Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GFEFNIMVVGQSGLGKSTMVNTLFKSKVWKSNPPPTPQTLQLHSLTHVIEEVKLKLTVTDTPGFGDQINNDNCWDPILGY
INEQYEQYLQEEILITRQRHIPDTRVHCCVYFVPPTGHCLRPLDIEFLQRLCRTVNVVPVIARADSLTMEEREAFRRRIQ
QNLRTHCIDVYPQMCFDEDINDKILNSKLRDRIPFAVVGADQEHLVNGRCVLGRKTKWGIIEVENMAHCEFPLLRDLLIR
SHLQDLKDITHNIHYENYRVIRLNE

The query sequence (length=265) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6mq9:B 267 267 1.0000 0.9925 0.9925 0.0 6mq9:A, 6mq9:D, 6mq9:C, 6mqb:A, 6mqk:A, 6mqk:D, 6mqk:B, 6mqk:C, 6mql:A
2 5cyo:A 272 271 0.6566 0.6397 0.6421 1.40e-131 5cyo:B, 4yqf:B, 4yqf:A
3 6uqq:C 280 273 0.6340 0.6000 0.6154 1.18e-128 3sop:A, 3sop:B, 6uqq:D, 4z51:A, 4z54:A, 4z54:B
4 5cyp:A 248 263 0.6226 0.6653 0.6274 9.65e-120 5cyp:B, 5cyp:C
5 9bhw:B 299 270 0.5925 0.5251 0.5815 2.33e-114 9bhw:C
6 5cyp:D 227 264 0.5698 0.6652 0.5720 4.63e-107
7 9bht:C 282 267 0.4642 0.4362 0.4607 6.92e-89 9bht:D, 9bhw:A, 9bhw:D
8 7m6j:D 273 269 0.4679 0.4542 0.4610 4.02e-85 7m6j:C, 6n0b:C, 6n0b:A, 6n0b:B, 6n0b:D, 6n12:A, 6n12:B, 3t5d:A, 3t5d:C, 6uqq:A, 6uqq:B
9 8sgd:A 291 271 0.4755 0.4330 0.4649 8.03e-84 8fwp:A, 8pfh:A, 8sgd:C
10 6upq:A 270 272 0.4830 0.4741 0.4706 8.80e-82 3ftq:A, 7m6j:F, 6upr:A
11 8dkt:A 264 270 0.5019 0.5038 0.4926 1.05e-81
12 3ftq:B 252 266 0.4755 0.5000 0.4737 8.12e-79 3ftq:C, 3ftq:D, 2qnr:B, 6upa:A
13 7m6j:E 296 268 0.4151 0.3716 0.4104 3.94e-73 7m6j:B, 6upa:B
14 6upr:B 270 268 0.4151 0.4074 0.4104 3.18e-72
15 3tw4:A 218 262 0.4226 0.5138 0.4275 1.57e-71 3tw4:B
16 9bht:A 220 262 0.4377 0.5273 0.4427 4.21e-71 9bht:F
17 4kva:B 258 267 0.4302 0.4419 0.4270 7.73e-71 4kv9:A, 4kv9:B, 4kva:A
18 9bht:E 288 268 0.4113 0.3785 0.4067 9.41e-71 9bht:B
19 8dkt:B 262 266 0.4000 0.4046 0.3985 2.99e-69
20 6upq:B 247 262 0.3925 0.4211 0.3969 2.46e-67
21 7m6j:A 234 263 0.4189 0.4744 0.4221 3.12e-66
22 8pfh:B 287 269 0.4189 0.3868 0.4126 4.80e-65 8fwp:B, 8sgd:B, 8sgd:D
23 2qag:C 224 263 0.4038 0.4777 0.4068 1.32e-60
24 8pfh:C 289 270 0.3962 0.3633 0.3889 7.67e-60
25 2qa5:B 234 263 0.4264 0.4829 0.4297 1.64e-57 2qa5:A, 2qag:A, 2qnr:A
