Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
GDVTVIRDQYGVPHLYAKNKQDLYKAYGYVMAKDRLFQLEMFRRGNEGTVSEVFGEEYLAKDEQSRRDGYSDEEIKEMLN
DLEDKPRAYIQQFAEGISLYVQEALKNPDEKLSKEFHDYKFLPRKWDATDVVRLYLVSMTYFMDNHQELTNAEILAKLEQ
TYGEEQAEKMFDDLVWKNDPEAPASIQAEDE

The query sequence (length=191) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6nvy:A 191 191 1.0000 1.0000 1.0000 4.85e-142 6nvy:C
2 1gm9:A 207 191 0.3403 0.3140 0.3403 3.17e-44 1fxh:A, 1fxv:A, 1k7d:A, 1kec:A
3 7rep:A 764 192 0.3455 0.0864 0.3438 1.41e-40 4pel:B, 4pel:D, 4pel:F, 4pel:H, 4pem:B, 7reo:A
4 7ea4:A 762 131 0.2199 0.0551 0.3206 1.13e-17 7ea4:B, 7eby:A, 7eby:B, 7eby:C, 7eby:D, 7eby:E, 7eby:F
5 1jvz:A 152 109 0.1571 0.1974 0.2752 2.79e-04
6 4yf9:D 168 112 0.1518 0.1726 0.2589 0.042 4yf9:A, 4yf9:G, 4yf9:J, 4yfa:A, 4yfa:D, 4yfa:G, 4yfa:J, 4yfb:D, 4yfb:A
7 4r1d:A 517 130 0.1675 0.0619 0.2462 0.051
8 5ck5:A 221 57 0.1047 0.0905 0.3509 0.51 5ck4:A, 5ck4:B, 5ck5:B, 5ck5:C, 5ck5:D
9 4v6i:BB 254 50 0.0681 0.0512 0.2600 0.55 8aaf:j, 8agt:j, 8agu:j, 8agv:j, 8agw:j, 8agx:j, 8agz:j, 5apn:A, 5apo:A, 7azy:x, 7b7d:LD, 8bip:LA, 8bjq:LA, 8bn3:L2, 8bqd:AW, 8bqx:AW, 7bt6:A, 7btb:A, 8c3a:j, 8c3a:AW, 8ccs:EE, 8cdl:EE, 8cdr:EE, 8ceh:EE, 8cf5:EE, 8cg8:EE, 8cgn:EE, 8civ:EE, 8cku:EE, 8cmj:EE, 8cq7:j, 8cq7:AW, 8cqw:j, 8cqw:AW, 8cre:j, 8cre:AW, 5dat:L2, 5dat:l2, 5dc3:L2, 5dc3:l2, 5dge:L2, 5dge:l2, 5dgf:L2, 5dgf:l2, 5dgv:L2, 5dgv:l2, 8eub:AA, 8evp:AA, 8evq:AA, 8evr:AA, 8evs:AA, 8evt:AA, 8ewb:AA, 8ewc:AA, 5fci:L2, 5fci:l2, 5fcj:L2, 5fcj:l2, 6ft6:A, 5gak:E, 6gq1:A, 6gqb:A, 6gqv:A, 5h4p:A, 6hd7:E, 8hfr:B4, 6hhq:j, 6hhq:CD, 5i4l:L2, 5i4l:l2, 6i7o:AW, 6i7o:XW, 5it7:AA, 3j6x:L2, 3j6y:L2, 3j77:L2, 3j78:L2, 3jct:A, 5jcs:A, 5juo:F, 5jup:F, 5jus:F, 5jut:F, 5juu:F, 8k2d:LA, 8k82:LA, 5lyb:L2, 5lyb:l2, 5m1j:A5, 6m62:A, 5mc6:AW, 5mei:j, 5mei:CD, 7mpi:AA, 7mpj:AA, 6n8j:A, 6n8k:A, 6n8l:A, 6n8m:D, 6n8n:D, 6n8o:D, 7n8b:AA, 5ndg:L2, 5ndg:l2, 5ndv:L2, 5ndv:l2, 5ndw:L2, 5ndw:l2, 7nrc:LD, 7nrd:LD, 5obm:L2, 5obm:l2, 8oeq:j, 8oeq:AW, 7of1:A, 7oh3:A, 7ohq:A, 6oig:A, 5on6:j, 5on6:CD, 7osa:uL2, 7osm:uL2, 8p8m:LF, 8p8n:LF, 8p8u:LF, 