BioLiP

>protein
GFKQDIATLRGDLRTYAQDIFLAFLNKYPDEKRNFKNYVGKSDQELKSMAKFGDHTEKVFNLMMEVADRATDCVPLASDA
STLVQMKQHSGLTTGNFEKLFVALVEYMRASGQSFDSQSWDRFGKNLVSALSSAGMK

The query sequence (length=137) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7acp:A	137	137	1.0000	1.0000	1.0000	3.61e-101	7acp:B, 7adf:A, 7adf:B, 7adq:A, 7adq:B, 7adx:A, 7adx:B, 5chq:A, 5chq:B, 5chr:A, 5chr:B, 6ch5:A, 6ch5:B, 6ch6:A, 6ch6:B, 6cke:A, 6cke:B, 6co5:A, 6co5:B, 6cre:A, 6cre:B, 8dog:A, 8dog:B, 8doh:A, 8doh:B, 8doi:A, 8doi:B, 8doj:A, 8doj:B, 3dr9:A, 3dr9:B, 4dwt:A, 4dwt:B, 4dwu:A, 4dwu:B, 8ejn:A, 8ejn:B, 1ew6:A, 1ew6:B, 1ewa:A, 1ewa:B, 4fh6:A, 4fh6:B, 4fh7:A, 4fh7:B, 4gzg:A, 4gzg:B, 4hsw:A, 4hsw:B, 4hsx:A, 4hsx:B, 6i6g:A, 6i6g:B, 6i7f:A, 6i7f:B, 4ilz:A, 4ilz:B, 3ixf:A, 3ixf:B, 4jac:A, 4jac:B, 7jor:A, 7jor:B, 4jyq:A, 4jyq:B, 5k1l:A, 5k1l:B, 3k3u:A, 3k3u:B, 7kcu:A, 7kcu:B, 7kfm:A, 7kfm:B, 4kjt:A, 4kjt:B, 4kmv:A, 4kmv:B, 4kmw:A, 4kmw:B, 4kn3:A, 4kn3:B, 3kun:A, 3kun:B, 3kuo:A, 3kuo:B, 3lb1:A, 3lb1:B, 3lb2:A, 3lb2:B, 3lb3:A, 3lb3:B, 3lb4:A, 3lb4:B, 5lk9:A, 5lk9:B, 5lkv:A, 5lkv:B, 5llz:A, 5llz:B, 7lzk:A, 7lzk:B, 7lzn:A, 7lzn:B, 7lzo:A, 7lzo:B, 7m0f:A, 7m0f:B, 7m0h:A, 7m0h:B, 7m1i:A, 7m1i:B, 7m1j:A, 7m1j:B, 7m1k:A, 7m1k:B, 7mnh:A, 7mnh:B, 3mou:A, 3mou:B, 3mym:A, 3mym:B, 3myn:A, 3myn:B, 3o7n:A, 3o7n:B, 3oj1:A, 3oj1:B, 3ok5:A, 3ok5:B, 6ong:A, 6ong:B, 6onk:A, 6onk:B, 6onr:A, 6onr:B, 6onx:A, 6onx:B, 6onz:A, 6onz:B, 6oo1:A, 6oo1:B, 6oo6:A, 6oo6:B, 6oo8:A, 6oo8:B, 3ord:A, 3ord:B, 2qfk:A, 2qfk:B, 2qfn:A, 2qfn:B, 7sjb:A, 7sjb:B, 7sjc:A, 7sjc:B, 7sjd:A, 7sjd:B, 7sje:A, 7sje:B, 7sjf:A, 7sjf:B, 7sjg:A, 7sjg:B, 7sjh:A, 7sjh:B, 7sji:A, 7sji:B, 7t9c:A, 7t9c:B, 7t9d:A, 7t9d:B, 7t9e:AAA, 7t9e:BBB, 5v5j:A, 5v5j:B, 5v5q:A, 5v5q:B, 5v5r:B, 5v5r:A, 6vd3:A, 6vd3:B, 6vd4:A, 6vd4:B, 6vd5:A, 6vd5:B, 6vd6:A, 6vd6:B, 6vdr:A, 6vdr:B, 6vds:A, 6vds:B, 6vdt:A, 6vdt:B, 6vdu:A, 6vdu:B, 6vdv:A, 6vdv:B, 6vdw:A, 6vdw:B, 6vdx:A, 6vdx:B, 6vdy:A, 6vdy:B, 8vkc:AAA, 8vkc:BBB, 8vkd:AAA, 8vkd:BBB, 5vlx:A, 5vlx:B, 8vsk:AAA, 8vsk:BBB, 5vts:A, 5vts:B, 5vtt:A, 5vtt:B, 8vzr:A, 8vzr:B
2	1dm1:A	146	123	0.2336	0.2192	0.2602	3.03e-05	2fal:A, 2fam:A, 1mba:A, 3mba:A, 4mba:A, 5mba:A
3	1x46:A	150	143	0.2482	0.2267	0.2378	1.07e-04
4	1hlm:A	158	113	0.2117	0.1835	0.2566	0.002
5	3a5a:A	152	57	0.1241	0.1118	0.2982	0.008	3a5b:A, 3a5g:A, 3a9m:A, 3arj:A, 3ark:A, 3arl:A, 1x3k:A, 2zwj:A
6	1eca:A	136	91	0.1387	0.1397	0.2088	0.083	1ecd:A, 1ecn:A, 1eco:A
7	7vlf:C	150	124	0.2336	0.2133	0.2581	0.23	7vlc:C, 7vlc:G, 7vld:C, 7vld:G, 7vle:C, 7vle:G, 7vlf:G, 3wct:C, 3wct:G, 3wcu:C, 3wcu:G, 3wcv:C, 3wcv:G, 3wcw:C, 3wcw:G
8	8oup:B	151	50	0.1095	0.0993	0.3000	0.25	8oup:A, 8oup:C, 8oup:D
9	1yhu:D	149	127	0.2190	0.2013	0.2362	0.65	1yhu:H, 1yhu:L, 1yhu:P, 1yhu:T, 1yhu:X
10	8xvg:L	3485	41	0.1022	0.0040	0.3415	1.0	8xvv:L
11	7ktr:A	3042	41	0.1022	0.0046	0.3415	1.1
12	3c4a:A	365	45	0.0949	0.0356	0.2889	1.8
13	4zs9:B	378	43	0.1095	0.0397	0.3488	2.1	4zs9:A, 4zza:A, 4zza:B, 4zze:A, 4zze:B
14	4txe:A	288	41	0.1168	0.0556	0.3902	4.9	2uy3:A, 2uy4:A, 2uy5:A
15	4bts:A0	99	29	0.1022	0.1414	0.4828	6.3	4bts:B0, 4bts:C0, 4bts:D0
16	1avc:A	642	25	0.0730	0.0156	0.4000	6.8
17	1m9i:A	664	25	0.0730	0.0151	0.4000	10.0

[Back]