BioLiP

>protein
GFLELERSSGKLEWSAILQKMASDLGFSKILFGLLPKDSQDYENAFIVGNYPAAWREHYDRAGYARVDPTVSHCTQSVLP
IFWEPSIYQTRKQHEFFEEASAAGLVYGLTMPLHGARGELGALSLSVEAENRAEANRFMESVLPTLWMLKDYALQSGAGL
AFE

The query sequence (length=163) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6v7w:E	234	163	1.0000	0.6966	1.0000	1.95e-120	6d6a:A, 6d6a:B, 6d6a:C, 6d6a:D, 6d6a:E, 6d6a:F, 6d6a:G, 6d6a:H, 6d6b:A, 6d6b:B, 6d6b:C, 6d6b:D, 6d6b:E, 6d6b:F, 6d6b:G, 6d6b:H, 6d6c:A, 6d6c:B, 6d6c:C, 6d6c:D, 6d6c:E, 6d6c:F, 6d6c:G, 6d6c:H, 6d6c:I, 6d6c:J, 6d6c:K, 6d6c:L, 6d6d:A, 6d6d:B, 6d6l:A, 6d6l:B, 6d6l:C, 6d6l:D, 6d6m:A, 6d6m:B, 6d6m:C, 6d6m:D, 6d6n:A, 6d6n:B, 6d6n:C, 6d6n:D, 6d6o:A, 6d6o:B, 6d6o:C, 6d6o:D, 6d6p:A, 6d6p:B, 6d6p:C, 6d6p:D, 3ix3:A, 3ix3:B, 3ix4:A, 3ix4:B, 3ix4:C, 3ix4:D, 3ix4:E, 3ix4:F, 3ix4:G, 3ix4:H, 3ix8:A, 3ix8:B, 3ix8:C, 3ix8:D, 3jpu:A, 3jpu:B, 3jpu:C, 3jpu:D, 3jpu:E, 6mvm:A, 6mvm:B, 6mvn:A, 6mvn:B, 6mwh:A, 6mwh:B, 6mwl:A, 6mwl:B, 6mww:A, 6mww:B, 6mwz:A, 6mwz:B, 4ng2:A, 4ng2:B, 4ng2:C, 4ng2:D, 2uv0:E, 2uv0:F, 2uv0:G, 2uv0:H, 6v7w:B, 6v7x:B
2	7r3g:B	236	123	0.2270	0.1568	0.3008	1.69e-13	7r3g:A, 7r3h:B, 7r3h:A, 7r3i:A, 7r3i:B
3	6cbq:A	234	152	0.2638	0.1838	0.2829	2.39e-11	6cbq:B, 6cc0:A, 6cc0:B, 3szt:A, 3szt:B
4	7r3e:A	545	116	0.1963	0.0587	0.2759	1.85e-09	8b4a:A, 8b4a:B, 8b4a:C, 8b4a:D, 3dh8:A, 8dq0:C, 8dq0:D, 8dq1:C, 8dq1:D, 5hio:A, 5hip:A, 5hiq:A, 5his:A, 7kgw:A, 7kgx:A, 2q0i:A, 2q0j:A, 2q0j:B, 7r3e:B, 7r3f:A, 7r3j:A, 7r3j:B, 7r3j:C, 7r3j:D, 7tz9:A, 7tza:A, 7u6g:A, 2vw8:A
5	5l09:B	164	82	0.1350	0.1341	0.2683	2.34e-07	5l09:A
6	3qp5:A	251	118	0.1840	0.1195	0.2542	4.86e-04	3qp1:A, 3qp2:A, 3qp4:A, 3qp5:B, 3qp5:C, 3qp5:D
7	3qp6:A	258	76	0.1350	0.0853	0.2895	6.25e-04	3qp8:A, 3qp8:B, 3qp8:C, 3qp8:D
8	2q0o:A	235	112	0.1656	0.1149	0.2411	6.82e-04	2q0o:B
9	4y13:A	244	77	0.1411	0.0943	0.2987	0.015	2avx:A, 4y15:A, 4y15:B, 4y15:C, 4y17:A, 4y17:B, 4y17:C
10	1l3l:B	233	84	0.1166	0.0815	0.2262	0.038	1h0m:A, 1h0m:B, 1h0m:C, 1h0m:D, 1l3l:D, 1l3l:A, 1l3l:C
11	4mae:A	577	69	0.1104	0.0312	0.2609	1.5	6fkw:A, 6fkw:B, 6fkw:C, 6fkw:D, 4mae:B
12	8ppt:A	447	78	0.1350	0.0492	0.2821	4.7	6hmf:A, 6hmf:B, 5ihe:A, 5ihe:B, 8ppu:A, 8ppv:A, 6t8h:A
13	3u8p:A	336	49	0.0982	0.0476	0.3265	6.1	3c63:A, 3c63:B, 3c63:C, 3c63:D, 8drj:A, 6dy8:A, 6dy8:B, 6dy8:D, 6dy8:C, 6dyf:A, 6dyf:B, 6dyg:A, 6dyg:B, 6dyh:A, 6dyh:D, 7lr5:C, 7lr5:A, 7lra:C, 7lra:A, 7lrb:A, 7lrb:B, 7lrr:A, 7lrr:B, 7lrv:C, 7lrv:A, 7lv1:C, 7lv1:A, 7lv4:C, 7lv4:A, 7mk4:A, 7mk4:B, 7n4f:C, 7n4f:A, 7n4g:C, 7n4g:A, 3u8p:B, 3u8p:C, 6wyu:A, 6wyu:B, 6wyu:C, 6wz0:A, 6wz0:B, 6wz0:C
14	3o78:A	402	49	0.0982	0.0398	0.3265	7.3	7aug:A, 3ek4:A, 3ek7:A, 3ek8:A, 3ekh:A, 3evr:A, 3evu:A, 3evv:A, 4ik1:A, 4ik3:A, 4ik4:A, 4ik5:A, 4ik8:A, 4ik9:A, 3o77:A, 3o78:B, 3sg2:A, 3sg3:A, 3sg4:A, 3sg5:A, 3sg6:A, 3sg7:A, 7st4:A, 6tv7:A, 3wlc:A, 3wld:A, 6ya9:A, 6zsm:A, 6zsn:A
15	6hr1:A	406	49	0.0982	0.0394	0.3265	8.3	6hr1:B
16	8smu:D	394	44	0.0920	0.0381	0.3409	8.9	8smu:A, 8smu:C, 8smu:B

[Back]