Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GEDVYCICKRPDYGELMVGCDGCDDWFHFTCLHIPEQFKDLVFSFYCPYCQAGITGKEGSLPKTLWKRKCRISDCYKPCL
QDSKYCSEEHGR

The query sequence (length=92) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6j2p:A 98 93 0.9891 0.9286 0.9785 3.75e-63 6j2p:B, 6j2p:D, 6j2p:C
2 9c0o:A 63 66 0.2391 0.3492 0.3333 1.04e-09
3 3kv6:D 448 89 0.3043 0.0625 0.3146 1.14e-07 3kv5:D, 3kv5:A, 3kv6:A, 3kv9:A, 3kva:A, 3u78:A
4 1x4i:A 70 67 0.3043 0.4000 0.4179 1.33e-07 7zmx:A, 7zmx:B
5 2f6j:A 168 62 0.2391 0.1310 0.3548 1.84e-07 8ag2:A, 6aze:A, 7dmy:A, 7dn4:A, 7dn4:B, 7dn4:C, 7dn4:D, 7dn4:E, 7dn4:F, 7f5c:A, 7f5d:A, 7f5e:A, 2f6j:B, 2f6j:C, 2f6n:A, 2f6n:B, 8f6g:A, 2fsa:A, 2fsa:B, 2fsa:C, 2fuu:A, 5h6y:A, 7k6r:A, 7k6s:A, 7kdw:A, 7kdw:B, 7kdz:A, 7lp0:A, 7lp0:B, 7lpk:A, 7lpk:B, 7lrk:A, 7lrk:B, 7lro:A, 7lro:B, 6lu5:A, 6lu6:A, 7m2e:A, 8ou2:A, 8ou2:B, 3qzs:A, 3qzs:B, 3qzt:A, 3qzv:A, 5r4g:A, 5r4h:A, 5r4i:A, 5r4j:A, 5r4k:A, 5r4l:A, 5r4m:A, 5r4n:A, 2ri7:A, 7rwn:A, 7rwo:A, 7rwp:A, 7rwq:A, 7vd4:A
6 2k16:A 75 51 0.2283 0.2800 0.4118 2.74e-07 5c13:A, 5c13:C, 5c13:E, 5c13:G, 2k17:A, 5wxg:A, 5wxh:C, 5wxh:A, 5xmy:A, 5xmy:C
7 8f8y:B 433 49 0.2065 0.0439 0.3878 3.32e-07 8f8y:A, 8f8z:A, 8f8z:B, 3kqi:A, 7m10:A, 3pu3:A, 3pu3:B, 3pu8:B, 3pu8:A, 3pua:A, 3pus:A, 3pus:B
8 1wep:A 79 50 0.2065 0.2405 0.3800 6.08e-07
9 3kv4:A 432 50 0.2065 0.0440 0.3800 9.91e-07 4do0:A, 3k3n:A, 3k3o:A, 2wwu:A
10 1wem:A 76 51 0.2065 0.2500 0.3725 2.32e-06 4l7x:A, 2m3h:A
11 5wlf:A 60 53 0.1848 0.2833 0.3208 6.28e-06 5wle:A
12 5znp:B 186 48 0.2065 0.1022 0.3958 1.17e-05 5znp:A, 5znr:A, 5znr:B
13 2mum:A 50 51 0.2283 0.4200 0.4118 3.05e-05
14 2qic:A 51 54 0.2283 0.4118 0.3889 3.15e-05
15 1wes:A 71 54 0.2283 0.2958 0.3889 3.50e-05 2g6q:A
16 1weu:A 91 54 0.2174 0.2198 0.3704 1.31e-04 3c6w:A, 3c6w:C, 2k1j:A, 2m1r:A, 2pnx:A, 2pnx:C, 2vnf:A, 2vnf:C, 1wen:A
17 5z8l:A 204 50 0.1957 0.0882 0.3600 4.52e-04 5z8n:A, 5z8n:B, 5z8n:C
18 5oqd:C 192 61 0.2283 0.1094 0.3443 0.001 5oqd:B, 5oqd:A, 5oqd:D, 5oqd:E, 5oqd:F
19 2miq:A 94 44 0.2065 0.2021 0.4318 0.001
20 6wxk:B 51 48 0.1630 0.2941 0.3125 0.004 6wxk:A, 6wxk:C, 6wxk:D, 6wxk:E
21 3o70:A 55 40 0.1522 0.2545 0.3500 0.004 3o7a:A
22 6fhq:A 58 50 0.2283 0.3621 0.4200 0.005 6fhq:B, 6fi1:A, 6fi1:B, 4qf3:A, 4qf3:B
23 5xfr:A 309 53 0.2174 0.0647 0.3774 0.007 5xfr:B
