Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
GEFLATTLERIEKNFVITDPRLPDNPIIFASDSFLQLTEYSREEILGRNCRFLQGPETDRATVRKIRDAIDNQTEVTVQL
INYTKSGKKFWNLFHLQPMRDQKGDVQYFIGVQLDGTEHVRDAAEREGVMLIKKTAENIDEAAKEL

The query sequence (length=146) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2wkp:A 320 143 0.9795 0.4469 1.0000 1.70e-102 6agp:A, 7ajk:BBB, 6bc1:A, 6bc1:B, 2c2h:A, 2c2h:B, 1ds6:A, 1e96:A, 2fju:A, 2g0n:A, 2g0n:B, 1g4u:R, 4gzl:A, 4gzl:B, 4gzm:A, 4gzm:B, 2h7v:A, 2h7v:B, 1he1:C, 1he1:D, 1hh4:A, 1hh4:B, 1i4d:D, 1i4l:D, 1i4t:D, 2ic5:A, 2ic5:B, 1mh1:A, 5n6o:A, 5n6o:B, 5o33:A, 2ov2:A, 2ov2:F, 2ov2:B, 2ov2:C, 2ov2:G, 2ov2:D, 2ov2:E, 2ov2:H, 2p2l:A, 2p2l:B, 2p2l:C, 8q0n:C, 2qme:A, 5qqd:A, 5qqe:A, 5qqf:A, 5qqg:A, 5qqh:A, 5qqi:A, 5qqj:A, 5qqk:A, 5qql:A, 5qqm:A, 5qqn:A, 2rmk:A, 1ryf:A, 1ryf:B, 1ryh:A, 1ryh:B, 3ryt:C, 3sbd:A, 3sbd:B, 3sbe:A, 3su8:A, 3sua:A, 3sua:B, 3sua:C, 3th5:A, 3th5:B, 7usd:F, 7use:F, 7use:G, 2w2t:A, 2w2v:A, 2w2v:B, 2w2v:C, 2w2v:D, 2w2x:A, 2w2x:B, 8wej:E, 2wkq:A, 2wkr:A
2 5hzh:A 320 142 0.9589 0.4375 0.9859 6.42e-100
3 5hzi:A 476 143 0.9726 0.2983 0.9930 7.24e-100 5djt:A, 5dju:A, 5dju:C, 5efw:A, 5hzi:B, 5hzj:A, 5hzj:B, 5hzk:B, 5hzk:D, 7pgx:AAA, 7pgy:AAA, 7pgz:AAA, 7ph0:AAA, 2v0u:A, 2v0w:A, 2v1a:A, 2v1b:A
4 7tbq:A 375 138 0.9041 0.3520 0.9565 2.54e-94 7tal:A, 7tbn:A, 7tbq:B, 7tbq:C, 7tbq:D, 7tbq:E
5 7tcd:A 436 135 0.8562 0.2867 0.9259 8.00e-88 4wf0:A, 4wf0:B
6 4hhd:A 152 143 0.8288 0.7961 0.8462 2.97e-86 4hhd:B
7 7qf2:AAA 117 106 0.6301 0.7863 0.8679 2.88e-66 8a2v:A, 8a2w:A, 8a2w:B, 8a4e:A, 4eep:A, 4eer:A, 4ees:A, 4eet:B, 6gpu:A, 6gpv:A, 8q5f:A, 8q5f:B, 7qf3:AAA, 7qf4:AAA, 7qf5:AAA, 6qqh:A, 6qqi:A, 6qqj:A, 6qqk:A, 6qsa:A, 6s45:A, 6s46:A
8 4eeu:A 109 108 0.6027 0.8073 0.8148 1.03e-62 7aby:A, 4eet:D, 4nxb:A, 4nxb:B, 4nxe:A, 4nxe:B, 4nxf:A, 4nxf:B, 4nxg:A, 4nxg:B
9 1g28:A 104 101 0.5205 0.7308 0.7525 9.88e-55 1g28:B, 1g28:C, 1g28:D, 1jnu:A, 1jnu:B, 1jnu:C, 1jnu:D