26 2qag:B 246 267 0.3736 0.4024 0.3708 8.25e-50
27 8pfh:D 291 295 0.3321 0.3024 0.2983 3.00e-45
28 5irr:B 281 277 0.2792 0.2633 0.2671 1.50e-23 5irr:A
29 1svw:A 190 100 0.1057 0.1474 0.2800 0.013 1svi:A, 1svw:B
30 1wf3:A 296 59 0.0755 0.0676 0.3390 0.023
31 3cbq:A 169 35 0.0491 0.0769 0.3714 0.052
32 5xc3:A 168 61 0.0792 0.1250 0.3443 0.066 5xc5:A
33 3iev:A 302 145 0.1283 0.1126 0.2345 0.077 7c1o:A, 3r9w:A, 3r9x:A
34 2g6b:A 162 103 0.0943 0.1543 0.2427 0.12
35 3kow:B 728 154 0.1434 0.0522 0.2468 0.18 3kow:A, 3kow:C, 3kow:D, 3kox:A, 3kox:B, 3kox:C, 3kox:D, 3koy:A, 3koy:B, 3koy:D, 3koy:C, 3koz:A, 3koz:B, 3koz:C, 3koz:D, 3kp0:A, 3kp0:B, 3kp0:C, 3kp0:D, 3kp1:C, 3kp1:A, 3kp1:D, 3kp1:B
36 3zjc:E 286 61 0.0717 0.0664 0.3115 0.21 3zjc:A, 3zjc:B, 3zjc:C, 3zjc:D
37 2cxx:A 184 143 0.1208 0.1739 0.2238 0.33 2cxx:B, 2cxx:C
38 3q85:B 151 20 0.0415 0.0728 0.5500 0.36 4aii:A, 4aii:B, 3q85:A
39 3pqc:B 194 61 0.0642 0.0876 0.2787 0.54 3pqc:A
40 3zjc:F 252 61 0.0679 0.0714 0.2951 0.57
41 2j3e:A 249 85 0.0830 0.0884 0.2588 0.57 3bb3:A, 3bb4:A, 3def:A
42 1h65:A 257 72 0.0755 0.0778 0.2778 0.66 3bb1:A, 3bb1:B, 3bb1:C, 3bb1:D, 3bb1:E, 3bb1:F, 3bb1:G, 3bb1:H, 1h65:B, 1h65:C
43 5oxf:B 591 38 0.0566 0.0254 0.3947 0.86
44 5oxf:A 703 38 0.0566 0.0213 0.3947 0.90
45 7aih:BE 84 55 0.0755 0.2381 0.3636 0.96 7ane:BE
46 7c3k:B 389 88 0.0943 0.0643 0.2841 0.99 7c3k:A, 8jqz:A, 8jqz:B
47 7vex:A 412 61 0.0830 0.0534 0.3607 1.3 8h4m:A
48 8dmf:A 718 99 0.1132 0.0418 0.3030 1.4 7uvp:A
49 3lxx:A 169 62 0.0642 0.1006 0.2742 1.6
50 5tvg:A 468 88 0.0830 0.0470 0.2500 1.7 5tvg:B, 5tvg:C, 5tvg:D, 5tvg:E, 5tvg:F, 5tvg:G, 5tvg:H, 5uof:B
51 5c1s:A 288 24 0.0415 0.0382 0.4583 1.7 5c1s:B, 5c1t:A, 5c1t:B
52 2oil:A 174 62 0.0528 0.0805 0.2258 1.9 3tso:A, 3tso:B
53 4d0g:A 167 63 0.0679 0.1078 0.2857 2.0 4drz:A, 1z0f:A
54 7yq0:A 173 22 0.0415 0.0636 0.5000 2.2 7yq0:B, 7yq1:A, 7yq1:B, 7yq1:C, 7yq1:D, 7yq1:E, 7yq1:F
55 2iut:A 408 29 0.0453 0.0294 0.4138 2.2 2iut:B, 2iuu:A, 2iuu:B, 2iuu:C, 2iuu:D, 2iuu:E, 2iuu:F, 6t8b:A, 6t8b:B, 6t8b:C, 6t8b:F, 6t8b:D, 6t8b:E, 6t8g:A, 6t8g:B, 6t8g:C, 6t8g:D, 6t8g:E, 6t8g:F, 6t8o:A, 6t8o:B, 6t8o:C, 6t8o:D, 6t8o:E, 6t8o:F