24 3n9m:A 503 34 0.1630 0.0298 0.4412 0.011 3n9l:A, 3n9m:C, 3n9n:A, 3n9o:A, 3n9p:A, 3n9q:A, 3puq:A, 3puq:C, 3pur:A, 3pur:C
25 2jmi:A 60 41 0.1739 0.2667 0.3902 0.018 2jmj:A
26 5tab:A 53 51 0.1630 0.2830 0.2941 0.020
27 2e6r:A 92 73 0.2065 0.2065 0.2603 0.034
28 1wee:A 72 48 0.2065 0.2639 0.3958 0.041
29 5yc3:A 60 37 0.1304 0.2000 0.3243 0.058 5yc4:A
30 1we9:A 64 37 0.1304 0.1875 0.3243 0.073
31 2lv9:A 80 70 0.2391 0.2750 0.3143 0.081 4l58:A
32 2rsd:A 68 53 0.1739 0.2353 0.3019 0.098
33 5xfo:A 315 56 0.1957 0.0571 0.3214 0.12 8h43:A, 8h43:B, 8h43:C, 4hcz:A, 4hcz:B, 7lky:B, 7lky:H, 7lky:A, 7lky:C, 7lky:D, 7lky:E, 7lky:F, 7lky:G, 6wat:AA, 6wat:AC, 6wat:BA, 6wat:BC, 6wat:CA, 6wat:CC, 6wat:DA, 6wat:DC, 6wat:EC, 6wat:EA, 6wat:FA, 6wat:FC, 6wat:GA, 6wat:GC, 6wat:HA, 6wat:HC, 6wat:IA, 6wat:IC, 6wat:JA, 6wat:JC, 6wat:KA, 6wat:KC, 6wat:OC, 6wat:LA, 6wat:LC, 6wat:MA, 6wat:MC, 6wat:NA, 6wat:NC, 6wat:OA, 6wav:A, 6wav:C, 6wav:B, 6wav:D, 5xfn:A, 5xfp:B, 5xfp:A, 5xfp:E, 5xfq:A, 5xfq:B
34 5y20:A 52 36 0.1196 0.2115 0.3056 0.12
35 5tbn:A 57 36 0.1304 0.2105 0.3333 0.25
36 2ke1:A 66 35 0.1739 0.2424 0.4571 0.26 2kft:A, 1xwh:A
37 7xga:A 126 66 0.2065 0.1508 0.2879 0.31 6vfo:A
38 4q6f:A 56 46 0.1630 0.2679 0.3261 0.33 6fap:A, 6fap:B, 6fap:C, 6fap:D, 6fhu:A, 6fhu:B, 6fhu:D, 6fhu:C, 6fi0:A, 6fi0:B, 6fi0:C, 6fi0:D, 6fkp:A, 6fkp:D, 6fkp:C, 6fkp:B, 4q6f:B, 4q6f:C, 4q6f:D, 4qf2:A, 4qf2:B, 4qf2:C, 4qf2:D, 5t8r:D, 5t8r:A, 5t8r:B, 5t8r:C
39 1f62:A 51 48 0.1413 0.2549 0.2708 0.48
40 7tau:A 951 37 0.1304 0.0126 0.3243 0.67 7tau:C, 7tau:D, 7tau:E, 7tau:F, 7tau:H, 7tau:I, 7tau:G, 7tau:K, 7tau:L, 7tau:J, 5tx1:A, 5tx1:C, 5tx1:D, 5tx1:E, 5tx1:F, 5tx1:H, 5tx1:I, 5tx1:G, 5tx1:J, 5tx1:L
41 7klo:A 59 46 0.1848 0.2881 0.3696 0.82 7klr:A
42 2puy:B 60 61 0.2065 0.3167 0.3115 0.95 2puy:A
43 7duf:A 62 51 0.1522 0.2258 0.2745 1.5 7duf:B
44 5c11:A 52 35 0.1413 0.2500 0.3714 1.5 3gl6:A, 2kgg:A, 2kgi:A
45 2mny:A 55 46 0.1739 0.2909 0.3478 1.6 2mnz:A
46 3a9b:A 374 36 0.1304 0.0321 0.3333 2.0 3abx:A, 3vof:A
47 6zaz:A 555 43 0.1630 0.0270 0.3488 2.1 8aa0:B, 8aa0:J, 8aa1:B, 8aa1:J, 8aa2:B, 8aa2:J, 8aa3:B, 8aa3:J, 5t3r:A, 5t4y:A, 5t4y:B, 6z8i:A, 6z9a:A
