BioLiP

>protein
GFKQDIATIRGDLRTYAQDIFLAFLNKYPDERRYFKNYVGKSDQELKSMAKFGDHSEKVFNLMMEVADRATDCVPLASDA
NTLVQMKQHSSLTTGNFEKLFVALVEYMRASGQSFDSQSWDRFGKNLVSALSSAGMK

The query sequence (length=137) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7acp:A	137	137	0.9562	0.9562	0.9562	3.94e-97	7acp:B, 7adf:A, 7adf:B, 7adq:A, 7adq:B, 7adx:A, 7adx:B, 5chq:A, 5chq:B, 5chr:A, 5chr:B, 6ch5:A, 6ch5:B, 6ch6:A, 6ch6:B, 6cke:A, 6cke:B, 6co5:A, 6co5:B, 6cre:A, 6cre:B, 8dog:A, 8dog:B, 8doh:A, 8doh:B, 8doi:A, 8doi:B, 8doj:A, 8doj:B, 3dr9:A, 3dr9:B, 4dwt:A, 4dwt:B, 4dwu:A, 4dwu:B, 8ejn:A, 8ejn:B, 1ew6:A, 1ew6:B, 1ewa:A, 1ewa:B, 4fh6:A, 4fh6:B, 4fh7:A, 4fh7:B, 4gzg:A, 4gzg:B, 4hsw:A, 4hsw:B, 4hsx:A, 4hsx:B, 6i6g:A, 6i6g:B, 6i7f:A, 6i7f:B, 4ilz:A, 4ilz:B, 3ixf:A, 3ixf:B, 4jac:A, 4jac:B, 7jor:A, 7jor:B, 4jyq:A, 4jyq:B, 5k1l:A, 5k1l:B, 3k3u:A, 3k3u:B, 7kcu:A, 7kcu:B, 7kfm:A, 7kfm:B, 4kjt:A, 4kjt:B, 4kmv:A, 4kmv:B, 4kmw:A, 4kmw:B, 4kn3:A, 4kn3:B, 3kun:A, 3kun:B, 3kuo:A, 3kuo:B, 3lb1:A, 3lb1:B, 3lb2:A, 3lb2:B, 3lb3:A, 3lb3:B, 3lb4:A, 3lb4:B, 5lk9:A, 5lk9:B, 5lkv:A, 5lkv:B, 5llz:A, 5llz:B, 7lzk:A, 7lzk:B, 7lzn:A, 7lzn:B, 7lzo:A, 7lzo:B, 7m0f:A, 7m0f:B, 7m0h:A, 7m0h:B, 7m1i:A, 7m1i:B, 7m1j:A, 7m1j:B, 7m1k:A, 7m1k:B, 7mnh:A, 7mnh:B, 3mou:A, 3mou:B, 3mym:A, 3mym:B, 3myn:A, 3myn:B, 3o7n:A, 3o7n:B, 3oj1:A, 3oj1:B, 3ok5:A, 3ok5:B, 6ong:A, 6ong:B, 6onk:A, 6onk:B, 6onr:A, 6onr:B, 6onx:A, 6onx:B, 6onz:A, 6onz:B, 6oo1:A, 6oo1:B, 6oo6:A, 6oo6:B, 6oo8:A, 6oo8:B, 3ord:A, 3ord:B, 2qfk:A, 2qfk:B, 2qfn:A, 2qfn:B, 7sjb:A, 7sjb:B, 7sjc:A, 7sjc:B, 7sjd:A, 7sjd:B, 7sje:A, 7sje:B, 7sjf:A, 7sjf:B, 7sjg:A, 7sjg:B, 7sjh:A, 7sjh:B, 7sji:A, 7sji:B, 7t9c:A, 7t9c:B, 7t9d:A, 7t9d:B, 7t9e:AAA, 7t9e:BBB, 5v5j:A, 5v5j:B, 5v5q:A, 5v5q:B, 5v5r:B, 5v5r:A, 6vd3:A, 6vd3:B, 6vd4:A, 6vd4:B, 6vd5:A, 6vd5:B, 6vd6:A, 6vd6:B, 6vdr:A, 6vdr:B, 6vds:A, 6vds:B, 6vdt:A, 6vdt:B, 6vdu:A, 6vdu:B, 6vdv:A, 6vdv:B, 6vdw:A, 6vdw:B, 6vdx:A, 6vdx:B, 6vdy:A, 6vdy:B, 8vkc:AAA, 8vkc:BBB, 8vkd:AAA, 8vkd:BBB, 5vlx:A, 5vlx:B, 8vsk:AAA, 8vsk:BBB, 5vts:A, 5vts:B, 5vtt:A, 5vtt:B, 8vzr:A, 8vzr:B
2	1dm1:A	146	124	0.2409	0.2260	0.2661	2.82e-05	2fal:A, 2fam:A, 1mba:A, 3mba:A, 4mba:A, 5mba:A
3	1x46:A	150	139	0.2263	0.2067	0.2230	0.001
4	3a5a:A	152	56	0.1314	0.1184	0.3214	0.004	3a5b:A, 3a5g:A, 3a9m:A, 3arj:A, 3ark:A, 3arl:A, 1x3k:A, 2zwj:A
5	1hlm:A	158	112	0.1971	0.1709	0.2411	0.011
6	1ith:A	141	100	0.1825	0.1773	0.2500	0.023	1ith:B
7	8oup:B	151	50	0.1095	0.0993	0.3000	0.025	8oup:A, 8oup:C, 8oup:D
8	4u8u:B	142	109	0.1752	0.1690	0.2202	0.84	4u8u:F, 4u8u:J, 4u8u:Q, 4u8u:U, 4u8u:Y, 4u8u:f, 4u8u:j, 4u8u:n
9	4zs9:B	378	66	0.1387	0.0503	0.2879	1.4	4zs9:A, 4zza:A, 4zza:B, 4zze:A, 4zze:B
10	3c4a:A	365	45	0.1022	0.0384	0.3111	1.5
11	3omb:A	503	73	0.1533	0.0417	0.2877	1.6
12	8xvg:L	3485	41	0.1022	0.0040	0.3415	1.9	8xvv:L
13	7vlf:C	150	114	0.2044	0.1867	0.2456	2.5	7vlc:C, 7vlc:G, 7vld:C, 7vld:G, 7vle:C, 7vle:G, 7vlf:G, 3wct:C, 3wct:G, 3wcu:C, 3wcu:G, 3wcv:C, 3wcv:G, 3wcw:C, 3wcw:G
14	2h0k:A	318	80	0.1752	0.0755	0.3000	2.9	2h0k:B, 2h0l:A, 2ie6:A, 2ie7:A, 1n41:A, 1n42:A, 1n44:A, 2ran:A
15	7ktr:A	3042	41	0.1022	0.0046	0.3415	3.1
16	7t3n:A	452	34	0.0949	0.0288	0.3824	3.4
17	1yhu:D	149	117	0.1898	0.1745	0.2222	5.3	1yhu:H, 1yhu:L, 1yhu:P, 1yhu:T, 1yhu:X
18	4nf9:A	216	40	0.1022	0.0648	0.3500	6.6	4nf9:B
19	8ouw:K	656	43	0.1095	0.0229	0.3488	6.9
20	2d2m:B	142	111	0.2263	0.2183	0.2793	7.7	2d2n:B, 7e96:B, 7e97:B, 7e98:B, 7e99:B, 2zfo:B, 2zs0:B, 2zs1:B
21	3a52:A	400	105	0.2190	0.0750	0.2857	8.3	3a52:B

[Back]