>protein
GELEFVPLAANDDETVGQWLDLMALAAETGPRAAPPCNVDMVGSLRFAPPATALDDWVVRSGGRVVGALRLALPDGAPTA
RVDQLLVHPGRRRRGIGRALWAHARELARKHDRTTLTATVVESLPSGPAQDPGPAAFAAAMGAHRSDIPAGTHQWLDLDR
HDPLADGVPAVPAGYSLVTWGTITPDEYAVPVSELELRAAQEVRTSYARQFETMRVGRGRRAYHTGAVHDATGALAGYTS
VSKTTGNPAYALQGMTVVHREHRGHALGTLLKLANLEYVLRHEPEVRLVETANAEDNHPMIAVNAALGFEPYDRWVFWTA
EAGPSD
The query sequence (length=326) is searched through a non-redundant set of database sequences
protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.
# |
Hit |
Hit length |
Aligned length |
Identity (normalized by query) |
Identity (normalized by hit) |
Identity (normalized by aligned length) |
E-value |
Homologs to hit |
1 |
2wpw:A |
328 |
326 |
1.0000 |
0.9939 |
1.0000 |
0.0 |
2wpw:B, 2wpw:C, 2wpw:D, 2wpx:A, 2wpx:B |
2 |
1ghe:B |
171 |
63 |
0.0736 |
0.1404 |
0.3810 |
1.91e-04 |
1ghe:A, 1j4j:A, 1j4j:B |
3 |
2c27:A |
301 |
43 |
0.0613 |
0.0664 |
0.4651 |
0.089 |
1ozp:A, 1p0h:A |
4 |
6b3t:A |
396 |
60 |
0.0798 |
0.0657 |
0.4333 |
1.5 |
6b0u:A, 6b0u:B, 6b0u:C, 8d1r:A, 8d23:A, 8d25:A, 5ebv:A, 5ec4:A, 8f4a:A, 8f4t:A, 8f4u:A, 8f4w:A, 8f4z:A, 8f51:A, 8f55:A, 8f57:A, 8f58:A, 5iv0:A, 4jd6:A, 4jd6:B, 4jd6:C, 4jd6:D, 4jd6:E, 4jd6:F, 6p3t:A, 6p3u:A, 6p3v:A, 3r1k:A, 3ryo:A, 3ryo:B, 3ryo:C, 3ryo:D, 3ryo:E, 3ryo:F, 3ryo:G, 3ryo:H, 3ryo:I, 3ryo:J, 3ryo:K, 3ryo:L, 5tvj:A, 6vur:A, 6vus:A, 6vut:A, 6vuu:A, 6vuw:A, 6vux:A, 6vuy:A, 6vuz:A, 6vv0:A, 6vv1:A, 6vv2:A, 6vv3:A, 6x10:A, 6x6g:AAA, 6x6i:AAA, 6x6y:AAA, 6x7a:AAA |
5 |
3f8k:A |
131 |
104 |
0.0859 |
0.2137 |
0.2692 |
1.8 |
|
6 |
5wci:A |
284 |
84 |
0.0798 |
0.0915 |
0.3095 |
1.9 |
6ba2:A, 6ba4:A, 7cmr:A, 6ct2:A, 4dnc:A, 4dnc:B, 2giv:A, 5j8c:A, 5j8f:A, 6oin:A, 6oio:A, 6oip:A, 6oiq:A, 6oir:A, 6owh:A, 6owi:A, 6pd8:A, 6pd9:A, 6pda:A, 6pdb:A, 6pdc:A, 6pdd:A, 6pde:A, 6pdf:A, 6pdg:A, 2pq8:A, 3qah:A, 3toa:A, 3tob:A, 8w13:A, 2y0m:A |
7 |
1dvr:A |
220 |
75 |
0.0644 |
0.0955 |
0.2800 |
4.1 |
1aky:A, 2aky:A, 3aky:A, 1dvr:B |
8 |
2zpa:B |
662 |
37 |
0.0429 |
0.0211 |
0.3784 |
5.5 |
2zpa:A |
9 |
1h4b:A |
84 |
38 |
0.0460 |
0.1786 |
0.3947 |
7.7 |
|
[Back]