10 3ue6:E 138 110 0.4110 0.4348 0.5455 1.43e-40 3ue6:A, 3ue6:B, 3ue6:C, 3ue6:D, 3ue6:F, 3ulf:A, 3ulf:B, 3ulf:C, 3ulf:D, 3ulf:E, 3ulf:F
11 6t74:B 141 107 0.3904 0.4043 0.5327 4.45e-39 5a8b:A, 5a8b:B, 5a8b:C, 5a8b:D, 5dkk:A, 5dkk:B, 5dkl:A, 5dkl:B, 6t73:A, 6t73:B, 6t73:C, 6t74:A
12 6i21:A 135 120 0.3904 0.4222 0.4750 6.28e-39 6i20:A, 6i20:B, 6i20:C, 6i20:D, 6i22:A, 6i22:B, 6i22:C, 6i22:D, 6i23:A, 6i23:B, 6i24:A, 6i25:A
13 2z6d:A 118 116 0.3493 0.4322 0.4397 4.41e-36 2z6d:B
14 6ph4:B 460 103 0.3562 0.1130 0.5049 2.80e-34 5epv:A, 5epv:B, 5epv:C, 5epv:D, 6ph2:A, 6ph2:B, 6ph2:C, 6ph2:D, 6ph3:A, 6ph3:B, 6ph3:C, 6ph3:D, 6ph4:A, 6pps:A, 6pps:B, 6pps:C, 6pps:D, 3t50:A, 3t50:B
15 4gcz:B 378 118 0.3973 0.1534 0.4915 7.41e-34 4gcz:A
16 8qi8:A 110 108 0.3425 0.4545 0.4630 4.67e-33 1n9l:A, 1n9n:A, 1n9o:A, 8qi9:A, 8qia:A, 8qib:A, 8qif:A, 8qig:A, 8qih:A, 8qii:A, 8qik:A, 8qil:A, 8qim:A, 8qin:A, 8qio:A, 8qip:A, 8qiq:A, 8qir:A, 8qis:A, 8qit:A, 8qiu:A, 8qiv:A, 8qiw:A
17 2mwg:A 261 118 0.3836 0.2146 0.4746 9.06e-33 2mwg:B, 2pr5:A, 2pr5:B, 2pr6:A, 2pr6:B
18 2z6c:A 121 118 0.3219 0.3884 0.3983 1.43e-31 2z6c:B
19 6gb3:A 120 102 0.3151 0.3833 0.4510 3.65e-30 6gay:A, 6gay:B, 6gba:A, 6gbv:A, 4kuk:A, 4kuo:A, 7zqu:A
20 8pm1:A 109 107 0.3288 0.4404 0.4486 6.17e-30 7ab6:A, 7ab6:B, 7ab7:A, 7ab7:B, 8pky:A, 8pky:B, 8pm1:B, 6rhf:A, 6rhf:B, 6rhg:A, 6rhg:B, 6y7r:A, 6y7r:B, 6y7u:A, 6y7u:B, 6ywg:A, 6ywg:B, 6ywh:A, 6ywh:B, 6ywi:A, 6ywi:B, 6ywq:A, 6ywq:B, 6ywr:B, 6ywr:A, 6yx4:A, 6yx4:B, 6yx6:A, 6yx6:B, 6yxb:A, 6yxb:B, 6yxb:C, 6yxb:D, 6yxc:A, 6yxc:B
21 8j68:A 129 122 0.3219 0.3643 0.3852 2.36e-28 8i11:A, 8il9:A, 8iyn:A
22 6hmj:A 359 106 0.3219 0.1309 0.4434 1.02e-26 6hmj:B, 6hmj:C, 6hmj:D
23 3hjk:A 150 112 0.3014 0.2933 0.3929 2.10e-26 6cny:A, 6cny:B, 6cny:C, 6cny:D, 3d72:A, 3d72:B, 3hji:A, 3hji:B, 3hjk:B, 3is2:A, 3is2:B, 2pd7:A, 2pd7:B, 2pd8:A, 2pd8:B, 2pdr:A, 2pdr:B, 2pdr:C, 2pdr:D, 3rh8:B, 3rh8:D