8pfr:LF, 7pzy:j, 7q08:j, 7q0f:j, 7q0p:j, 7q0r:j, 8q5i:j, 6q8y:AW, 6qik:B, 6qt0:B, 6qtz:B, 6r84:E, 6r86:E, 6r87:E, 6ri5:B, 7rr5:LA, 6rzz:B, 6s05:B, 6s47:AD, 6snt:h, 6sv4:AW, 6sv4:XW, 6sv4:zW, 6t4q:LA, 5t62:D, 5t6r:D, 6t7i:LA, 6t7t:LA, 6t83:Ay, 6t83:Da, 5tbw:j, 5tbw:CD, 6tb3:AW, 5tga:L2, 5tga:l2, 5tgm:L2, 5tgm:l2, 6tnu:AW, 7too:AL02, 7top:AL02, 7u0h:A, 4u3m:L2, 4u3m:l2, 4u3n:L2, 4u3n:l2, 4u3u:L2, 4u3u:l2, 4u4n:L2, 4u4n:l2, 4u4o:L2, 4u4o:l2, 4u4q:L2, 4u4q:l2, 4u4r:L2, 4u4r:l2, 4u4u:L2, 4u4u:l2, 4u4y:L2, 4u4y:l2, 4u4z:L2, 4u4z:l2, 4u50:L2, 4u50:l2, 4u51:L2, 4u51:l2, 4u52:L2, 4u52:l2, 4u53:L2, 4u53:l2, 4u55:L2, 4u55:l2, 4u56:L2, 4u56:l2, 4u6f:L2, 4u6f:l2, 7ug6:A, 7uoo:A, 7uqb:A, 7uqz:A, 6uz7:AA, 7v08:A, 4v4b:BB, 4v7f:B, 4v7h:BB, 4v7r:BB, 4v7r:DB, 4v88:BA, 4v88:DA, 4v8t:A, 4v8y:BA, 4v8z:BA, 4v91:A, 6woo:A, 6xiq:A, 6xir:A, 8y0u:LA, 6ylg:A, 6ylh:A, 6yly:A, 7z34:A, 6z6j:LA, 6z6k:LA, 7zpq:BA, 7zrs:BA, 7zs5:BC, 7zuw:BA, 7zux:EA, 7zw0:LE
10 5ubk:A 709 48 0.0890 0.0240 0.3542 1.1 4k2f:B, 4k2g:B, 3l91:B, 4m1j:C, 3srb:A, 3srb:B, 3src:B, 4wks:C, 4wkt:C, 4wku:B, 4wkv:C, 2wyc:A, 2wyc:B
11 5r7x:B 344 97 0.1361 0.0756 0.2680 1.5 4c8d:A, 5r7x:A, 5raa:A, 5raa:B, 5rab:A, 5rab:B, 5rac:A, 5rac:B, 5rad:A, 5rad:B, 5rae:A, 5rae:B, 5raf:A, 5raf:B, 5rag:A, 5rag:B, 5rah:A, 5rah:B, 5rai:A, 5rai:B, 5raj:A, 5raj:B, 5rak:A, 5rak:B, 5ral:A, 5ral:B, 5ram:A, 5ram:B, 5ran:A, 5ran:B, 5rao:A, 5rao:B, 5rap:A, 5rap:B, 5raq:A, 5raq:B, 5rar:A, 5rar:B, 5ras:A, 5ras:B, 5rau:A, 5rau:B, 5rav:A, 5rav:B, 5raw:A, 5raw:B, 5rax:A, 5rax:B, 5ray:A, 5ray:B, 5raz:A, 5raz:B, 5rb0:A, 5rb0:B, 5rb1:A, 5rb1:B, 5rb2:A, 5rb2:B, 5rb3:A, 5rb3:B, 5rb4:A, 5rb4:B, 5rb5:A, 5rb5:B, 5rb6:A, 5rb6:B, 5rb7:A, 5rb7:B, 6rbj:A, 6rbj:B, 6ydv:AAA, 6ydv:BBB
12 7pua:Cg 487 69 0.1152 0.0452 0.3188 1.6 6hiv:Cg, 6hiw:Cg, 6hiz:Cg, 7pub:Cg, 6sg9:Cg, 6sgb:Cg
13 5ck3:B 270 30 0.0681 0.0481 0.4333 1.6
14 5ck3:D 230 30 0.0681 0.0565 0.4333 2.2
