 5oa8:A, 7olk:A, 7oll:A, 7olm:A, 7olo:A, 7olp:A, 7olq:A, 7olr:A, 7olt:A, 5y7r:B, 5y7t:B
11	3zyy:X	628	25	0.1064	0.0159	0.4000	3.7	4c1n:J, 4c1n:I, 4c1n:K, 4c1n:X, 3zyy:Y
12	7ze9:CCC	168	62	0.1489	0.0833	0.2258	4.0	7ze9:AAA, 7ze9:BBB
13	6gos:D	396	40	0.1489	0.0354	0.3500	4.3	6grg:D
14	8ppt:B	1191	18	0.0957	0.0076	0.5000	5.2	8ppu:B, 8ppv:B, 6t8h:B
15	5ijl:A	943	18	0.0957	0.0095	0.5000	5.3
16	2lcq:A	161	14	0.0745	0.0435	0.5000	6.1
17	1biy:A	689	38	0.1489	0.0203	0.3684	6.9	2alu:A, 2ays:A, 2b65:A, 1blf:A, 1ce2:A, 3cfl:A, 3ci8:A, 3crb:A, 5cry:A, 5cry:B, 4dig:A, 2doj:A, 2dp8:A, 2dqv:A, 2ds9:A, 2dsf:A, 2dvc:A, 2dwa:A, 2dwh:A, 2dwi:A, 2dwj:A, 2dxr:A, 2dxy:A, 4dxu:A, 2dyx:A, 2e0s:A, 2e1s:A, 3e9x:A, 7enu:A, 7enu:B, 7equ:A, 7equ:B, 7ev0:A, 7ev0:P, 7evq:A, 7evq:B, 2fa7:A, 7fdw:A, 7fdw:B, 4fim:A, 4fjp:A, 4for:A, 4g2z:A, 4g77:A, 4g8h:A, 2g93:A, 4grk:A, 2h4i:A, 5hbc:A, 5hbc:B, 2hca:A, 3iaz:A, 3ib0:A, 3ib1:A, 3ib2:A, 1jw1:A, 3k0v:A, 3kj7:A, 3mjn:A, 4n6p:A, 4ned:A, 1nkx:A, 2nuv:A, 2nwj:A, 2o1l:A, 2o51:A, 3o97:A, 2ocu:A, 2p1s:A, 2px1:A, 2q8j:A, 2qje:A, 2r71:A, 2r9j:A, 3rgy:A, 1sdx:A, 3sdf:A, 3taj:A, 3tod:A, 3ttr:A, 3tus:A, 3u72:A, 3u8q:A, 3ugw:A, 3uk4:A, 3usd:A, 3v5a:A, 3vdf:A, 2zmb:A
18	4cib:A	413	38	0.1489	0.0339	0.3684	7.3	4az0:A, 4az0:B, 4az3:A, 4az3:B, 4cia:A
19	4ari:A	821	25	0.1064	0.0122	0.4000	9.9	4arc:A, 4as1:A, 8pot:A, 3zjt:A, 3zju:A, 3zjv:A

[Back]