24 4r3a:A 318 106 0.2945 0.1352 0.4057 1.16e-24 4r38:A, 4r38:B, 4r38:C, 4r38:D, 4r39:A, 4r39:B, 4r39:C, 4r39:D
25 7oo9:A 106 105 0.3356 0.4623 0.4667 1.65e-24 7oo9:B
26 8a5r:AAA 206 100 0.2877 0.2039 0.4200 2.01e-23 8a5s:AAA, 3p7n:A, 3p7n:B
27 8c05:A 305 104 0.2671 0.1279 0.3750 3.31e-22
28 4r3a:B 278 102 0.2740 0.1439 0.3922 2.40e-21
29 7wa4:B 107 102 0.2877 0.3925 0.4118 2.40e-21
30 4wuj:C 145 106 0.2877 0.2897 0.3962 5.02e-21 4wuj:A, 4wuj:B, 4wuj:D
31 5svu:B 135 120 0.2877 0.3111 0.3500 7.32e-19 5svg:B, 5svg:A, 5svg:C, 5svg:D, 5svu:A, 5svu:C, 5svu:D, 5svv:D, 5svv:A, 5svv:B, 5svv:C, 5svw:B, 5svw:A, 5svw:C, 5svw:D, 6wle:B, 6wle:A, 6wle:C, 6wle:D, 6wle:E, 6wle:F, 6wle:G, 6wlp:B, 6wlp:A, 6wlp:C, 6wlp:D, 6wlp:E, 6wlp:F, 6wlp:G
32 8a6x:B 368 119 0.2603 0.1033 0.3193 2.78e-17 8a3u:A, 8a52:A, 8a52:B, 8a6x:A, 8a7f:A, 8a7f:B, 8a7h:A, 8a7h:B
33 7a6p:A 149 120 0.2534 0.2483 0.3083 3.01e-17 7a6p:B
34 7yx0:A 166 114 0.2671 0.2349 0.3421 6.49e-17 7yx0:C
35 7r56:A 137 120 0.2603 0.2774 0.3167 9.49e-17 8a33:A, 8a36:A, 8a36:B, 8a36:C, 8a36:D, 8a37:A, 6gg9:A, 6gg9:B, 6gg9:C, 6gg9:D, 5j3w:A, 5j3w:B, 5j3w:C, 5j3w:D, 5j4e:A, 5j4e:B, 5j4e:C, 5j4e:D, 8q5e:A, 8q5e:B, 7r4s:A, 7r4s:B, 7r4s:C, 7r4s:D, 3sw1:A, 3sw1:B
36 7r5n:B 151 107 0.2534 0.2450 0.3458 9.78e-17 7r5n:A
37 4hj6:B 178 114 0.2603 0.2135 0.3333 4.86e-16 4hia:A, 4hia:B, 4hj3:A, 4hj3:B, 4hj4:A, 4hj4:B, 4hj6:A, 4hnb:A, 4hnb:B, 7ob0:A, 7ob0:B, 7ob0:C, 7ob0:D, 7obz:A, 7obz:B, 7obz:C, 7obz:D, 7obz:E, 7obz:F
38 7yid:A 660 101 0.1781 0.0394 0.2574 2.25e-12 7yid:B, 7yid:C, 7yid:D
39 3ewk:A 227 91 0.1575 0.1013 0.2527 5.43e-07
40 3ewk:A 227 95 0.1233 0.0793 0.1895 0.047
41 2gj3:A 119 117 0.2055 0.2521 0.2564 4.62e-06 2gj3:B
42 6pl0:B 608 84 0.1370 0.0329 0.2381 0.002 5akp:A, 5akp:B, 7l59:A, 6ndo:A, 6ndo:B, 6ndp:A, 6ndp:B, 6pl0:A, 5uyr:A, 5uyr:B
