GEIEFIESSKDAGFPVINTPSKTKLEPSVFHQVFEGNKEPAVLRSGDPRLKANFEEAIFSKYIGNVNTHVDEYMLEAVDH
YAGQLATLDISTEPMKLEDAVYGTEGLEALDLTTSAGYPYVALGIKKRDILSKKTKDLTKLKECMDKYGLNLPMVTYVKD
ELRSIEKVAKGKSRLIEASSLNDSVAMRQTFGNLYKTFHLNPGVVTGSAVGCDPDLFWSKIPVMLDGHLIAFDYSGYDAS
LSPVWFACLKMILEKLGYTHKETNYIDYLCNSHHLYRDKHYFVRGGMPSGCSGTSIFNSMINNIIIRTLMLKVYKGIDLD
QFRMIAYGDDVIASYPWPIDASLLAEAGKGYGLIMTPADKGECFNEVTWTNVTFLKRYFRADEQYPFLVHPVMPMKDIHE
SIRWTKDPKNTQDHVRSLCLLAWHNGEHEYEEFIRKIRSVPVGRCLTLPAFSTLRRKWLDSFG
The query sequence (length=463) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.
| # | Hit | Hit length |
Aligned length |
Identity (normalized by query) |
Identity (normalized by hit) |
Identity (normalized by aligned length) |
E-value | Homologs to hit |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 3cdu:A | 468 | 462 | 0.9935 | 0.9829 | 0.9957 | 0.0 | 3cdw:A, 4k4x:A, 4k4x:E, 4k4x:I, 4k4x:M, 4k4y:A, 4k4y:E, 4k4y:I, 4k4y:M, 4k4z:A, 4k4z:E, 4k4z:I, 4k4z:M, 4y2a:A, 4y34:A |
| 2 | 2ijd:1 | 644 | 462 | 0.7387 | 0.5311 | 0.7403 | 0.0 | 4dcd:A, 2ijd:2, 2ily:A, 2ilz:A, 2im0:A, 2im1:A, 2im2:A, 2im3:A, 4k4s:A, 4k4s:E, 4k4t:A, 4k4t:E, 4k4u:A, 4k4u:E, 4k4v:A, 4k4v:E, 4k4w:A, 4k4w:E, 3ol6:A, 3ol6:E, 3ol6:I, 3ol6:M, 3ol7:A, 3ol7:E, 3ol7:I, 3ol7:M, 3ol8:A, 3ol8:E, 3ol8:I, 3ol8:M, 3ol9:A, 3ol9:E, 3ol9:I, 3ol9:M, 3ola:A, 3ola:E, 3ola:I, 3ola:M, 3olb:A, 3olb:E, 3olb:I, 3olb:M, 1ra7:A |
| 3 | 5xe0:A | 457 | 457 | 0.7343 | 0.7440 | 0.7440 | 0.0 | 5zit:A |
| 4 | 6lse:A | 464 | 462 | 0.6674 | 0.6659 | 0.6688 | 0.0 | 5f8g:A, 5f8h:A, 5f8i:A, 5f8j:A, 5f8l:A, 5f8m:A, 5f8n:A, 4ika:A, 6kwq:A, 6kwr:A, 6lsf:A, 6lsg:A, 6lsh:A, 3n6m:A, 3n6n:A, 7w9s:A, 5y6z:A, 5y6z:E |
| 5 | 4k50:A | 460 | 463 | 0.5724 | 0.5761 | 0.5724 | 0.0 | 4k50:I, 4k50:E, 4k50:M, 1tp7:A |
| 6 | 1rdr:A | 316 | 286 | 0.4320 | 0.6329 | 0.6993 | 3.10e-147 | |
| 7 | 1rdr:A | 316 | 90 | 0.0972 | 0.1424 | 0.5000 | 2.22e-16 | |
| 8 | 4nyz:A | 460 | 458 | 0.3132 | 0.3152 | 0.3166 | 2.68e-77 | |
| 9 | 4wyw:A | 479 | 463 | 0.3002 | 0.2902 | 0.3002 | 4.00e-62 | 8c1n:A, 8c1n:B, 8c2p:A, 2d7s:A, 2e9r:X, 2e9t:A, 2e9t:D, 2e9z:A, 2ec0:A, 2ec0:D, 2f8e:X, 6gvy:A, 4iqx:A, 5jxs:A, 3klv:A, 3kmq:A, 3kms:A, 3kna:A, 3koa:A, 5n95:A, 3nl0:A, 3nma:A, 1wne:A, 4wyl:A, 4wzm:A, 4wzq:A, 4x2b:A |
| 10 | 3qid:A | 492 | 340 | 0.1879 | 0.1768 | 0.2559 | 8.22e-11 | 3nai:A, 3nai:B, 3nai:C, 4nru:A, 4nru:B, 4nru:C, 4nru:D, 4nru:E, 4nru:F, 4o4r:A, 4o4r:B, 4o4r:C, 3qid:B, 3qid:C, 3sfg:A, 3sfg:B, 3sfg:C, 3sfu:A, 3sfu:B, 3sfu:C, 3upf:A, 3upf:B, 3upf:C, 3ur0:B, 3ur0:C |
| 11 | 1khw:B | 497 | 370 | 0.1944 | 0.1811 | 0.2432 | 5.51e-10 | 1khw:A |
| 12 | 1sh3:B | 503 | 418 | 0.2181 | 0.2008 | 0.2416 | 1.36e-07 | 3bsn:A, 3bso:A, 3h5x:A, 3h5y:A, 4lq3:A, 4lq9:A, 4nrt:A, 4qpx:A, 1sh3:A, 5tsn:A |
| 13 | 8iib:A | 355 | 158 | 0.0821 | 0.1070 | 0.2405 | 0.69 | 8iib:B |
| 14 | 2ipi:A | 492 | 92 | 0.0518 | 0.0488 | 0.2609 | 1.7 | 2ipi:B, 2ipi:C, 2ipi:D |
| 15 | 8gjk:C | 1032 | 154 | 0.0864 | 0.0388 | 0.2597 | 4.0 | 8gjl:C, 8gk0:C, 8gk4:C |
| 16 | 3rwm:B | 179 | 81 | 0.0497 | 0.1285 | 0.2840 | 5.7 | 3rwo:B, 3rwo:A |
| 17 | 4ffg:A | 480 | 60 | 0.0454 | 0.0437 | 0.3500 | 6.0 | 4ffg:B, 4ffg:C, 4ffg:D, 4ffh:A, 4ffh:B, 4ffh:C, 4ffh:D, 4ffi:A, 4ffi:B, 4ffi:C, 4ffi:D |
| 18 | 3pg9:A | 338 | 84 | 0.0497 | 0.0680 | 0.2738 | 7.7 | 3pg9:F, 3pg9:B, 3pg9:G, 3pg9:C, 3pg9:E, 3pg9:D, 3pg9:H, 1rzm:A, 1rzm:B |
| 19 | 2jf6:B | 472 | 55 | 0.0367 | 0.0360 | 0.3091 | 8.7 | 2jf6:A, 3zj7:A, 3zj7:B, 3zj8:A, 3zj8:B |
umich.edu