BioLiP

>protein
GGAVKLSISYRNGTLFIMVMHIKDLVTEDGADPNPYVKTYLLPDNHKTSKRKTKISRKTRNPTFNEMLVYSGYSKETLRQ
RELQLSVLSAESLRGNFFLGGVTLPLKDFNLSKETVKWYQLTA

The query sequence (length=123) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6bty:B	128	123	0.9919	0.9531	0.9919	3.81e-88	2b3r:A, 2b3r:B, 6btz:A, 6btz:D, 6btz:B, 6btz:C, 6bu0:A, 6bu0:B, 6bu0:C
2	6ank:B	263	123	0.3496	0.1635	0.3496	5.18e-16	6anj:A, 6ank:A, 6lcy:A, 3n5a:A
3	6ank:B	263	109	0.2358	0.1103	0.2661	2.48e-04	6anj:A, 6ank:A, 6lcy:A, 3n5a:A
4	4lt7:A	128	126	0.3496	0.3359	0.3413	4.63e-15	2k3h:A, 4np9:A, 4ns0:A
5	4lcv:C	129	109	0.3171	0.3023	0.3578	2.61e-14
6	4ldc:A	149	104	0.2927	0.2416	0.3462	7.72e-13
7	5h4z:A	129	119	0.2927	0.2791	0.3025	8.32e-12	5h4y:A, 5h4z:B
8	3hn8:A	279	106	0.3171	0.1398	0.3679	2.78e-10	1dqv:A, 3hn8:B, 3hn8:C
9	3hn8:A	279	102	0.2439	0.1075	0.2941	7.93e-07	1dqv:A, 3hn8:B, 3hn8:C
10	5cch:E	280	120	0.2927	0.1286	0.3000	3.27e-10	1byn:A, 8c5h:S, 5ccg:E, 5ccg:F, 5ccg:K, 5cch:F, 5cci:E, 5cci:F, 3f05:A, 1k5w:A, 5kj7:E, 5kj7:F, 5kj7:K, 5kj8:E, 5kj8:F, 5kj8:K, 2lha:A, 6mti:1, 6mti:2, 6mti:3, 6mti:4, 6mti:5, 6mti:6, 1tjx:A, 7tx9:A, 7u4q:A, 1uov:A, 1uow:A, 4v11:A, 5vfe:A, 5vfe:B, 5vff:A, 5vfg:A, 5w5c:F, 2yoa:A, 2yoa:B
11	5cch:E	280	104	0.2358	0.1036	0.2788	0.26	1byn:A, 8c5h:S, 5ccg:E, 5ccg:F, 5ccg:K, 5cch:F, 5cci:E, 5cci:F, 3f05:A, 1k5w:A, 5kj7:E, 5kj7:F, 5kj7:K, 5kj8:E, 5kj8:F, 5kj8:K, 2lha:A, 6mti:1, 6mti:2, 6mti:3, 6mti:4, 6mti:5, 6mti:6, 1tjx:A, 7tx9:A, 7u4q:A, 1uov:A, 1uow:A, 4v11:A, 5vfe:A, 5vfe:B, 5vff:A, 5vfg:A, 5w5c:F, 2yoa:A, 2yoa:B
12	2cm6:A	149	131	0.3252	0.2685	0.3053	1.87e-09	2cm5:A, 2cm6:B, 5lo8:A, 5lo8:B, 5lob:A, 5lob:B, 5lob:C, 5low:A, 5low:B, 5low:C, 5low:H, 5low:I, 5low:J
13	6uwa:A	187	124	0.2927	0.1925	0.2903	1.81e-08	1dsy:A, 3gpe:A, 2nce:A, 3twy:A, 5w4s:A
14	3pfq:A	523	112	0.2927	0.0688	0.3214	3.90e-08	1a25:A, 1a25:B, 2i0e:A, 2i0e:B
15	2uzp:A	142	94	0.2358	0.2042	0.3085	1.79e-07	2uzp:B, 2uzp:C
16	1w15:A	132	105	0.2520	0.2348	0.2952	4.84e-06
17	3b7y:A	144	78	0.1951	0.1667	0.3077	0.008
18	4ihb:E	126	59	0.1382	0.1349	0.2881	0.029	7jof:A, 7jof:B, 7jof:C, 7jof:D
19	7atp:A	129	87	0.2358	0.2248	0.3333	0.24
20	9bcz:A	606	87	0.2114	0.0429	0.2989	1.2
21	8rzg:A	659	69	0.1789	0.0334	0.3188	3.3	8rzg:B, 8rzg:C, 8rzg:D, 8rzh:A, 8rzh:B, 8rzh:C, 8rzh:D, 8rzi:A, 8rzi:B, 8rzi:C, 8rzi:D, 8rzj:A, 8rzj:B, 8rzj:C, 8rzj:D, 8rzk:A, 8rzk:B, 8rzk:C, 8rzk:D
22	3fi0:G	302	55	0.1626	0.0662	0.3636	3.8	3fhj:A, 3fhj:B, 3fhj:E, 3fhj:F, 3fi0:A, 3fi0:B, 3fi0:C, 3fi0:D, 3fi0:E, 3fi0:F, 3fi0:H, 3fi0:I, 3fi0:J, 3fi0:K, 3fi0:L, 3fi0:M, 3fi0:N, 3fi0:O, 3fi0:P, 3fi0:Q, 3fi0:R
23	5wjm:A	216	56	0.1220	0.0694	0.2679	7.2
24	3sxq:A	519	36	0.0813	0.0193	0.2778	7.8	3sxq:B, 3ttb:A, 3ttb:B
25	7skh:B	220	56	0.1220	0.0682	0.2679	7.9	7skh:A
26	5b2o:A	1455	55	0.1382	0.0117	0.3091	8.6	5b2p:A, 5b2q:A
27	2d3t:C	390	31	0.0894	0.0282	0.3548	8.9	2d3t:D, 1wdk:C, 1wdk:D, 1wdl:C, 1wdl:D, 1wdm:C, 1wdm:D
28	6w4x:C	375	33	0.0732	0.0240	0.2727	9.3	7ai8:A, 7ai9:A, 2alx:A, 1av8:A, 1av8:B, 2av8:A, 2av8:B, 7bet:A, 1biq:A, 1biq:B, 5ci0:A, 5ci1:A, 5ci2:A, 5ci3:A, 5ci4:A, 5cns:E, 5cns:F, 5cns:G, 5cns:H, 5cnt:E, 5cnt:F, 5cnt:G, 5cnt:H, 5cnu:E, 5cnu:F, 5cnu:G, 5cnu:H, 5cnv:E, 5cnv:F, 5cnv:G, 5cnv:H, 4erm:E, 4erm:F, 4erm:G, 4erm:H, 4erp:E, 4erp:F, 4erp:G, 4erp:H, 1jpr:A, 1jpr:B, 1jqc:A, 1jqc:B, 1mrr:A, 1mrr:B, 1mxr:A, 1mxr:B, 1pfr:A, 1pfr:B, 1pim:A, 1pim:B, 1piu:A, 1piu:B, 1piy:A, 1piy:B, 1piz:A, 1piz:B, 1pj0:A, 1pj0:B, 1pj1:A, 1pj1:B, 1pm2:A, 1pm2:B, 1r65:A, 1r65:B, 1rib:A, 1rib:B, 1rnr:A, 1rnr:B, 1rsr:A, 1rsr:B, 1rsv:A, 1rsv:B, 3uus:E, 3uus:F, 3uus:G, 3uus:H, 6w4x:D, 1xik:A, 1xik:B, 2xof:A, 2xof:B, 1yfd:A, 1yfd:B

[Back]