43 8dik:A 127 92 0.1233 0.1417 0.1957 0.032 8dik:B
44 6iix:A 323 70 0.1301 0.0588 0.2714 1.1 4mfk:A, 4mfl:A, 4mfp:A, 4mfq:A, 4q36:A, 4q38:A
45 4jmr:B 173 74 0.1370 0.1156 0.2703 1.3 4jmr:D, 4jmr:A, 4jmr:C
46 7x0l:A 409 43 0.1096 0.0391 0.3721 2.2 7x0j:A, 7x0j:B, 7x0k:A, 7x0k:B, 7x0l:B, 7x0m:A, 7x0m:B, 7x0n:A, 7x0n:B
47 1w2b:R 84 39 0.1027 0.1786 0.3846 7.2 3cc2:S, 3cc4:S, 3cc7:S, 3cce:S, 3ccj:S, 3ccl:S, 3ccm:S, 3ccq:S, 3ccr:S, 3ccs:S, 3ccu:S, 3ccv:S, 3cd6:S, 3cma:S, 3cme:S, 3cpw:R, 3cxc:R, 3g4s:S, 3g6e:S, 3g71:S, 3i55:S, 3i56:S, 1jj2:R, 1k73:T, 1k8a:T, 1k9m:T, 1kc8:T, 1kd1:T, 1kqs:R, 1m1k:T, 1m90:T, 1n8r:T, 1nji:T, 2otj:S, 2otl:S, 3ow2:R, 1q7y:T, 1q81:T, 1q82:T, 1q86:T, 2qa4:S, 2qex:S, 1qvf:R, 1qvg:R, 1s72:S, 4v4p:AT, 4v4r:BX, 4v4s:BX, 4v4t:BX, 4v9f:S, 1vq4:S, 1vq5:S, 1vq6:S, 1vq7:S, 1vq8:S, 1vq9:S, 1vqk:S, 1vql:S, 1vqm:S, 1vqn:S, 1vqo:S, 1vqp:S, 1yhq:S, 1yi2:S, 1yij:S, 1yit:S, 1yj9:S, 1yjn:S, 1yjw:S
48 1s66:L 119 95 0.1712 0.2101 0.2632 7.2 1s66:U, 1s67:L, 1s67:U, 1v9y:A, 1v9y:B, 1v9z:A, 1v9z:B, 1vb6:A, 1vb6:B
49 1mfz:A 436 29 0.0822 0.0275 0.4138 7.7 1mfz:B, 1mfz:C, 1mfz:D, 1muu:C, 1muu:A, 1muu:B, 1muu:D, 1mv8:B, 1mv8:A, 1mv8:C, 1mv8:D
50 8kdb:A 2117 67 0.1164 0.0080 0.2537 8.4 8kdc:A
51 8js5:B 253 111 0.1986 0.1146 0.2613 9.0 2cmn:A, 1dp6:A, 1dp8:A, 1dp9:A, 1drm:A, 8js5:A, 8js5:C, 8js5:D, 8js5:E, 8js5:F, 8js5:G, 8js5:H, 8js5:I, 8js5:J, 8js6:A, 8js6:B, 8js6:C, 8js6:D, 8js6:E, 8js6:F, 8js6:G, 8js6:H, 8js6:I, 8js6:J, 8js7:A, 8js7:B, 8js7:C, 8js7:D, 8js7:E, 8js7:F, 8js7:G, 8js7:H, 8js7:I, 8js7:J, 1lsv:A, 1lsw:A, 1lsx:A, 1lt0:A, 2owh:A, 2owj:A, 2vv6:A, 2vv6:D, 2vv6:B, 2vv6:C, 2vv7:A, 2vv7:B, 2vv7:C, 2vv7:D, 2vv8:A, 2vv8:D, 2vv8:B, 2vv8:C, 1xj2:A, 1xj3:A, 1xj4:A, 1xj4:B, 1xj6:A, 1xj6:B, 1y28:A
52 3jcs:K 156 80 0.1507 0.1410 0.2750 9.1

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218