BioLiP

>protein
GGGTLFVTVQRCRNLKNKETIGVSDPYVKLQLRKQTRKSPYISSTLNPDFNFEAALEVYDIRSDVLHISILDKNDLVKDR
LMGTLRIMLSQVAAAPGDIIRGDMNLDPEGQISLELKLLRH

The query sequence (length=121) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7a1r:A	121	121	1.0000	1.0000	1.0000	8.91e-87	7a1r:B
2	6uwa:A	187	100	0.2810	0.1818	0.3400	7.94e-08	1dsy:A, 3gpe:A, 2nce:A, 3twy:A, 5w4s:A
3	7atp:A	129	84	0.2149	0.2016	0.3095	3.98e-07
4	2uzp:A	142	101	0.2727	0.2324	0.3267	5.38e-07	2uzp:B, 2uzp:C
5	4ldc:A	149	91	0.2397	0.1946	0.3187	5.86e-07
6	2cm6:A	149	74	0.2314	0.1879	0.3784	8.76e-07	2cm5:A, 2cm6:B, 5lo8:A, 5lo8:B, 5lob:A, 5lob:B, 5lob:C, 5low:A, 5low:B, 5low:C, 5low:H, 5low:I, 5low:J
7	3hn8:A	279	95	0.2562	0.1111	0.3263	1.69e-06	1dqv:A, 3hn8:B, 3hn8:C
8	3hn8:A	279	104	0.2645	0.1147	0.3077	3.56e-06	1dqv:A, 3hn8:B, 3hn8:C
9	6ank:B	263	106	0.2645	0.1217	0.3019	2.37e-06	6anj:A, 6ank:A, 6lcy:A, 3n5a:A
10	6ank:B	263	96	0.2149	0.0989	0.2708	7.91e-04	6anj:A, 6ank:A, 6lcy:A, 3n5a:A
11	6nyt:A	135	75	0.1901	0.1704	0.3067	3.08e-06
12	3pfq:A	523	98	0.2645	0.0612	0.3265	3.24e-06	1a25:A, 1a25:B, 2i0e:A, 2i0e:B
13	5a50:A	165	115	0.2893	0.2121	0.3043	6.64e-06	5a4x:A, 5a4x:B, 5a50:B, 5a51:A, 5a51:B, 4v29:A, 4v29:B
14	4lcv:C	129	98	0.2231	0.2093	0.2755	1.68e-05
15	4lt7:A	128	100	0.2397	0.2266	0.2900	8.88e-05	2k3h:A, 4np9:A, 4ns0:A
16	5ixc:A	684	100	0.2314	0.0409	0.2800	0.001	5ixc:B, 5izr:A, 5izr:B, 5izr:D
17	5a52:A	154	81	0.2066	0.1623	0.3086	0.001
18	5cch:E	280	102	0.2231	0.0964	0.2647	0.002	1byn:A, 8c5h:S, 5ccg:E, 5ccg:F, 5ccg:K, 5cch:F, 5cci:E, 5cci:F, 3f05:A, 1k5w:A, 5kj7:E, 5kj7:F, 5kj7:K, 5kj8:E, 5kj8:F, 5kj8:K, 2lha:A, 6mti:1, 6mti:2, 6mti:3, 6mti:4, 6mti:5, 6mti:6, 1tjx:A, 7tx9:A, 7u4q:A, 1uov:A, 1uow:A, 4v11:A, 5vfe:A, 5vfe:B, 5vff:A, 5vfg:A, 5w5c:F, 2yoa:A, 2yoa:B
19	5cch:E	280	93	0.1983	0.0857	0.2581	0.045	1byn:A, 8c5h:S, 5ccg:E, 5ccg:F, 5ccg:K, 5cch:F, 5cci:E, 5cci:F, 3f05:A, 1k5w:A, 5kj7:E, 5kj7:F, 5kj7:K, 5kj8:E, 5kj8:F, 5kj8:K, 2lha:A, 6mti:1, 6mti:2, 6mti:3, 6mti:4, 6mti:5, 6mti:6, 1tjx:A, 7tx9:A, 7u4q:A, 1uov:A, 1uow:A, 4v11:A, 5vfe:A, 5vfe:B, 5vff:A, 5vfg:A, 5w5c:F, 2yoa:A, 2yoa:B
20	5h4z:A	129	95	0.2066	0.1938	0.2632	0.002	5h4y:A, 5h4z:B
21	4p42:A	455	125	0.2975	0.0791	0.2880	0.002	4npk:A
22	5ue8:A	847	97	0.2066	0.0295	0.2577	0.012	5ue8:B, 1y8f:A
23	4ihb:E	126	77	0.1570	0.1508	0.2468	0.026	7jof:A, 7jof:B, 7jof:C, 7jof:D
24	5izr:C	659	100	0.2314	0.0425	0.2800	0.086
25	8ayh:B	951	76	0.1736	0.0221	0.2763	1.9	3frp:A, 3hrz:A, 3hs0:A, 3hs0:F
26	6sga:FJ	353	15	0.0909	0.0312	0.7333	2.2	6sg9:FJ, 6sgb:FJ
27	1kqf:C	216	55	0.1240	0.0694	0.2727	2.5	1kqg:C
28	4p42:B	431	96	0.2149	0.0603	0.2708	3.0
29	8pxk:A	403	35	0.0992	0.0298	0.3429	3.4	1d7y:A, 1f3p:A, 2gqw:A, 2gr0:A, 2gr1:A, 2gr2:A, 2gr3:A, 4h4p:A, 4h4q:A, 4h4r:A, 4h4s:A, 4h4t:A, 4h4u:A, 4h4v:A, 4h4w:A, 4h4x:A, 4h4y:A, 4h4z:A, 4h50:A, 8pxl:A, 2yvf:A, 2yvg:A, 2yvj:A, 2yvj:P
30	3eph:A	402	43	0.1074	0.0323	0.3023	4.6	3eph:B, 3epj:A, 3epj:B, 3epk:A, 3epk:B, 3epl:A, 3epl:B
31	2fah:C	608	34	0.1157	0.0230	0.4118	6.0	2faf:A, 2faf:B, 2fah:D, 2fah:A, 2fah:B, 2qzy:A, 2qzy:B
32	1aom:B	559	23	0.0661	0.0143	0.3478	8.2	1aof:A, 1aof:B, 1aom:A, 1aoq:A, 1aoq:B, 1dy7:A, 1dy7:B, 1e2r:A, 1e2r:B, 1gq1:A, 1gq1:B, 1h9x:A, 1h9x:B, 1h9y:A, 1h9y:B, 1hcm:A, 1hcm:B, 1hj3:A, 1hj3:B, 1hj4:A, 1hj4:B, 1hj5:A, 1hj5:B, 1qks:A, 1qks:B

[Back]