15 7nng:A 572 55 0.0838 0.0280 0.2909 2.4 5rl6:A, 5rl7:A, 5rl8:A, 5rl9:A, 5rlb:A, 5rlc:A, 5rld:A, 5rle:A, 5rlf:A, 5rlg:A, 5rlh:A, 5rli:A, 5rlj:A, 5rlk:A, 5rll:A, 5rlm:A, 5rln:A, 5rlo:A, 5rlp:A, 5rlq:A, 5rlr:A, 5rls:A, 5rlt:A, 5rlu:A, 5rlv:A, 5rlw:A, 5rly:A, 5rlz:A, 5rm0:A, 5rm1:A, 5rm2:A, 5rm3:A, 5rm4:A, 5rm5:A, 5rm6:A, 5rm7:A, 5rm8:A, 5rm9:A, 5rma:A, 5rmb:A, 5rmc:A, 5rmd:A, 5rme:A, 5rmf:A, 5rmg:A, 5rmh:A, 5rmi:A, 5rmj:A, 5rmk:A, 5rml:A, 5rmm:A, 5rob:A, 6zsl:A
16 8sx2:A 313 50 0.0995 0.0607 0.3800 3.1 8sx2:B
17 5iu9:B 422 38 0.0628 0.0284 0.3158 3.6 5iu9:A
18 5ck3:F 147 24 0.0628 0.0816 0.5000 4.0
19 6k0a:I 116 31 0.0576 0.0948 0.3548 5.0 6k0a:J, 6k0b:I, 6k0b:J, 1sds:A, 1sds:C, 1sds:B
20 4ozt:E 238 158 0.1937 0.1555 0.2342 5.1
21 6jyt:A 597 21 0.0524 0.0168 0.4762 5.4 7cxm:E, 7cxm:F, 7cxn:E, 7cxn:F, 7cyq:F, 7cyq:E, 7egq:E, 7egq:R, 7egq:F, 7egq:S, 7eiz:E, 7eiz:F, 8gw1:E, 8gw1:F, 8gwb:F, 8gwb:E, 8gwe:F, 8gwe:E, 8gwf:F, 8gwf:E, 8gwg:F, 8gwg:E, 8gwi:F, 8gwi:E, 8gwk:E, 8gwk:F, 8gwm:E, 8gwm:F, 8gwn:F, 8gwn:E, 8gwo:F, 8gwo:E, 6jyt:B, 7krn:E, 7kro:E, 7kro:F, 7nio:A, 7nio:E, 7nn0:A, 7nn0:B, 7nn0:C, 7nn0:D, 7nng:B, 7rdx:E, 7rdx:F, 7rdy:E, 7rdy:F, 7rdz:E, 7rdz:F, 7re0:E, 7re0:F, 7re1:E, 7re1:F, 7re2:E, 7re3:E, 7re3:F, 7re3:K, 7re3:L, 5rl6:B, 5rl7:B, 5rl8:B, 5rl9:B, 5rlb:B, 5rlc:B, 5rld:B, 5rle:B, 5rlf:B, 5rlg:B, 5rlh:B, 5rli:B, 5rlj:B, 5rlk:B, 5rll:B, 5rlm:B, 5rln:B, 5rlo:B, 5rlp:B, 5rlq:B, 5rlr:B, 5rls:B, 5rlt:B, 5rlu:B, 5rlv:B, 5rlw:B, 5rly:B, 5rlz:B, 5rm0:B, 5rm1:B, 5rm2:B, 5rm3:B, 5rm4:B, 5rm5:B, 5rm6:B, 5rm7:B, 5rm8:B, 5rm9:B, 5rma:B, 5rmb:B, 5rmc:B, 5rmd:B, 5rme:B, 5rmf:B, 5rmg:B, 5rmh:B, 5rmi:B, 5rmj:B, 5rmk:B, 5rml:B, 5rmm:B, 5rob:B, 6xez:E, 6xez:F, 6zsl:B
22 7y9x:A 1458 36 0.0838 0.0110 0.4444 5.9 8gs2:A
23 1jig:A 146 41 0.0838 0.1096 0.3902 5.9 1jig:B, 1jig:C, 1jig:D
24 7wah:A 1473 36 0.0838 0.0109 0.4444 6.1
25 8wm4:A 1331 36 0.0838 0.0120 0.4444 6.2
26 8eey:A 1544 36 0.0838 0.0104 0.4444 6.3 7yna:A, 7ynb:A, 7ync:A
27 7yn9:A 1514 36 0.0838 0.0106 0.4444 6.7
28 7ynd:A 1567 36 0.0838 0.0102 0.4444 6.7
29 6uv8:A 183 55 0.0838 0.0874 0.2909 6.9 6uvb:A
30 1p1m:A 404 35 0.0785 0.0371 0.4286 8.8 2plm:A
31 6qd5:A 356 35 0.0681 0.0365 0.3714 9.7 8blp:A, 8blp:C, 8blp:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218