BioLiP

>protein
GEERGRILISLKYSSQKQGLLVGIVRCAHLAAMDANGYSDPYVKTYLKPDVDKKSKHKTAVKKKTLNPEFNEEFCYEIKH
GDLAKKTLEVTVWDYDIGKSNDFIGGVVLGINAKGERLKHWFDCLKNKDKRIERWHTLTNEIPGAVLSD

The query sequence (length=149) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4ldc:A	149	149	1.0000	1.0000	1.0000	1.26e-109
2	2cm6:A	149	138	0.6980	0.6980	0.7536	3.21e-77	2cm5:A, 2cm6:B, 5lo8:A, 5lo8:B, 5lob:A, 5lob:B, 5lob:C, 5low:A, 5low:B, 5low:C, 5low:H, 5low:I, 5low:J
3	5cch:E	280	141	0.4228	0.2250	0.4468	5.03e-26	1byn:A, 8c5h:S, 5ccg:E, 5ccg:F, 5ccg:K, 5cch:F, 5cci:E, 5cci:F, 3f05:A, 1k5w:A, 5kj7:E, 5kj7:F, 5kj7:K, 5kj8:E, 5kj8:F, 5kj8:K, 2lha:A, 6mti:1, 6mti:2, 6mti:3, 6mti:4, 6mti:5, 6mti:6, 1tjx:A, 7tx9:A, 7u4q:A, 1uov:A, 1uow:A, 4v11:A, 5vfe:A, 5vfe:B, 5vff:A, 5vfg:A, 5w5c:F, 2yoa:A, 2yoa:B
4	5cch:E	280	122	0.3490	0.1857	0.4262	1.66e-25	1byn:A, 8c5h:S, 5ccg:E, 5ccg:F, 5ccg:K, 5cch:F, 5cci:E, 5cci:F, 3f05:A, 1k5w:A, 5kj7:E, 5kj7:F, 5kj7:K, 5kj8:E, 5kj8:F, 5kj8:K, 2lha:A, 6mti:1, 6mti:2, 6mti:3, 6mti:4, 6mti:5, 6mti:6, 1tjx:A, 7tx9:A, 7u4q:A, 1uov:A, 1uow:A, 4v11:A, 5vfe:A, 5vfe:B, 5vff:A, 5vfg:A, 5w5c:F, 2yoa:A, 2yoa:B
5	5h4z:A	129	121	0.3154	0.3643	0.3884	2.78e-24	5h4y:A, 5h4z:B
6	3hn8:A	279	109	0.3289	0.1756	0.4495	3.20e-24	1dqv:A, 3hn8:B, 3hn8:C
7	3hn8:A	279	138	0.3356	0.1792	0.3623	1.37e-22	1dqv:A, 3hn8:B, 3hn8:C
8	2uzp:A	142	111	0.2953	0.3099	0.3964	9.18e-23	2uzp:B, 2uzp:C
9	6ank:B	263	135	0.3423	0.1939	0.3778	1.10e-22	6anj:A, 6ank:A, 6lcy:A, 3n5a:A
10	6ank:B	263	109	0.3087	0.1749	0.4220	1.93e-19	6anj:A, 6ank:A, 6lcy:A, 3n5a:A
11	6uwa:A	187	112	0.3020	0.2406	0.4018	1.17e-21	1dsy:A, 3gpe:A, 2nce:A, 3twy:A, 5w4s:A
12	3pfq:A	523	130	0.3490	0.0994	0.4000	1.41e-21	1a25:A, 1a25:B, 2i0e:A, 2i0e:B
13	1w15:A	132	137	0.3423	0.3864	0.3723	6.05e-21
14	4lt7:A	128	124	0.2953	0.3438	0.3548	1.95e-17	2k3h:A, 4np9:A, 4ns0:A
15	4lcv:C	129	102	0.2685	0.3101	0.3922	6.08e-17
16	6bty:B	128	120	0.2685	0.3125	0.3333	8.09e-13	2b3r:A, 2b3r:B, 6btz:A, 6btz:D, 6btz:B, 6btz:C, 6bu0:A, 6bu0:B, 6bu0:C
17	7atp:A	129	90	0.2282	0.2636	0.3778	6.25e-10
18	5a50:A	165	110	0.2483	0.2242	0.3364	3.46e-07	5a4x:A, 5a4x:B, 5a50:B, 5a51:A, 5a51:B, 4v29:A, 4v29:B
19	7a1r:A	121	91	0.1946	0.2397	0.3187	7.21e-07	7a1r:B
20	6nyt:A	135	118	0.2282	0.2519	0.2881	3.01e-06
21	5a52:A	154	102	0.2215	0.2143	0.3235	2.13e-05
22	1djg:B	561	79	0.1611	0.0428	0.3038	1.42e-04	1djg:A, 1djh:A, 1djh:B, 1dji:A, 1dji:B, 1djw:A, 1djw:B, 1djx:A, 1djx:B, 1djy:A, 1djy:B, 1djz:A, 1djz:B
23	5ue8:A	847	96	0.1745	0.0307	0.2708	0.002	5ue8:B, 1y8f:A
24	3b7y:A	144	116	0.2215	0.2292	0.2845	0.004
25	4ihb:E	126	51	0.1208	0.1429	0.3529	0.62	7jof:A, 7jof:B, 7jof:C, 7jof:D
26	4h1g:A	670	32	0.1007	0.0224	0.4688	0.81
27	5ek8:A	668	39	0.0805	0.0180	0.3077	1.8
28	3nsj:A	530	89	0.1611	0.0453	0.2697	4.4	7pag:A, 5ug7:A, 4y1s:A, 4y1t:A
29	8p5d:LEE	135	87	0.1544	0.1704	0.2644	5.1	8p60:LEE, 8p60:KEE, 7qca:LEE
30	8boq:A	515	73	0.1611	0.0466	0.3288	6.4	8boq:D
31	6pmp:C	617	23	0.0604	0.0146	0.3913	8.2	6pmp:A, 6pmp:B, 6pmp:D
32	4a2m:B	750	26	0.0805	0.0160	0.4615	8.2	4a2l:E, 4a2m:A, 4a2m:C, 4a2m:D
33	6kxk:D	553	58	0.1208	0.0325	0.3103	8.4	6kxk:F, 6kxu:A, 6kxu:B, 6kxu:C, 6kxu:D, 6kxu:E, 6kxu:F, 6kxu:G, 6kxu:H

[Back]