BioLiP

>protein
GDRVADVIESSIGDSVSRALTHALPAPTGQNTQVSSHRLDTGKVPALQAAEIGASSNASDESMIETRCVLNSHSTAETTL
DSFFSRAGLVGEIDLPLKGTTNPNGYANWDIDITGYAQMRRKVELFTYMRFDAEFTFVACTPTGEVVPQLLQYMFVPPGA
PKPDSRESLAWQTATNPSVFVKLSDPPAQVSVPFMSPASAYQWFYDGYPTFGEHKQEKDLEYGACPNNMMGTFSVRTVGT
SKSKYPLVVRIYMRMKHVRAWIPRPMRNQNYLFKANPNYAGNSIKPTGASRTAITTL

The query sequence (length=297) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4cdq:A	297	297	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	8c6d:A, 4cdu:A, 4cdw:A, 4cdx:A, 4cew:A, 4cey:A, 6i2k:A, 6lqd:A, 3vbf:A, 3zff:A, 3zfg:A
2	5abj:A	286	286	0.7037	0.7308	0.7308	6.92e-160
3	1bev:1	268	256	0.3771	0.4179	0.4375	6.78e-66
4	6t40:A	271	248	0.3939	0.4317	0.4718	1.05e-65	5osn:A, 6t48:A, 6t4c:A
5	7taf:A	296	277	0.3872	0.3885	0.4152	5.26e-65	5bnn:A, 5bnp:A, 6crp:A, 6cs3:A, 6cv1:A, 6cvb:A, 7ebr:A, 6mzi:A, 7tag:A, 6wdt:A, 4wm7:A
6	7ozk:A	297	292	0.3906	0.3906	0.3973	1.05e-62	7ozl:A
7	6sk7:A	285	298	0.3939	0.4105	0.3926	8.00e-58
8	3vdd:A	280	268	0.3636	0.3857	0.4030	6.73e-57	8ay4:A, 3dpr:A, 1fpn:1, 1v9u:1
9	1aym:1	285	272	0.3569	0.3719	0.3897	2.16e-55	1ayn:1, 1c8m:1, 1ncr:A, 1nd2:A, 1nd3:A, 1qju:1, 1qjx:1, 1qjy:1
10	1z7s:1	283	252	0.3401	0.3569	0.4008	4.24e-55	1z7z:1
11	2hwd:1	283	267	0.3704	0.3887	0.4120	5.26e-54	2hwe:1, 2hwf:1, 1r1a:1
12	7oj7:111	281	254	0.3367	0.3559	0.3937	2.24e-53	4q4w:1, 4q4x:1, 4q4y:1, 7qb5:111, 6tsd:111
13	8ayz:A	278	246	0.3266	0.3489	0.3943	1.05e-51	1eah:1, 3epf:1
14	6ppo:A	261	239	0.3266	0.3716	0.4059	3.84e-51	6psf:A
15	6sk5:A	273	273	0.3367	0.3663	0.3663	7.50e-51
16	1mqt:A	271	272	0.3535	0.3875	0.3860	3.19e-50
17	6zck:A	271	259	0.3333	0.3653	0.3822	3.71e-50
18	1piv:1	279	237	0.3165	0.3369	0.3966	1.80e-49	8ayx:A, 8ayy:A, 5o5b:1, 5o5p:1, 1vba:1, 1vbb:1, 1vbc:1, 1vbe:1
19	6gzv:A	269	265	0.3535	0.3903	0.3962	2.08e-49	6zcl:A
20	1h8t:A	289	259	0.3300	0.3391	0.3784	1.13e-48
21	1d4m:1	284	295	0.3367	0.3521	0.3390	1.56e-47
22	4pdw:A	274	261	0.3199	0.3467	0.3640	8.92e-47	1hri:1, 1hrv:1, 2hwb:1, 2hwc:1, 1na1:A, 1ncq:A, 1r08:1, 1r09:1, 2r04:1, 2r06:1, 2r07:1, 2rm2:1, 2rr1:1, 2rs1:1, 2rs3:1, 2rs5:1, 1ruc:1, 1rud:1, 1rue:1, 1rug:1, 1ruh:1, 1rui:1, 1vrh:1
23	1po1:1	283	240	0.3030	0.3180	0.3750	1.10e-45	1po2:1, 1vbd:1
24	9fjc:1	223	234	0.2997	0.3991	0.3803	7.90e-42
25	1qcf:A	450	51	0.0606	0.0400	0.3529	0.11	1ad5:B, 1ad5:A, 2c0i:A, 2c0i:B, 2c0o:A, 2c0o:B, 2c0t:A, 2c0t:B, 5h09:A, 5h0b:A, 5h0e:A, 5h0g:A, 5h0h:A, 2hck:B, 2hck:A, 2hk5:A, 3vry:A, 3vry:B, 3vrz:A, 3vrz:B, 3vs0:A, 3vs0:B, 3vs1:B, 3vs2:A, 3vs2:B, 3vs3:A, 3vs3:B, 3vs4:B, 3vs4:A, 3vs5:A, 3vs5:B, 3vs6:A, 3vs6:B, 3vs7:A, 5zj6:A, 5zj6:B
26	3vs7:B	427	51	0.0606	0.0422	0.3529	0.12	4lud:B, 4lud:A, 4lue:B, 4lue:A, 3vs1:A
27	7esy:B	732	66	0.0707	0.0287	0.3182	0.38
28	1aot:F	106	74	0.0741	0.2075	0.2973	0.52	1aou:F, 2mrk:A, 4u1p:A
29	5o8x:A	304	59	0.0606	0.0592	0.3051	4.4	4anr:A, 5o8x:B
30	7ye1:D	1144	69	0.0640	0.0166	0.2754	4.5	7ye2:D
31	6efx:A	345	46	0.0471	0.0406	0.3043	7.3

[Back]