56 3ieu:A 293 59 0.0717 0.0648 0.3220 2.2 3ieu:B
57 7szs:A 204 153 0.1472 0.1912 0.2549 2.2 7szs:B
58 6hiv:Bf 50 36 0.0566 0.3000 0.4167 2.4 6hix:Bf
59 2e87:A 356 120 0.0981 0.0730 0.2167 2.5
60 6g0z:A 290 58 0.0679 0.0621 0.3103 2.6 6g0z:B, 6g12:A, 6g12:B, 6g14:B, 6g14:A, 6g15:A, 6g15:B
61 3rwm:B 179 61 0.0642 0.0950 0.2787 3.0 3rwo:B, 3rwo:A
62 6mfu:A 216 22 0.0415 0.0509 0.5000 3.3 6mfu:B, 6mfu:C, 6mfu:D
63 8iy6:R 293 58 0.0604 0.0546 0.2759 3.5
64 8iy5:R 316 58 0.0604 0.0506 0.2759 3.5 8hbd:R, 8hcx:C, 8xgr:R, 8xve:R, 8xvh:R
65 6s5f:A 188 62 0.0528 0.0745 0.2258 3.5
66 5m7h:A 420 90 0.0830 0.0524 0.2444 4.0 4dcs:A, 4dct:A, 4dcu:A, 2hjg:A, 5mbs:A, 5x4b:A, 5x4b:B
67 3cpj:B 164 60 0.0604 0.0976 0.2667 4.5
68 1tq6:A 402 19 0.0377 0.0249 0.5263 4.7 5fph:A, 5fph:B, 5fph:C, 5fph:D, 5fph:E, 5fph:F, 5fph:G, 4lv5:B, 4lv8:B, 1tpz:A, 1tpz:B, 1tq2:A, 1tq2:B, 1tq4:A
69 6if2:B 178 61 0.0679 0.1011 0.2951 5.1 6ekk:C, 6ekk:D, 6if3:B
70 1byu:B 215 61 0.0642 0.0791 0.2787 5.4 6a38:A, 6a3a:A, 6a3b:A, 6a3c:A, 6a3e:A, 3a6p:C, 3a6p:H, 7b51:B, 2bku:A, 2bku:C, 5bxq:C, 5bxq:D, 5bxq:E, 1byu:A, 4c0q:C, 4c0q:D, 3ch5:A, 5ciq:A, 5ciq:B, 5cit:A, 5cit:B, 5ciw:A, 5ciw:B, 6cit:A, 5cj2:A, 5cj2:B, 5cj2:C, 5cj2:D, 5cj2:E, 5cj2:F, 5cj2:G, 5cj2:H, 5cll:A, 5cll:C, 5clq:A, 5clq:C, 7cnd:A, 7dbg:A, 5dh9:A, 5dha:A, 5dhf:A, 5di9:A, 5dif:A, 5dis:B, 5dlq:C, 5dlq:D, 3ea5:A, 3ea5:C, 3gj0:A, 3gj0:B, 3gj3:A, 3gj4:A, 3gj4:C, 3gj5:A, 3gj5:C, 3gj6:A, 3gj7:A, 3gj7:C, 3gj8:A, 3gj8:C, 3gjx:C, 3gjx:F, 4gmx:A, 4gpt:A, 4hat:A, 4hau:A, 4hav:A, 4haw:A, 4hax:A, 4hay:A, 4haz:A, 4hb0:A, 4hb2:A, 4hb3:A, 4hb4:A, 8hq3:A, 8hq4:A, 8hq5:A, 8hq6:A, 8huf:A, 8hug:A, 1ibr:A, 1ibr:C, 8itv:A, 5jlj:A, 1k5d:A, 1k5d:D, 1k5d:G, 1k5d:J, 1k5g:A, 1k5g:D, 1k5g:G, 1k5g:J, 6kft:A, 7l5e:A, 6lq9:A, 6m60:A, 6m6x:A, 7mnp:A, 7mnp:C, 7mnq:A, 7mnr:A, 7mns:A, 7mnt:A, 7mnt:C, 7mnu:A, 7mnv:A, 7mnw:A, 7mnw:C, 7mnw:E, 7mnw:G, 7mnx:A, 7mnx:C, 7mnx:E, 7mnx:G, 7mnx:I, 7mnx:K, 7mny:A, 7mny:C, 7mny:E, 7mny:G, 7mny:I, 7mny:K, 