48 7ood:z 50 41 0.0978 0.1800 0.2195 2.6 7p6z:z, 7pah:z, 7pai:z, 7paj:z, 7pak:z, 7pal:z, 7pam:z, 7pan:z, 7pao:z, 7paq:z, 7par:z, 7pas:z, 7pat:z, 7pau:z, 7ph9:z, 7pha:z, 7phb:z, 7phc:z, 7pi8:z, 7pi9:z, 7pia:z, 7pib:z, 7pic:z, 7pio:z, 7pip:z, 7piq:z, 7pir:z, 7pis:z, 7pit:z
49 7s78:H 933 37 0.1196 0.0118 0.2973 2.6 6b1t:E, 6b1t:F, 6b1t:D, 6b1t:A, 6b1t:C, 6cgv:A, 6cgv:C, 7s78:D, 7s78:F, 7s78:E, 7s78:G, 7s78:J, 7s78:L
50 6z7n:A 788 37 0.1196 0.0140 0.2973 2.7
51 6z7n:K 840 37 0.1196 0.0131 0.2973 2.7
52 6z7n:B 847 37 0.1196 0.0130 0.2973 2.7
53 6z7n:C 860 37 0.1196 0.0128 0.2973 2.7 6z7n:L
54 6z7n:H 894 37 0.1196 0.0123 0.2973 2.7 6z7n:G, 6z7n:D, 6z7n:E, 6z7n:F
55 6yba:E 917 37 0.1196 0.0120 0.2973 2.7 6yba:F, 6yba:D, 6yba:A, 6yba:C, 6yba:G, 6yba:I, 6yba:B, 6z7n:I, 6z7n:J
56 2owo:A 586 25 0.0978 0.0154 0.3600 3.0 4glx:A, 5tt5:A
57 5tdr:A 70 33 0.1196 0.1571 0.3333 3.3 5tdw:A
58 6o9l:Q 430 35 0.1087 0.0233 0.2857 3.4 8bvw:W, 8byq:W, 7eg9:U, 7ega:U, 7egb:U, 7egc:U, 7ena:EA, 7enc:EA, 5gpy:A, 8gxq:EA, 8gxs:EA, 5iy6:Q, 5iy8:Q, 5iy9:Q, 5iya:Q, 5iyb:Q, 5iyc:Q, 5iyd:Q, 7lbm:Q, 7nvr:W, 7nvs:W, 7nvt:W, 7nvu:W, 7nvy:W, 7nvz:W, 7nw0:W, 8s51:W, 8s52:W, 8s54:W, 8s55:W, 8s5n:W, 1vd4:A, 8wak:U, 8wal:U, 8wan:U, 8wao:U, 8wap:U, 8waq:U, 8war:U, 8was:U
59 2nax:A 76 57 0.1739 0.2105 0.2807 3.4 5m9z:A
60 5hh7:A 192 73 0.2500 0.1198 0.3151 3.5
61 4gy5:A 215 32 0.1413 0.0605 0.4062 4.4 3ask:A, 3ask:B, 3ask:D, 3asl:A, 3db3:A, 7fb7:B, 4gy5:B, 6iiw:A, 2lgg:A, 2lgk:A, 2lgl:A, 4qqd:A, 4qqd:B, 3shb:A, 3sou:A, 3sou:B, 3sow:A, 3sow:B, 3sox:A, 3sox:B, 3t6r:B, 3t6r:A, 8wms:A, 5xpi:A, 5yy9:A, 5yy9:B, 3zvy:A, 3zvy:B, 3zvz:B
62 6lqf:A 175 52 0.1848 0.0971 0.3269 4.5 6lqe:A
63 6mlc:C 85 40 0.1304 0.1412 0.3000 4.8 6mlc:A, 6mlc:B, 6mlc:D
64 2obe:A 915 37 0.1196 0.0120 0.2973 4.8 2obe:B, 2obe:C
65 7rd1:J 942 37 0.1196 0.0117 0.2973 4.8 7rd1:L, 7rd1:A, 7rd1:C, 7rd1:D, 7rd1:F, 7rd1:B, 7rd1:E, 7rd1:G, 7rd1:H, 7rd1:K, 7rd1:I
66 8i02:G 284 59 0.1739 0.0563 0.2712 5.0 8ifg:P
67 2ma5:A 61 35 0.1304 0.1967 0.3429 6.2
68 9atn:A 98 31 0.1087 0.1020 0.3226 6.5
69 2m85:A 65 38 0.1522 0.2154 0.3684 6.6
70 7mju:A 184 30 0.1413 0.0707 0.4333 7.2 5dag:A, 5dah:B, 5dah:A
71 7w1m:H 322 26 0.0978 0.0280 0.3462 9.8 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
72 7msw:A 635 32 0.1304 0.0189 0.3750 9.9 7exm:A, 7exm:B, 7exm:C, 7exm:D, 7msx:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218