BioLiP

>protein
GDTSYAKNSAYNQLVLAKVKPVLEQCVRELLRANLPNINKCIKVADLGCASGPNTLLTVRDIVQSIDKVGQLERPTIQIF
LNDLFPNDFNSVFKLLPSFYRKLEKENGRKIGSCLIGAMPGSFYSRLFPEESMHFLHSCYCLQWLSQVPSGLVTEIGTNK
GSIYSSKASRLPVQKAYLDQFTKDFTTFLRIHSEELFSHGRMLLTCICKGVELDARNAIDLLEMAINDLVVEGHLEEEKL
DSFNLPVYIPSAEEVKCIVEEEGSFEILYLETFKVLYDAGFSHIKAEYVASSVRAVYEPILASHFGEAIIPDIFHRFAKH
AAKVLPLGKGFYNNLIISLAKKP

The query sequence (length=343) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2eg5:E	346	346	1.0000	0.9913	0.9913	0.0	2eg5:A, 2eg5:C, 2eg5:G
2	2efj:A	348	349	0.8047	0.7931	0.7908	0.0
3	1m6e:X	359	358	0.4227	0.4039	0.4050	6.39e-80
4	6lyh:A	358	331	0.3790	0.3631	0.3927	4.44e-71	6lyh:B, 6lyh:C, 6lyh:D, 6lyh:E, 6lyh:F, 6lyh:G, 6lyh:H
5	8t2g:A	333	332	0.3615	0.3724	0.3735	9.52e-66	8t2g:B, 8uzd:A, 8uzd:B
6	6c8r:A	358	331	0.3294	0.3156	0.3414	8.06e-50	6c8r:B, 6c8s:A, 6c8s:B
7	3b5i:A	344	300	0.3032	0.3023	0.3467	1.40e-45	3b5i:B
8	5f2k:A	358	276	0.2041	0.1955	0.2536	1.87e-16	5f2k:B, 5f2n:A, 5f2n:B, 5f2o:A, 5f2o:B
9	2imc:B	405	84	0.0816	0.0691	0.3333	0.35	3dse:A, 4hev:A, 4hev:B, 2ima:A, 2ima:B, 2imb:A, 2imb:B, 2imc:A, 7ky2:A, 7ky2:B, 7kyh:A, 7kyh:B, 7kyh:C, 7kyh:D, 7n18:A, 7n18:B, 3nf3:A, 3qix:A, 3qix:B, 3qiy:A, 3qiz:A, 3qj0:A, 5v8p:A, 5v8p:B, 5v8r:A, 5v8r:B, 5v8u:A, 5v8u:B
10	3v0a:A	1280	84	0.0816	0.0219	0.3333	0.62	8agk:AAA, 3bon:A, 3boo:A, 3bta:A, 3bwi:A, 3c88:A, 3c89:A, 3c8a:A, 3c8b:A, 3dda:A, 3ddb:A, 3ds9:A, 1e1h:A, 1e1h:C, 4ej5:A, 4el4:A, 4elc:A, 2g7n:A, 2g7p:A, 2g7p:B, 2g7q:A, 2g7q:B, 8hkh:A, 8hkh:B, 2ilp:A, 2ilp:B, 2ise:A, 2ise:B, 2isg:A, 2isg:B, 2ish:A, 2ish:B, 3k3q:B, 4ks6:A, 4ktx:A, 4kuf:A, 7kyf:C, 7l6v:A, 7lzp:A, 7lzp:D, 7m1h:A, 2nyy:A, 2nz9:A, 2nz9:B, 7qpt:A, 7qpu:A, 3qw5:A, 3qw6:A, 3qw7:A, 3qw8:A, 5tpb:B, 5tpc:A, 3v0b:A, 3v0c:A, 5vgv:A, 2vu9:A, 2w2d:A, 2w2d:C, 6xcb:A, 6xcc:A, 6xcd:A, 6xce:A, 6xcf:A, 1xtf:A, 1xtf:B, 1xtg:A, 4zjx:A, 3zus:A, 3zus:B, 3zus:C, 3zus:D
11	8vsi:B	579	42	0.0321	0.0190	0.2619	2.0
12	1p9b:A	424	91	0.0758	0.0613	0.2857	3.1
13	9b8t:A	1146	53	0.0437	0.0131	0.2830	4.3	9b8s:A, 9f6d:A, 9f6e:A, 9f6f:A, 9f6i:A, 9f6j:A, 9f6k:A, 9f6l:A
14	7zbh:B	374	92	0.0787	0.0722	0.2935	5.7	7zbh:A, 7zbh:D, 7zbh:F, 7zbh:I, 7zbh:K
15	7ehq:A	406	40	0.0554	0.0468	0.4750	5.7	7ehu:A
16	4wji:A	293	24	0.0292	0.0341	0.4167	7.5
17	7v9a:D	117	51	0.0408	0.1197	0.2745	8.8

[Back]