7mnz:A, 7mnz:C, 7mnz:E, 7mnz:G, 7mnz:I, 7mnz:K, 7mo0:A, 7mo0:C, 7mo1:A, 7mo2:A, 7mo2:C, 7mo3:A, 7mo3:C, 7mo4:A, 7mo4:C, 7mo5:A, 3nby:C, 3nby:F, 3nbz:C, 3nbz:F, 3nc0:C, 3nc0:F, 3nc1:C, 4ol0:A, 6q82:B, 6q84:B, 6q84:E, 1qbk:C, 1qg2:A, 1qg4:A, 1qg4:B, 3ran:A, 3ran:B, 3ran:C, 3ran:D, 1rrp:A, 1rrp:C, 6tvo:B, 5uwh:A, 5uwi:A, 5uwj:A, 5uwo:A, 5uwp:A, 5uwq:A, 5uwr:A, 5uws:A, 5uwt:A, 5uwu:A, 5uww:A, 3w3z:B, 1wa5:A, 4wvf:A, 6x2m:A, 6x2o:A, 6x2p:A, 6x2r:A, 6x2s:A, 6x2u:A, 6x2v:A, 6x2w:A, 6x2x:A, 6x2y:A, 6xjp:A, 6xjr:A, 6xjs:A, 6xjt:A, 6xju:A, 7ypz:A, 5yro:A, 5yst:A, 5ysu:A, 5ytb:A, 5yu6:B, 5yu6:D, 3zjy:A, 3zjy:D, 3zjy:F, 5zpu:A
71 2xto:A 224 29 0.0377 0.0446 0.3448 5.5 2xtm:A, 2xtm:B, 2xtn:A, 2xto:B
72 6h4d:A 274 18 0.0415 0.0401 0.6111 5.5
73 8bns:A 433 17 0.0340 0.0208 0.5294 6.1 8bns:B, 8bns:C, 8bns:D
74 5fv0:B 458 29 0.0491 0.0284 0.4483 6.3
75 6i7n:A 490 29 0.0377 0.0204 0.3448 6.8 4adw:A, 4adw:B, 4apn:A, 4apn:B, 5ebk:A, 5ebk:B, 6er5:A, 6i7n:B, 2jk6:A, 2jk6:B, 6t95:A, 6t97:A, 6t98:A, 2w0h:A, 2w0h:B, 2x50:A, 2x50:B, 2yau:A, 2yau:B
76 4lya:A 521 29 0.0491 0.0250 0.4483 6.9 5fv0:A
77 5x93:A 430 58 0.0604 0.0372 0.2759 6.9 6k1q:A, 5xpr:A
78 7pr1:A 587 21 0.0453 0.0204 0.5714 7.4 7pr1:B, 7pru:A, 7pru:B
79 6igk:A 471 58 0.0604 0.0340 0.2759 7.7 5glh:A, 6igl:A, 6lry:A
80 8tzf:A 1589 24 0.0377 0.0063 0.4167 8.6
81 4v8l:D 2822 39 0.0642 0.0060 0.4359 8.6 4ce4:o, 6hiv:US, 6hiv:UT, 6hiw:US, 6hiw:UT, 6hiy:US, 6hiy:UT, 4v8l:E, 4v8l:F, 4v8l:A, 4v8l:B, 4v8l:C, 4v8v:A, 4v8v:B, 4v8v:C, 4v8v:D, 4v8v:E, 4v8v:F, 4v8w:D, 4v8w:E, 4v8w:F, 4v8w:A, 4v8w:B, 4v8w:C
82 8u8b:A 1712 24 0.0377 0.0058 0.4167 8.8 8u7l:B, 8u7l:A, 8u8a:B, 8u8a:C, 8u8b:B, 2zej:A
83 8fo9:F 2289 24 0.0377 0.0044 0.4167 9.0 9c61:A, 9c61:B, 8fo2:E, 8fo7:C, 8fo8:C, 8fo8:E, 8fo9:E, 7lht:A, 7lht:B, 7lhw:A, 7li3:A, 7li4:A, 6oje:A, 6oje:B, 6ojf:A, 6ojf:B, 7thy:A, 7thz:A, 6xaf:A, 6xaf:B, 2zej:B
84 5ws4:A 650 18 0.0415 0.0169 0.6111 9.1 5ws4:B
85 8kie:y 363 31 0.0453 0.0331 0.3871 9.8
86 8jxu:A 1410 20 0.0415 0.0078 0.5500 10.0 8jxq:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218